アライメント

バイオインフォマティクスにおいて、アライメントは２つの分子の構成要素がどれだけ似ているかの度合いをさします。タンパク質ではアミノ酸、DNAまたはRNAでは核酸がその構成要素にあたります。 タンパク質のアライメントでは、２種類の基本的なアライメントがよく使われます。 １つは配列アライメントで、アミノ酸配列だけを比較するものです。 もう１つは構造アライメントで、立体構造を比較するものです。 両者を組み合わせた方法や、二次構造、溶媒などの他の情報と組み合わせた方法もあります。