登録情報 | データベース: PDB / ID: 7mjy |
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タイトル | MiaB in the complex with s-adenosyl-L-homocysteine and RNA |
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要素 | - RNA (5'-R(P*UP*AP*UP*UP*C)-3')
- tRNA-2-methylthio-N(6)-dimethylallyladenosine synthase
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キーワード | TRANSFERASE/RNA / tRNA-2-methylthio-N(6)-dimethylallyladenosine synthase / TRANSFERASE (転移酵素) / TRANSFERASE-RNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tRNA-2-methylthio-N6-dimethylallyladenosine synthase / methylthiotransferase activity / tRNA modification / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / metal ion binding / 細胞質類似検索 - 分子機能 tRNA-2-methylthio-N(6)-dimethylallyladenosine synthase MiaB / Methylthiotransferase / Methylthiotransferase, N-terminal / Methylthiotransferase, N-terminal domain superfamily / Uncharacterized protein family UPF0004 / Methylthiotransferase N-terminal domain profile. / Methylthiotransferase, conserved site / Methylthiotransferase radical SAM domain signature. / TRAM domain / TRAM domain ...tRNA-2-methylthio-N(6)-dimethylallyladenosine synthase MiaB / Methylthiotransferase / Methylthiotransferase, N-terminal / Methylthiotransferase, N-terminal domain superfamily / Uncharacterized protein family UPF0004 / Methylthiotransferase N-terminal domain profile. / Methylthiotransferase, conserved site / Methylthiotransferase radical SAM domain signature. / TRAM domain / TRAM domain / Radical SAM, alpha/beta horseshoe / TRAM domain profile. / Elp3/MiaB/NifB / Elongator protein 3, MiaB family, Radical SAM / Radical SAM superfamily / Radical SAM core domain profile. / Radical SAM類似検索 - ドメイン・相同性 FE3-S4 CLUSTER / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / TRIETHYLENE GLYCOL / S-アデノシル-L-ホモシステイン / 鉄・硫黄クラスター / リボ核酸 / RNA (> 10) / tRNA-2-methylthio-N(6)-dimethylallyladenosine synthase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Bacteroides uniformis (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.86 Å |
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データ登録者 | Esakova, O.A. / Grove, T.L. / Yennawar, N.H. / Arcinas, A.J. / Wang, B. / Krebs, C. / Almo, S.C. / Booker, S.J. |
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資金援助 | 米国, 3件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | NIH (GM-122595 to S.J.B) | 米国 | National Science Foundation (NSF, United States) | NSF (MCB-1716686 to S.J.B.) | 米国 | Howard Hughes Medical Institute (HHMI) | Squire J. Booker | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Nature / 年: 2021 タイトル: Structural basis for tRNA methylthiolation by the radical SAM enzyme MiaB. 著者: Esakova, O.A. / Grove, T.L. / Yennawar, N.H. / Arcinas, A.J. / Wang, B. / Krebs, C. / Almo, S.C. / Booker, S.J. |
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履歴 | 登録 | 2021年4月20日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2021年9月15日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2021年9月29日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / Item: _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title |
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改定 1.2 | 2021年10月6日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2023年10月18日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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