PDB-5kob: Crystal structure of a peptide deformylase from Burkholderia xeno...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5kob

タイトル

Crystal structure of a peptide deformylase from Burkholderia xenovorans

要素

Peptide deformylase

ペプチドデホルミラーゼ

キーワード

HYDROLASE (加水分解酵素) / SSGCID /

peptide deformylase (ペプチドデホルミラーゼ) /

Structural Genomics (構造ゲノミクス) / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease

機能・相同性

機能・相同性情報

ペプチドデホルミラーゼ /

peptide deformylase activity /

翻訳 (生物学) /

metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Burkholderia xenovorans (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.6 Å

データ登録者

SSGCID / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)

引用

ジャーナル: to be published
タイトル: Crystal structure of a peptide deformylase from Burkholderia xenovorans
著者: Mayclin, S.J. / Conrady, D.G. / Edwards, T.E. / Staker, B. / Myler, P. / Stewart, L.

履歴

登録	2016年6月30日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年7月13日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年11月22日	Group: Derived calculations / Refinement description / カテゴリ: pdbx_struct_oper_list / software Item: _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _software.classification
改定 1.2	2023年10月4日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5kob.cif.gz	299.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5kob.ent.gz	242.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5kob.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ko/5kob ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ko/5kob	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5ghwS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1szz-1 1sv2-1 1vez-1 1szz-3 1vey-2 5cwy-1 6mt1-d 1vey-1 5e5d-1 1szz-4 1vev-2 5i2b-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: SSGCID-BuxeA.00078.a

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#111 - 2009年3月ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase) 類似性 (1) #240 - 2019年12月低酸素誘導因子 (Hypoxia-Inducible Factors) 類似性 (1) #244 - 2020年4月光合成超複合体 (Photosynthetic Supercomplexes) 類似性 (1) #147 - 2012年3月ロドプシン (Rhodopsin) 類似性 (1) #61 - 2005年1月フェニルアラニン水酸化酵素 (Phenylalanine Hydroxylase) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#111 - 2009年3月
ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase)
類似性 (1)
#240 - 2019年12月
低酸素誘導因子 (Hypoxia-Inducible Factors)
類似性 (1)
#244 - 2020年4月
光合成超複合体 (Photosynthetic Supercomplexes)
類似性 (1)
#147 - 2012年3月
ロドプシン (Rhodopsin)
類似性 (1)
#61 - 2005年1月
フェニルアラニン水酸化酵素 (Phenylalanine Hydroxylase)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Peptide deformylase

B: Peptide deformylase

C: Peptide deformylase

D: Peptide deformylase

ヘテロ分子

85.3 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Peptide deformylase

C: Peptide deformylase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
42.7 kDa, 2 ポリマー
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2

B: Peptide deformylase

D: Peptide deformylase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
42.6 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	63.550, 92.000, 142.110
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Peptide deformylase / ペプチドデホルミラーゼ / PDF / Polypeptide deformylase 分子量: 20942.793 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Burkholderia xenovorans (strain LB400) (バクテリア) 株: LB400 / 遺伝子: def, Bxe_A1677 / プラスミド: AVA0421 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q13XB1, ペプチドデホルミラーゼ
#2: 化合物	ChemComp-FE2 / FE (II) ION 分子量: 55.845 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe
#3: 化合物	... ChemComp-FMT / FORMIC ACID / ギ酸 / ギ酸分子量: 46.025 Da / 分子数: 24 / 由来タイプ: 合成 / 式: CH₂O₂
#4: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル / エチレングリコール分子量: 62.068 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#5: 水	ChemComp-HOH / water / 水分子量: 18.015 Da / 分子数: 681 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.61 Å³/Da / 溶媒含有率: 53 %
結晶化	温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: JCSG+ A5 (270125a5): 20% w/v PEG3350, 200mM Magnesium formate dihydrate; 20eg2step; protein 22mg/mL; ehj6-10

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 21-ID-F / 波長: 0.97872 Å

検出器

タイプ: RAYONIX MX-225 / 検出器: CCD / 日付: 2016年3月31日

放射

モノクロメーター: Diamond [111] / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97872 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.6→50 Å / Num. obs: 109668 / % possible obs: 99.3 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 5.5 % / B_iso Wilson estimate: 20.38 Å² / CC_1/2: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.05 / Net I/σ(I): 17.52

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	CC_1/2	Diffraction-ID	% possible all
1.6-1.64	5.5	0.508	2.89	0.892	1	100
1.64-1.69		0.414	3.55	0.925	1	99.9
1.69-1.74		0.337	4.4	0.946	1	100
1.74-1.79		0.269	5.48	0.964	1	100
1.79-1.85		0.205	7.12	0.976	1	100
1.85-1.91		0.165	8.88	0.986	1	99.9
1.91-1.98		0.126	11.41	0.991	1	99.9
1.98-2.07		0.1	14.32	0.994	1	99.7
2.07-2.16		0.082	17.45	0.995	1	99.8
2.16-2.26		0.071	20.45	0.996	1	99.7
2.26-2.39		0.061	23.28	0.997	1	99.4
2.39-2.53		0.055	25.74	0.998	1	99.3
2.53-2.7		0.049	28.88	0.998	1	99.1
2.7-2.92		0.043	31.99	0.998	1	98.8
2.92-3.2		0.038	35.33	0.998	1	98.6
3.2-3.58		0.035	38.69	0.998	1	98.3
3.58-4.13		0.032	41.09	0.999	1	98
4.13-5.06		0.031	41.89	0.999	1	97.4
5.06-7.16		0.031	41.4	0.999	1	96.1
7.16-50		0.032	39.56	0.998	1	90.9

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XSCALE		データスケーリング
MOLREP		位相決定
PHENIX	(dev_2443: ???)	精密化
PDB_EXTRACT	3.2	データ抽出
XDS		データスケーリング
Coot		モデル構築

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5GHW

5ghw

解像度: 1.6→49.072 Å / SU ML: 0.15 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 18.78

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.1919	1931	1.76 %
R_work	0.1647	-	-
obs	0.1652	109637	99.29 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 86.15 Å² / B_iso mean: 30.2831 Å² / B_iso min: 13.22 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.6→49.072 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5137	0	88	684	5909
B_iso mean	-	-	52.14	38.74	-
残基数	-	-	-	-	659

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.006	5528
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.873	7510
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.061	816
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	994
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.451	3327

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 14

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
1.6-1.64	0.2557	134	0.2284	7628	7762	100
1.64-1.6844	0.2206	142	0.2065	7607	7749	100
1.6844-1.7339	0.2156	164	0.1911	7666	7830	100
1.7339-1.7899	0.2046	124	0.1796	7658	7782	100
1.7899-1.8539	0.2064	127	0.1751	7695	7822	100
1.8539-1.9281	0.2241	145	0.1765	7706	7851	100
1.9281-2.0159	0.2424	147	0.1714	7629	7776	100
2.0159-2.1221	0.1819	149	0.1678	7711	7860	100
2.1221-2.2551	0.1935	141	0.1679	7700	7841	100
2.2551-2.4292	0.194	114	0.168	7727	7841	99
2.4292-2.6737	0.212	125	0.1743	7690	7815	99
2.6737-3.0605	0.2213	135	0.1749	7723	7858	99
3.0605-3.8557	0.1684	143	0.1544	7747	7890	98
3.8557-49.0949	0.165	141	0.1433	7819	7960	96

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	6.2293	-1.9185	-5.2879	3.0825	4.1929	9.1066	-0.1529	-0.1867	0.1617	0.5107	-0.0154	0.5303	-0.6364	-0.5863	0.1392	0.372	0.0633	0.0629	0.2114	-0.0123	0.2488	-24.0323	10.6157	3.3673
2	7.6279	2.8622	-5.2235	4.1348	-3.1268	3.9813	-0.2146	-0.4809	-0.3359	0.1023	-0.1887	-0.0775	0.3052	0.2052	0.5319	0.2233	-0.0052	0.0162	0.1596	-0.0006	0.1181	-19.1866	-4.3261	11.3031
3	4.1267	-1.9266	2.5584	5.6486	-4.5501	3.9819	-0.1008	-0.152	0.1987	0.4113	0.1137	0.2241	-0.5137	-0.716	-0.024	0.2195	0.0232	0.0663	0.2774	-0.0297	0.2068	-31.9231	2.6317	11.1215
4	1.2446	0.2389	-0.4586	2.4366	-0.26	2.1361	-0.0455	0.217	-0.024	-0.1024	-0.0363	0.4051	0.2456	-0.5811	0.0679	0.1841	-0.0419	0.0167	0.2714	-0.0286	0.1814	-31.0492	-3.2544	-0.2949
5	2.8994	-0.6019	0.2393	4.2901	-3.5158	4.0964	-0.0781	0.346	-0.402	-0.3036	-0.2386	0.0055	0.9367	-0.1598	0.1794	0.3151	-0.0615	0.0578	0.1939	-0.0318	0.1987	-25.9175	-11.135	-14.7655
6	1.7855	1.1094	-0.1374	3.6549	-0.2566	3.589	0.0165	0.0392	0.0298	0.0802	-0.0069	0.1161	0.1541	-0.3387	0.0084	0.0991	-0.008	0.017	0.1402	-0.0009	0.1134	-26.3107	1.2136	-10.9545
7	0.6524	-0.0267	0.2987	0.9	-1.8262	3.8462	0.052	0.0231	-0.1092	0.3911	-0.0382	0.2935	1.4828	-0.5964	0.0779	0.4073	-0.1471	0.0748	0.2197	-0.0115	0.2582	-28.77	-14.0774	5.1517
8	2.3675	0.038	0.1266	1.2098	-0.9498	3.2764	-0.061	-0.0269	-0.1469	0.0902	0.013	0.1853	0.3381	-0.3877	0.0064	0.2338	-0.0393	0.0623	0.1342	-0.015	0.1581	-27.8602	-9.396	-2.837
9	2.6648	1.0479	2.3695	3.8185	-0.4869	2.7505	0.1068	0.2228	-0.0909	0.1401	0.0427	-0.0679	0.395	0.7295	-0.1301	0.1987	0.0281	0.0097	0.2062	-0.007	0.1529	-18.7455	-0.5145	-12.1284
10	4.3631	-0.1114	0.2523	6.3277	1.2876	8.6937	-0.0195	0.1442	0.2846	-0.1086	0.0736	0.5913	-0.2565	-0.5649	-0.0661	0.1265	-0.0097	0.0003	0.21	0.0408	0.2051	-28.8475	6.727	-19.4195
11	6.7662	2.4858	-3.0946	5.9968	-2.2798	6.2043	0.1187	-0.4446	-0.3418	0.1167	-0.2516	0.0782	0.2483	-0.3022	0.1295	0.1526	-0.0326	-0.0021	0.2429	0.0112	0.1732	-26.7124	-5.426	-34.7152
12	2.4873	-1.2631	0.8928	5.4478	-1.5061	1.5599	-0.1787	-0.4878	-0.0664	0.5779	0.0882	-0.1372	0.0081	0.0662	0.1222	0.2436	0.0162	0.0066	0.2874	0.0114	0.1138	-12.7607	-4.2014	-22.7672
13	6.4325	0.8476	4.466	3.6372	2.4942	7.1289	0.2569	-0.4096	-0.7471	-0.1459	0.2531	0.4719	1.2733	-0.5835	-0.4164	0.4748	-0.061	-0.0318	0.2069	0.1182	0.3427	-20.3152	-16.4088	-26.4969
14	4.5339	-0.8353	-0.3482	5.0019	1.0782	3.6426	0.0377	0.2699	-0.7622	-0.2628	-0.0291	-0.0229	0.6622	-0.0095	0.0432	0.2842	0.0181	0.0071	0.1573	-0.0249	0.1983	-15.5806	-13.8396	-34.0158
15	4.7389	-0.0007	-0.8275	2.577	0.4991	2.8124	0.029	-0.1849	-0.0167	0.2223	0.0324	-0.1048	0.2093	0.231	-0.0665	0.2258	0.0764	-0.0063	0.2296	-0.0047	0.1467	-5.5137	-8.6157	-32.5079
16	9.7712	0.5904	-0.0624	0.7326	-0.313	1.0475	-0.0532	0.2987	-0.1183	-0.0636	0.0216	-0.0685	0.2516	0.1797	0.0543	0.2428	0.048	0.0001	0.1732	-0.0078	0.1527	-12.8818	-9.0943	-48.4932
17	4.6679	1.8069	-5.7725	1.6581	-2.7378	8.1407	0.0202	-0.6814	-0.2423	0.1959	-0.0667	0.0615	0.1075	1.184	0.1528	0.2808	0.1611	-0.0024	0.2753	0.0349	0.1947	-3.8074	-12.5353	-30.5652
18	2.2016	-0.3018	0.9092	0.8763	0.2168	3.6978	-0.1228	-0.1079	-0.1688	0.0337	0.0621	0.0178	0.1032	0.2141	0.0598	0.1415	0.0274	0.0129	0.1742	0.0071	0.1244	-10.4175	-8.3363	-41.5358
19	9.5763	3.1569	-3.0231	6.216	-1.5358	6.0962	-0.078	0.3722	-0.6092	-0.1142	0.194	0.154	0.823	-0.2261	-0.1468	0.2856	0.0123	-0.0641	0.1705	-0.0274	0.1975	-23.3839	-11.1395	-55.9815
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21	1.9167	0.6719	-1.4324	2.1768	-1.8496	2.3522	-0.1393	0.4063	0.4058	-0.5523	0.3621	0.4103	-0.4704	-0.14	-0.2021	0.3306	-0.09	-0.0541	0.28	0.1081	0.2756	-19.2225	23.8683	-32.8836
22	7.1855	3.2851	-5.5623	6.1889	-3.1885	6.4879	0.2017	-0.4779	0.0745	0.4673	-0.2027	0.1132	-0.6149	0.6558	-0.0429	0.3222	-0.1331	0.0308	0.2326	-0.0158	0.2277	-10.5188	26.5223	-17.2302
23	4.241	2.3331	2.3115	3.6171	-1.5227	5.0305	-0.2391	0.5875	0.0327	-0.6239	0.2883	0.0664	-0.1908	0.6095	0.009	0.2233	-0.1585	0.039	0.3318	-0.0047	0.1565	-8.1183	20.6128	-34.1517
24	9.3777	-1.5026	-6.0782	1.7963	0.85	3.9764	-0.1256	-0.3379	-0.2404	0.0758	0.1766	-0.5608	0.2849	1.1016	0.0042	0.1652	0.0395	0.0163	0.4946	-0.0278	0.3472	-1.9744	12.297	-19.8249
25	1.8059	1.1968	-0.7604	2.0267	-0.8914	2.3701	-0.0391	0.2102	0.0586	-0.3375	0.2038	-0.1242	-0.2366	0.4209	-0.1259	0.2059	-0.0686	0.0283	0.2624	-0.0174	0.1869	-10.0697	18.6969	-27.0243
26	3.0866	1.5066	-1.459	2.6288	0.0546	2.0494	-0.0654	0.0839	-0.0359	-0.1278	0.1533	-0.1782	-0.1791	0.5178	-0.0024	0.1253	-0.0497	0.0045	0.251	-0.0028	0.1566	-9.8958	14.6935	-24.8771
27	7.3647	2.9868	2.8004	3.5435	5.5065	9.3895	-0.1482	-0.3263	0.6659	0.0241	0.2831	0.2063	-0.8114	0.3155	-0.1477	0.2989	-0.0284	0.0368	0.1764	-0.0134	0.2276	-16.919	17.2553	-6.8271
28	6.819	2.4829	0.067	4.5391	1.8677	4.9409	0.1027	0.2515	-0.0775	-0.2673	0.0203	0.4743	0.6288	-0.348	-0.1174	0.2607	-0.025	-0.0838	0.1441	0.0027	0.2294	-31.3702	-8.7585	-63.3308
29	4.4563	-0.6325	2.7413	1.7008	-0.7348	2.5324	0.4612	0.9965	-0.2916	-0.4551	-0.1716	0.2071	0.5539	0.1008	-0.2354	0.3519	0.0353	-0.0899	0.4266	-0.0329	0.208	-33.2202	-0.3335	-78.5423
30	4.4461	-0.7985	3.0279	3.0109	-1.8136	7.9221	0.1362	-0.2409	-0.6752	-0.321	0.3874	0.9929	0.6574	-1.1281	-0.3651	0.3001	-0.1088	-0.1664	0.47	0.0891	0.5637	-44.6529	-3.1963	-70.5676
31	5.664	-0.1461	0.7054	5.4039	-2.8763	8.2936	0.1764	-0.0678	-0.0917	0.0914	0.185	0.414	0.1614	-0.337	-0.2374	0.2274	-0.0196	-0.0713	0.1618	0.0116	0.2239	-36.1178	-2.1654	-67.0481
32	2.2687	-2.981	-3.0788	4.0701	3.8461	4.5037	-0.0297	-0.1897	-0.1715	0.1234	-0.1242	0.7884	0.3296	-1.1108	0.1751	0.179	0.0369	-0.0264	0.4544	0.0045	0.341	-41.9345	7.4167	-65.6774
33	3.6787	-0.4649	-0.1731	3.1629	0.0552	4.5466	-0.0086	0.2687	0.2512	-0.1099	0.0678	0.0014	-0.3589	-0.0791	-0.0303	0.1996	0.0463	-0.0343	0.2266	0.0253	0.2251	-33.4854	10.5718	-71.5791
34	7.6598	4.644	-4.0989	4.6061	-0.5977	4.2642	0.3108	-0.3172	0.4876	0.2677	-0.2176	0.2225	-0.9204	0.5643	-0.0368	0.3716	-0.0368	-0.0628	0.2331	-0.0268	0.2852	-27.3921	15.4428	-55.3984
35	1.8907	-0.0737	-0.0814	6.4154	-3.1797	6.7617	-0.0505	-0.0903	0.0657	0.005	-0.0188	0.1377	-0.1221	-0.2432	0.0457	0.119	0.0194	-0.0295	0.1782	-0.0227	0.1688	-30.6452	3.2913	-54.0867
36	3.9605	1.6335	1.817	5.811	3.9275	7.141	-0.2048	0.4468	0.4223	-0.4514	0.1553	0.4195	-0.7472	-0.2663	0.0403	0.3192	0.0788	-0.0805	0.2401	0.0774	0.2928	-37.2347	13.0971	-73.0975
37	2.1482	-0.7027	0.9092	2.9692	-1.4195	4.8557	-0.0144	-0.0399	0.1692	0.0435	0.0703	0.1655	-0.3475	-0.3018	-0.0664	0.1656	0.0102	-0.0306	0.1405	-0.0071	0.1783	-30.885	8.7419	-62.0551
38	2.4122	2.0002	-3.2122	9.7867	0.1746	5.5535	0.3119	-0.305	0.0881	0.6052	-0.1226	0.5607	-0.3312	-0.6402	-0.1988	0.2391	0.0459	-0.0103	0.3375	0.0078	0.2118	-30.4124	1.0081	-43.9072

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 0 through 13 )	A	0 - 13
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 14 through 25 )	A	14 - 25
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 26 through 41 )	A	26 - 41
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 42 through 87 )	A	42 - 87
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 88 through 97 )	A	88 - 97
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 98 through 112 )	A	98 - 112
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 113 through 125 )	A	113 - 125
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 126 through 147 )	A	126 - 147
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 148 through 157 )	A	148 - 157
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'A' and (resid 158 through 169 )	A	158 - 169
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 1 through 14 )	B	1 - 14
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 15 through 25 )	B	15 - 25
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 26 through 42 )	B	26 - 42
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 43 through 77 )	B	43 - 77
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 78 through 87 )	B	78 - 87
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 88 through 112 )	B	88 - 112
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resid 113 through 125 )	B	113 - 125
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'B' and (resid 126 through 157 )	B	126 - 157
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'B' and (resid 158 through 169 )	B	158 - 169
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 2 through 14 )	C	2 - 14
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 15 through 66 )	C	15 - 66
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 67 through 76 )	C	67 - 76
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 77 through 87 )	C	77 - 87
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resid 88 through 97 )	C	88 - 97
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resid 98 through 125 )	C	98 - 125
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'C' and (resid 126 through 160 )	C	126 - 160
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'C' and (resid 161 through 171 )	C	161 - 171
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 2 through 14 )	D	2 - 14
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 15 through 25 )	D	15 - 25
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 26 through 41 )	D	26 - 41
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'D' and (resid 42 through 57 )	D	42 - 57
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'D' and (resid 58 through 77 )	D	58 - 77
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'D' and (resid 78 through 87 )	D	78 - 87
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'D' and (resid 88 through 97 )	D	88 - 97
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'D' and (resid 98 through 112 )	D	98 - 112
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'D' and (resid 113 through 125 )	D	113 - 125
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'D' and (resid 126 through 157 )	D	126 - 157
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'D' and (resid 158 through 169 )	D	158 - 169

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