登録情報 | データベース: PDB / ID: 4e7k |
---|
タイトル | PFV integrase Target Capture Complex (TCC-Mn), freeze-trapped prior to strand transfer, at 3.0 A resolution |
---|
要素 | - DNA (5'-D(*AP*TP*TP*GP*TP*CP*AP*TP*GP*GP*AP*AP*TP*TP*TP*CP*GP*CP*A)-3')
- DNA (5'-D(*CP*CP*CP*GP*AP*GP*GP*CP*AP*CP*GP*TP*GP*CP*TP*AP*GP*CP*AP*CP*GP*TP*GP*CP*CP*TP*CP*GP*GP*G)-3')
- DNA (5'-D(*TP*GP*CP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*CP*AP*TP*GP*AP*CP*A)-3')
- Pro-Pol polyprotein
|
---|
キーワード | RECOMBINATION/DNA / protein-DNA complex (デオキシリボ核酸) / tetramer (四量体) / HHCC motif / endonuclease (エンドヌクレアーゼ) / metal-binding / multifunctional enzyme / nuclease (ヌクレアーゼ) / nucleotidyltransferase / nucleus (細胞核) / transferase (転移酵素) / virion (ウイルス) / DNA-binding / zinc-binding / viral protein (ウイルスタンパク質) / recombination (遺伝的組換え) / viral protein-DNA complex (ウイルス性) / RECOMBINATION-DNA complex |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報 |
---|
生物種 | Human spumaretrovirus (ウイルス) synthetic DNA (人工物) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.02 Å |
---|
データ登録者 | Maertens, G.N. / Cherepanov, P. |
---|
引用 | ジャーナル: Embo J. / 年: 2012 タイトル: 3'-Processing and strand transfer catalysed by retroviral integrase in crystallo. 著者: Hare, S. / Maertens, G.N. / Cherepanov, P. |
---|
履歴 | 登録 | 2012年3月17日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2012年5月23日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2012年7月25日 | Group: Database references |
---|
改定 1.2 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
|
---|