登録情報 | データベース: PDB / ID: 3af5 |
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タイトル | The crystal structure of an archaeal CPSF subunit, PH1404 from Pyrococcus horikoshii |
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要素 | Putative uncharacterized protein PH1404 |
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キーワード | HYDROLASE (加水分解酵素) / archaeal CPSF / beta-CASP family / KH domain (KHドメイン) / ribonuclease (リボヌクレアーゼ) / metallo-beta-lactamase superfamily / Pyrococcus horikoshii / archaea (古細菌) |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
GMP Synthetase; Chain A, domain 3 - #230 / Transcription termination factor CPSF1, archaea / KH domain, archaeal / KHドメイン / Rossmann fold - #10890 / Metallo-beta-lactamase superfamily domain / Beta-Casp domain / Beta-Casp domain / Beta-Casp domain / Zn-dependent metallo-hydrolase, RNA specificity domain ...GMP Synthetase; Chain A, domain 3 - #230 / Transcription termination factor CPSF1, archaea / KH domain, archaeal / KHドメイン / Rossmann fold - #10890 / Metallo-beta-lactamase superfamily domain / Beta-Casp domain / Beta-Casp domain / Beta-Casp domain / Zn-dependent metallo-hydrolase, RNA specificity domain / Zn-dependent metallo-hydrolase RNA specificity domain / K homology (KH) domain / GMP Synthetase; Chain A, domain 3 / Metallo-beta-lactamase superfamily / Metallo-beta-lactamase / Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like / Metallo-beta-lactamase; Chain A / Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like / KHドメイン / K homology RNA-binding domain / K homology domain superfamily, prokaryotic type / 4-Layer Sandwich / K homology domain-like, alpha/beta / ロスマンフォールド / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Pyrococcus horikoshii (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 2.6 Å |
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データ登録者 | Nishida, Y. / Ishikawa, H. / Nakagawa, N. / Masui, R. / Kuramitsu, S. |
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引用 | ジャーナル: Proteins / 年: 2010 タイトル: Crystal structure of an archaeal cleavage and polyadenylation specificity factor subunit from Pyrococcus horikoshii 著者: Nishida, Y. / Ishikawa, H. / Baba, S. / Nakagawa, N. / Kuramitsu, S. / Masui, R. |
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履歴 | 登録 | 2010年2月23日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2010年4月21日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2024年3月13日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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