登録情報 データベース : PDB / ID : 2ziy 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of squid rhodopsin 要素Rhodopsin 詳細 キーワード SIGNALING PROTEIN / transmembrane helices / Chromophore / G-protein coupled receptor / Glycoprotein / Lipoprotein / Palmitate / Phosphoprotein / Photoreceptor protein / Receptor / Retinal protein / Sensory transduction / Transducer / Vision機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
rhabdomere membrane / G protein-coupled photoreceptor activity / cellular response to light stimulus / retinal binding / phototransduction / visual perception / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 XYPPX repeat / XYPPX repeat (two copies) / Opsin / Visual pigments (opsins) retinal binding site / Visual pigments (opsins) retinal binding site. / : / Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins / Rhodopsin 7-helix transmembrane proteins / Serpentine type 7TM GPCR chemoreceptor Srsx / G-protein coupled receptors family 1 signature. ... XYPPX repeat / XYPPX repeat (two copies) / Opsin / Visual pigments (opsins) retinal binding site / Visual pigments (opsins) retinal binding site. / : / Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins / Rhodopsin 7-helix transmembrane proteins / Serpentine type 7TM GPCR chemoreceptor Srsx / G-protein coupled receptors family 1 signature. / G protein-coupled receptor, rhodopsin-like / GPCR, rhodopsin-like, 7TM / G-protein coupled receptors family 1 profile. / 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) / Up-down Bundle / Mainly Alpha 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Todarodes pacificus (イカ)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 3.7 Å 詳細データ登録者 Miyano, M. / Shimamura, T. 引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2008タイトル : Crystal structure of squid rhodopsin with intracellularly extended cytoplasmic region著者 : Shimamura, T. / Hiraki, K. / Takahashi, N. / Hori, T. / Ago, H. / Masuda, K. / Takio, K. / Ishiguro, M. / Miyano, M. 履歴 登録 2008年2月27日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2008年5月6日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2023年11月1日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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