登録情報 | データベース: PDB / ID: 1zy1 |
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タイトル | X-ray structure of peptide deformylase from Arabidopsis thaliana (AtPDF1A) in complex with Met-Ala-Ser |
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要素 | - Peptide deformylase, mitochondrial
- tripeptide fragment
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キーワード | HYDROLASE / peptide deformylase / PDF1A / eukaryote / higher plant / Arabidopsis thaliana / zinc ion |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
plant-type cell wall / co-translational protein modification / peptide deformylase / peptide deformylase activity / chloroplast stroma / chloroplast / translation / mitochondrion / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Peptide Deformylase / Peptide deformylase / Peptide deformylase / Peptide deformylase superfamily / Polypeptide deformylase / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Peptide deformylase 1A, chloroplastic/mitochondrial類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / rigid body / 解像度: 3 Å |
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データ登録者 | Fieulaine, S. / Juillan-Binard, C. / Serero, A. / Dardel, F. / Giglione, C. / Meinnel, T. / Ferrer, J.-L. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2005 タイトル: The crystal structure of mitochondrial (Type 1A) peptide deformylase provides clear guidelines for the design of inhibitors specific for the bacterial forms 著者: Fieulaine, S. / Juillan-Binard, C. / Serero, A. / Dardel, F. / Giglione, C. / Meinnel, T. / Ferrer, J.-L. |
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履歴 | 登録 | 2005年6月9日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2005年9月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年8月23日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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