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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1vtc | ||||||||||||||||||
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タイトル | MOLECULAR STRUCTURE OF THE OCTAMER D(G-G-C-C-G-G-C-C) MODIFIED A-DNA | ||||||||||||||||||
要素 | DNA (5'-D(*キーワード | DNA (デオキシリボ核酸) / A-DNA (A-DNA) / DOUBLE HELIX | 機能・相同性 | デオキシリボ核酸 | 機能・相同性情報 手法 | X線回折 / 解像度: 2.25 Å | データ登録者 | Wang, A.H.-J. / Fujii, S. / Van Boom, J.H. / Rich, A. | 引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 1982 | タイトル: Molecular Structure of the Octamer d(G-G-C-C-G-G-C-C) Modified A-DNA 著者: Wang, A.H.-J. / Fujii, S. / Van Boom, J.H. / Rich, A. 履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1vtc.cif.gz | 11 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1vtc.ent.gz | 6.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1vtc.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vt/1vtc ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vt/1vtc | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 2428.593 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.08 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.97 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 7 / 詳細: pH 7.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 255 K |
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検出器 | タイプ: NICOLET P3 / 検出器: DIFFRACTOMETER |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 1221 |
-解析
精密化 | 最高解像度: 2.25 Å / σ(I): 3 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.25 Å
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