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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1kob | ||||||
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タイトル | TWITCHIN KINASE FRAGMENT (APLYSIA), AUTOREGULATED PROTEIN KINASE DOMAIN | ||||||
要素 | TWITCHIN | ||||||
キーワード | KINASE (キナーゼ) / TWITCHIN / INTRASTERIC REGULATION | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Aplysia californica (ジャンボアメフラシ) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 2.3 Å | ||||||
データ登録者 | Kobe, B. / Heierhorst, J. / Feil, S.C. / Parker, M.W. / Benian, G.M. / Weiss, K.R. / Kemp, B.E. | ||||||
引用 | ジャーナル: EMBO J. / 年: 1996 タイトル: Giant protein kinases: domain interactions and structural basis of autoregulation. 著者: Kobe, B. / Heierhorst, J. / Feil, S.C. / Parker, M.W. / Benian, G.M. / Weiss, K.R. / Kemp, B.E. #1: ジャーナル: Nature / 年: 1996 タイトル: Ca2+/S100 Regulation of Giant Protein Kinases 著者: Heierhorst, J. / Kobe, B. / Feil, S.C. / Parker, M.W. / Benian, G.M. / Weiss, K.R. / Kemp, B.E. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1kob.cif.gz | 155 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1kob.ent.gz | 128.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1kob.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ko/1kob ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ko/1kob | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 44731.879 Da / 分子数: 2 / 断片: KINASE FRAGMENT / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Aplysia californica (ジャンボアメフラシ) 遺伝子: CDNA / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q16980 #2: 化合物 | ChemComp-VAL / | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.34 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.35 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / PH range low: 8.5 / PH range high: 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: Photon Factory / タイプ: PHOTON FACTORY / 波長: 1 |
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検出器 | 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1995 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→40 Å / Num. obs: 33532 / % possible obs: 88.1 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 2.9 % / Rmerge(I) obs: 0.118 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 153335 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.3→40 Å / σ(F): 0
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原子変位パラメータ | Biso mean: 31.4 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.28 Å / Luzzati sigma a obs: 0.39 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→40 Å
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拘束条件 |
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