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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ak7 | ||||||
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タイトル | DESTRIN, NMR, 20 STRUCTURES | ||||||
要素 | DESTRIN | ||||||
キーワード | ACTIN DEPOLYMERIZATION FACTOR | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 actin filament fragmentation / positive regulation of actin filament depolymerization / actin filament severing / actin filament depolymerization / actin polymerization or depolymerization / cortical actin cytoskeleton / 運動性 / actin filament binding / マイクロフィラメント / extracellular exosome / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Sus scrofa (ブタ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DYNAMICAL SIMULATED ANNEALING | ||||||
データ登録者 | Hatanaka, H. / Moriyama, K. / Ogura, K. / Ichikawa, S. / Yahara, I. / Inagaki, F. | ||||||
引用 | ジャーナル: Cell(Cambridge,Mass.) / 年: 1996 タイトル: Tertiary structure of destrin and structural similarity between two actin-regulating protein families. 著者: Hatanaka, H. / Ogura, K. / Moriyama, K. / Ichikawa, S. / Yahara, I. / Inagaki, F. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ak7.cif.gz | 1.1 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1ak7.ent.gz | 1 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ak7.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ak/1ak7 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ak/1ak7 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19379.652 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 細胞内の位置: CYTOPLASM AND NUCLEUS / プラスミド: PKID-W / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: Escherichia coli BL21 (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / 参照: UniProt: P60981, UniProt: P60982*PLUS |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
試料状態 | pH: 7.0 / 温度: 301 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITYPLUS 600 / 製造業者: Varian / モデル: UNITYPLUS 600 / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DYNAMICAL SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST FNOE+FREPEL / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |