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- EMDB-13111: Cryo-EM structure of the 1 hpf zebrafish embryo 80S ribosome -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-13111
タイトルCryo-EM structure of the 1 hpf zebrafish embryo 80S ribosome
マップデータ
試料
  • 複合体: 80S ribosome from 1 hpf zebrafish embryosEukaryotic ribosome
    • RNA: x 4種
    • タンパク質・ペプチド: x 78種
  • リガンド: x 2種
機能・相同性
機能・相同性情報


Hypusine synthesis from eIF5A-lysine / Platelet degranulation / optokinetic behavior / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / RMTs methylate histone arginines / TNFR1-mediated ceramide production / : / : / Formation of a pool of free 40S subunits ...Hypusine synthesis from eIF5A-lysine / Platelet degranulation / optokinetic behavior / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / RMTs methylate histone arginines / TNFR1-mediated ceramide production / : / : / Formation of a pool of free 40S subunits / Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex / Ribosomal scanning and start codon recognition / : / Protein methylation / Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) / Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) / mTORC1-mediated signalling / brain segmentation / TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway / Regulation of TNFR1 signaling / convergent extension involved in gastrulation / : / Neutrophil degranulation / primitive hemopoiesis / embryonic retina morphogenesis in camera-type eye / death domain binding / positive regulation of translational termination / mitochondrial cytochrome c oxidase assembly / ribosome hibernation / hemoglobin biosynthetic process / : / positive regulation of translational elongation / chordate embryonic development / embryonic brain development / ribosomal subunit / positive regulation of gastrulation / exocrine pancreas development / anatomical structure development / laminin receptor activity / mitochondrial large ribosomal subunit / positive regulation of translational fidelity / definitive hemopoiesis / 膵臓 / regulation of establishment of cell polarity / cytoplasmic side of rough endoplasmic reticulum membrane / erythrocyte development / translational elongation / negative regulation of Wnt signaling pathway / regulation of innate immune response / regulation of cell division / erythrocyte maturation / endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / protein-RNA complex assembly / positive regulation of translational initiation / 造血 / translation regulator activity / intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator / hematopoietic stem cell differentiation / endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / 小胞体 / mRNA transport / 脈管形成 / laminin binding / translation elongation factor activity / rescue of stalled ribosome / translation initiation factor binding / 核膜孔 / maturation of SSU-rRNA / translation repressor activity / class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / positive regulation of apoptotic signaling pathway / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of LSU-rRNA / ribosomal large subunit biogenesis / cellular response to amino acid starvation / translation initiation factor activity / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / small-subunit processome / negative regulation of autophagy / positive regulation of RNA splicing / 赤血球形成 / protein kinase C binding / apoptotic signaling pathway / brain development / modification-dependent protein catabolic process / mRNA 5'-UTR binding / regulation of erythrocyte differentiation / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal large subunit assembly / spindle / small ribosomal subunit rRNA binding / protein tag activity / ribosomal small subunit assembly / rRNA processing / cytosolic small ribosomal subunit / regulation of protein localization / large ribosomal subunit rRNA binding / cellular response to xenobiotic stimulus
類似検索 - 分子機能
DAP1/DAPL1 / Death-associated protein / Intracellular hyaluronan-binding protein 4, N-terminal domain / Intracellular hyaluronan-binding protein 4 N-terminal / PA2G4 family / Hyaluronan / mRNA binding family / RNA binding protein HABP4/SERBP1 / Translation elongation factor, IF5A, hypusine site / Eukaryotic initiation factor 5A hypusine signature. / Eukaryotic elongation factor 5A hypusine, DNA-binding OB fold ...DAP1/DAPL1 / Death-associated protein / Intracellular hyaluronan-binding protein 4, N-terminal domain / Intracellular hyaluronan-binding protein 4 N-terminal / PA2G4 family / Hyaluronan / mRNA binding family / RNA binding protein HABP4/SERBP1 / Translation elongation factor, IF5A, hypusine site / Eukaryotic initiation factor 5A hypusine signature. / Eukaryotic elongation factor 5A hypusine, DNA-binding OB fold / Translation elongation factor IF5A-like / Translation elongation factor, IF5A C-terminal / Eukaryotic elongation factor 5A hypusine, DNA-binding OB fold / Peptidase M24A, methionine aminopeptidase, subfamily 2, binding site / Methionine aminopeptidase subfamily 2 signature. / Hyaluronan/mRNA-binding protein / Hyaluronan / mRNA binding family / Ubiquitin-like protein FUBI / 40S ribosomal protein SA / 40S ribosomal protein SA, C-terminal domain / 40S ribosomal protein SA C-terminus / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L28e / Ribosomal protein L2, archaeal-type / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Ribosomal protein L23 / Elongation Factor G, domain II / Elongation Factor G, domain III / Ribosomal L28e/Mak16 / Peptidase M24 / Metallopeptidase family M24 / Creatinase/aminopeptidase-like / Ribosomal L28e protein family / Translation elongation factor EFG/EF2, domain IV / Elongation factor G, domain IV / Elongation factor G, domain IV / Elongation factor G C-terminus / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / Elongation factor EFG, domain V-like / Elongation factor G C-terminus / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / EF-G domain III/V-like / metallochaperone-like domain / TRASH domain / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S19e, conserved site / Ribosomal protein L29e / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S25 / Ribosomal protein S26e signature. / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Tr-type G domain, conserved site / Ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal L29e protein family / Translational (tr)-type guanine nucleotide-binding (G) domain signature. / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein L27e, conserved site / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein S21e signature. / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein S17e-like superfamily / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S19e / Ribosomal_S19e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S8e, conserved site / 40S ribosomal protein S11, N-terminal / Ribosomal protein L24e, conserved site / 40S ribosomal protein S1/3, eukaryotes / Ribosomal protein S6, eukaryotic / Ribosomal protein S7e / Ribosomal protein L34e, conserved site / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / Eukaryotic Ribosomal Protein L27, KOW domain / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein L38e / Ribosomal protein L38e superfamily / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein L27e / Ribosomal protein L27e superfamily / Ribosomal S17 / Ribosomal protein S19e signature. / Ribosomal protein L22e / Ribosomal protein L22e superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
60S ribosomal protein L41 / 60S ribosomal protein L24 / Zgc:171772 / 60S ribosomal protein L14 / 40S ribosomal protein S23 / Zgc:103482 / 40S ribosomal protein S24 / 60S ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L22 / Ribosomal protein L23a ...60S ribosomal protein L41 / 60S ribosomal protein L24 / Zgc:171772 / 60S ribosomal protein L14 / 40S ribosomal protein S23 / Zgc:103482 / 40S ribosomal protein S24 / 60S ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L22 / Ribosomal protein L23a / Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1 / 60S ribosomal protein L36a / 40S ribosomal protein S7 / 40S ribosomal protein S8 / 40S ribosomal protein S16 / 60S ribosomal protein L13a / 60S ribosomal protein L32 / 60S ribosomal protein L31 / Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 / 40S ribosomal protein S27 / 60S ribosomal protein L6 / 40S ribosomal protein S17 / Rpl3 protein / 60S ribosomal protein L9 / 40S ribosomal protein S4, X isoform / 60S ribosomal protein L18 / 60S ribosomal protein L29 / 60S ribosomal protein L38 / 60S ribosomal protein L35a / 40S ribosomal protein S6 / Ribosomal protein L15 / 40S ribosomal protein S13 / Ribosomal protein L39 / Ribosomal protein L5b / 60S ribosomal protein L11 / Ribosomal protein L37 / 60S ribosomal protein L21 / 40S ribosomal protein S2 / Eukaryotic translation initiation factor 5A / 60S ribosomal protein L8 / 60S ribosomal protein L27a / Eukaryotic translation elongation factor 2 / 60S ribosomal protein L19 / 40S ribosomal protein S9 / 40S ribosomal protein S26 / 40S ribosomal protein S20 / 40S ribosomal protein S25 / 40S ribosomal protein S28 / Ribosomal protein S14 / 40S ribosomal protein S19 / 40S ribosomal protein S3a / 60S ribosomal protein L7a / FAU ubiquitin-like and ribosomal protein S30 fusion a / 60S ribosomal protein L23 / Ribosomal protein S5 / 60S ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L7 / 40S ribosomal protein S29 / 40S ribosomal protein S15a / 40S ribosomal protein S15 / 60S ribosomal protein L26 / 40S ribosomal protein S10 / 60S ribosomal protein L17 / 40S ribosomal protein S21 / 60S ribosomal protein L30 / 40S ribosomal protein S11 / 60S ribosomal protein L27 / 60S ribosomal protein L10 / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / 60S ribosomal protein L4 / 60S ribosomal protein L18a / 60S ribosomal protein L34 / 40S ribosomal protein SA / Novel protein similar to human proliferation-associated 2G4 protein (PA2G4) / 40S ribosomal protein S18 / 60S ribosomal protein L35 / 60S ribosomal protein L13 / Death-associated protein-like 1 homolog
類似検索 - 構成要素
生物種Danio rerio (ゼブラフィッシュ) / Zebrafish, Brachydanio rerio
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å
データ登録者Leesch F / Lorenzo-Orts L / Grishkovskaya I / Kandolf S / Belacic K / Meinhart A / Haselbach D / Pauli A
資金援助 オーストリア, スイス, 5件
OrganizationGrant number国
Austrian Research Promotion AgencyFFG-852936 オーストリア
Austrian Science FundSTART Projekt Y 1031-B28 オーストリア
Austrian Science FundSFB RNA-Deco F 80 オーストリア
Swiss National Science FoundationP2GEP3_191204 スイス
European Molecular Biology Organization (EMBO)ALTF 1165-2019
引用ジャーナル: Nature / 年: 2023
タイトル: A molecular network of conserved factors keeps ribosomes dormant in the egg.
著者: Friederike Leesch / Laura Lorenzo-Orts / Carina Pribitzer / Irina Grishkovskaya / Josef Roehsner / Anastasia Chugunova / Manuel Matzinger / Elisabeth Roitinger / Katarina Belačić / Susanne ...著者: Friederike Leesch / Laura Lorenzo-Orts / Carina Pribitzer / Irina Grishkovskaya / Josef Roehsner / Anastasia Chugunova / Manuel Matzinger / Elisabeth Roitinger / Katarina Belačić / Susanne Kandolf / Tzi-Yang Lin / Karl Mechtler / Anton Meinhart / David Haselbach / Andrea Pauli /
要旨: Ribosomes are produced in large quantities during oogenesis and are stored in the egg. However, the egg and early embryo are translationally repressed. Here, using mass spectrometry and cryo-electron ...Ribosomes are produced in large quantities during oogenesis and are stored in the egg. However, the egg and early embryo are translationally repressed. Here, using mass spectrometry and cryo-electron microscopy analyses of ribosomes isolated from zebrafish (Danio rerio) and Xenopus laevis eggs and embryos, we provide molecular evidence that ribosomes transition from a dormant state to an active state during the first hours of embryogenesis. Dormant ribosomes are associated with four conserved factors that form two modules, consisting of Habp4-eEF2 and death associated protein 1b (Dap1b) or Dap in complex with eIF5a. Both modules occupy functionally important sites and act together to stabilize ribosomes and repress translation. Dap1b (also known as Dapl1 in mammals) is a newly discovered translational inhibitor that stably inserts into the polypeptide exit tunnel. Addition of recombinant zebrafish Dap1b protein is sufficient to block translation and reconstitute the dormant egg ribosome state in a mammalian translation extract in vitro. Thus, a developmentally programmed, conserved ribosome state has a key role in ribosome storage and translational repression in the egg.
履歴
登録2021年6月24日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年7月13日-
マップ公開2022年7月13日-
更新2023年2月8日-
現状2023年2月8日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_13111.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_13111.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 421.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.06 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.9
最小 - 最大-0.55146945 - 8.711687
平均 (標準偏差)0.08918378 (±0.28424817)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ480480480
Spacing480480480
セルA=B=C: 508.8 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : 80S ribosome from 1 hpf zebrafish embryos

全体名称: 80S ribosome from 1 hpf zebrafish embryosEukaryotic ribosome
要素
  • 複合体: 80S ribosome from 1 hpf zebrafish embryosEukaryotic ribosome
    • RNA: 18S rRNA18S ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein SAリボソームタンパク質SA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4, X isoformリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S14
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
    • タンパク質・ペプチド: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyaseDNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S10
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S16
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29
    • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S19
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18
    • タンパク質・ペプチド: Zgc:103482
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L31
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L37
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L38
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36a
    • タンパク質・ペプチド: Zgc:171772
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L460S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L5bリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L7
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L9
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L2260S ribosomal protein L22
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L23aリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: ATPase H+ transporting V0 subunit e1
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L39
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L41
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L40
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27a
    • RNA: 28S rRNA28SリボソームRNA
    • RNA: 5S rRNA5SリボソームRNA
    • RNA: 5.8S rRNA5.8SリボソームRNA
    • タンパク質・ペプチド: Novel protein similar to human proliferation-associated 2G4 protein (PA2G4)
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation elongation factor 2
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 5A
    • タンパク質・ペプチド: Dap1b
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION

+
超分子 #1: 80S ribosome from 1 hpf zebrafish embryos

超分子名称: 80S ribosome from 1 hpf zebrafish embryos / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#82
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ) / 組織: 1 hpf embryos

+
分子 #1: 18S rRNA

分子名称: 18S rRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 625.9685 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAAUAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAAGUCUA AGUGCACACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGAUCGCUC CACCCGGUUA CUUGGAUAAC UGUGGCAAUU C CAGAGCUA ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAAUAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAAGUCUA AGUGCACACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGAUCGCUC CACCCGGUUA CUUGGAUAAC UGUGGCAAUU C CAGAGCUA AUACAUGCCA ACGAGCGCCG ACCUGGGCCG CCCUUCUCCC CUCGGGGCGG GGGGUGGGUA CCCGGGGACG CG UGCAUUU AUCAGAUCCA AAACCCAUGC GGGUGCGCGG GCGGUGGAGA GGGGGGCCUC GCGCCUACCC GCCGCCGUCC GCC CCCGGC CUCGCUUUGG UGACUCUAGA UAACCUCGGG CCGAUCGCGC GCCCUCGCGG CGGCGACGGU UCAUUCGAAU GUCU GCCCU AUCAACUUUC GAUGGUAGGU CCGUCGCCUA CCAUGGUGAC CACGGGUGAC GGGGAAUCAG GGUUCGAUUC CGGAG AGGG AGCCUGAGAA ACGGCUACCA CAUCCAAGGA AGGCAGCAGG CGCGCAAAUU ACCCAUUUCC GACACGGAGA GGUAGU GAC GAAAAAUAAC AAUGCAGGUC UCUUUCGAGG CCCUGCAAUU GGAAUGAGUG CAUCCCAAAC CCAUGGGCGA GGACCCA UU GGAGGGCAAG UCUGGUGCCA GCAGCCGCGG UAAUUCCAGC UCCAAUAGCG UAUGCUAACG UUGCUGCAGU UAAAAAGC U CGUAGUUGGA UCUCGGGGAC CGGGCCGCGC GGUCCGCCGC GAGGCGAGCC ACCGCCGGUC CCGGACCCCC AGGCCUCCC GGCGCCCCCC GGAUGCCCUU GACUGGGUGU CCUCGGCUUG GGGCCCGGAG CGUUUACUUU GAAAAAAUUA GAGUGUUCAA GGCAGGGCC GGCACCGCGC CCCAUUGAAU ACCCCAGCUA GGAAUAAUGG AAUAGGACCC CGGUUCUAUU UUCUGUGGGU U UCCGGAAC CCGGGGCCAU GAUCGAGAGG GACGGCCGGG GGCAUUCGUA UUGCGCCGCU AGAGGUGAAA UUCUUGGACC GG CGCAAGA CGGACCGGAG CGAAAGCGUU UGCCAAGAAC GUUUUCAUUA AUCAAGAACG AAAGUCGGAG GUUCGAAGAC GAU CAGAUA CCGUCGUAGU UCCGACCGUA AACGAUGCCG ACCCGCGAUC CGGCGGCGUU UAUUCCCAUG ACCCGCCGGG CAGC GUUGC GGGAAACCAC GAGUCUCUGG GCUCCGGGGG GAGUAUGGUU GCAAAGCUGA AACUUAAAGG AAUUGACGGA AGGGC ACCA CCAGGAGUGG AGCCUGCGGC UUAAUUUGAC UCAACACGGG GAACCUCACC CGGCCCGGAC ACGGAAAGGA UUGACA GAU UGACGGCUCU UUCUCGAUUC UGUGGGUGGU GGUGCAUGGC CGUUCGUAGU UGGUGGAGCG AUUUGUCUGG UUGAUUC CG AUAACGAACG AGACUCUGGC AUGCUAACUA GUUACGCGGC CCCGCGCGGU CGGCGUCUGC AACUUCUUAG AGGGACAA G UGGCGUUCAG CCACGCGAGA CUGAGCAAUA ACAGGUCUGU GAUGCCCUUA GAUGUCCGGG GCUGCACGCG CGCCACAAU GGGCGGAUCA ACGUGUGCCU ACCCUGCGCC GACAGGCGCG GGUAACCCGU UGAACCCCGC CCGUGAUGGG GACCGGGGAU UGAAACUAU UUCCCGAGAA CGAGGAAUUC CCAGUAAGCG CAGGUCAUCA GCUUGCGUUG AUUAAGUCCC UGCCCUUUGU A CACACCGC CCGUCGCUAC UACCGAUUGA GCGGCUCAGU GAGGUCCUCG GAUCGGCCCC GCCCGGGGCU CCCUUACCGG GG GCCCUGG UGGAGCGCCG AGAAGACGAU CGAACUCGGU CGUUUAGAGG AAGUAAAAGU CGUAACAAGG UUUCCGUAGG UGA ACCUGC GGAAGGAUCA UUA

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分子 #76: 28S rRNA

分子名称: 28S rRNA / タイプ: rna / ID: 76 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 1.382249125 MDa
配列文字列: CACGACCUCA GCUCAGACGA GAAGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUACUA AGCGGAGGAA AAGAAACCAA CCGGGAUUCC CCCAGUAGC GGCGAGCGAA GAGGGAAAAG UCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCUCUGCCGA GGGCGAGGGA CCUGUGGCGU A CGGAGGGC ...文字列:
CACGACCUCA GCUCAGACGA GAAGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUACUA AGCGGAGGAA AAGAAACCAA CCGGGAUUCC CCCAGUAGC GGCGAGCGAA GAGGGAAAAG UCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCUCUGCCGA GGGCGAGGGA CCUGUGGCGU A CGGAGGGC CGCCUCUCUC GGCGCGGGCC GGGGGGCCAA AGUCCUUCUG AUGGAGGCUU AGCCCGCGGA CGGUGUGAGG CC GGUGUCG GCCCCCGCCC CGCCGGGGUG CGGUUCCUCC CGGAGUCGGG UUGUUUGGGA AUGCAGCCCA AAGCGGGUGG UAA ACUCCA UCUAAGGCUA AAUACCGGCA CGAGACCGAU AGCGGACAAG UACCGUGAGG GAAAGUUGAA AAGAACUUUG AAGA GAGAG UUCAACAGGG CGUGAAACCG UUAAGAGGUA AACGGGUGGG GACCGCACCG UCCGCCCGGU GGAUUCAGCC CGGCG GGGC GGGGUCGGCC CGUCCGGUGC GCGCUCCCUU CGCUCCCUCA UUCCUGGGGG UGGCGCGGGG GGUUGACGCC CGGGCG AAG GCUCGGCCGC CGCCGGGUGC AUUUCCGCCG CGGUGGAGCG CCGCGACCGG CUCCGGUUCG GCUUGGAAGG GUCAGGG GG CGAAGGUGGC CCGUCGGUUC AGGCCGUCGG GCUUUACAGC GCCCUCCCGC CCCGACUUCG CCGCUUGCUC UCCGGGGC C GCGGGUGAGU GUCCUCCGCG CCCUCUCUGC CCUCCCUCCC UGUGGGGGGA GGUGCGGGGA CGGGGUCCCC CGCCCCCGG CGUGGCGCGA CAGGGGUGGA CUGUCCUCAG UCCGCCCACG GCUGCGCCGC GCCGCCCAGG GCGGGGAUCC GACCCACGUU CGGGCGCCC GAGGUCCGCG GCGACGCCGG CCUCCCACCC GACCCGUCUU GAAACACGGA CCAAGGAGUC CAACGCGCGC G CGAGUCAG AGGGUGGCUC GCGAGCCCCU GCGGCGCAAU GAAGGUGAGA ACGGGGGUCU CCCCCGGGUG GGAUCCCCCC GC CCCGGCG GGGGGCGCAC CACCGGCCCG CCUCGCGACC CUCCGGGGGG CAGGUGGAGU UGGAGCGCGC GCGAUGGCAC CCG AAAGAU GGUGAACUAU GCCUGGGCAG GGCGAAGCCA GGGGAAACUC UGGUGGAGGC CCGCCGCGGU CCUGACGUGC AAAU CGGUC GUCCGACCUG GGCAUAGGGG CGAAAGACUA AUCGAACCAU CUAGUAGCUG GUUCCCUCCG AAGUUUCCCU CAGGA UAGC UGGCGCUCGC CGAUCAAGCA GUUUUAUCCG GUAAAGCCAA UGACUAGAGG CCUUGGGGCC GAAACGGCCU CAACCU AUU CUCAAACUUU AAAUGGGUAA GAGGCCCGGC UCGCUGGCGC UGGAGCCGGG CGUGGAAUGC GACGCGCCUA GUGGGCC AU UUUUGGUAAG CAGAACUGGU GCUGCGGGAU GAACCGAACG CCGGGUUAAG GCGCCCGAUG CCGACGCUCA UCAGACCC C AUAAAAGGUG UUGGUUGAUA UAGACAGCAG GACGGUGGCC AUGGAAGUCG GCACCCGCCA AGGAGUGUGU AACAACUCA CCUGCCGAAU CAACUAGCCC UGAAAAUGGA UGGCGCUGGA GCGUCGGGCC CAUACCCGGC CGUCGACGGC ACAAGGGACA CGCGAGCGG UCGCGCGCGC UGCAAGCCUC GACGAGUAGG AGGGCCGCCG CGGUGGCGCC GAAGCCCAGG GCGCGGGCCC G GGUGGAGC CGCCGCGGGC GCAGAUCUUG GUGGUAGUAG CAAAUAUUCA AACGAGAGCU UUGAAGGCCG AAGUGGAGAA GG GUUCCAU GUGAACAGCA GUUGAACAUG GGUGAGCCGG UCCUAAGGGA CGGGCCUACG CCGUUCGGAG GGGAGGGGCG AUG GCCUCU GUCGCCCCCG CUCGACCGAA AGGGAGUCGG GUCCAGAUCC CCGAGCCCGG AGCGGCGGAG ACGGGCGCCG CGAG GCGCC CAGUGCGGUG ACGCAAACGA ACCCGGAGAU GCCGGCGGGU GCCCCGGGAA AGAGUUCUCU UUUCUUUGUG AAGGG CAGG GCGCCCUGGA ACGGGUUCGC CCCGAGAGAG GGGCCCGCGC CCUGGAAAGC GCCGCGCUUC UGGCGGCGUC CGGUGA GCU CUCGUCGGCC CUUGAAAAUC CGGGGGAGAA GGUGUAAAUC UCGCGCCGGG CCGUACCCAU AUCCGCAGCA GGUCUCC AA GGUGAACAGC CUCUGGCGUG UUGGAACAAG GCAGAGUAAG GGAAGUCGGC AAGUCAGAUC CGUAACUUCG GGAUAAGG A UUGGCUCUAA GGGCUGAGCC GGUCGGGCUG AGGUGCGAAG CGGGCCUGGG CCCGAGCCGC GACUGGGGGA GCGGCCGCC CCGAGGUGCC CUGACCCCCG UUCCCGAGCC GCGGGGGUGC GCGCGCGGUG GCGCGCGGUC CCUCUCUCCC CCCGCCGCGU CCGCCUCGG GCCUUUUUGC GGUCUCGACU CCCCCCGACU CUUCCCCUCC GCCCUUUCCC CGUCCGCGGG GGUCGGGCGG G GGGGUCUC GGAGGAGGGG GGGUGGAGAG GCCGUGGGGA GGAAAGGGGU GGUUCGUGGC GUCGGGGGGC AACGGGAGGG UC CUCGCCU GCCGCGCGAU GCCUCCGCUG GCCGGGGCCC GCGGGGGGCG GGAUGCGCAG CGGUUGGCGG CGGCGACCCU GGG CGCGCG CCGCGCCCUU CCCGCGGAUC UCCGCAGCUA CGGCCCCGCG CCGGGGCCCG CGUCCGCGCG UGCGCCCCCC UCCG GGGGA GUGGCGCGCG GCCUCGGCUC CCCCCGGUGC GGGCGCCUCG GCCGGCGGCU AGCAGCCAGC UUAGAACUGU CGCGG ACCA GGGGAAUCCG ACUGUUUAAU UAAAACAAAG CAUCGCGAAG GCCCUCGGCG GGUGUUGACG CGAUGUGAUU UCUGCC CAG UGCUCUGAAU GUCAAAGUGA AGAAAUUCAA CGAAGCGCGG GUAAACGGCG GGAGUAACUA UGACUCUCUU AAGGUAG CC AAAUGCCUCG UCAUCUAAUU AGUGACGCGC AUGAAUGGAU GAACGAGAUU CCCACUGUCC CUACCUGCUA UCUAGCGA A ACCACAGCCA AGGGAACGGG CUUGGCAGAA UCAGCGGGGA AAGAAGACCC UGUUGAGCUU GACUCUAGUC UGGCCCUGU GAAGAGACAU GAGGGGUGUA GAAUAAGUGG GAGGCCCCCG GGCUUCCCGG GCCGGCCGCC GGUGAAAUAC CACUACUCUU AUCGUUUCC UCACUUACCC GGUGAGGCGG GGAAGCCGGG CGUCCCCCGG CGGGGGCCGC CCCUGCUUCU GGCGUCAAGC G CCCCGGGG CCGUGCGGGG GGUGGGGGCA ACCCCCCUUC CCCUCCCGGC CGCCGACCGG GGCGCGACCC GCCCCGGGGA CA GCGUCAG GUGGGGAGUU UGACUGGGGC GGUACACCUG UCAAACGGUA ACGCAGGUGU CCUAAGGCGA GCUCAGGGGG GAC AGAAAC CUCCCGUAGA GCAGAAGGGC AAAAGCUCGC UUGAUCUUGA UUUUCAGUAU GAGUACGGAC CGCGAAAGCG GGGC CUCAC GAUCCUUCCG GCUUUUGGGG UUUUAAGCGG GAGGUGUCAG AAAAGUUACC ACAGGGAUAA CUGGCUUGUG GCGGC CAAG CGUUCAUAGC GACGUCGCUU UUUGAUCCUU CGAUGUCGGC UCUUCCUAUC AUUGUGAAGC AGAAUUCACC AAGCGU UGG AUUGUUCACC CACUAACAGG GAACGUGAGC UGGGUUUAGA CCGUCGUGAG ACAGGUUAGU UUUACCCUAC UGAUGUG AG CCGUUGUUGC AAUAGUAAUC CCGCUCAGUA CGAGAGGAAC CGCGGGUUCA GACAUUUGGU UCGUGCGCUU GGCUGAGG A GCCACUGGCG CGAAGCCACC AUCUGCGGGA UUAUGACUGA ACGCCUCUAA GUCAGAAUCC CGCCUAAAAG CAACGAUAC AGCAGCGCCG UCGGAUCUCC GAUAGGCCCC GGGUAACCGG GAAGCCCCUC UCCGGGGGGG CCCCCGGCGC GGAGAGCCAU UCGUGACAG GAACCGGGGG CGCGGCUAGA ACGAGCGCCG CCCCCUCUUC CAGUGACGCA CCGCAUGUUU GUGGGGAACC C GGUGCUUA AAUGACUCGU AGACGACCUG AUUCUGGGUC GGGGUGUCGU GCGUGGCAGA GCAGCUCUGU UGCUGCGAUC CA UUGAAAG UCAGCCCUCG AUCCAAGUUU UG

+
分子 #77: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 77 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 38.739027 KDa
配列文字列:
GCUUACGGCC AUACCACCCU GGAAAUGCCC GAUCUCAUCU GAACUCGGAA GUAAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCAGGU GCUGUAAGCU A

+
分子 #78: 5.8S rRNA

分子名称: 5.8S rRNA / タイプ: rna / ID: 78 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 50.823137 KDa
配列文字列:
AACUCUUAGC GGUGGAUCAC UCGGCUCGUG CGUCGAUGAA GAACGCAGCU AGCUGCGAGA ACUAAUGUGA AUUGCAGGAC ACACAUUGA UCAUCGACCU UUCGAACGCA CAUUGCGGCC CCGGGUCCAU CCCGGGGCCA CGCCUGUCUG AGGGUCGCC

+
分子 #2: 40S ribosomal protein SA

分子名称: 40S ribosomal protein SA / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 34.043191 KDa
配列文字列: MSGGLDVLQM KEEDVLKFLA AGTHLGGTNL DFQMEQYVYK RKSDGVYIIN LKKTWEKLLL AARAIVAIEN PADVCVISSR NTGQRAVLK FASATGSTTF AGRFTPGTFT NQIQAAFREP RLLIVTDPRA DHQPLTEASY VNIPTIALCN TDSPLRYVDI A IPCNNKGP ...文字列:
MSGGLDVLQM KEEDVLKFLA AGTHLGGTNL DFQMEQYVYK RKSDGVYIIN LKKTWEKLLL AARAIVAIEN PADVCVISSR NTGQRAVLK FASATGSTTF AGRFTPGTFT NQIQAAFREP RLLIVTDPRA DHQPLTEASY VNIPTIALCN TDSPLRYVDI A IPCNNKGP HSVGLMWWML AREVLRMRGT ISREHPWEVM PDLYFYRDPE EIEKEEQAAA EKAVGKEEFQ GEWTAPVPDF NQ PEVADWS EGVQVPSVPI QQFPAGIEAP GKPAPAEVYA EDWSAQPATE DWSAAPTAQA GDWGGATADW S

+
分子 #3: 40S ribosomal protein S3a

分子名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 30.256352 KDa
配列文字列: MAVGKNKRLT KGGKKGAKKK IVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNLGKTLVT RTQGTRIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLVTE DVQGKNCLTN FHGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRTNQ IRKTSYAQHQ Q VRQIRKKM ...文字列:
MAVGKNKRLT KGGKKGAKKK IVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNLGKTLVT RTQGTRIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLVTE DVQGKNCLTN FHGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRTNQ IRKTSYAQHQ Q VRQIRKKM MEIMTREVQT NDLKEVVNKL IPDSVGKDIE KACQSIYPLH DVYVRKVKML KKPKFELGKL MELHGEGGST SA AAKPAEG DTGAKVERAD GYEPPIQESV

+
分子 #4: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 30.342279 KDa
配列文字列: MADDAGGRGG FRGGFGTGGR GRGRGRGRGR GRGRGARGGK SEDKEWVPVT KLGRLVKDMK IKSLEEIYLY SLPIKESEII DFFLGSALK DEVLKIMPVQ KQTRAGQRTR FKAFVAIGDY NGHVGLGVKC SKEVATAIRG AIILAKLSII PVRRGYWGNK I GKPHTVPC ...文字列:
MADDAGGRGG FRGGFGTGGR GRGRGRGRGR GRGRGARGGK SEDKEWVPVT KLGRLVKDMK IKSLEEIYLY SLPIKESEII DFFLGSALK DEVLKIMPVQ KQTRAGQRTR FKAFVAIGDY NGHVGLGVKC SKEVATAIRG AIILAKLSII PVRRGYWGNK I GKPHTVPC KVTGRCGSVL VRLIPAPRGT GIVSAPVPKK LLMMAGIDDC YTSARGCTAT LGNFAKATFD AISKTYSYLT PD LWKETVF TKSPYQEFTD HLAKTHTRVS VQRTQGALPQ GTS

+
分子 #5: 40S ribosomal protein S4, X isoform

分子名称: 40S ribosomal protein S4, X isoform / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 29.746068 KDa
配列文字列: MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTGVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN RLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRTDI TYPTGFMDV VSIEKTGENF RLIYDVKGRF TVHRITNEEA KYKLCKVRKI LIGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT I RIDLDTGK ...文字列:
MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTGVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN RLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRTDI TYPTGFMDV VSIEKTGENF RLIYDVKGRF TVHRITNEEA KYKLCKVRKI LIGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT I RIDLDTGK ITDFIKFETG NMCMVTGGAN LGRIGVITNR EKHPGSFDVV HVKDSIGNSF ATRLSNIFVI GKGNKPWVSL PR GKGVRLT IAEERDKRLA AKQSSS

+
分子 #6: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 28.778922 KDa
配列文字列: MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRIFYEK RMATEVAADS LGDEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVRKGEK DIPGLTDSTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR R PLTKEGKK ...文字列:
MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRIFYEK RMATEVAADS LGDEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVRKGEK DIPGLTDSTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR R PLTKEGKK PRTKAPKIQR LVTPRVLQHK RRRIALKRQR TLKNKEAAAE YTKLLAKRMK EAKEKRQEQI AKRRRLSSLR AS TSKSESS QK

+
分子 #7: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 22.293119 KDa
配列文字列: MFSTSAKIVK PNGEKPDEFE SGISQALLEL EMNSDLKAQL RELHITAAKE IEVGGSRKAI IIFVPVPQLK SFQKIQVRLV RELEKKFSG KHVVFIAQRR ILPKPTRKSR TKNKQKRPRS RTLTNVHDAI LEDLVFPSEI VGKRIRVKLD SSRLIKVHLD K AQQNNVEH ...文字列:
MFSTSAKIVK PNGEKPDEFE SGISQALLEL EMNSDLKAQL RELHITAAKE IEVGGSRKAI IIFVPVPQLK SFQKIQVRLV RELEKKFSG KHVVFIAQRR ILPKPTRKSR TKNKQKRPRS RTLTNVHDAI LEDLVFPSEI VGKRIRVKLD SSRLIKVHLD K AQQNNVEH KVETFAGVYK KLTGKDVIFE FPEFQL

+
分子 #8: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 24.151434 KDa
配列文字列: MGISRDNWHK RRRTGGKRKP VHKKRKYELG RPAANTKIGP RRIHTIRVRG GNKKYRALRL DVGNFSWGSE CCTRKTRIID VVYNASNNE LVRTKTLVKN CVVLVDSTPY RQWYESHYAL PLGRKKGAKL TPEEEEILNK KRSKKVQKKF TLRRKTAKIS P LLEEQFLQ ...文字列:
MGISRDNWHK RRRTGGKRKP VHKKRKYELG RPAANTKIGP RRIHTIRVRG GNKKYRALRL DVGNFSWGSE CCTRKTRIID VVYNASNNE LVRTKTLVKN CVVLVDSTPY RQWYESHYAL PLGRKKGAKL TPEEEEILNK KRSKKVQKKF TLRRKTAKIS P LLEEQFLQ GKLLACISSR PGQCGRADGY VLEGKELEFY LRKIKAKKGK

+
分子 #9: 40S ribosomal protein S9

分子名称: 40S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 22.515379 KDa
配列文字列: MPVAKTWVCS KTYVTPRRPF EKSRLDQELR LIGEYGLRNK REVWRVKFTL AKIRKAAREL LTLDEKDPKR LFEGNALLRR LVRIGVLDE GKMKLDYILG LKVEDFLERR LQTQVFKLGL AKSIHHARVL IRQRHIRVRK QVVNIPSFVV RLDSQKHIDF S LRSPYGGG ...文字列:
MPVAKTWVCS KTYVTPRRPF EKSRLDQELR LIGEYGLRNK REVWRVKFTL AKIRKAAREL LTLDEKDPKR LFEGNALLRR LVRIGVLDE GKMKLDYILG LKVEDFLERR LQTQVFKLGL AKSIHHARVL IRQRHIRVRK QVVNIPSFVV RLDSQKHIDF S LRSPYGGG RPGRVKRKNA KKAQGGGGGG DDEEED

+
分子 #10: 40S ribosomal protein S11

分子名称: 40S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 18.444666 KDa
配列文字列:
MADTQNERAY QKQPTIFQNK KRVLAVEGSG KEKLPRYHRN VGLGFKTPRE AIDGTYIDKK CPFTGNVSIR GRILSGVVTK MKMQRTIVI RRDYLHYIRK YNRFEKRHKN MSVHLSPCFR DVTVGDIVTV GECRPLSKTV RFNVLKVTKA AGAKKQFQKF

+
分子 #11: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 17.23134 KDa
配列文字列:
MGRMHAPGKG LSQSALPYRR SVPTWLKLTS DDVKEQIFKL AKKGLTPSQI GVILRDSHGV AQVRFVTGNK ILRILKSKGL APDLPEDLY HLIKKAVAVR KHLERNRKDK DAKFRLILVE SRIHRLARYY KTRRVLAPNW KYESSTASAL VA

+
分子 #12: Ribosomal protein S14

分子名称: Ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 16.274757 KDa
配列文字列:
MAPRKGKEKK EEQVISLGPQ VAEGENVFGV CHIFASFNDT FVHVTDLSGK ETICRVTGGM KVKADRDESS PYAAMLAAQD VAQKCKELG ITALHIKLRA TGGNRTKTPG PGAQSALRAL ARSGMKIGRI EDVTPIPSDS TRRKGGRRGR RL

+
分子 #13: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 15.481043 KDa
配列文字列:
MGRVRTKTVK KAARVIIEKY YTRLGNDFHT NKRVCEEIAI IPSKKLRNKI AGYVTHLMKR IQRGPVRGIS IKLQEEERER RDNYVPEVS ALDQEIIEVD TDTKEMLKLL DFGSLSNLQV TQPPVGMNFK TPRGV

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S21

分子名称: 40S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 8.915166 KDa
配列文字列:
MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQINIAEVD RVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGEADDSLL RLAKTDSIVA K

+
分子 #15: 40S ribosomal protein S15a

分子名称: 40S ribosomal protein S15a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 14.865555 KDa
配列文字列:
MVRMNVLADA LKSINNAEKR GKRQVLLRPC SKVIVRFLTV MMKHGYIGEF EIIDDHRAGK IVVNLTGRLN KCGVISPRFD VQLKDLEKW QNNLLPSRQF GFIVLTTSAG IMDHEEARRK HTGGKILGFF F

+
分子 #16: 40S ribosomal protein S23

分子名称: 40S ribosomal protein S23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 15.885717 KDa
配列文字列:
MGKCRGLRTA RKLRNHRREQ KWHDKQYKKA HLGTALKANP FGGASHAKGI VLEKVGVEAK QPNSAIRKCV RVQLIKNGKK ITAFVPNDG CLNFIEENDE VLVAGFGRKG HAVGDIPGVR FKVVKVANVS LLALYKGKKE RPRS

+
分子 #17: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 15.383306 KDa
配列文字列:
MNDTVTVRTR KFMTNRLLQR KQMIVDVLHP GKATVPKTEI REKLAKMYKT TPDVVFVFGF KTQFGGGKTT GFGMIYDSLD YAKKNEPKY RLQRHGLYEK KKTSRKQRKE RKNRMKKVRG IKKASVGASG KKK

+
分子 #18: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 13.053496 KDa
配列文字列:
MTKKRRNNGR AKKGRGHVQP IRCTNCARCV PKDKAIKKFV IRNIVEAAAV RDISEASVFD SYVLPKLYVK LHYCVSCAIH SKVVRNRSR EARKDRTPPP RFRPTGGAPR APPKPM

+
分子 #19: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 9.550239 KDa
配列文字列:
MPLAKDLLHP TPEEERRRHK KKRLVQSPNS YFMDVKCPGC YKITTVFSHA QTVVLCVGCS TVLCQPTGGK ARLTEGCSFR RKQH

+
分子 #20: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 14.651978 KDa
配列文字列:
MQLFLRAQSL HTLEVSGNET VRDIKAHVEA LEGVCVEDQL LLLSGAPLQD DSTLLNCGIT EFCTLEVSGR LLGGKVHGSL ARAGKVRGQ TPKVDKQEKK KKKTGRAKRR IQYNRRFVNV VPTFGKKKGP NANS

+
分子 #21: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase

分子名称: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 26.879502 KDa
配列文字列: MAVQISKKRK FVSDGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGGVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV ...文字列:
MAVQISKKRK FVSDGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGGVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV DTAVRHVLLR QGVLGIKVKI MLPWDPSGKI GPKKPLPDHV SIVEPKEEVL STTPVSEQKG AKPEVPVMPQ GT PVPTA

+
分子 #22: Ribosomal protein S5

分子名称: Ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 22.9094 KDa
配列文字列: MAEDWEAAPA VAETPEIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSSGRYAAKR FRKAQCPIVE RVTNSMMMHG RNNGKKLLT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QILVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT ...文字列:
MAEDWEAAPA VAETPEIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSSGRYAAKR FRKAQCPIVE RVTNSMMMHG RNNGKKLLT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QILVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT IAECLADELI NAAKGSSNSY AIKKKDELER VAKSNR

+
分子 #23: Ribosomal protein S10

分子名称: Ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 18.919795 KDa
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHLA KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSCGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DFLHLPPEI VPATLRRQTR PETARPRPKG LEGERPARLA RGEGDRDAYR RSAAQPGADK KAEAGAGAAT EFQFRGGFGR G RGQQPQ

+
分子 #24: 40S ribosomal protein S15

分子名称: 40S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 17.040109 KDa
配列文字列:
MADTEQKKKR TFRKFTYRGV DLDQLLDMSY EQLMQLYSAR QRRRLNRGLR RKQQSLLKRL RKAKKEAPPM EKPEVVKTHL RDMVILPEM VGSMVGVYNG KTFNQVEIKP EMIGHYLGEF SITYKPVKHG RPGIGATHSS RFIPLK

+
分子 #25: Ribosomal protein S16

分子名称: Ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 16.387312 KDa
配列文字列:
MPAKGPLQSV QVFGRKKTAT AVAHCKRGNG LIKVNGRPLE MIEPVTLQYK LLEPLLLLGK ERFAGVDIRV RVKGGGHVAQ VYAIRQAIS KALVAYYQKY VDEASKKEIK DILIQYDRTL LVADPRRCES KKFGGPGARA RYQKSYR

+
分子 #26: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 13.315674 KDa
配列文字列:
MAFKDTGKAP VEAEVAIHRI RITLTSRNVK SLEKVCADLI RGAKEKSLKV KGPVRMPTKT LRITTRKTPC GEGSKTWDRF QMRIHKRLI DLHSPSEIVK QITSISIEPG VEVEVTIADA

+
分子 #27: 40S ribosomal protein S28

分子名称: 40S ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 7.838026 KDa
配列文字列:
MDASRVQPIK LARVTKVLGR TGSQGQCTQV RVEFMDDSNR SIIRNVKGPV REGDVLTLLE SEREARRLR

+
分子 #28: 40S ribosomal protein S29

分子名称: 40S ribosomal protein S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 6.692794 KDa
配列文字列:
MGHQQLYWSH PRKYGQGSRS CRVCSNRHGL IRKYGLNMCR QCFRQYAKDI GFVKLD

+
分子 #29: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1

分子名称: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 35.161703 KDa
配列文字列: MTEQMTVRGT LKGHSGWVTQ IATTPQFPDM ILSASRDKTI IMWKLTRDET NYGIPQRALR GHSHFVSDVV ISSDGQFALS GSWDGTLRL WDLTTGTTTR RFVGHTKDVL SVAFSADNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGVCK YTIQDDSHTE WVSCVRFSPN S SNPIIVSC ...文字列:
MTEQMTVRGT LKGHSGWVTQ IATTPQFPDM ILSASRDKTI IMWKLTRDET NYGIPQRALR GHSHFVSDVV ISSDGQFALS GSWDGTLRL WDLTTGTTTR RFVGHTKDVL SVAFSADNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGVCK YTIQDDSHTE WVSCVRFSPN S SNPIIVSC GWDKMVKVWN LANCKLKTNH IGHTGYLNTV TVSPDGSLCA SGGKDGQAML WDLNEGKHLY TLDGGDTINA LC FSPNRYW LCAATGPSIK IWDLEGKIIV DELRQDIITT NSKAEPPQCT SLAWSADGQT LFAGYTDNLI RVWQVTIGTR

+
分子 #30: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 13.894333 KDa
配列文字列:
MPPKDSKQKK DAGKSKKDKD PVNKSGGKAK KKKWSKGKVR DKLNNLVLFD KATYDKLYKE VPNYKLITPA VVSERLKIRG SLARAALQE LLGKGLIKLV SKHRAQVIYT RNTKGTDEAA PEKEA

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分子 #31: 40S ribosomal protein S19

分子名称: 40S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 15.971671 KDa
配列文字列:
MPGGVTVKDV NQQEFVRALA AFLKKSGKLK VPDWVDIVKL AKHKELAPCD ENWFYIRAAS TVRHLYLRGG VGVGSMTKIY GGRKRNGVC PSHFSVGSKN VARKVLQALE GLKMVEKDPN GGRRLTPQGT RDLDRIAGQV AAASKKV

+
分子 #32: 40S ribosomal protein S18

分子名称: 40S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 17.772777 KDa
配列文字列:
MSLVIPEKFQ HILRVLNTNI DGRRKIAFAI TAIKGVGRRY AHVVLRKADI DLNKRAGELT EDEVERVVTI MQNPRQYKIP DWFLNRQKD IKDGKYSQVL ANGLDNKLRE DLERLKKIRA HRGLRHFWGL RVRGQHTKTT GRRGRTVGVS KKK

+
分子 #33: Zgc:103482

分子名称: Zgc:103482 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 38.616762 KDa
配列文字列: MKELVEEMPD EGYGCTVANR FGQLLGDESD PFDILYAAGT EKKQKKKKEE PKKTSTTTKS VKKESQRDRK TILPAGGGGQ VRPGHEVVE EPIQRRVTFD RKFNDAEKPP LSFSVERPVD VLDRPARGRG TGRGKGARGP GFPRSNDGFD QRGKREFERH S GSDRSSVR ...文字列:
MKELVEEMPD EGYGCTVANR FGQLLGDESD PFDILYAAGT EKKQKKKKEE PKKTSTTTKS VKKESQRDRK TILPAGGGGQ VRPGHEVVE EPIQRRVTFD RKFNDAEKPP LSFSVERPVD VLDRPARGRG TGRGKGARGP GFPRSNDGFD QRGKREFERH S GSDRSSVR SEEKRSGSGS RNWGSVRDHM SVIEVASPSE EVTENEETQE AVETDGENRP SETEEVIEVA MEMTLDEWKA LQ EQSRPKV ELNIRKTESS VPSKAVVIHK SKLLQKQDGM DEDVVFRRPA NDITCQLEFN FGSLDRPTRG GRGGRGGRGR GGP SMPTLR SPQKFDSAPN PDDPEDFPAL A

+
分子 #34: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 15.819896 KDa
配列文字列:
MGKFMKPGKV VMVLAGRYAG RKAVIVKNID DGTADRPYSH ALVAGIDRYP RKVTATMGKK KIAKRSKIKA FVKVFNYNHL MPTRYSVDI PLDKTVVNKD VFRDPALKRK ARREAKVKFE ERYKTGKNKW FFQKLRF

+
分子 #35: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 7.596919 KDa
配列文字列:
MAKSKNHTTH NQSRKWHRNG IKKPRSQRYE SLKGVDPKFL RNMRFAKKHN KKGAKTIARK EASK

+
分子 #36: 60S ribosomal protein L30

分子名称: 60S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 13.004215 KDa
配列文字列:
MVAAKKTKKS LESINSRLQL VMKSGKYVLG YKQSQKMIRQ GKAKLVILAN NCPALRKSEI EYYAMLAKTG VHHYSGNNIE LGTACGKYY RVCTLAIIDP GDSDIIRSMP DQQQGGEK

+
分子 #37: 60S ribosomal protein L31

分子名称: 60S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 14.369771 KDa
配列文字列:
MAPKKGEKKK GRSAINEVVT REYTINIHKR IHGISFKRRA PRALKEIRKF AVKEMGTPDV RIDTRLNKAV WAKGVRNVPY RMRVRLSRK RNEDEDSPNK LYTLVTYVPV TTYKGLQTVN VDEN

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分子 #38: Ribosomal protein L32

分子名称: Ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 15.851852 KDa
配列文字列:
MAALRPLTKP KIVKKRTKKF IRHQSDRYVK IRANWRKPRG IDNRVRRRFK GQMLMPNIGY GSNRKTKHML PSGFKKFLVH NVKELEVLM MSNKSHCAEI AHNVSSKNRK LIVERAAQLA IKVTNPNARL RSEENE

+
分子 #39: 60S ribosomal protein L35a

分子名称: 60S ribosomal protein L35a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 12.50383 KDa
配列文字列:
MPGRLWSKAI FAGYKRGLRN QREHTALLKL EGVYNRGEVD FYLGKRCAYV YKAKKKTATP GGKPNKTRVI WGKVTRAHGN SGMVRAKFK SNLPAKAIGH RIRVMLYPSR V

+
分子 #40: 60S ribosomal protein L34

分子名称: 60S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 13.401077 KDa
配列文字列:
MVQRLTYRRR LSYNTASNKT RLSRTPGNRI VYLYTKKTGK SPKSACGICP GRLRGIRAVR PQVLMRLSKT KKHVSRAYGG SMCAKCVRD RIKRAFLIEE QKIVVKVLKA QAQTQKSK

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分子 #41: 60S ribosomal protein L35

分子名称: 60S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 14.47053 KDa
配列文字列:
MAKIKARDLR GKKKEELLKQ LDDLKVELSQ LRVAKVTGGA ASKLSKIRVV RKSIARVLTV INQTQKENLR KFYKGKKYKP LDLRPKKTR AIRRQLTKHE ENLMTKKMQR KSRLYSIRKF AVKA

+
分子 #42: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 12.216753 KDa
配列文字列:
MVVRYPMAVG LNKGHKVTKN VSKPKHSRRR GRLTKHAKFA RDLIREVCGF APYERRAMEL LKVSKDKRAL KFIKKRVGTH IRAKRKREE LSNTLAAMRK AAAKKE

+
分子 #43: Ribosomal protein L37

分子名称: Ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 11.074016 KDa
配列文字列:
MTKGTSSFGK RRNKTHTLCR RCGSKAYHLQ KSTCGKCGYP AKRKRKYNWS AKAKRRSTTG TGRMRHMKVV FRRFRNGFRE GTVPKPRRA AVAASSSS

+
分子 #44: 60S ribosomal protein L38

分子名称: 60S ribosomal protein L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 8.238948 KDa
配列文字列:
MPRKIEEIKD FLLTARRKDA KSVKIKKNKD NVKFKVRCSR YLYTLVITDK EKAEKLKQSL PPGLAVKELK

+
分子 #45: 60S ribosomal protein L36a

分子名称: 60S ribosomal protein L36a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 12.565102 KDa
配列文字列:
MVNVPKTRRT YCKKCKKHQP HKVTQYKKGK DSLYAQGKRR YDRKQSGYGG QTKPIFRKKA KTTKKIVLRL ECVEPNCRSK RMLAIKRCK HFELGGDKKR KGQVIQF

+
分子 #46: Zgc:171772

分子名称: Zgc:171772 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 10.229295 KDa
配列文字列:
MAKRTKKVGI VGKYGTRYGA SLRKMVKKIE ISQHAKYTCS FCGKTKMKRK AVGIWHCGSC MKTVAGGAWS YNTTSAVTVK SAIKRLKEL KDQ

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分子 #47: 60S ribosomal protein L8

分子名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 28.131973 KDa
配列文字列: MGRVIRGQRK GAGSVFKAHV KHRKGAAKLR HIDFAERHGY IKGIVKDIIH DPGRGAPLAK VMFRDPYRFK KRTELFIAAE GIHTGQFIY CGKKAQLNIG NVLPVGTMPE GTIVCCLEEK PGDRGKLARA SGNYATVISH NPETKKSRVK LPSGSKKVIS S ANRAVVGV ...文字列:
MGRVIRGQRK GAGSVFKAHV KHRKGAAKLR HIDFAERHGY IKGIVKDIIH DPGRGAPLAK VMFRDPYRFK KRTELFIAAE GIHTGQFIY CGKKAQLNIG NVLPVGTMPE GTIVCCLEEK PGDRGKLARA SGNYATVISH NPETKKSRVK LPSGSKKVIS S ANRAVVGV VAGGGRIDKP ILKAGRAYHK YKAKRNCWPR VRGVAMNPVE HPFGGGNHQH IGKPSTIRRD APAGRKVGLI AA RRTGRLR GTKTVQDKEN

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分子 #48: Ribosomal protein L3

分子名称: Ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 46.358297 KDa
配列文字列: MSHRKFSAPR HGSLGFLPRK RCKRHRGKVK SFPKDDPSKP VHLTAFLGYK AGMTHIVREV DRPGSKVNKK EVVEAVTVVE TPPMIVVGV VGYVMTPRGL RSFKTIFAEH ISDECKRRFY KNWYKSKKKA FTKYCKRWQD EEGKKQLEKD FSSMKKYCQI I RIIAHTQM ...文字列:
MSHRKFSAPR HGSLGFLPRK RCKRHRGKVK SFPKDDPSKP VHLTAFLGYK AGMTHIVREV DRPGSKVNKK EVVEAVTVVE TPPMIVVGV VGYVMTPRGL RSFKTIFAEH ISDECKRRFY KNWYKSKKKA FTKYCKRWQD EEGKKQLEKD FSSMKKYCQI I RIIAHTQM RLLPHRQKKS HLMEIQLNGG TISDKVDWAR EKLEQSIPIA NVFSQDEMID VIGVTKGHGC KGVTSRWHTK KL PRKTHRG LRKVACIGAW HPARVAFSVA RAGQKGYHHR TEINKKIYKI GVGYHNKDGK LVKNNASTDY DLSNKSINPL GGF VHYGEV TNDFLMLKGC VVGTKKRVLT LRKSLLVQTS RRAQEKIDLK FIDTTSKFGH GRFQTIEEKK NFMGPLKKDR LAKE EMA

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分子 #49: Ribosomal protein L4

分子名称: Ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 42.644477 KDa
配列文字列: MACARPLISV YSEKGETSGK NVVMPAVFRA PIRPDIVNFV HTNMRKNKRQ PYAVSELAGH QTSAESWGTG RAVARIPRVR GGGTHRSGQ GAFGNMCRGG RMFAPTKTWR RWHRRVNVNQ KRYAMCSALA ASALPSLVMA KGHRIEEIPE VPLVVDDKVE G YKKTKEAV ...文字列:
MACARPLISV YSEKGETSGK NVVMPAVFRA PIRPDIVNFV HTNMRKNKRQ PYAVSELAGH QTSAESWGTG RAVARIPRVR GGGTHRSGQ GAFGNMCRGG RMFAPTKTWR RWHRRVNVNQ KRYAMCSALA ASALPSLVMA KGHRIEEIPE VPLVVDDKVE G YKKTKEAV LLLKKLKAWN DIKKVYASQR MRAGKGKMRN RRRIQRKGPC IIYNEDNGVT RAFRNIPGIT LQSVSRLDLL KL APGGHIG RFCIWTEGAF RKLDDLYGTW RKASTLKVDY NLPMHKMSIT DLNRIIKSEE VQKAIRPANR KINRRVFKKN PLK NLRVMM KLNPYAKTAR RRAIMAHNPD VKAKMLKPKK KRVVKKTKAK KAEATPAQA

+
分子 #50: Ribosomal protein L5b

分子名称: Ribosomal protein L5b / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 34.118434 KDa
配列文字列: MGFVKVVKNK SYFKRYQVKF RRRREGKTDY FARKRLVIQD KNKYNTPKYR MIVRFSNRDI VCQIAYAKIE GDMIVCAAYS HELPKYGIS VGLTNYAAAY CTGLLLARRL LNKFGLDKVY DGQVEITGDE FNVESIDGQP GAFTCYLDAG LARTTTGNKV F GALKGAVD ...文字列:
MGFVKVVKNK SYFKRYQVKF RRRREGKTDY FARKRLVIQD KNKYNTPKYR MIVRFSNRDI VCQIAYAKIE GDMIVCAAYS HELPKYGIS VGLTNYAAAY CTGLLLARRL LNKFGLDKVY DGQVEITGDE FNVESIDGQP GAFTCYLDAG LARTTTGNKV F GALKGAVD GGLSIPHSTK RFPGYDVESK EFNAEVHRKH ILGLNIAEYM RLLMEEDEEC YKKQFSRFIK NGVTADSMEE MY KKAHAAI RENPVHEKKP KREVKKKRWN RAKLTLAQRK DRVAQKKASF LRAQAAEED

+
分子 #51: 60S ribosomal protein L6

分子名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 30.61851 KDa
配列文字列: MAEGDKKKVA RKHGSRNPEL VRGIGRYSRS AMFARRAMYK RKTKAPVTKV EKKIKEKKVK QKSKNPTTAI KTVGGDKNGG TRVVKLRKM PRYYPTEDVR RKLRSHGIKA FSQHRRKLRK TITPGTVLIM LTGRHRGKRV VFLKQLDSGL LLVTGPLAIN R VPLRRAHQ ...文字列:
MAEGDKKKVA RKHGSRNPEL VRGIGRYSRS AMFARRAMYK RKTKAPVTKV EKKIKEKKVK QKSKNPTTAI KTVGGDKNGG TRVVKLRKM PRYYPTEDVR RKLRSHGIKA FSQHRRKLRK TITPGTVLIM LTGRHRGKRV VFLKQLDSGL LLVTGPLAIN R VPLRRAHQ KFCIATNTKV DISGMKIPRT LTDSYFKKKK LRKPKHQEGE IFDTEKEKYQ LTEQRKADQK AVDSQLLPLI KK VPQLRGY LRSMFSLSNG VYPHKLVF

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分子 #52: Ribosomal protein L7

分子名称: Ribosomal protein L7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 28.505924 KDa
配列文字列: MAGETKKKIP SVPESLLKRR QRFAAIRAVR LKKAKADKKA SKVTRKLIFK RAEAYHKEYK QLYRREIRMS RMARKAGNYY VPAEPKLAF VIRIRGINGV SPKVRKVLQL LRLRQIFNGV FVKLNKASIN MLRIAEPYIA WGYPNLKSVR ELIYKRGFGK I KKQRIALT ...文字列:
MAGETKKKIP SVPESLLKRR QRFAAIRAVR LKKAKADKKA SKVTRKLIFK RAEAYHKEYK QLYRREIRMS RMARKAGNYY VPAEPKLAF VIRIRGINGV SPKVRKVLQL LRLRQIFNGV FVKLNKASIN MLRIAEPYIA WGYPNLKSVR ELIYKRGFGK I KKQRIALT DNSLIEKTLG QCGIICIEDL IHEIYTVGKN FKAANNFLWP FKLSSPRGGM NKKTTHFVEG GDAGNREDQI NR LVRRMN

+
分子 #53: 60S ribosomal protein L7a

分子名称: 60S ribosomal protein L7a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 30.07768 KDa
配列文字列: MPKGKKGKGK KVAPAPSVAK KHEVKKVVNP LFEKRPKNFG IGQDIQPKRD LTRFVKWPRY VRLQRQRAIL YKRLKVPPAI NQFTQALDR QTATQLFKLA HKYRPETKHE KKQRLLARAE QKAAGKGDTP TKRPPVLRAG VNTVTTLVES KKAQLVVIAH D VDPIELVV ...文字列:
MPKGKKGKGK KVAPAPSVAK KHEVKKVVNP LFEKRPKNFG IGQDIQPKRD LTRFVKWPRY VRLQRQRAIL YKRLKVPPAI NQFTQALDR QTATQLFKLA HKYRPETKHE KKQRLLARAE QKAAGKGDTP TKRPPVLRAG VNTVTTLVES KKAQLVVIAH D VDPIELVV FLPALCRKMG VPYCIVKGKA RLGRLVHRKT CTSIAFTQTN PEDKAALAKL VEAIKTNYND RYEEIRRHWG GN VLGPKST ARIAKLEKAK AKELATKLG

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分子 #54: 60S ribosomal protein L9

分子名称: 60S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 21.689256 KDa
配列文字列: MKTILSNQTV DIPDNVTVSL KGRTVTVKGP RGVLRREFNH INLELSLLGK KQKKLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQESG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR QGVACAVSAA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK ...文字列:
MKTILSNQTV DIPDNVTVSL KGRTVTVKGP RGVLRREFNH INLELSLLGK KQKKLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQESG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR QGVACAVSAA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVV EAES

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分子 #55: 60S ribosomal protein L11

分子名称: 60S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 20.415695 KDa
配列文字列:
MADQSEKKEN PMRELRIRKL CLNICVGESG DRLTRAAKVL EQLTGQTPVF SKARYTVRSF GIRRNEKIAV HCTVRGAKAE EILEKGLKV REYELRKNNF SDTGNFGFGI QEHIDLGIKY DPSIGIYGLD FYVVLGRPGF SIADKKRKTG RIGAKHRIRK E EAMRWFQQ KYDGIILPGK

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分子 #56: 60S ribosomal protein L13

分子名称: 60S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 24.426879 KDa
配列文字列: MAPSRNGMIL NPHFHKDWQK RVRTWFNQPA RKIRRRKARQ AKARRIAPRP VSGPLRPVVR CPTIRYHTKV RAGRGFTLEE LKAAGINKK VARTIGISVD SRRRNRSTES LQANVQRLKE YRTKLIIFPR KAAKPKKGDS TEEELKMATQ LTGPVMPIKK V HKKEKARV ...文字列:
MAPSRNGMIL NPHFHKDWQK RVRTWFNQPA RKIRRRKARQ AKARRIAPRP VSGPLRPVVR CPTIRYHTKV RAGRGFTLEE LKAAGINKK VARTIGISVD SRRRNRSTES LQANVQRLKE YRTKLIIFPR KAAKPKKGDS TEEELKMATQ LTGPVMPIKK V HKKEKARV ISEDEKNFKA FASLRMARAN ARLFGIRAKR AKEAAEQDVE KKK

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分子 #57: 60S ribosomal protein L14

分子名称: 60S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 16.166252 KDa
配列文字列:
MVFKRFVEIG RVAFIAFGPH EGKLVAIVDV IDQNRALVDG PCTGVKRQAL PFKCLQLTDY VIKVPHSARQ KYVRRAWEKA EISKKWEES SWAKKIEARK KRAAMSDFDR YKVSKAKKMR NKIIRHEMKK LQKAAAQKKA

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分子 #58: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 24.124232 KDa
配列文字列: MGAYKYMQEL WRKKQSDVMR FLLRVRCWQY RQLSSLHRAP RPTRPDKARR LGYKAKQGYV IYRIRVRRGG RKRPVPKGAT YGKPVHHGV NQIKFARSLQ SVAEERAGRH CGGLRVLNSY WVGEDSTYKF FEVILIDTFH KAIRRNPDTQ WITKAVHKHR E MRGLTSAG ...文字列:
MGAYKYMQEL WRKKQSDVMR FLLRVRCWQY RQLSSLHRAP RPTRPDKARR LGYKAKQGYV IYRIRVRRGG RKRPVPKGAT YGKPVHHGV NQIKFARSLQ SVAEERAGRH CGGLRVLNSY WVGEDSTYKF FEVILIDTFH KAIRRNPDTQ WITKAVHKHR E MRGLTSAG KKSRGLGKGH KFHLTIGGSR RAAWKRRNTL QLHRYR

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分子 #59: 60S ribosomal protein L13a

分子名称: 60S ribosomal protein L13a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 23.731516 KDa
配列文字列: MADRFNKVLI IDGRGHLLGR LSAIVAKQVL LGHKIVVVRC EGINISGNFY RNKLKYLAFL RKRMNTNPSR GPYHFRAPSR IFWRTVRGM LPHKTKRGQA ALDRLKVFDG IPPPYDKRKR MVVPAALKIV RLKPTRKFAL LGRLAHEVGW KYQAITATLE E KRKEKAKL ...文字列:
MADRFNKVLI IDGRGHLLGR LSAIVAKQVL LGHKIVVVRC EGINISGNFY RNKLKYLAFL RKRMNTNPSR GPYHFRAPSR IFWRTVRGM LPHKTKRGQA ALDRLKVFDG IPPPYDKRKR MVVPAALKIV RLKPTRKFAL LGRLAHEVGW KYQAITATLE E KRKEKAKL RYSKKKVEMK LTKQAEKNVE SKIAVYTDVL KKYGVLV

+
分子 #60: 60S ribosomal protein L17

分子名称: 60S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 21.476158 KDa
配列文字列:
MVRYSLDPEN PTKSCKSRGS NLRVHFKNTR ETAQAIKGMH IRKANKYLKD VIVKHQCVPF RRYNGGVGRC AQAKQHDWTQ GRWPKKSAE FLLHMLKNAE SNAELKGLDV DSLVIEHIQV NKAPKMRRRT YRAHGRINPY MSSPCHIEMI LTEKEQIVPK P EEEVSQKK KVSQKKLKKQ KLMARE

+
分子 #61: Ribosomal protein L18

分子名称: Ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 21.04501 KDa
配列文字列:
MGVDIRHNKD RKVHRKEPKS QDIYLRLLVK LYRFLSRRSD APFNKVILRR LFMSKTNRPP LALSRLIRKM KLPGRENLTA VVVGTITDD VRIQNIPKLK VCALKVTDRA RSRILKAGGQ IMTFDQLALT SPRGRGTVLL SGPRKGRQVY RHFGKAPGTP H SHTKPYVR SKGRKFERAR GRRH

+
分子 #62: 60S ribosomal protein L19

分子名称: 60S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 23.522225 KDa
配列文字列: MSMLRLQKRL ASSVLRCGKK KVWLDPNETN EIANANSRQQ IRKLVKDGLI IKKPVTVHSR ARCRKNTLAR RKGRHMGVGK RKGTANARM PEKLCWMRRM RILRRLLRRY REAKKIDRHM YHSLYLRAKG NVFKNKRILM EHIHKLKADK ARKKLLADQA E ARRTKTRE ...文字列:
MSMLRLQKRL ASSVLRCGKK KVWLDPNETN EIANANSRQQ IRKLVKDGLI IKKPVTVHSR ARCRKNTLAR RKGRHMGVGK RKGTANARM PEKLCWMRRM RILRRLLRRY REAKKIDRHM YHSLYLRAKG NVFKNKRILM EHIHKLKADK ARKKLLADQA E ARRTKTRE ARKRREERQQ AKKEEIIKTL SKEDETKK

+
分子 #63: 60S ribosomal protein L21

分子名称: 60S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 18.574945 KDa
配列文字列:
MTNTRGKRRG TRYMFARPFR KHGPIPLSTY MRIYKKGDIV DIKGTGTIQK GMPHKCYHGK TGRVYNVTQH AVGIIVNKQV KGKILAKRI NVRIEHIKHS KSRDSFLQRV KENEKKKVEA KKEGTWIELK RQPAAPRPAH FVSTKNNKPQ LLEPIPYEFM A

+
分子 #64: Ribosomal protein L22

分子名称: Ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 16.316792 KDa
配列文字列:
MRFFSSSFLP KLSAMAPIKK QVTKGGKKKK QVLKFTLDCT HPVEDGIMDA ANFEQFLQER IKVNGKAGNL GGGVVSIERS KSKITVTSE VPFSKRYLKY LTKKYLKKNN LRDWLRVVAN TKESYELRYF QINQDEEEED ED

+
分子 #65: 60S ribosomal protein L23

分子名称: 60S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 14.908505 KDa
配列文字列:
MSKRGRGGSS GAKFRISLGL PVGAVINCAD NTGAKNLYII SVKGIKGRLN RLPSAGVGDM VMATVKKGKP ELRKKVHPAV VIRQRKSYR RKDGVFLYFE DNAGVIVNNK GEMKGSAITG PVAKECADLW PRIASNAGSI A

+
分子 #66: 60S ribosomal protein L24

分子名称: 60S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 17.929113 KDa
配列文字列:
MKVELCSFSG YKIYPGHGRR YARIDGKVFQ FLNAKCESAF LSKRNPRQIN WTVLYRRKHK KGQSEEVSKK RTRRAVKFQR AITGASLAE ILAKRNQKPE VRKAQREQAI RAAKEAKKAK QATKKQTTQS SKAPAKSAQK QKIAKPMKVS APRVGGKR

+
分子 #67: Ribosomal protein L23a

分子名称: Ribosomal protein L23a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 17.686102 KDa
配列文字列:
MAPKAKKEAV PAKTEAKSKA LKAKKAVLKG VHSQKKKKIR TTPTFHRPKT LRLRRQPKYP RKSAPRRNKL DHYAIIKFPL TTESAMKKI EDNNTLVFIV DVKANKHQIK HAVKKLYDID VAKVNTLIRP DGEKKAYVRL APDYDALDVA NKIGII

+
分子 #68: ATPase H+ transporting V0 subunit e1

分子名称: ATPase H+ transporting V0 subunit e1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 17.387506 KDa
配列文字列:
MKLNTFVTSS RRKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQDI KEKGKYKEET IEKMQE

+
分子 #69: Ribosomal protein L39

分子名称: Ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 6.410758 KDa
配列文字列:
MASHKTFRIK RFLAKKQKQN RPIPQWIRMK TGNKIRYNSK RRHWRRTKLG L

+
分子 #70: 60S ribosomal protein L41

分子名称: 60S ribosomal protein L41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 3.473451 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRSK

+
分子 #71: 60S ribosomal protein L28

分子名称: 60S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 15.661467 KDa
配列文字列:
MASPHLQWMV IRNSSSFLIK RNKQTYSTEP NNLKARNAFR FNGLIHRKTI GIEPAADGKG VVVVLKKRSG QRKPASSYGK ITINKNSRA TLASVRNIIR KNKYRRDLRM AALRRVSAIL SSQKPVVVRK KRSRAPKSS

+
分子 #72: 60S ribosomal protein L10

分子名称: 60S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 24.664143 KDa
配列文字列: MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDPK IRIFDLGRKK AKVDEFPLCA HMVSDEYEQL SSEALEAARI CANKYMVKTC GKDGFHIRV RLHPFHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV HIGQVIMSVR TKAQNKEHVI EALRRAKFKF P GRQKIHVS ...文字列:
MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDPK IRIFDLGRKK AKVDEFPLCA HMVSDEYEQL SSEALEAARI CANKYMVKTC GKDGFHIRV RLHPFHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV HIGQVIMSVR TKAQNKEHVI EALRRAKFKF P GRQKIHVS KKYGFTKFNT CDFDNMLAEK RLIPDGCGVK YIPSRGPLSR WKALHAN

+
分子 #73: 60S ribosomal protein L18a

分子名称: 60S ribosomal protein L18a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 20.725533 KDa
配列文字列:
MKASGTLREY KVVGRLLPSV KNPAPPLYRM RIFAPNHVVA KSRFWYFVSQ LRKMKKASGE IVYCGLVFEK SPLKVKNFGI WLRYDSRSG THNMYREYRD LTTSGAVTQC YRDMGARHRA RAHAIQIMKV QVIAANKCRR PAIKQFHDSK IKFPLPHRVL R RQHKPRFT TKRPNTFF

+
分子 #74: 60S ribosomal protein L40

分子名称: 60S ribosomal protein L40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 14.786446 KDa
配列文字列:
MQIFVKTLTG KTITLEVEPS DTIENVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGRTLSDYN IQKESTLHLV LRLRGGIIEP SLRQLAQKY NCEKMICRKC YARLHPRAVN CRKKKCGHTN NLRPKKKLK

+
分子 #75: 60S ribosomal protein L27a

分子名称: 60S ribosomal protein L27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 16.62149 KDa
配列文字列:
MPTKKSKTRK LRGHVSHGHG RVGKHRKHPG GRGNAGGLHH HRINFDKYHP GYFGKVGMRH YHLKRNTTFC PTINLDKLWT LVSEQTRVN YSQKPDGPAP IIDVVRAGYF KVLGKGKLPK QPVIVKAKFF SRRAEEKIKG VGGACVLTA

+
分子 #79: Novel protein similar to human proliferation-associated 2G4 prote...

分子名称: Novel protein similar to human proliferation-associated 2G4 protein (PA2G4)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 43.391629 KDa
配列文字列: MSDDEQQEQT IAEDLVVTKY KMGGDIANQA LRAVIEAAKP GVSVLSLCQK GDAFIMAETG KIFKREKDMK KGIAFPTCVS VNNCVCHFS PLKSDPDYML KDGDLVKIDL GVHVDGFISN VAHSFVIGAT KEAPVTGRKA DVIKAAHLCA EAALRLVKPG N QNTQVTEA ...文字列:
MSDDEQQEQT IAEDLVVTKY KMGGDIANQA LRAVIEAAKP GVSVLSLCQK GDAFIMAETG KIFKREKDMK KGIAFPTCVS VNNCVCHFS PLKSDPDYML KDGDLVKIDL GVHVDGFISN VAHSFVIGAT KEAPVTGRKA DVIKAAHLCA EAALRLVKPG N QNTQVTEA WNKIAHSFKC NPIEGMLSHQ LKQHVIDGEK TIIQNPTDQQ KKDHEKAEFE VHEVYAVDVL ISSGEGKARD GG QRTTIYK RDPSKQYGLK MKTSRMFFSE VERRFDAMPF TLRAFEDEGK ARLGVVECAK HELLQPFSVL NEKEGEFVAQ FKF TVLLMA NGPLRITSGP LEAELYKSEH DVQDPELKSL IQSSASRKAQ KKKKKKASKT AETATGQPAE NEVAAK

+
分子 #80: Eukaryotic translation elongation factor 2

分子名称: Eukaryotic translation elongation factor 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 95.623453 KDa
配列文字列: MVNFTVDQIR AIMDKKSNIR NMSVIAHVDH GKSTLTDSLV SKAGIIASAR AGETRFTDTR KDEQERCITI KSTAISMYYE LTENDLAFI KQCKDGSGFL INLIDSPGHV DFSSEVTAAL RVTDGALVVV DCVSGVCVQT ETVLRQAIAE RIKPVLMMNK M DRALLELQ ...文字列:
MVNFTVDQIR AIMDKKSNIR NMSVIAHVDH GKSTLTDSLV SKAGIIASAR AGETRFTDTR KDEQERCITI KSTAISMYYE LTENDLAFI KQCKDGSGFL INLIDSPGHV DFSSEVTAAL RVTDGALVVV DCVSGVCVQT ETVLRQAIAE RIKPVLMMNK M DRALLELQ LEPEELYQTF QRIVENVNVI ISTYGEDEGG PMGNIMIDPV IGTVGFGSGL HGWAFTLKQF AEMYVAKFAS KG EAQLSPA DRCKKVEDMM KKLWGDRYFD PAGGKFTKTA NGPDGKKYPR TFAQLILDPI FKVFDAIMNF KKEETAKLIE KLD IKLDTE DKDKEGKPLL KAVMRRWLPA GEALLQMITI HLPSPVTAQK YRCELLYEGP GDDEAAMGIK NCDPKGPLMM YISK MVPTT DKGRFYAFGR VFSGVVSTGL KVRIMGPNYT PGKKEDLYLK PIQRTILMMG RYVEPIEDVP CGNIVGLVGV DQFLV KTGT ITTFDQAHNM RVMKFSVSPV VRVAVEAKNP ADLPKLVEGL KRLAKSDPMV QCIIEESGEH IIAGAGELHL EICLKD LEE DHACIPLKKS DPVVSYRETV SAESDQMCLS KSPNKHNRLY MKARPFPDGL AEDIDKGDVS SRQELKTRAR YLADKYE WE VTEARKIWCF GPDGTGPNML VDVTKGVQYL NEIKDSVVAG FQWATKEGAL CEENMRAVRF DIHDVTLHTD AIHRGGGQ I IPTARRVLYA CQLTAEPRLM EPIYLVEIQC PEQVVGGIYG VLNRKRGHVF EESQVMGTPM FVVKAYLPVN ESFGFTADL RSNTGGQAFP QCVFDHWQIL PGDPKDAASK PCQIVADTRK RKGLKEGIPA LDNFLDKL

+
分子 #81: Eukaryotic translation initiation factor 5A

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 5A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 16.987439 KDa
配列文字列:
MADPDLDFAS GDAGASATYP MQCSALRKNG FVVLKGRPCK IVEMSTSKTG (5CT)HGHAKVHLV GIDIFTNKKY EDICPS THN MDVPNIKRND YQLVDISEGF LSLMMDNGDV REDLRVPDGD LGKEIENKFA AGEEMLVTVL SAMGEESAVA LKPMTK

+
分子 #82: Dap1b

分子名称: Dap1b / タイプ: protein_or_peptide / ID: 82 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Zebrafish, Brachydanio rerio
分子量理論値: 12.12815 KDa
配列文字列:
MVQLSKTGVR DTLKAGHPPA VKAGGKRVVK KSADENANVE KETRKTDKPR SVLAPSRMQH LSLLLSGPLE KLGHDFPETP VSVRHSRVR PSVEKPHISR IPCIQQPRKF

+
分子 #83: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 83 / コピー数: 7 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #84: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 84 / コピー数: 202 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.6
構成要素:
濃度式名称
20.0 mMHEPESHEPES
100.0 mMKClpotassium chloride
5.0 mMMg(OAc)2magnesium acetate
10.0 mMNH4Clammonium chloride
1.0 mMDTTdithiothreitolジチオトレイトール
グリッドモデル: Quantifoil R3.5/1 / 材質: COPPER / メッシュ: 200 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 2.0 nm / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 60 sec. / 前処理 - 雰囲気: AIR
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 70 % / 装置: LEICA EM GP

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / Cs: 2.7 mm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / 平均電子線量: 43.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

粒子像選択選択した数: 1961364
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC
最終 3次元分類クラス数: 3 / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 2.14) / 使用した粒子像数: 535633

-
原子モデル構築 1

精密化プロトコル: OTHER
得られたモデル

PDB-7oya:
Cryo-EM structure of the 1 hpf zebrafish embryo 80S ribosome

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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