ChemComp-0G7: D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-oxohexan-3-yl...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 0G7
• 名称: 名称: D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-oxohexan-3-yl]-L-prolinamide; 別称: d-Phe-Pro-Arg chloromethylketone (PPACK); 日化辞名称: D-フェニルアラニル-L-プロリル-L-アルギニルクロロメチルケトン

BIRD information

• タイプ: ペプチド様 / 阻害剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition / Family definition

別称

• (2S)-1-[(2R)-2-amino-3-phenylpropanoyl]-N-[(3S)-1-chloro-6-(diaminomethylideneamino)-2-oxohexan-3-yl]pyrrolidine-2-carboxamide (PubChem)
• Phe-Pro-Arg-Chloromethylketone (PubChem)

Annotation

• 分子機能: Inhibitor of THROMBIN, EC: 3.4.21.5EC: Inhibitor of THROMBIN, EC: 3.4.21.5 / 情報源: PubMed: 8102368

External info

• BindingDB: 50287780
• ChemSpider: 4470699
• ChEBI: 212749
• ChEMBL: 307440
• PubChem: 5311176

Family

PPACK

D-Phe-Pro-Arg-CH2Cl / D-Phe-Pro-Arg chloromethylketone (PPACK) / N(alpha)-((acetylthio)acetyl)-phenylalanyl-prolyl-arginine chloromethyl ketone

Chemical information

組成

組成式: C₂₁H₃₁ClN₆O₃ / 原子数: 62 / 化学式量: 450.962 / 形式電荷: 0

その他

1hut

DPN

PRO

ARG

0QE

タイプ: peptide-like / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 0G7 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 1HUT / 子要素: DPN, PRO, ARG, 0QE

履歴

作成	2010年11月3日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2012年1月5日
Modify synonyms	2021年3月1日

• 外部リンク: BindingDB / UniChem / Brenda / ChEMBL / ChemicalBook / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(NC(C(=O)CCl)CCCNC(=[N@H])N)C2N(C(=O)C(N)Cc1ccccc1)CCC2
• CACTVS 3.385: N[CH](Cc1ccccc1)C(=O)N2CCC[CH]2C(=O)N[CH](CCCNC(N)=N)C(=O)CCl
• OpenEye OEToolkits 1.7.5: c1ccc(cc1)CC(C(=O)N2CCCC2C(=O)NC(CCCNC(=N)N)C(=O)CCl)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: N[C@H](Cc1ccccc1)C(=O)N2CCC[C@H]2C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)CCl
• OpenEye OEToolkits 1.7.5: [H]/N=C(\N)/NCCC[C@@H](C(=O)CCl)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](Cc2ccccc2)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C21H31ClN6O3/c22-13-18(29)16(8-4-10-26-21(24)25)27-19(30)17-9-5-11-28(17)20(31)15(23)12-14-6-2-1-3-7-14/h1-3,6-7,15-17H,4-5,8-13,23H2,(H,27,30)(H4,24,25,26)/t15-,16+,17+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: KWPACVJPAFGBEQ-IKGGRYGDSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-oxohexan-3-yl]-L-prolinamide
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: (2S)-1-[(2R)-2-azanyl-3-phenyl-propanoyl]-N-[(3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-oxo-hexan-3-yl]pyrrolidine-2-carboxamide

PDBエントリ

全5件を表示しています

PDB-1hut:
THE STRUCTURE OF ALPHA-THROMBIN INHIBITED BY A 15-MER SINGLE-STRANDED DNA APTAMER

PDB-2fir:
Crystal structure of DFPR-VIIa/sTF

PDB-2hpp:
Structures of the noncovalent complexes of human and bovine prothrombin fragment 2 with human ppack-thrombin

PDB-2hpq:
Structures of the noncovalent complexes of human and bovine prothrombin fragment 2 with human ppack-thrombin

PDB-3pmh:
Mechanism of Sulfotyrosine-Mediated Glycoprotein Ib Interaction with Two Distinct alpha-Thrombin Sites