SASDBQ7: Domain 3'X of hepatitis C virus RNA at higher ionic strength

基本情報

• 登録情報: データベース: SASBDB / ID: SASDBQ7

試料

Domain 3'X of hepatitis C virus RNA at higher ionic strength

• Domain 3'X of hepatitis C virus (RNA), 3'X, Hepatitis C virus

• 生物種: Hepatitis C virus (ウイルス)
• 引用: 日付: 2017 Jun 19; タイトル: Three-dimensional structure of the 3′X-tail of hepatitis C virus RNA in monomeric and dimeric states; 著者: Cantero-Camacho A / Fan L / Wang Y

登録者

• José Gallego (Universidad Católica de Valencia, Valencia, Spain)

モデル

• モデル #906: ; タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 4.25 A / 対称性: 1 / カイ2乗値: 3.861 / P-value: 0.001000; Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

試料

• 試料: 名称: Domain 3'X of hepatitis C virus RNA at higher ionic strength; 試料濃度: 0.37-1.50
• バッファ: 名称: 10mM Tris 0.1 mM EDTA 2 mM MgCl2 50 mM NaCl / pH: 7

要素 #506

名称: 3'X / タイプ: RNA / 記述: Domain 3'X of hepatitis C virus / 分子量: 31.7 / 分子数: 2 / 由来: Hepatitis C virus
配列:

GGUGGCUCCA UCUUAGCCCU AGUCACGGCU AGCUGUGAAA GGUCCGUGAG CCGCUUGACU GCAGAGAGUG CUGAUACUGG CCUCUCUGCA GAUCAAGU

実験情報

• ビーム: 設備名称: Rigaku BioSAXS-2000 / 地域: Frederick, MD / 国: USA / 線源: X-ray in house / 波長: 0.154 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 0.5 mm
• 検出器: 名称: Pilatus 100K / Pixsize x: 172 mm

スキャン

タイトル: Domain 3'X of hepatitis C virus RNA at higher ioni
測定日: 2015年11月20日 / 保管温度: 27 °C / セル温度: 27 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 30 / 単位: 1/A /

	Min	Max
Q	0	1

距離分布関数 P(R)

ソフトウェア P(R): GNOM 4.6 / ポイント数: 150 /

	Min	Max
Q	0.002	0.3
P(R) point	1	150
R	0	244

結果

Experimental MW: 81.9 kDa / カーブのタイプ: extrapolated

	P(R)	Guinier	Guinier error
前方散乱 I0	91.7	89.69	0.2
慣性半径, Rg	6.477 nm	5.992 nm	0.022

	Min	Max	Error
D	-	24.4	0.06
Guinier point	6	12	-