SASDBP7: Domain 3'X of hepatitis C virus RNA at low ionic strength

基本情報

• 登録情報: データベース: SASBDB / ID: SASDBP7

試料

Domain 3'X of hepatitis C virus RNA at low ionic strength

• Domain 3'X of hepatitis C virus (RNA), 3'X, Hepatitis C virus

• 生物種: Hepatitis C virus (ウイルス)
• 引用: 日付: 2017 Jun 19; タイトル: Three-dimensional structure of the 3′X-tail of hepatitis C virus RNA in monomeric and dimeric states; 著者: Cantero-Camacho A / Fan L / Wang Y

登録者

• José Gallego (Universidad Católica de Valencia, Valencia, Spain)

モデル

• モデル #903: ; タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 3.25 A / 対称性: 1 / カイ2乗値: 0.261 / P-value: 0.033000; Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

試料

• 試料: 名称: Domain 3'X of hepatitis C virus RNA at low ionic strength; 試料濃度: 0.37-1.50
• バッファ: 名称: 10mM Tris 0.1 mM EDTA / pH: 7

要素 #505

名称: 3'X / タイプ: RNA / 記述: Domain 3'X of hepatitis C virus / 分子量: 31.7 / 分子数: 1 / 由来: Hepatitis C virus
配列:

GGUGGCUCCA UCUUAGCCCU AGUCACGGCU AGCUGUGAAA GGUCCGUGAG CCGCUUGACU GCAGAGAGUG CUGAUACUGG CCUCUCUGCA GAUCAAGU

実験情報

• ビーム: 設備名称: Advanced Photon Source (APS) 12ID-B SAXS/WAXS / 地域: Argonne, IL / 国: USA / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.0886 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2 mm
• 検出器: 名称: Pilatus 2M

スキャン

タイトル: Domain 3'X of hepatitis C virus RNA at low ionic s
測定日: 2015年11月11日 / 保管温度: 27 °C / セル温度: 27 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 30 / 単位: 1/A /

	Min	Max
Q	0	1

距離分布関数 P(R)

ソフトウェア P(R): GNOM 4.6 / ポイント数: 150 /

	Min	Max
Q	0.002	0.3
P(R) point	1	150
R	0	148

結果

Experimental MW: 36.8 kDa / カーブのタイプ: extrapolated

	P(R)	Guinier	Guinier error
前方散乱 I0	0.09238	0.092	0.0011
慣性半径, Rg	3.956 nm	3.732 nm	0.03

	Min	Max	Error
D	-	14.8	0.06
Guinier point	4	19	-