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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDDP9 |
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![]() | C-terminal half of pseudorabies virus tegument protein UL37
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機能・相同性 | Herpesvirus UL37 / Herpesvirus UL37 tegument protein / virion assembly / metal ion binding / UL37![]() |
生物種 | ![]() ![]() |
![]() | ![]() タイトル: The dynamic nature of the conserved tegument protein UL37 of herpesviruses. 著者: "Koenigsberg A", "Heldwein E" |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #2171 | ![]() タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 3.60 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.120 ![]() |
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モデル #2172 | ![]() タイプ: dummy / ソフトウェア: (5.0) / ダミー原子の半径: 3.50 A / 対称性: P1 / コメント: Mean NSD (10 models ) = 0.78 / カイ2乗値: 1.120 ![]() |
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試料
![]() | 名称: C-terminal half of pseudorabies virus tegument protein UL37 試料濃度: 6 mg/ml |
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バッファ | 名称: 100 mM HEPES 150 mM NaCl 5% glycerol 0.1 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP) pH: 7.5 |
要素 #1187 | タイプ: protein / 記述: Tegument protein UL37 / 分子量: 48.525 / 分子数: 1 / 由来: Suid alphaherpesvirus 1 / 参照: UniProt: Q911W0 配列: GPGSGLRADG AGETPMEAPT SAALVDLAAA ADLVNYPSMV HLEAMADPSF APFFVVTAVA DAYNCLLTAS YDRRADLAQV LTWARDYGAG LIPNVSGYRT KLAALVAALA REDLTVAHAR NVEALAHELH GVVRAAAEVL EAPAPAPPSL AASAFLGDLL ARALRRRLED ...配列: GPGSGLRADG AGETPMEAPT SAALVDLAAA ADLVNYPSMV HLEAMADPSF APFFVVTAVA DAYNCLLTAS YDRRADLAQV LTWARDYGAG LIPNVSGYRT KLAALVAALA REDLTVAHAR NVEALAHELH GVVRAAAEVL EAPAPAPPSL AASAFLGDLL ARALRRRLED MATHTGDLLD SMATAAGAVA ERVVALERLF TCRFVFRGRT ASVFAPGEGG PCLGTWRLAD VVDAVGAFRA EVNTHRSDMR ADAGALRGVM AQTTEALREC EALGLQAPVF RTLCADHARL SKLQTSAALT AGRLQAATVL RPVERFLARW DLVSAALRRA VDERGVLALV ATLRETWTEA REEQAPPAPA FTPEELREAA DRVLGDYHEV AGDGEAGPDA VPLSASVNVR DWAAVNLEVL RRGARAPDDA SAGVPLLAQT WVPVDRLLAE VDAVSKGGSG GSWSHPQFEK |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Cornell High Energy Synchrotron Source (CHESS) G1 地域: Ithaca, NY / 国: USA ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 200K / タイプ: Pilatus / Pixsize x: 172 mm | |||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | 測定日: 2017年6月3日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 4 °C / 照射時間: 2 sec. / フレーム数: 300 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) |
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結果 | コメント: Additional SEC parameters: Column type: Superdex 200 Increase 5/150 GE; Flow rate: 0.3 ml/min; Sample injection concentration: 6 mg/ml; Injection volume: 100 µl. The models displayed ...コメント: Additional SEC parameters: Column type: Superdex 200 Increase 5/150 GE; Flow rate: 0.3 ml/min; Sample injection concentration: 6 mg/ml; Injection volume: 100 µl. The models displayed in this entry are: Top, individual best-fit DAMMIN model and; Bottom, the bead-occupancy and volume-corrected averaged spatial representation of the protein (DAMFILT model) obtained from ten individual DAMMIN runs (NSD = 0.78; resolution estimate = 4.1 nm).
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