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基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDDQ8 |
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![]() | The complex formed between the class II apurinic/apyrimidinic-endonuclease/3'-5' exonuclease III (XthA) bound to the BRCT domain from Mycobacterium tuberculosis DNA ligase
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機能・相同性 | ![]() : / DNA ligase (NAD+) / DNA ligase (NAD+) activity / base-excision repair, DNA ligation / exodeoxyribonuclease III / DNA ligation / peptidoglycan-based cell wall / DNA replication / endonuclease activity / DNA repair ...: / DNA ligase (NAD+) / DNA ligase (NAD+) activity / base-excision repair, DNA ligation / exodeoxyribonuclease III / DNA ligation / peptidoglycan-based cell wall / DNA replication / endonuclease activity / DNA repair / magnesium ion binding / DNA binding / plasma membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | ![]() ![]() |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #2154 | ![]() タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 3.75 A / カイ2乗値: 1.301 ![]() |
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試料
![]() | 名称: The complex formed between the class II apurinic/apyrimidinic-endonuclease/3'-5' exonuclease III (XthA) bound to the BRCT domain from Mycobacterium tuberculosis DNA ligase 試料濃度: 4.6 mg/ml / Entity id: 1121 / 1122 |
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バッファ | 名称: 50 mM Tris-HCl 500 mM NaCl 5mM β-mercaptoethanol / pH: 8 |
要素 #1121 | 名称: MtbXthA / タイプ: protein / 記述: Probable exodeoxyribonuclease III protein XthA / 分子量: 32.931 / 分子数: 1 / 由来: Mycobacterium tuberculosis / 参照: UniProt: A0A0T9L251 配列: MPDGTIDGGH PQRPASPRLR SPLLRLATWN VNSIRTRLDR VLDWLGRADV DVLAMQETKC PDGQFPALPL FELGYDVAHV GFDQWNGVAI ASRVGLDDVR VGFDGQPSWS GKPEVAATTE ARALGATCGG IRVWSLYVPN GRALDDPHYT YKLDWLAALR DTAEGWLRDD ...配列: MPDGTIDGGH PQRPASPRLR SPLLRLATWN VNSIRTRLDR VLDWLGRADV DVLAMQETKC PDGQFPALPL FELGYDVAHV GFDQWNGVAI ASRVGLDDVR VGFDGQPSWS GKPEVAATTE ARALGATCGG IRVWSLYVPN GRALDDPHYT YKLDWLAALR DTAEGWLRDD PAAPIALMGD WNIAPTDDDV WSTEFFAGCT HVSEPERKAF NAIVDAQFTD VVRPFTPGPG VYTYWDYTQL RFPKKQGMRI DFILGSPALA ARVMDAQIVR EERKGKAPSD HAPVLVDLHA GHHHHHH |
要素 #1122 | 名称: BRCT domain / タイプ: protein / 記述: M. tb. LigA BRCT domain / 分子量: 10.272 / 分子数: 1 / 由来: Mycobacterium tuberculosis / 参照: UniProt: P9WNV1 配列: VDERDESVPR TLAGLTIVVT GSLTGFSRDD AKEAIVARGG KAAGSVSKKT NYVVAGDSPG SKYDKAVELG VPILDEDGFR RLLADGPASR THHHHHH |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm | |||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | 測定日: 2018年3月9日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 10 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) |
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結果 | コメント: The ab initio model displayed in this entry represents the spatially aligned, volume and bead-occupancy-corrected (averaged) representation of the protein (DAMFILT). The displayed fit ...コメント: The ab initio model displayed in this entry represents the spatially aligned, volume and bead-occupancy-corrected (averaged) representation of the protein (DAMFILT). The displayed fit corresponds to an individual model fit to the SAXS data.
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