SASDAA2: Conalbumin in PBS (Ovotransferrin)

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: SASBDB / ID: SASDAA2
試料	Conalbumin in PBS Ovotransferrin (protein), Gallus gallus
機能・相同性	機能・相同性情報 organomineral extracellular matrix / iron ion transmembrane transport / antimicrobial humoral response / ferric iron binding / acute-phase response / iron ion transport / recycling endosome / antibacterial humoral response / response to lipopolysaccharide / intracellular iron ion homeostasis ...organomineral extracellular matrix / iron ion transmembrane transport / antimicrobial humoral response / ferric iron binding / acute-phase response / iron ion transport / recycling endosome / antibacterial humoral response / response to lipopolysaccharide / intracellular iron ion homeostasis / early endosome / iron ion binding / response to xenobiotic stimulus / extracellular space / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 Transferrin-like domain signature 2. / Transferrin family, iron binding site / Transferrin-like domain signature 1. / Transferrin-like domain signature 3. / Transferrin / Transferrin-like domain / Transferrin / Transferrin-like domain profile. / Transferrin 類似検索 - ドメイン・相同性 Ovotransferrin 類似検索 - 構成要素
生物種	Gallus gallus (ニワトリ)
登録者	Darja Ruskule (EMBL-Hamburg, European Molecular Biology Laboratory (EMBL) - Hamburg outstation, Notkestraße 85, Geb. 25A, 22607 Hamburg, Deutschland, Germany)

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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Data source

SASBDBのページ	SASDAA2

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関連構造データ

類似構造データ	4rg7-d 2x4p-d 4cfe-2 4yh6-d 3v05-d 2aqj-1 2x4n-d 4cff-2 3v5d-d 4jfo-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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外部リンク

「今月の分子」の関連する項目	#63 - 2005年3月 T細胞受容体 (T-Cell Receptor) 類似性 (10) #193 - 2016年1月シデロカリン (Siderocalin) 類似性 (9) #35 - 2002年11月フェリチンとトランスフェリン (Ferritin and Transferrin) 類似性 (9) #37 - 2003年1月血清アルブミン (Serum Albumin) 類似性 (9)

モデル #14	タイプ: dummy / ソフトウェア: dammif / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.034289 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #13	タイプ: atomic / ソフトウェア: crysol (28) / カイ2乗値: 3.404025 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

試料	名称: Conalbumin in PBS / Ext coefficient: 11.63 / Purity method: gel filtration / Dry vol: 99221 / Sample MW: 311.12 kDa / 試料濃度: 12.17 mg/ml / 濃度測定法: nanodrop
バッファ	名称: PBS / PK: 7 / pH: 7.4
要素 #12	タイプ: protein / 記述: Ovotransferrin / 分子量: 77.78 / 分子数: 1 / 由来: Gallus gallus / 参照: UniProt: P02789 配列: MKLILCTVLS LGIAAVCFAA PPKSVIRWCT ISSPEEKKCN NLRDLTQQER ISLTCVQKAT YLDCIKAIAN NEADAISLDG GQAFEAGLAP YKLKPIAAEV YEHTEGSTTS YYAVAVVKKG TEFTVNDLQG KTSCHTGLGR SAGWNIPIGT LLHRGAIEWE GIESGSVEQA ...配列: MKLILCTVLS LGIAAVCFAA PPKSVIRWCT ISSPEEKKCN NLRDLTQQER ISLTCVQKAT YLDCIKAIAN NEADAISLDG GQAFEAGLAP YKLKPIAAEV YEHTEGSTTS YYAVAVVKKG TEFTVNDLQG KTSCHTGLGR SAGWNIPIGT LLHRGAIEWE GIESGSVEQA VAKFFSASCV PGATIEQKLC RQCKGDPKTK CARNAPYSGY SGAFHCLKDG KGDVAFVKHT TVNENAPDQK DEYELLCLDG SRQPVDNYKT CNWARVAAHA VVARDDNKVE DIWSFLSKAQ SDFGVDTKSD FHLFGPPGKK DPVLKDLLFK DSAIMLKRVP SLMDSQLYLG FEYYSAIQSM RKDQLTPSPR ENRIQWCAVG KDEKSKCDRW SVVSNGDVEC TVVDETKDCI IKIMKGEADA VALDGGLVYT AGVCGLVPVM AERYDDESQC SKTDERPASY FAVAVARKDS NVNWNNLKGK KSCHTAVGRT AGWVIPMGLI HNRTGTCNFD EYFSEGCAPG SPPNSRLCQL CQGSGGIPPE KCVASSHEKY FGYTGALRCL VEKGDVAFIQ HSTVEENTGG KNKADWAKNL QMDDFELLCT DGRRANVMDY RECNLAEVPT HAVVVRPEKA NKIRDLLERQ EKRFGVNGSE KSKFMMFESQ NKDLLFKDLT KCLFKVREGT TYKEFLGDKF YTVISSLKTC NPSDILQMCS FLEGK

ビーム

設備名称:

DORIS III X33

/ 地域: Hamburg / 国: Germany

/ 形状: 0.6 / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.15 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.7 mm

検出器

名称: Pilatus 1M-W / Pixsize x: 0.172 mm

スキャン

測定日: 2012年9月21日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 15 sec. / フレーム数: 8 / 単位: 1/nm /

	Min	Max
Q	0.0871	6.0145

距離分布関数 P(R)

ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 1224 /

	Min	Max
Q	0.294912	3.64138
P(R) point	1	1224
R	0	11

結果

カーブのタイプ: merged / Standard: BSA

	実験値	Standard	Porod
分子量	68 kDa	68 kDa	-
体積	-	-	116.6 nm³

	P(R)	Guinier
前方散乱 I0	70	82.8
慣性半径, Rg	3.36 nm	3.78 nm

	Min	Max
D	-	11
Guinier point	38	95

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