PDB-9r1y: PLK1 SURFACE ENTROPY REDUCTION (SER) MUTANT IN COMPLEX WITH INHIB...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 9r1y

タイトル

PLK1 SURFACE ENTROPY REDUCTION (SER) MUTANT IN COMPLEX WITH INHIBITOR GSK461364

要素

Serine/threonine-protein kinase PLK1

キーワード

TRANSFERASE / SURFACE ENTROPY REDUCTION / SER / SMALL MOLECULE INHIBITOR / DRUG DESIGN / KINASE / SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE

機能・相同性

機能・相同性情報

Mitotic Telophase/Cytokinesis / regulation of protein localization to cell cortex / Mitotic Metaphase/Anaphase Transition / synaptonemal complex disassembly / Activation of NIMA Kinases NEK9, NEK6, NEK7 / polo kinase / mitotic nuclear membrane disassembly / protein localization to nuclear envelope / Phosphorylation of Emi1 / homologous chromosome segregation ...Mitotic Telophase/Cytokinesis / regulation of protein localization to cell cortex / Mitotic Metaphase/Anaphase Transition / synaptonemal complex disassembly / Activation of NIMA Kinases NEK9, NEK6, NEK7 / polo kinase / mitotic nuclear membrane disassembly / protein localization to nuclear envelope / Phosphorylation of Emi1 / homologous chromosome segregation / metaphase/anaphase transition of mitotic cell cycle / female meiosis chromosome segregation / nuclear membrane disassembly / synaptonemal complex / Phosphorylation of the APC/C / anaphase-promoting complex binding / Golgi inheritance / outer kinetochore / positive regulation of ubiquitin protein ligase activity / microtubule bundle formation / double-strand break repair via alternative nonhomologous end joining / mitotic chromosome condensation / Polo-like kinase mediated events / Golgi Cisternae Pericentriolar Stack Reorganization / regulation of mitotic spindle assembly / centrosome cycle / regulation of mitotic metaphase/anaphase transition / sister chromatid cohesion / positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity / regulation of mitotic cell cycle phase transition / mitotic spindle assembly checkpoint signaling / mitotic spindle pole / spindle midzone / mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling / regulation of anaphase-promoting complex-dependent catabolic process / mitotic cytokinesis / establishment of mitotic spindle orientation / mitotic sister chromatid segregation / positive regulation of proteolysis / Regulation of MITF-M-dependent genes involved in cell cycle and proliferation / negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination / Cyclin A/B1/B2 associated events during G2/M transition / protein localization to chromatin / Amplification of signal from unattached kinetochores via a MAD2 inhibitory signal / Loss of Nlp from mitotic centrosomes / Loss of proteins required for interphase microtubule organization from the centrosome / centriole / Recruitment of mitotic centrosome proteins and complexes / Recruitment of NuMA to mitotic centrosomes / Mitotic Prometaphase / Anchoring of the basal body to the plasma membrane / EML4 and NUDC in mitotic spindle formation / regulation of mitotic cell cycle / AURKA Activation by TPX2 / Resolution of Sister Chromatid Cohesion / Condensation of Prophase Chromosomes / mitotic spindle organization / regulation of cytokinesis / establishment of protein localization / RHO GTPases Activate Formins / peptidyl-serine phosphorylation / APC/C:Cdh1 mediated degradation of Cdc20 and other APC/C:Cdh1 targeted proteins in late mitosis/early G1 / protein destabilization / kinetochore / positive regulation of protein localization to nucleus / G2/M transition of mitotic cell cycle / centriolar satellite / spindle / spindle pole / The role of GTSE1 in G2/M progression after G2 checkpoint / Separation of Sister Chromatids / Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition / positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process / mitotic cell cycle / double-strand break repair / microtubule cytoskeleton / midbody / microtubule binding / protein phosphorylation / protein kinase activity / regulation of cell cycle / protein ubiquitination / protein serine kinase activity / protein serine/threonine kinase activity / centrosome / protein kinase binding / negative regulation of apoptotic process / chromatin / magnesium ion binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleoplasm / ATP binding / identical protein binding / nucleus / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.602 Å

データ登録者

Hillig, R.C. / Schulze, V.K. / Siemeister, G. / Schmitz, A.A. / Eberspaecher, U.

資金援助

1件

引用

ジャーナル: Acta Crystallogr D Struct Biol / 年: 2025
タイトル: Polo-like kinase 1-inhibitor co-complex structures via the surface-entropy reduction approach and a DARPin-assisted approach.
著者: Eberspaecher, U. / Schmitz, A.A. / Siemeister, G. / Bomer, U. / Bandeiras, T.M. / Matias, P.M. / Schulze, V.K. / Hillig, R.C.

履歴

登録	2025年4月28日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2025年11月26日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2025年12月10日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_ISSN / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	9r1y.cif.gz	247.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb9r1y.ent.gz		表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	9r1y.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/r1/9r1y ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/r1/9r1y	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	9r1wC 9r1xC 9r8bC 9r8cC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#205 - 2017年1月核膜孔複合体 (Nuclear Pore Complex) 類似性 (6) #122 - 2010年2月エンハンセオソーム (Enhanceosome) 類似性 (1) #236 - 2019年8月サイクリンとサイクリン依存性キナーゼ (Cyclin and Cyclin-dependent Kinase) 類似性 (1) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (1) #47 - 2003年11月シミアンウイルス40 (Simian Virus 40) 類似性 (1) #43 - 2003年7月 Srcチロシンキナーゼ (Src Tyrosine Kinase) 類似性 (1) #60 - 2004年12月ユビキチン (Ubiquitin) 類似性 (1) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#205 - 2017年1月
核膜孔複合体 (Nuclear Pore Complex)
類似性 (6)
#122 - 2010年2月
エンハンセオソーム (Enhanceosome)
類似性 (1)
#236 - 2019年8月
サイクリンとサイクリン依存性キナーゼ (Cyclin and Cyclin-dependent Kinase)
類似性 (1)
#245 - 2020年5月
スプライソソーム (Spliceosomes)
類似性 (1)
#47 - 2003年11月
シミアンウイルス40 (Simian Virus 40)
類似性 (1)
#43 - 2003年7月
Srcチロシンキナーゼ (Src Tyrosine Kinase)
類似性 (1)
#60 - 2004年12月
ユビキチン (Ubiquitin)
類似性 (1)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (1)

登録構造単位

AAA: Serine/threonine-protein kinase PLK1

BBB: Serine/threonine-protein kinase PLK1

ヘテロ分子

75.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	113.772, 104.174, 71.286
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 115.309, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	BBB-158- ARG

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	AAA
2	1	BBB

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1 / Beg auth comp-ID: LYS / Beg label comp-ID: LYS / End auth comp-ID: ARG / End label comp-ID: ARG / Auth seq-ID: 38 - 324 / Label seq-ID: 23 - 309

Dom-ID	Component-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID
1	1	AAA	A
2	2	BBB	B

NCSアンサンブル: (詳細: Local NCS retraints between domains: 1 2)

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AAABBB

#1: タンパク質	Serine/threonine-protein kinase PLK1 / Polo-like kinase 1 / PLK-1 / Serine/threonine-protein kinase 13 / STPK13 分子量: 36546.387 Da / 分子数: 2 / 変異: K225D, K226A / 由来タイプ: 組換発現詳細: N-TERMINAL GLY-SER IS A CLONING ARTIFACT FROM THROMBIN CLEAVAGE SITE. DOUBLE MUTATION K225D,K226A INTRODUCED AS SURFACE ENTROPY REDUCTION MUTATION TO INCREASE THE LIKELIHOOD TO OBTAIN CRYSTALS. 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: PLK1, PLK / 細胞株 (発現宿主): High Five / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: P53350, polo kinase

#1: タンパク質

Serine/threonine-protein kinase PLK1 / Polo-like kinase 1 / PLK-1 / Serine/threonine-protein kinase 13 / STPK13

分子量: 36546.387 Da / 分子数: 2 / 変異: K225D, K226A / 由来タイプ: 組換発現
詳細: N-TERMINAL GLY-SER IS A CLONING ARTIFACT FROM THROMBIN CLEAVAGE SITE. DOUBLE MUTATION K225D,K226A INTRODUCED AS SURFACE ENTROPY REDUCTION MUTATION TO INCREASE THE LIKELIHOOD TO OBTAIN CRYSTALS.
由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: PLK1, PLK / 細胞株 (発現宿主): High Five / 発現宿主:

Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: P53350, polo kinase

-
非ポリマー , 5種, 72分子

#2: 化合物	ChemComp-A1JCQ / 5-[6-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]benzimidazol-1-yl]-3-[(1~{R})-1-[2-(trifluoromethyl)phenyl]ethoxy]thiophene-2-carboxamide 分子量: 543.604 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₇H₂₈F₃N₅O₂S / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#5: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 56 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.61 Å³/Da / 溶媒含有率: 52.92 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 / 詳細: sodium acetate, ammonium sulphate, MES

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: BESSY / ビームライン: 14.2 / 波長: 0.91841 Å
検出器	タイプ: MAR CCD 165 mm / 検出器: CCD / 日付: 2008年2月13日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.91841 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.6→42.43 Å / Num. obs: 84640 / % possible obs: 88.9 % / 冗長度: 4.1 % / B_iso Wilson estimate: 45.3 Å² / R_sym value: 0.07 / Net I/σ(I): 14.9
反射シェル	解像度: 2.6→2.68 Å / Mean I/σ(I) obs: 4.1 / Num. unique obs: 2831 / R_sym value: 0.23

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0267	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.602→42.428 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.948 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.925 / SU B: 20.196 / SU ML: 0.216 / 交差検証法: FREE R-VALUE / ESU R Free: 0.304 / 詳細: Hydrogens have been added in their riding positions

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2178	1031	5.025 %
R_work	0.185	19487	-
all	0.187	-	-
obs	-	20518	88.592 %

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK BULK SOLVENT

原子変位パラメータ

B_iso mean: 68.082 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.871 Å²	0 Å²	2.433 Å²
2-	-	-2.466 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-0.488 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.602→42.428 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	4735	0	147	56	4938

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.004	0.013	5074
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.015	4898
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.256	1.675	6878
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.03	1.602	11313
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.513	5	611
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	28.981	20.401	274
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	13.358	15	906
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	12.448	15	47
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.042	0.2	636
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr_other	0.032	0.2	18
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.002	0.02	6124
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	1178
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.17	0.2	845
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_nbd_other	0.159	0.2	4306
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.151	0.2	2374
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_nbtor_other	0.069	0.2	2253
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.099	0.2	114
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_nbd_refined	0.143	0.2	17
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.181	0.2	67
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_xyhbond_nbd_refined	0.121	0.2	7
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	2.311	4.238	2372
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	2.31	4.236	2371
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	3.76	9.535	2971
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other	3.759	9.538	2972
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.934	4.742	2702
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other	2.933	4.743	2703
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	4.821	10.433	3895
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other	4.82	10.435	3896
X-RAY DIFFRACTION	r_lrange_it	7.03	50.664	5286
X-RAY DIFFRACTION	r_lrange_other	7.029	50.659	5284
X-RAY DIFFRACTION	r_ncsr_local_group_1	0.064	0.05	9262

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	1	AAA	X-RAY DIFFRACTION	Local ncs	0.0644	0.05009
1	2	BBB	X-RAY DIFFRACTION	Local ncs	0.0644	0.05009

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.602-2.67	0.241	42	0.233	847	X-RAY DIFFRACTION	51.417
2.67-2.743	0.22	54	0.238	960	X-RAY DIFFRACTION	60.6822
2.743-2.822	0.273	44	0.226	1038	X-RAY DIFFRACTION	68.4377
2.822-2.909	0.304	53	0.215	1174	X-RAY DIFFRACTION	77.6091
2.909-3.004	0.252	68	0.212	1264	X-RAY DIFFRACTION	87.287
3.004-3.109	0.268	85	0.212	1318	X-RAY DIFFRACTION	95.3773
3.109-3.227	0.226	64	0.207	1349	X-RAY DIFFRACTION	99.5772
3.227-3.358	0.228	85	0.208	1277	X-RAY DIFFRACTION	100
3.358-3.507	0.261	61	0.198	1257	X-RAY DIFFRACTION	100
3.507-3.678	0.228	54	0.183	1182	X-RAY DIFFRACTION	99.9192
3.678-3.876	0.197	61	0.165	1137	X-RAY DIFFRACTION	99.9166
3.876-4.111	0.188	64	0.161	1057	X-RAY DIFFRACTION	100
4.111-4.393	0.181	48	0.146	1023	X-RAY DIFFRACTION	99.9067
4.393-4.744	0.164	43	0.144	948	X-RAY DIFFRACTION	100
4.744-5.195	0.263	60	0.169	851	X-RAY DIFFRACTION	100
5.195-5.804	0.236	43	0.2	790	X-RAY DIFFRACTION	99.8801
5.804-6.695	0.232	32	0.217	697	X-RAY DIFFRACTION	100
6.695-8.183	0.217	34	0.174	592	X-RAY DIFFRACTION	100
8.183-11.5	0.125	25	0.153	462	X-RAY DIFFRACTION	99.3878
11.5-42.428	0.185	11	0.25	264	X-RAY DIFFRACTION	95.8188

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.4839	-1.3368	-0.574	6.0218	-1.0637	4.3562	0.0533	1	0.5602	-0.1723	0.1805	0.316	-1.075	-0.6074	-0.2337	0.3861	0.0967	0.001	0.3242	0.2168	0.1935	26.197	14.975	-1.526
2	3.1977	0.0878	0.5871	1.7367	0.0361	1.896	-0.0131	0.1947	-0.3851	-0.1217	-0.0131	0.0629	0.2416	0.0588	0.0261	0.0608	-0.0159	0.0223	0.0331	-0.0327	0.1383	36.2	-4.935	12.146
3	6.509	0.1803	0.058	5.2977	0.7844	4.8078	0.156	-0.4415	-0.4443	0.4829	0.2341	-0.9095	0.57	1.5209	-0.3901	0.1417	0.1	-0.1281	0.6313	-0.0525	0.4666	15.428	-30.377	34.553
4	3.143	1.4822	-0.5568	3.2341	-0.5319	1.4342	0.004	0.0116	0.5636	-0.0818	0.115	0.3627	-0.108	0.0808	-0.119	0.041	-0.0457	0.0247	0.0621	0.0251	0.3936	-3.484	-18.606	20.762

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	ALL	AAA	38 - 132
2	X-RAY DIFFRACTION	2	ALL	AAA	133 - 334
3	X-RAY DIFFRACTION	3	ALL	BBB	38 - 132
4	X-RAY DIFFRACTION	4	ALL	BBB	133 - 325

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AAABBB

-
非ポリマー , 5種, 72分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-タンパク質 , 1種, 2分子 AAABBB

-非ポリマー , 5種, 72分子

-詳細

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AAABBB

-
非ポリマー , 5種, 72分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)