PDB-9f8j: Crystal Structure of PhzA/B from Burkholderia cepacia R18194 in c...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 9f8j

タイトル

Crystal Structure of PhzA/B from Burkholderia cepacia R18194 in complex with (3-Bromophenyl)[6-hydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)benzo[b]thiophen-3-yl]methanone

要素

Phenazine biosynthesis protein A/B

キーワード

BIOSYNTHETIC PROTEIN / pyocyanin / phenazine biosynthesis / virulence / inhibitor / ketosteroid-isomerase / cocrystal / PhzA/B / Burkholderia cepacia

機能・相同性

Phenazine biosynthesis protein A/B / Phenazine biosynthesis protein A/B / antibiotic biosynthetic process / NTF2-like domain superfamily / : / Phenazine biosynthesis protein A/B

機能・相同性情報

生物種

Burkholderia lata (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.6 Å

データ登録者

Thiemann, M. / Zimmermann, M. / Kunick, C. / Blankenfeldt, W.

資金援助

1件

引用

ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2025
タイトル: From Bones to Bugs: Structure-Based Development of Raloxifene-Derived Pathoblockers That Inhibit Pyocyanin Production in Pseudomonas aeruginosa.
著者: Thiemann, M. / Zimmermann, M. / Diederich, C. / Zhan, H. / Lebedev, M. / Pletz, J. / Baumgarten, J. / Handke, M. / Musken, M. / Breinbauer, R. / Krasteva-Christ, G. / Zanin, E. / Empting, M. ...

履歴

登録	2024年5月6日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2025年4月16日	Provider: repository / タイプ: Initial release

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	9f8j_validation.pdf.gz	2.9 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	9f8j_full_validation.pdf.gz	2.9 MB	表示
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CIF形式データ	9f8j_validation.cif.gz	50 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f8/9f8j ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f8/9f8j	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	9f8hC 9f8iC 9f8kC 9f8lC 9f8mC 9f8nC 9f8oC 9f8pC 9f8qC 9f8rC 9f8sC C: 同じ文献を引用 (文献)
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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#44 - 2003年8月カルモジュリン (Calmodulin) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Phenazine biosynthesis protein A/B

B: Phenazine biosynthesis protein A/B

C: Phenazine biosynthesis protein A/B

D: Phenazine biosynthesis protein A/B

ヘテロ分子

89.3 kDa, 4 ポリマー
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1

A: Phenazine biosynthesis protein A/B

B: Phenazine biosynthesis protein A/B

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
44.6 kDa, 2 ポリマー
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2

C: Phenazine biosynthesis protein A/B

D: Phenazine biosynthesis protein A/B

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
44.7 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	69.363, 69.088, 82.993
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.05, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	Phenazine biosynthesis protein A/B 分子量: 21531.025 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Burkholderia lata (バクテリア) / 遺伝子: Bcep18194_B1568 / プラスミド: pET15b / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q396C9
#2: 化合物	ChemComp-A1IAG / (3-bromophenyl)-[2-(4-hydroxyphenyl)-6-oxidanyl-1-benzothiophen-3-yl]methanone / (3-Bromophenyl)[6-hydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)benzo[b]thiophen-3-yl]methanone 分子量: 425.295 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₁H₁₃BrO₃S / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#3: 化合物	ChemComp-MES / 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID / 2-モルホリノエタンスルホン酸分子量: 195.237 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₃NO₄S / コメント: pH緩衝剤*YM
#4: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 534 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	Y
Has protein modification	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.38 Å³/Da / 溶媒含有率: 48.3 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法詳細: 15% (w/v) PEG monomethyl ether, 0.1 M MES pH 6.14, 0.122 M ammonium acetate, 5% (v/v) glycerol

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: PETRA III, DESY / ビームライン: P11 / 波長: 1.0332 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER2 X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2022年5月19日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.0332 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.6→82.99 Å / Num. obs: 98772 / % possible obs: 95.6 % / 冗長度: 6.4 % / CC_1/2: 0.998 / R_merge(I) obs: 0.08 / R_pim(I) all: 0.034 / R_rim(I) all: 0.088 / Χ²: 0.83 / Net I/σ(I): 11.2
反射シェル	解像度: 1.6→1.63 Å / 冗長度: 6.1 % / R_merge(I) obs: 0.967 / Mean I/σ(I) obs: 2.1 / Num. unique obs: 4561 / CC_1/2: 0.806 / R_pim(I) all: 0.419 / R_rim(I) all: 1.057 / % possible all: 88.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XDS	Jan 10, 2022	データ削減
Aimless	v0.7.7	データスケーリング
PHASER	v2.8.3	位相決定
PHENIX	v1.20.1-4487	精密化
autoPROC	v1.0.5 (20211020)	data processing
PDB_EXTRACT	v4.2	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.6→48.95 Å / SU ML: 0.16 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.37 / 位相誤差: 19.79 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.1872	4808	4.87 %
R_work	0.1641	-	-
obs	0.1652	98628	95.49 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 30.377 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.6→48.95 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5076	0	194	534	5804

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.009	5691
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.066	7741
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	18.005	2046
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.061	712
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.01	1019

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.6-1.62	0.2659	124	0.2497	2944	X-RAY DIFFRACTION	90
1.62-1.64	0.2548	177	0.2424	2819	X-RAY DIFFRACTION	87
1.64-1.66	0.2463	167	0.2256	3166	X-RAY DIFFRACTION	96
1.66-1.68	0.2436	159	0.2178	3064	X-RAY DIFFRACTION	96
1.68-1.7	0.2302	174	0.2056	3086	X-RAY DIFFRACTION	96
1.7-1.72	0.2012	166	0.1907	3179	X-RAY DIFFRACTION	96
1.72-1.75	0.248	152	0.1846	3122	X-RAY DIFFRACTION	96
1.75-1.78	0.2056	198	0.1808	3159	X-RAY DIFFRACTION	96
1.78-1.8	0.194	138	0.1795	3145	X-RAY DIFFRACTION	96
1.8-1.83	0.2265	207	0.1785	3141	X-RAY DIFFRACTION	97
1.83-1.86	0.2026	156	0.1724	3131	X-RAY DIFFRACTION	96
1.86-1.9	0.1737	179	0.173	3080	X-RAY DIFFRACTION	96
1.9-1.93	0.1979	165	0.1779	3185	X-RAY DIFFRACTION	97
1.93-1.97	0.2147	119	0.1736	3213	X-RAY DIFFRACTION	96
1.97-2.02	0.2178	129	0.1621	3140	X-RAY DIFFRACTION	97
2.02-2.06	0.2231	140	0.166	3190	X-RAY DIFFRACTION	96
2.06-2.12	0.1748	167	0.1605	3132	X-RAY DIFFRACTION	96
2.12-2.17	0.2313	164	0.1624	3132	X-RAY DIFFRACTION	95
2.17-2.24	0.1885	134	0.1605	2814	X-RAY DIFFRACTION	86
2.24-2.31	0.2023	169	0.16	3118	X-RAY DIFFRACTION	94
2.31-2.39	0.2021	165	0.1517	3155	X-RAY DIFFRACTION	98
2.39-2.49	0.1546	165	0.1525	3177	X-RAY DIFFRACTION	98
2.49-2.6	0.203	186	0.1557	3195	X-RAY DIFFRACTION	98
2.6-2.74	0.1705	186	0.151	3217	X-RAY DIFFRACTION	98
2.74-2.91	0.1936	149	0.1531	3244	X-RAY DIFFRACTION	98
2.91-3.13	0.2013	147	0.162	3233	X-RAY DIFFRACTION	98
3.13-3.45	0.175	172	0.1578	3225	X-RAY DIFFRACTION	97
3.45-3.95	0.1669	159	0.1459	3111	X-RAY DIFFRACTION	95
3.95-4.97	0.125	128	0.1332	3051	X-RAY DIFFRACTION	90
4.97-48.95	0.2002	167	0.207	3252	X-RAY DIFFRACTION	96

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	6.7516	3.1277	2.5354	6.03	0.6444	3.8931	0.0622	-0.0978	0.1433	0.0387	-0.005	0.4539	-0.1495	-1.3809	-0.0107	0.2416	0.0601	0.0277	0.5414	0.0187	0.181	18.2595	-10.2082	12.7954
2	6.5873	3.5547	-1.2577	3.6317	-3.2075	4.0171	0.2513	-0.6535	0.2774	0.2667	-0.533	-0.1126	-0.5404	0.016	0.2395	0.2823	-0.0073	0.0131	0.3051	-0.0333	0.2036	31.4562	-5.1141	22.1567
3	8.0233	1.2326	-5.253	1.1088	-0.9898	7.3375	-0.2956	-0.4645	-0.6821	0.1043	-0.0322	-0.0971	0.5851	0.2827	0.4185	0.2399	0.0222	0.0014	0.1896	0.0595	0.2626	37.24	-19.2284	14.1101
4	4.858	5.8031	-2.7619	7.0389	-2.7194	2.9998	0.0407	-0.6937	-0.5614	0.4873	-0.3059	-0.5855	0.057	0.0789	0.2746	0.2497	0.0082	-0.0262	0.3637	0.0761	0.2871	38.7907	-11.4604	23.8749
5	4.2084	1.226	1.4807	1.135	0.7867	2.784	-0.0216	-0.1258	0.177	0.0601	-0.0614	-0.0094	-0.2624	-0.2614	0.1037	0.1801	0.0346	0.0099	0.1235	0.0008	0.1539	30.5216	-6.5955	8.2509
6	7.3446	1.5984	0.7911	0.563	0.5361	2.1861	-0.0016	-0.1647	0.1185	0.061	-0.0172	-0.0122	-0.1534	0.112	0.0414	0.1907	0.0217	-0.0101	0.1016	-0.0121	0.1695	40.7611	-7.5241	11.5035
7	9.5578	-0.9449	-7.9218	1.5257	0.7504	8.0669	-0.1833	-0.5282	-0.1063	0.1245	-0.0095	0.1328	0.3036	0.1036	0.2108	0.1761	-0.0058	0.0033	0.1977	0.0206	0.1698	28.6156	-16.4699	13.4238
8	2.8772	3.8274	3.5195	5.1085	4.6753	4.4546	-0.0658	-0.0475	-0.0125	-0.1448	0.1273	-0.0812	-0.2624	0.2546	-0.0039	0.2091	-0.0149	-0.0104	0.1935	0.0097	0.1984	47.7923	-8.1144	4.8405
9	0.8589	-0.9197	-1.1214	5.3149	4.6065	4.1139	0.2133	0.2279	-0.0258	-0.5918	0.1654	-0.2865	-0.4039	0.7831	-0.2125	0.2513	-0.052	0.0552	0.3386	-0.0104	0.2886	53.1338	-10.469	-8.8445
10	2.5597	-3.7173	-0.8953	5.5937	1.1194	4.3647	-0.1851	0.1365	-0.3636	0.0994	-0.0654	0.5419	-0.1194	-0.8472	0.2327	0.1919	-0.0378	-0.0226	0.4207	-0.0531	0.2321	17.094	-14.8222	-10.269
11	8.6722	-4.74	1.8426	9.169	-4.1479	6.9892	0.1667	0.5615	-0.4747	-0.4931	-0.2625	-0.2755	0.3822	-0.0609	0.0977	0.211	-0.0361	-0.002	0.3597	-0.0831	0.2148	31.1665	-19.9887	-20.6619
12	7.5327	-1.8146	4.8379	1.7663	-1.9347	7.6659	-0.2324	0.4355	0.6248	0.0281	-0.1267	-0.2534	-0.5451	0.1866	0.4474	0.2247	-0.0207	-0.0003	0.2142	0.0586	0.2364	37.4335	-6.8085	-12.1274
13	5.2373	-5.571	0.2176	6.0085	-0.1608	4.2242	-0.0131	0.1578	-0.09	-0.2846	-0.1246	-0.3962	-0.2718	-0.0963	0.1526	0.2388	-0.0014	0.0127	0.3652	0.0202	0.3028	38.5708	-13.9592	-21.8435
14	3.5607	-1.1982	-2.1058	1.3539	0.927	2.6004	-0.1172	0.2058	-0.146	-0.0107	-0.0425	0.0102	0.1323	-0.2827	0.1844	0.1789	-0.032	-0.01	0.1632	-0.0236	0.1862	30.0974	-18.8874	-5.995
15	4.797	-0.5879	-1.3384	0.0462	-0.0327	2.1321	-0.0415	0.1961	-0.2623	-0.0731	-0.0756	-0.0321	0.0701	-0.0024	0.1358	0.1952	-0.025	0.0088	0.1313	-0.0254	0.2055	39.9584	-18.6849	-8.9691
16	3.0442	0.7806	5.1292	2.4281	0.6012	8.8936	-0.1382	0.1467	0.1321	-0.1207	-0.0398	0.0768	-0.4709	-0.4848	0.1942	0.1789	0.0184	0.0107	0.2762	0.0278	0.1799	28.6336	-9.0779	-11.0929
17	8.1557	-3.4962	-3.4757	3.8622	3.6209	3.3959	-0.2586	-0.1671	-0.3478	0.2011	0.1596	0.0061	0.3149	0.1021	0.0536	0.2099	0.002	0.0105	0.1497	0.0241	0.2133	47.4428	-18.6202	-2.7571
18	0.0316	0.379	0.3695	3.467	3.5448	3.5959	0.0588	-0.1699	0.0574	0.2887	0.0464	-0.0743	-0.0383	0.6563	0.0892	0.2033	0.0447	-0.0474	0.3335	-0.0183	0.2379	53.145	-16.73	11.1625
19	8.4171	6.3538	1.604	7.6263	1.4046	3.8358	-0.1174	0.2574	0.4187	0.0138	-0.0216	0.7089	0.1519	-0.8506	0.154	0.2	0.0014	0.0333	0.3763	-0.016	0.2065	-18.2497	-11.6916	53.5668
20	5.7124	1.1359	0.2005	3.0073	-3.8232	5.5241	-0.0196	-0.3662	0.2402	0.1534	-0.1836	-0.2845	-0.427	-0.19	0.1432	0.2567	0.011	0.0073	0.2351	-0.0295	0.1824	-3.9344	-5.6158	63.4947
21	1.9181	1.8644	1.7523	3.812	0.6077	2.2179	0.0139	-0.4334	-0.4981	0.36	-0.2537	0.022	0.2413	-0.052	0.4839	0.2302	-0.0087	0.0106	0.2282	0.0821	0.2119	-3.8362	-19.0091	60.4674
22	8.4165	0.7489	-6.2063	1.3547	-1.2282	9.9223	-0.3111	-0.1049	-0.5654	0.0056	-0.0979	-0.1995	0.8238	0.5742	0.4702	0.255	0.0493	-0.007	0.1907	0.0158	0.2624	6.6098	-19.6166	53.1113
23	5.4987	5.9743	-4.6414	6.5347	-4.8122	5.8888	-0.0192	-0.4768	-0.4709	0.2063	-0.371	-0.8044	0.2058	0.1785	0.394	0.2345	0.0095	-0.0116	0.306	0.0365	0.3275	4.6494	-11.2804	65.6172
24	2.93	1.1156	1.6598	1.4838	1.0832	2.6822	-0.0372	-0.0342	0.0972	0.0326	-0.0249	0.0242	-0.1256	-0.1818	0.0868	0.172	0.0242	0.0287	0.145	-0.0015	0.1621	-4.4407	-6.9793	49.4074
25	5.1223	1.455	0.749	0.5444	0.1865	2.2906	0.0393	-0.1434	0.1042	0.095	-0.0253	-0.0402	-0.0851	0.1529	0.0015	0.21	0.015	0.001	0.132	-0.0174	0.2054	5.5538	-7.8375	52.9052
26	7.7741	-0.1625	-3.9106	1.3186	0.3527	6.353	-0.0968	-0.3544	-0.1786	0.1635	-0.0447	0.0288	0.4895	-0.0917	0.0871	0.2081	-0.028	-0.0023	0.1989	0.0269	0.1731	-6.0776	-17.0288	54.8511
27	6.4264	2.2596	2.2131	2.5486	2.4072	3.9367	0.0075	-0.1548	0.0813	-0.0676	0.0172	-0.009	-0.1042	-0.0411	-0.0451	0.191	-0.0084	0.0053	0.1737	0.0108	0.1924	12.6982	-7.5517	46.3793
28	0.3531	-0.932	-1.0673	2.3257	2.7089	3.1437	0.0497	0.2493	-0.0897	-0.2817	0.0375	-0.0404	-0.255	0.6473	-0.0233	0.196	-0.0576	0.0276	0.3006	-0.025	0.2429	18.3729	-9.648	32.6077
29	1.868	-1.8413	-0.3475	2.5428	0.1852	0.6918	-0.0532	0.0708	-0.3168	0.0599	0.0539	0.5643	0.2258	-1.1118	0	0.225	-0.07	-0.0088	0.582	0.0414	0.2849	-17.802	-16.9416	30.8543
30	6.7559	-2.627	-0.0617	8.9745	-4.5908	7.2546	0.0492	0.4372	-0.2196	-0.1469	-0.3231	-0.4259	0.4687	-0.0832	0.1976	0.194	-0.0239	-0.0177	0.2347	-0.0495	0.1701	-3.1614	-21.2965	21.5432
31	8.5401	-0.7889	5.1861	1.3349	0.0309	5.9917	-0.3421	0.5986	0.7032	-0.0864	-0.0439	-0.1231	-0.5763	0.4382	0.4595	0.2141	-0.0252	-0.0039	0.2148	0.0743	0.2227	2.2726	-7.116	29.2712
32	4.7892	-5.0142	1.3979	5.3188	-1.0411	4.3897	0.0807	0.5554	0.3685	-0.3902	-0.342	-0.6863	-0.1682	0.1383	0.2337	0.2579	-0.0422	0.0384	0.3633	0.0996	0.3343	4.5975	-14.7085	19.6669
33	2.699	-0.5277	-1.1215	0.8121	0.4254	2.1784	-0.0769	0.0797	-0.1153	-0.0002	0.0119	-0.0339	0.2167	-0.2928	0.0688	0.1884	-0.0354	-0.0095	0.167	0.001	0.1786	-4.116	-19.7364	35.517
34	2.7747	-0.2631	0.2283	0.562	0.4541	1.3591	-0.0156	0.0517	-0.0464	-0.0708	0.0243	-0.0603	0.0354	-0.0292	-0.0013	0.1853	-0.0157	0.0101	0.147	0.0186	0.1796	4.0306	-16.0901	33.4286
35	0.6302	-1.3291	-1.3045	4.9272	4.4301	3.977	0.0909	-0.4572	-0.0121	0.6196	0.2215	-0.1902	0.3356	0.7167	-0.11	0.2614	-0.0165	-0.0584	0.4377	-0.0151	0.2756	18.2619	-15.5998	53.1733

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 12 through 31 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 32 through 44 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 45 through 66 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 67 through 80 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 81 through 110 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 111 through 131 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 132 through 141 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 142 through 151 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 152 through 165 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 10 through 32 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 33 through 44 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 45 through 66 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 67 through 80 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 81 through 110 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 111 through 131 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 132 through 141 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resid 142 through 151 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'B' and (resid 152 through 165 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 10 through 31 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 32 through 44 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 45 through 53 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 54 through 66 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 67 through 80 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resid 81 through 110 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resid 111 through 131 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'C' and (resid 132 through 141 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'C' and (resid 142 through 151 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'C' and (resid 152 through 165 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 12 through 31 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 32 through 44 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'D' and (resid 45 through 66 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'D' and (resid 67 through 80 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'D' and (resid 81 through 110 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'D' and (resid 111 through 151 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'D' and (resid 152 through 165 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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