PDB-9atm: SARS-CoV-2 EG.5 RBD bound to the VIR-7229 and the S2H97 Fab fragments

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 9atm

タイトル

SARS-CoV-2 EG.5 RBD bound to the VIR-7229 and the S2H97 Fab fragments

要素

(VIR-7229 Fab ...) x 2
S2H97 Fab heavy chain
S2H97 Fab light chain
SARS-CoV-2 EG.5 RBD

キーワード

VIRAL PROTEIN / Sarbecoviruses / Spike glycoprotein / fusion protein / neutralizing antibodies / inhibitor / Structural Genomics / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease / SSGCID

機能・相同性

NICKEL (II) ION

機能・相同性情報

生物種

Homo sapiens (ヒト)

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (ウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.9 Å

データ登録者

Rietz, T. / Park, Y.J. / Errico, J. / Czudnochowski, N. / Nix, J.C. / Corti, D. / Snell, G. / Marco, A.D. / Pinto, D. / Cameroni, E. ...

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Cell / 年: 2024
タイトル: A potent pan-sarbecovirus neutralizing antibody resilient to epitope diversification.
著者: Laura E Rosen / M Alejandra Tortorici / Anna De Marco / Dora Pinto / William B Foreman / Ashley L Taylor / Young-Jun Park / Dana Bohan / Tyson Rietz / John M Errico / Kevin Hauser / Ha V Dang ...
要旨: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) evolution has resulted in viral escape from clinically authorized monoclonal antibodies (mAbs), creating a need for mAbs that are ...

履歴

登録	2024年2月27日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2024年10月16日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 2.0	2024年10月23日	Group: Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / pdbx_nonpoly_scheme ...atom_site / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_assembly_prop / pdbx_struct_oper_list Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num / _pdbx_struct_assembly_prop.value
改定 2.1	2024年12月25日	Group: Database references / カテゴリ: citation / Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb9atm.ent.gz	352.7 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	9atm_validation.pdf.gz	506.8 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	9atm_full_validation.pdf.gz	513.2 KB	表示
XML形式データ	9atm_validation.xml.gz	52.7 KB	表示
CIF形式データ	9atm_validation.cif.gz	72.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/at/9atm ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/at/9atm	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	43813C 43842C 8s6mC 9asdC 9au1C 9au2C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#170 - 2014年2月広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies) 類似性 (1) #21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1)

登録構造単位

H: VIR-7229 Fab heavy chain

I: S2H97 Fab heavy chain

L: VIR-7229 Fab light chain

M: S2H97 Fab light chain

R: SARS-CoV-2 EG.5 RBD

ヘテロ分子

122 kDa, 5 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	48.728, 149.698, 167.078
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁
Space group name Hall	P2ac2ab
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: x+1/2,-y+1/2,-z #3: -x,y+1/2,-z+1/2 #4: -x+1/2,-y,z+1/2

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
d_1	ens_1	(chain "L" and (resid 2 through 7 or resid 9...
d_2	ens_1	(chain "M" and (resid 2 through 7 or resid 9...

NCSドメイン領域:

Ens-ID: ens_1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
d_1	1	SER	SER	PRO	PRO	L	C	2 - 7	2 - 7
d_1	2	SER	SER	SER	SER	L	C	9 - 17	9 - 17
d_1	3	THR	THR	GLY	GLY	L	C	19 - 24	19 - 24
d_1	4	SER	SER	GLY	GLY	L	C	26 - 30	26 - 30
d_1	5	TYR	TYR	ASN	ASN	L	C	32 - 33	32 - 33
d_1	6	VAL	VAL	LYS	LYS	L	C	35 - 47	35 - 47
d_1	7	MET	MET	VAL	VAL	L	C	49 - 53	49 - 53
d_1	8	ARG	ARG	VAL	VAL	L	C	56 - 60	56 - 60
d_1	9	ARG	ARG	LEU	LEU	L	C	63 - 75	63 - 75
d_1	10	ILE	ILE	TYR	TYR	L	C	77 - 93	77 - 93
d_1	11	SER	SER	SER	SER	L	C	96	96
d_1	12	VAL	VAL	GLY	GLY	L	C	100 - 102	100 - 102
d_1	13	GLY	GLY	THR	THR	L	C	104 - 105	104 - 105
d_1	14	VAL	VAL	GLU	GLU	L	C	109 - 214	109 - 214
d_2	1	SER	SER	PRO	PRO	M	D	2 - 7	2 - 7
d_2	2	SER	SER	SER	SER	M	D	9 - 17	9 - 17
d_2	3	THR	THR	GLY	GLY	M	D	19 - 24	19 - 24
d_2	4	SER	SER	GLY	GLY	M	D	26 - 30	26 - 30
d_2	5	TYR	TYR	ASN	ASN	M	D	32 - 33	32 - 33
d_2	6	VAL	VAL	LYS	LYS	M	D	35 - 47	35 - 47
d_2	7	MET	MET	VAL	VAL	M	D	49 - 53	49 - 53
d_2	8	ARG	ARG	VAL	VAL	M	D	56 - 60	56 - 60
d_2	9	ARG	ARG	LEU	LEU	M	D	63 - 75	63 - 75
d_2	10	ILE	ILE	TYR	TYR	M	D	77 - 93	77 - 93
d_2	11	SER	SER	SER	SER	M	D	96	96
d_2	12	VAL	VAL	GLY	GLY	M	D	102 - 104	102 - 104
d_2	13	GLY	GLY	THR	THR	M	D	106 - 107	106 - 107
d_2	14	VAL	VAL	GLU	GLU	M	D	111 - 216	111 - 216

NCS oper: (Code: givenMatrix: (0.392452501459, -0.889420877472, -0.234332107949), (-0.908321095319, -0.334700206916, -0.25085565429), (0.14468525114, 0.311297725991, -0.939233679068)ベクター: -5. ...

-
抗体 , 4種, 4分子 HILM

#1: 抗体	VIR-7229 Fab heavy chain 分子量: 24259.188 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#2: 抗体	S2H97 Fab heavy chain 分子量: 24157.113 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#3: 抗体	VIR-7229 Fab light chain 分子量: 22993.303 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#4: 抗体	S2H97 Fab light chain 分子量: 22935.219 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)

-
タンパク質 / 糖 , 2種, 2分子 R

#10: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE / N-アセチル-β-D-グルコサミン

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₅NO₆

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

#5: タンパク質

SARS-CoV-2 EG.5 RBD

分子量: 27068.621 Da / 分子数: 1 / Fragment: RBD / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (ウイルス)
株: EG.5 / 発現宿主:

Homo sapiens (ヒト)

-
非ポリマー , 5種, 682分子

#6: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#7: 化合物	ChemComp-NI / NICKEL (II) ION 分子量: 58.693 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ni
#8: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 式: Cl
#9: 化合物	ChemComp-TRS / 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL / TRIS BUFFER / トリス(ヒドロキシメチル)メチルアンモニウム分子量: 122.143 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₂NO₃ / コメント: pH緩衝剤*YM
#11: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 676 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	N
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.51 Å³/Da / 溶媒含有率: 50.99 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法詳細: 0.1 M TRIS pH 8, 22% w/v PEG-MME 2000, and 20 mM NiCl2

-
データ収集

回折	平均測定温度: 293 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 14-BM-C / 波長: 1.195 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2023年9月6日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.195 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.9→46.78 Å / Num. obs: 92795 / % possible obs: 99.91 % / 冗長度: 13.1 % / B_iso Wilson estimate: 36.44 Å² / CC_1/2: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.138 / Net I/σ(I): 12.8
反射シェル	解像度: 1.9→1.92 Å / Mean I/σ(I) obs: 0.6 / Num. unique obs: 3168 / CC_1/2: 0.323

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.18.2_3874	精密化
PHASER	2.8.3	位相決定
XDS	June 30, 2023	データ削減
Aimless	0.7.4	データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.9→46.78 Å / SU ML: 0.2789 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 26.0051
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2272	4870	5.01 %
R_work	0.1939	92425	-
obs	0.1956	97295	99.91 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 53.96 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.9→46.78 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	7948	0	36	676	8660

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0065	8232
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.8454	11262
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0568	1259
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0059	1439
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.3995	2840

Refine LS restraints NCS

タイプ: Torsion NCS / Rms dev position: 4.29210732005 Å

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.9-1.92	0.4276	151	0.4012	3017	X-RAY DIFFRACTION	99.69
1.92-1.94	0.3847	148	0.369	3101	X-RAY DIFFRACTION	99.94
1.94-1.97	0.3603	154	0.3528	3024	X-RAY DIFFRACTION	99.94
1.97-1.99	0.3099	195	0.3249	2983	X-RAY DIFFRACTION	100
1.99-2.02	0.3787	151	0.3208	3092	X-RAY DIFFRACTION	100
2.02-2.05	0.2952	160	0.2958	3017	X-RAY DIFFRACTION	100
2.05-2.08	0.3016	163	0.2886	3034	X-RAY DIFFRACTION	99.97
2.08-2.11	0.2725	141	0.2709	3096	X-RAY DIFFRACTION	99.97
2.11-2.14	0.3077	168	0.2738	3009	X-RAY DIFFRACTION	99.84
2.14-2.17	0.2909	157	0.2518	3061	X-RAY DIFFRACTION	100
2.17-2.21	0.2978	169	0.2545	3061	X-RAY DIFFRACTION	99.85
2.21-2.25	0.3151	165	0.242	3028	X-RAY DIFFRACTION	99.91
2.25-2.3	0.279	179	0.2356	3035	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3-2.34	0.2568	156	0.2251	3067	X-RAY DIFFRACTION	99.97
2.34-2.39	0.3184	123	0.2176	3080	X-RAY DIFFRACTION	99.91
2.39-2.45	0.2644	160	0.2085	3093	X-RAY DIFFRACTION	99.94
2.45-2.51	0.2512	165	0.1994	3026	X-RAY DIFFRACTION	100
2.51-2.58	0.2218	166	0.1965	3120	X-RAY DIFFRACTION	99.97
2.58-2.65	0.2493	168	0.1934	2999	X-RAY DIFFRACTION	99.75
2.65-2.74	0.2371	171	0.1905	3089	X-RAY DIFFRACTION	99.94
2.74-2.84	0.2341	158	0.1919	3092	X-RAY DIFFRACTION	99.94
2.84-2.95	0.2327	156	0.2088	3079	X-RAY DIFFRACTION	100
2.95-3.09	0.2853	156	0.2	3102	X-RAY DIFFRACTION	99.94
3.09-3.25	0.2422	175	0.1951	3103	X-RAY DIFFRACTION	100
3.25-3.45	0.2191	160	0.1814	3099	X-RAY DIFFRACTION	99.88
3.45-3.72	0.2187	172	0.1824	3123	X-RAY DIFFRACTION	99.97
3.72-4.09	0.1966	180	0.1608	3108	X-RAY DIFFRACTION	100
4.09-4.68	0.1724	163	0.1359	3143	X-RAY DIFFRACTION	99.64
4.68-5.9	0.1727	166	0.1498	3172	X-RAY DIFFRACTION	99.58
5.9-46.78	0.1825	174	0.1813	3372	X-RAY DIFFRACTION	99.86

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.35727447719	-0.723295019936	1.68672499615	1.81399550782	-0.662171363521	3.33077927231	0.0391133057401	0.10058495961	-0.0298085962889	-0.084802380922	-0.0546567736544	-0.167136693191	-0.0565309806823	0.256022152247	0.015470188985	0.28228957774	0.000540861062374	0.00762270148483	0.275394356402	0.0144458002845	0.261494139699	30.8013072836	-23.6919090841	-0.163762433269
2	3.26746846685	0.572346919431	-0.160140258311	4.54081796459	-2.00922188404	8.57324071628	0.028054837872	-0.229030280358	-0.0441062835803	0.569435258246	-0.12329765759	0.225443829942	0.181906510752	-0.222710766225	0.0699760205701	0.329704610443	-0.0443236066266	-0.0113797966893	0.244807427377	-0.025401762764	0.290695088493	42.4631810614	-37.128380671	32.8419014101
3	2.10977084074	-0.812798567984	-0.110352130654	2.76575526865	0.345690460888	2.55568629649	0.146318946893	0.154761239773	0.0812235483483	-0.215044643947	-0.0612450798614	-0.472302489929	0.25356571162	0.375686884503	-0.0893875010647	0.272205166197	0.0588069498156	0.0441141092236	0.359199275677	0.0769389210855	0.362325438679	26.8222316859	-11.4378406982	-35.0396273772
4	8.22746933317	-1.65136729074	2.66744411327	3.23942976725	-1.67560279284	2.25957105502	-0.498390599053	0.242785987885	-0.472212150324	-0.042491032763	0.32905859442	-0.0573863500598	0.701654180724	1.41536189644	0.136417777262	0.906964030165	0.412248443978	0.209981948001	1.14009848639	0.0196293207588	0.759827742665	36.3923172968	-23.2936068615	-73.3787035628
5	3.26010732788	-0.288236643747	0.187757716241	3.00931356621	-0.394568701284	4.7127807631	0.0161983937936	-0.471947431622	0.107857545101	0.0568841091671	0.0164638903528	0.170394536896	-0.312216398113	-0.477002383325	-0.044748505385	0.348062468397	0.0934652731315	-0.00453116703518	0.40648615047	-0.0383504103388	0.250679519743	17.5147658778	-13.6881104349	13.1083031897
6	9.20040957445	-1.62234173336	0.881327998272	3.02055727518	-0.402716573452	5.05614680319	0.00723879977405	-0.197209798439	0.14282891501	0.268921437769	0.0915952432461	-0.0519285334914	-0.0519783345709	-0.35251091143	-0.109924841965	0.429916769681	-0.0499133636008	-0.0776512257772	0.308168845006	-0.00654215509034	0.265695232364	40.0220182383	-22.6408829445	38.6576751247
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9	3.41415968679	-1.16421952012	1.28431272055	4.58555339593	-3.34916338642	3.82778711872	0.345785625008	0.00856496047184	0.19508355801	-0.438250732774	0.2097355449	1.06629778477	-0.359102826928	-0.73516480203	-0.541717661746	0.429453961043	0.162276702373	0.026019670387	0.459433722048	0.0545226395833	0.485184179887	-2.4460669297	3.92782732064	-17.6474323902
10	2.16146277686	-0.5667649113	1.33864446454	1.73068134774	-0.368759091757	4.8063766437	-0.0732876350233	-0.328251274801	0.667278634134	0.421111850512	0.100856980671	0.0402537702588	-1.3880115382	-0.716514987899	-0.0341849177048	0.726889618993	0.173401688947	0.0612835990521	0.449970104846	0.0141310918365	0.600899505987	5.06926260855	12.9455980812	-18.5540134195
11	2.89872681916	-0.545403593392	-0.404465650232	2.11367633616	0.147033719947	1.73273832916	0.0207130167901	-0.17872764706	-0.147000159341	0.119161315021	0.0600110037704	0.143902240521	0.0988512891432	-0.120938918335	-0.0905549636847	0.293862454468	0.0343545421682	-0.0532443927461	0.273528659542	0.0113232559591	0.247203436397	7.682209578	-9.07266829735	-10.6580506281
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13	2.59754121186	-2.34502453287	0.303525496813	2.75103690732	-1.02275167709	0.977223039703	1.05533737675	0.355776581247	1.02246812308	-0.347746497682	-0.149976429319	-0.276751882031	-1.23755394509	-0.46652913274	-0.796262427507	0.735268092171	0.141964070969	0.190918777698	0.364303951912	0.146475855139	0.582723628493	8.92308588543	14.4209636712	-31.5537147628

精密化 TLSグループ

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	chain 'H' and (resid 1 through 123 )	H	A	1 - 123	1 - 125
2	2	chain 'H' and (resid 124 through 226 )	H	A	124 - 226	126 - 227
3	3	chain 'I' and (resid 2 through 118 )	I	B	2 - 118	2 - 121
4	4	chain 'I' and (resid 119 through 220 )	I	B	119 - 220	122 - 217
5	5	chain 'L' and (resid 2 through 110 )	L	C	2 - 110	2 - 110
6	6	chain 'L' and (resid 111 through 215 )	L	C	111 - 215	111 - 215
7	7	chain 'M' and (resid 1 through 124 )	M	D	1 - 124	1 - 124
8	8	chain 'M' and (resid 125 through 216 )	M	D	125 - 216	125 - 216
9	9	chain 'R' and (resid 333 through 353 )	R	F	333 - 353	1 - 21
10	10	chain 'R' and (resid 354 through 393 )	R	F	354 - 393	22 - 61
11	11	chain 'R' and (resid 394 through 494 )	R	F	394 - 494	62 - 164
12	12	chain 'R' and (resid 495 through 516 )	R	F	495 - 516	165 - 188
13	13	chain 'R' and (resid 517 through 529 )	R	F	517 - 529	189 - 201

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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