PDB-8clg: Epothilone A and Colchicine bound to tubulin (T2R-TTL) complex

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8clg

タイトル

Epothilone A and Colchicine bound to tubulin (T2R-TTL) complex

要素

Stathmin-4
Tubulin alpha-1B chain
Tubulin beta-2B chain
Tubulin-Tyrosine Ligase

キーワード

CELL CYCLE / Drug-tubulin-complex Cell cycle inhibition

機能・相同性

機能・相同性情報

positive regulation of axon guidance / microtubule-based process / cytoplasmic microtubule / cellular response to interleukin-4 / structural constituent of cytoskeleton / microtubule cytoskeleton organization / neuron migration / mitotic cell cycle / double-stranded RNA binding / microtubule cytoskeleton ...
類似検索 - 分子機能

生物種

synthetic construct (人工物)

Bos taurus (ウシ)

手法

X線回折 /

自由電子レーザー /

分子置換 / 解像度: 2.8 Å

データ登録者

Wranik, M. / Bertrand, Q. / Kepa, M.W. / Weinert, T. / Steinmetz, M. / Standfuss, J.

資金援助

スイス, 3件

引用

ジャーナル: Nat Commun / 年: 2023
タイトル: A multi-reservoir extruder for time-resolved serial protein crystallography and compound screening at X-ray free-electron lasers.
著者: Wranik, M. / Kepa, M.W. / Beale, E.V. / James, D. / Bertrand, Q. / Weinert, T. / Furrer, A. / Glover, H. / Gashi, D. / Carrillo, M. / Kondo, Y. / Stipp, R.T. / Khusainov, G. / Nass, K. / ...

履歴

登録	2023年2月16日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2023年12月13日	Provider: repository / タイプ: Initial release

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8clg.cif.gz	913.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8clg.ent.gz	757.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8clg.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	8clg_validation.pdf.gz	1012.5 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8clg_full_validation.pdf.gz	1.1 MB	表示
XML形式データ	8clg_validation.xml.gz	85.2 KB	表示
CIF形式データ	8clg_validation.cif.gz	114.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cl/8clg ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cl/8clg	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	8cl5C 8cl6C 8cl7C 8cl8C 8cl9C 8clbC 8clcC 8cldC 8cleC 8clfC 8clhC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#175 - 2014年7月微小管 (Microtubules) 類似性 (19) #176 - 2014年8月ダイニン (Dynein) 類似性 (19) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (19) #118 - 2009年10月ナトリウム・カリウムポンプ (Sodium-Potassium Pump) 類似性 (1) #168 - 2013年12月 DNAヘリカーゼ (DNA Helicase) 類似性 (1) #195 - 2016年3月 RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#175 - 2014年7月
微小管 (Microtubules)
類似性 (19)
#176 - 2014年8月
ダイニン (Dynein)
類似性 (19)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (19)
#118 - 2009年10月
ナトリウム・カリウムポンプ (Sodium-Potassium Pump)
類似性 (1)
#168 - 2013年12月
DNAヘリカーゼ (DNA Helicase)
類似性 (1)
#195 - 2016年3月
RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Tubulin alpha-1B chain

B: Tubulin beta-2B chain

C: Tubulin alpha-1B chain

D: Tubulin beta-2B chain

E: Stathmin-4

F: Tubulin-Tyrosine Ligase

ヘテロ分子

254 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration

単位格子

Length a, b, c (Å)	106.760, 160.760, 180.960
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 , 4種, 6分子 ACBDEF

#1: タンパク質	Tubulin alpha-1B chain 分子量: 48966.324 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P81947
#2: タンパク質	Tubulin beta-2B chain 分子量: 48391.410 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: Q6B856
#3: タンパク質	Stathmin-4 分子量: 14536.567 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) synthetic construct (人工物) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
#4: タンパク質	Tubulin-Tyrosine Ligase 分子量: 40616.367 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) synthetic construct (人工物) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)

-
非ポリマー , 8種, 60分子

#5: 化合物	ChemComp-GTP / GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP 分子量: 523.180 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₄P₃ / コメント: GTP, エネルギー貯蔵分子*YM
#6: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#7: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#8: 化合物	ChemComp-EP / EPOTHILONE A / エポチロンA 分子量: 493.656 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 式: C₂₆H₃₉NO₆S / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#9: 化合物	ChemComp-LOC / N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide / COLCHICINE / コルヒチン分子量: 399.437 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₂H₂₅NO₆ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: 薬剤, 抗炎症剤*YM
#10: 化合物	ChemComp-GDP / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP タイプ: RNA linking / 分子量: 443.201 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₁P₂ / コメント: GDP, エネルギー貯蔵分子*YM
#11: 化合物	ChemComp-ACP / PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER / ADENOSINE-5'-[BETA, GAMMA-METHYLENE]TRIPHOSPHATE / β,γ-メチレンATP 分子量: 505.208 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₁₈N₅O₁₂P₃ コメント: AMP-PCP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM
#12: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 44 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.12 Å³/Da / 溶媒含有率: 60.52 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: batch mode / pH: 6.5 詳細: 6% PEG4000 (w/v), 30 mM MgCl2, 30 mM CaCl2, 0.1 M MES/Imidazole, 5 mM L-tyrosine

-
データ収集

回折	平均測定温度: 293 K / Serial crystal experiment: Y
放射光源	由来: 自由電子レーザー / サイト: SwissFEL ARAMIS / ビームライン: ESA / 波長: 1.03 Å
検出器	タイプ: PSI JUNGFRAU 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2020年2月28日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.03 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.6→15.26 Å / Num. obs: 95755 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 209.7 % / CC_1/2: 0.983 / Net I/σ(I): 4.72
反射シェル	解像度: 2.6→2.7 Å / Mean I/σ(I) obs: 0.89 / Num. unique obs: 9439 / CC_1/2: 0.37
Serial crystallography sample delivery	手法: injection
Serial crystallography sample delivery injection	Carrier solvent: Hydroxyethylcellulose / 解説: High-viscosity injection / Injector diameter: 75 µm

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.20_4487	精密化
CrystFEL	0.8.0	データ削減
CrystFEL	0.8.0	データスケーリング
PHENIX	1.20_4487	位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.8→15.26 Å / SU ML: 0.28 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 21.75 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2267	1427	1.86 %
R_work	0.1782	-	-
obs	0.1791	76658	99.88 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.8→15.26 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	17488	0	256	44	17788

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.009
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.353
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.113	2667
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.073	2773
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.011	3313

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.8-2.9	0.3091	141	0.271	7399	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9-3.01	0.2942	141	0.2626	7483	X-RAY DIFFRACTION	100
3.01-3.15	0.2771	142	0.2418	7465	X-RAY DIFFRACTION	100
3.15-3.32	0.2536	141	0.2193	7452	X-RAY DIFFRACTION	100
3.32-3.52	0.282	142	0.1963	7480	X-RAY DIFFRACTION	100
3.52-3.79	0.2235	142	0.1777	7505	X-RAY DIFFRACTION	100
3.79-4.16	0.2058	143	0.1574	7509	X-RAY DIFFRACTION	100
4.16-4.75	0.1829	143	0.1403	7575	X-RAY DIFFRACTION	100
4.75-5.92	0.2168	145	0.1571	7623	X-RAY DIFFRACTION	100
5.92-15.26	0.2088	147	0.1614	7740	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.4714	0.1184	-0.1848	2.4033	0.4619	2.3068	0.0858	0.0396	0.1768	-0.2092	0.0603	-0.1838	-0.3532	0.2009	-0.1153	0.3573	-0.0066	0.0301	0.3747	-0.1313	0.4014	29.2688	87.7662	55.9131
2	1.7265	1.1083	-0.6684	2.4342	1.6136	6.0439	0.2752	-0.0454	0.2867	0.1711	-0.0602	0.5424	-0.3356	-0.5928	-0.1665	0.3978	0.0169	0.1225	0.4249	-0.1405	0.533	9.6214	86.8188	71.7206
3	0.9353	-0.718	-0.4499	3.599	1.3328	2.7737	-0.0942	-0.057	-0.0622	0.6583	0.0764	0.1776	0.2273	0.1271	-0.0016	0.2677	-0.012	0.0179	0.2997	-0.0984	0.3794	23.4496	78.859	70.0677
4	1.8611	-0.4851	-0.4115	2.1371	1.0232	2.3695	0.0333	0.0952	0.2266	-0.4023	-0.0851	0.0977	-0.4505	-0.1545	-0.0052	0.3706	0.0208	-0.0176	0.3395	-0.1152	0.3506	19.3557	61.5487	21.5125
5	5.308	-1.0778	0.7816	3.7539	-0.532	2.8401	0.0742	-0.0251	0.1316	-0.2124	-0.0535	0.3367	-0.3042	-0.4372	0.0153	0.4053	0.0822	-0.0138	0.4052	-0.1901	0.3946	9.2451	64.5046	37.4045
6	1.0272	-0.2822	0.4359	2.0701	1.2707	2.8309	-0.0762	-0.2385	0.1584	0.293	-0.0888	0.1001	0.1501	-0.3854	0.0834	0.2371	-0.0412	0.0148	0.3632	-0.099	0.3448	14.1442	52.0922	38.4302
7	4.1669	-1.4546	-1.1334	4.4564	-0.4038	2.3416	-0.0722	0.2406	0.4696	0.0267	0.041	0.4137	-0.535	-0.154	-0.0152	0.3889	-0.0224	-0.0139	0.2685	0.0047	0.3301	14.2606	43.618	-13.2439
8	1.9027	0.1404	-0.3288	2.2667	0.1251	1.8707	0.0448	0.1167	0.0374	-0.1706	0.021	-0.0207	-0.1117	0.1157	-0.057	0.2588	-0.0444	0.0139	0.2454	-0.0398	0.2521	17.5932	29.6393	-8.6551
9	1.8176	-0.7431	0.4621	1.9076	0.0692	1.5459	-0.0424	-0.1126	0.0041	0.0969	-0.0679	0.2392	0.0185	-0.2314	0.0934	0.255	-0.0534	0.0269	0.3002	-0.0703	0.2833	3.598	29.2336	6.1673
10	2.9245	-1.5499	-2.6447	2.8535	3.0398	6.2268	-0.1996	-0.2254	-0.3493	0.4953	0.1906	-0.2349	0.9205	0.633	-0.1287	0.3637	0.0149	-0.0607	0.3174	-0.0154	0.3995	25.6408	12.8817	2.3872
11	5.0282	-1.9545	0.2275	4.1345	-0.3523	1.9921	-0.0551	0.6853	0.1846	-0.6815	0.0948	0.0194	-0.0343	-0.3001	-0.1018	0.7106	-0.0994	0.0529	0.7905	-0.0856	0.3862	17.0469	10.3864	-44.0328
12	1.9952	-0.0793	-0.3595	1.7118	0.0278	1.5964	-0.1082	0.4411	-0.3674	-0.4128	0.2059	-0.2151	0.2309	0.0392	-0.0511	0.539	-0.0879	0.107	0.6052	-0.2133	0.4682	23.058	-2.0407	-35.888
13	2.1681	-0.3493	-0.4832	2.0097	0.413	2.0803	-0.0827	0.2911	-0.2086	-0.0621	0.043	0.1471	0.2884	-0.2724	0.0011	0.4117	-0.0773	0.0258	0.3767	-0.1128	0.3883	7.9433	-1.7622	-22.0611
14	4.9792	-1.543	-3.0747	2.0605	0.7447	5.104	-0.3668	-0.2159	-0.5526	0.4069	0.2233	-0.167	0.974	0.6979	-0.0876	0.5884	0.0422	0.0195	0.5453	-0.2107	0.7194	30.4032	-16.3994	-24.3159
15	8.0817	-0.0119	0.899	7.6777	-6.1869	8.4497	-0.2471	-0.1488	0.2942	-0.0957	-0.3912	-0.2031	-0.3779	0.2033	0.4124	0.7111	-0.1466	0.075	0.6145	-0.2872	0.5863	25.8775	101.576	81.9371
16	0.0147	0.1289	0.0413	1.1244	0.3494	0.108	0.0004	-0.0211	-0.3884	0.765	-0.0194	-0.5329	0.7538	0.9847	0.0916	1.0793	0.2926	-0.1807	1.0015	-0.1386	0.5773	32.4447	84.6892	82.3118
17	0.1923	0.0093	-0.0238	0.3476	0.505	0.47	-0.2013	0.0354	-0.0015	0.5006	0.4437	-0.1929	0.547	0.7406	-0.4486	0.5339	0.0781	0.0362	0.6907	-0.2122	0.6701	43.0004	28.9906	3.5893
18	3.1864	0.6667	-1.2366	4.8604	0.951	4.4423	-0.4497	0.4668	-0.6818	-0.2701	0.3746	-0.1504	1.4152	-0.6677	0.125	0.8913	-0.1217	0.1109	0.5973	-0.1526	0.6587	6.1969	56.7154	69.5057
19	6.7077	-0.1909	1.7063	3.6543	-1.7013	4.6101	-0.1823	-0.9565	-0.15	0.3248	-0.0978	-0.8096	-0.2437	1.0557	0.1823	0.6362	0.0771	-0.0563	0.8965	0.0529	0.6945	16.4448	66.2827	99.9977
20	8.9013	0.1104	1.0997	6.44	-2.1621	8.2451	-0.2282	-1.1656	-0.4262	0.7146	0.173	-1.0658	0.543	1.1388	0.0862	1.0504	0.3729	-0.0423	1.4062	0.1639	1.1977	16.4268	56.4287	110.2575
21	1.9976	0.1086	-0.3339	2.1734	-1.1208	5.1005	-0.2829	-0.495	-0.7518	0.4154	-0.0238	-0.4178	0.836	0.7562	0.1908	0.9262	0.2353	0.1489	0.603	0.1709	0.8127	5.5515	55.2907	98.9008
22	3.3059	-1.1178	0.1761	0.6178	0.743	2.6822	-0.4244	-0.3665	-1.54	0.232	0.3111	-0.2509	1.4365	0.2525	0.196	1.997	0.1126	-0.0133	1.1709	0.2521	1.7068	5.0743	41.2358	105.0421
23	1.9379	-0.1302	-1.6425	1.6806	-0.2864	3.5307	-0.4305	0.1652	-0.5307	0.1379	0.2578	0.216	0.6771	-0.2557	0.1082	0.7531	-0.0184	0.0865	0.4424	0.026	0.6617	-3.8796	59.5248	90.7464

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 1 through 273 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 274 through 311 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 312 through 439 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 1 through 238 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 239 through 295 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 296 through 438 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'C' and (resid 1 through 72 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'C' and (resid 73 through 259 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'C' and (resid 260 through 401 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 402 through 440 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'D' and (resid 1 through 88 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'D' and (resid 89 through 251 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'D' and (resid 252 through 399 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'D' and (resid 400 through 441 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'E' and (resid 6 through 20 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'E' and (resid 21 through 46 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'E' and (resid 47 through 143 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'F' and (resid 1 through 66 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'F' and (resid 67 through 134 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'F' and (resid 135 through 165 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'F' and (resid 166 through 223 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'F' and (resid 224 through 257 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'F' and (resid 258 through 378 )

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 4種, 6分子 ACBDEF

-
非ポリマー , 8種, 60分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-タンパク質 , 4種, 6分子 ACBDEF

-非ポリマー , 8種, 60分子

-詳細

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 4種, 6分子 ACBDEF

-
非ポリマー , 8種, 60分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)