登録情報 | データベース: PDB / ID: 7vn5 |
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タイトル | Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning TTCACGTGAA |
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要素 | - DNA (5'-D(*TP*TP*TP*TP*CP*AP*CP*GP*TP*GP*AP*AP*AP*AP*A)-3')
- Maltodextrin-binding protein,Protein BRASSINAZOLE-RESISTANT 1
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キーワード | TRANSCRIPTION / Transcription factor-DNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
plant ovule development / seed development / brassinosteroid mediated signaling pathway / carbohydrate transmembrane transporter activity / maltose binding / maltose transport / maltodextrin transmembrane transport / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex, substrate-binding subunit-containing / periplasmic space / DNA-binding transcription factor activity ...plant ovule development / seed development / brassinosteroid mediated signaling pathway / carbohydrate transmembrane transporter activity / maltose binding / maltose transport / maltodextrin transmembrane transport / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex, substrate-binding subunit-containing / periplasmic space / DNA-binding transcription factor activity / negative regulation of DNA-templated transcription / DNA-templated transcription / regulation of DNA-templated transcription / DNA binding / nucleus / cytosol類似検索 - 分子機能 BZR family / BES1/BZR1 plant transcription factor, N-terminal / BES1/BZR1 plant transcription factor, N-terminal / Maltose/Cyclodextrin ABC transporter, substrate-binding protein / Solute-binding family 1, conserved site / Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 1 signature. / Bacterial extracellular solute-binding protein / Bacterial extracellular solute-binding protein / ACP-like superfamily / Carrier protein (CP) domain profile. / Phosphopantetheine binding ACP domain類似検索 - ドメイン・相同性 alpha-maltose / DNA / DNA (> 10) / Maltodextrin-binding protein / Protein BRASSINAZOLE-RESISTANT 1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Serratia sp. (バクテリア)
![](img/tx_plant.gif) Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) synthetic construct (人工物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.95 Å |
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データ登録者 | Nosaki, S. / Tanokura, M. / Miyakawa, T. |
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資金援助 | 日本, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) | 17H05835, 19H04855, 19K23658, 21H02114 | 日本 | Japan Agency for Medical Research and Development (AMED) | JP20am0101077 | 日本 |
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引用 | ジャーナル: Nat.Plants / 年: 2022 タイトル: Brassinosteroid-induced gene repression requires specific and tight promoter binding of BIL1/BZR1 via DNA shape readout. 著者: Nosaki, S. / Mitsuda, N. / Sakamoto, S. / Kusubayashi, K. / Yamagami, A. / Xu, Y. / Bui, T.B.C. / Terada, T. / Miura, K. / Nakano, T. / Tanokura, M. / Miyakawa, T. |
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履歴 | 登録 | 2021年10月10日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2022年12月7日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2022年12月28日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title |
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改定 1.2 | 2023年1月11日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.3 | 2023年11月29日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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