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- PDB-7qnx: The receptor binding domain of SARS-CoV-2 spike glycoprotein in c... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 7qnx
タイトルThe receptor binding domain of SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with Beta-55 and EY6A Fabs
要素
  • Beta-55 heavy chain
  • Beta-55 light chain
  • EY6A heavy chain
  • EY6A light chain
  • Surface glycoprotein
キーワードVIRAL PROTEIN / SARS-CoV-2 / beta variant / Omicron variant / B.1.351 / B.1.1.529 / antibody / RBD / spike / neutralisation / VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
機能・相同性Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Surface glycoprotein
機能・相同性情報
生物種Homo sapiens (ヒト)
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (ウイルス)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.92 Å
データ登録者Zhou, D. / Ren, J. / Stuart, D.I.
資金援助 英国, 2件
組織認可番号国
CAMS Innovation Fund for Medical Sciences (CIFMS)2018-I2M-2-002 英国
Medical Research Council (MRC, United Kingdom)MR/N00065X/1 英国
引用
ジャーナル: Cell / 年: 2022
タイトル: SARS-CoV-2 Omicron-B.1.1.529 leads to widespread escape from neutralizing antibody responses.
著者: Dejnirattisai, W. / Huo, J. / Zhou, D. / Zahradnik, J. / Supasa, P. / Liu, C. / Duyvesteyn, H.M.E. / Ginn, H.M. / Mentzer, A.J. / Tuekprakhon, A. / Nutalai, R. / Wang, B. / Dijokaite, A. / ...著者: Dejnirattisai, W. / Huo, J. / Zhou, D. / Zahradnik, J. / Supasa, P. / Liu, C. / Duyvesteyn, H.M.E. / Ginn, H.M. / Mentzer, A.J. / Tuekprakhon, A. / Nutalai, R. / Wang, B. / Dijokaite, A. / Khan, S. / Avinoam, O. / Bahar, M. / Skelly, D. / Adele, S. / Johnson, S.A. / Amini, A. / Ritter, T.G. / Mason, C. / Dold, C. / Pan, D. / Assadi, S. / Bellass, A. / Omo-Dare, N. / Koeckerling, D. / Flaxman, A. / Jenkin, D. / Aley, P.K. / Voysey, M. / Costa Clemens, S.A. / Naveca, F.G. / Nascimento, V. / Nascimento, F. / Fernandes da Costa, C. / Resende, P.C. / Pauvolid-Correa, A. / Siqueira, M.M. / Baillie, V. / Serafin, N. / Kwatra, G. / Da Silva, K. / Madhi, S.A. / Nunes, M.C. / Malik, T. / Openshaw, P.J.M. / Baillie, J.K. / Semple, M.G. / Townsend, A.R. / Huang, K.A. / Tan, T.K. / Carroll, M.W. / Klenerman, P. / Barnes, E. / Dunachie, S.J. / Constantinides, B. / Webster, H. / Crook, D. / Pollard, A.J. / Lambe, T. / Paterson, N.G. / Williams, M.A. / Hall, D.R. / Fry, E.E. / Mongkolsapaya, J. / Ren, J. / Schreiber, G. / Stuart, D.I. / Screaton, G.R.
#1: ジャーナル: Biorxiv / 年: 2021
タイトル: Omicron-B.1.1.529 leads to widespread escape from neutralizing antibody responses.
著者: Dejnirattisai, W. / Huo, J. / Zhou, D. / Zahradnik, J. / Supasa, P. / Liu, C. / Duyvesteyn, H.M.E. / Ginn, H.M. / Mentzer, A.J. / Tuekprakhon, A. / Nutalai, R. / Wang, B. / Dijokaite, A. / ...著者: Dejnirattisai, W. / Huo, J. / Zhou, D. / Zahradnik, J. / Supasa, P. / Liu, C. / Duyvesteyn, H.M.E. / Ginn, H.M. / Mentzer, A.J. / Tuekprakhon, A. / Nutalai, R. / Wang, B. / Dijokaite, A. / Khan, S. / Avinoam, O. / Bahar, M. / Skelly, D. / Adele, S. / Johnson, S.A. / Amini, A. / Ritter, T. / Mason, C. / Dold, C. / Pan, D. / Assadi, S. / Bellass, A. / Omo-Dare, N. / Koeckerling, D. / Flaxman, A. / Jenkin, D. / Aley, P.K. / Voysey, M. / Costa Clemens, S.A. / Naveca, F.G. / Nascimento, V. / Nascimento, F. / Fernandes da Costa, C. / Resende, P.C. / Pauvolid-Correa, A. / Siqueira, M.M. / Baillie, V. / Serafin, N. / Ditse, Z. / Silva, K.D. / Madhi, S. / Nunes, M.C. / Malik, T. / Openshaw, P.J. / Baillie, J.K. / Semple, M.G. / Townsend, A.R. / Huang, K.A. / Tan, T.K. / Carroll, M.W. / Klenerman, P. / Barnes, E. / Dunachie, S.J. / Constantinides, B. / Webster, H. / Crook, D. / Pollard, A.J. / Lambe, T. / Paterson, N.G. / Williams, M.A. / Hall, D.R. / Fry, E.E. / Mongkolsapaya, J. / Ren, J. / Schreiber, G. / Stuart, D.I. / Screaton, G.R.
#2: ジャーナル: Biorxiv / 年: 2021
タイトル: Omicron-B.1.1.529 leads to widespread escape from neutralizing antibody responses.
著者: Dejnirattisai, W. / Huo, J. / Zhou, D. / Zahradnik, J. / Supasa, P. / Liu, C. / Duyvesteyn, H.M.E. / Ginn, H.M. / Mentzer, A.J. / Tuekprakhon, A. / Nutalai, R. / Wang, B. / Dijokaite, A. / ...著者: Dejnirattisai, W. / Huo, J. / Zhou, D. / Zahradnik, J. / Supasa, P. / Liu, C. / Duyvesteyn, H.M.E. / Ginn, H.M. / Mentzer, A.J. / Tuekprakhon, A. / Nutalai, R. / Wang, B. / Dijokaite, A. / Khan, S. / Avinoam, O. / Bahar, M. / Skelly, D. / Adele, S. / Johnson, S.A. / Amini, A. / Ritter, T. / Mason, C. / Dold, C. / Pan, D. / Assadi, S. / Bellass, A. / Omo-Dare, N. / Koeckerling, D. / Flaxman, A. / Jenkin, D. / Aley, P.K. / Voysey, M. / Costa Clemens, S.A. / Naveca, F.G. / Nascimento, V. / Nascimento, F. / Fernandes da Costa, C. / Resende, P.C. / Pauvolid-Correa, A. / Siqueira, M.M. / Baillie, V. / Serafin, N. / Ditse, Z. / Silva, K.D. / Madhi, S. / Nunes, M.C. / Malik, T. / Openshaw, P.J. / Baillie, J.K. / Semple, M.G. / Townsend, A.R. / Huang, K.A. / Tan, T.K. / Carroll, M.W. / Klenerman, P. / Barnes, E. / Dunachie, S.J. / Constantinides, B. / Webster, H. / Crook, D. / Pollard, A.J. / Lambe, T. / Paterson, N.G. / Williams, M.A. / Hall, D.R. / Fry, E.E. / Mongkolsapaya, J. / Ren, J. / Schreiber, G. / Stuart, D.I. / Screaton, G.R.
#3: ジャーナル: Cell(Cambridge,Mass.) / 年: 2022
タイトル: SARS-CoV-2 Omicron-B.1.1.529 leads to widespread escape from neutralizing antibody responses
著者: Dejnirattisai, W. / Huo, J. / Zhou, D. / Zahradnik, J. / Supasa, P. / Liu, C. / Duyvesteyn, H.M. / Ginn, H.M. / Mentzer, A.J. / Tuekprakhon, A. / Nutalai, R. / Wang, B. / Dijokaite, A. / ...著者: Dejnirattisai, W. / Huo, J. / Zhou, D. / Zahradnik, J. / Supasa, P. / Liu, C. / Duyvesteyn, H.M. / Ginn, H.M. / Mentzer, A.J. / Tuekprakhon, A. / Nutalai, R. / Wang, B. / Dijokaite, A. / Khan, S. / Avinoam, O. / Bahar, M. / Skelly, D. / Adele, S. / Johnson, S.A. / Amini, A. / Ritter, T. / Mason, C. / Dold, C. / Pan, D. / Assadi, S. / Bellass, A. / Omo-Dare, N. / Koeckerling, D. / Flaxman, A. / Jenkin, D. / Aley, P.K. / Voysey, M. / Naveca, F.G. / Nascimento, V. / Nascimento, F. / Resende, P.C. / Pauvolid-Correa, A. / Siqueira, M.M. / Baillie, V. / Serafin, N. / Kwatra, G. / Madhi, S.A. / Nunes, M.C. / Malik, T. / Openshaw, P.J. / Baillie, J.K. / Semple, M.G. / Townsend, A.R. / Huang, K.Y.A. / Tan, T.K. / Carroll, M.W. / Klenerman, P. / Barnes, E. / Dunachie, S.J. / Constantinides, B. / Webster, H. / Crook, D. / Pollard, A.J. / Lambe, T. / Paterson, N.G. / Williams, M.A. / Hall, D.R. / Fry, E.E. / Mongkolsapaya, J. / Ren, J. / Schreiber, G. / Stuart, D.I. / Screaton, G.R.
履歴
登録2021年12月23日登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.02022年1月19日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12022年2月2日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author
改定 1.22022年10月26日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author
改定 1.32024年1月31日Group: Data collection / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
改定 1.42024年11月20日Group: Structure summary
カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature
Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
H: EY6A heavy chain
L: EY6A light chain
A: Beta-55 heavy chain
B: Beta-55 light chain
E: Surface glycoprotein
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)119,3376
ポリマ－118,9135
非ポリマー4241
水00
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者が定義した集合体
  • 根拠: homology
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
単位格子
Length a, b, c (Å)131.772, 131.772, 116.837
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number154
Space group name H-MP3221
Space group name HallP322"
Symmetry operation#1: x,y,z
#2: -y,x-y,z+2/3
#3: -x+y,-x,z+1/3
#4: x-y,-y,-z+1/3
#5: -x,-x+y,-z+2/3
#6: y,x,-z

-
要素

-
抗体 , 4種, 4分子 HLAB

#1: 抗体 EY6A heavy chain


分子量: 24346.273 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#2: 抗体 EY6A light chain


分子量: 23315.855 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#3: 抗体 Beta-55 heavy chain


分子量: 24895.922 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#4: 抗体 Beta-55 light chain


分子量: 23491.174 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)

-
タンパク質 / 糖 , 2種, 2分子 E

#5: タンパク質 Surface glycoprotein


分子量: 22863.623 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (ウイルス)
発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: A0A894R379
#6: 多糖 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose


タイプ: oligosaccharide / 分子量: 424.401 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
記述子タイププログラム
DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-Glycam Condensed SequenceGMML 1.0
WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1WURCSPDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}LINUCSPDB-CARE

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかN
Has protein modificationY

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.46 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.05 %
結晶化温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法
詳細: 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, pH 6.7 and 30% (w/v) PEG 3000

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: Diamond / ビームライン: I03 / 波長: 0.9763 Å
検出器タイプ: DECTRIS EIGER2 XE 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2021年12月15日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.9763 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.92→82 Å / Num. obs: 25801 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 20.5 % / Biso Wilson estimate: 69.2 Å2 / CC1/2: 0.986 / Rmerge(I) obs: 0.554 / Rpim(I) all: 0.125 / Net I/σ(I): 3.8
反射 シェル解像度: 2.92→2.97 Å / Mean I/σ(I) obs: 0.5 / Num. unique obs: 1228 / CC1/2: 0.311 / Rpim(I) all: 0.902

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
GDA1.19_4092データ収集
PHENIX1.19_4092精密化
xia2データ削減
xia2データスケーリング
PHASER位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 7NX8

7nx8


解像度: 2.92→81.64 Å / SU ML: 0.6181 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 30.7349
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2663 1236 4.8 %
Rwork0.2286 24493 -
obs0.2304 25729 99.65 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL
原子変位パラメータBiso mean: 74.98 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.92→81.64 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数8097 0 28 0 8125
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.00178326
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.476711334
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.04161268
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.00421445
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d10.92212966
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
2.92-3.040.39931310.37732621X-RAY DIFFRACTION97.18
3.04-3.180.42461410.35012671X-RAY DIFFRACTION100
3.18-3.340.3791200.31072717X-RAY DIFFRACTION99.89
3.34-3.550.32771530.28442701X-RAY DIFFRACTION99.89
3.55-3.830.25871300.24872708X-RAY DIFFRACTION100
3.83-4.210.25331310.22652724X-RAY DIFFRACTION99.96
4.21-4.820.20391630.1812702X-RAY DIFFRACTION100
4.82-6.080.24651250.18632782X-RAY DIFFRACTION100
6.08-81.640.22481420.17982867X-RAY DIFFRACTION99.87
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
14.954813048861.608204177060.02650595309144.129105384850.241071108072.52095560942-0.001303611644020.455359093741-0.225177509172-0.1744028518420.2402225181280.6047995176680.521823953632-0.0410414308251-0.165265773090.52991559474-0.00379305618471-0.02522158761470.559544371467-0.0285077842430.629154389859-46.2601455529-50.154101325222.3846217697
24.143137263782.024132190480.4047005013053.55123374026-1.141938112371.38782533934-0.03746734222770.1480160726390.810328329644-0.5600078873470.02197350461380.6720761702790.00418387165628-0.131111983122-0.1056909888430.7494603124630.0867091420862-0.02665669511310.7807277665090.007995021279180.602378758732-48.4659656799-41.504511835620.6902246757
33.698979691611.666736068641.072923883284.488022591180.4645233030922.181384157130.4247839168080.338876498035-0.0443155212419-0.1493688481220.067268255820.0306514597158-0.127855426976-0.224474911557-0.2057563718880.4650731360550.01938502119660.06320742290310.6706261127950.01643273387780.678988458924-42.051299158-46.707204011725.101382616
40.288885352317-1.20284478621-0.3097725808816.22695396826-0.6103650169814.23850566672-0.05172664107460.443420071602-0.306726928375-0.165684865977-0.014034176021-0.07668264254590.182698585386-0.3484176984910.1761997402040.580821300629-0.1344304997010.03161768600870.896207242188-0.1345288901370.846331126825-25.5010461357-71.109314217213.307201114
54.53583697731-2.97463990127-0.6819049752553.076081495781.544463304632.63693202107-0.296517538237-0.21165749847-0.2520310434650.1566015058050.340817708382-0.1857679670540.6330729514970.035626719597-0.2881579039210.746475192351-0.04566091116250.08396268267420.640816568006-0.047388393930.855548945272-21.606532004-73.64368834519.5295250012
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精密化 TLSグループ

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDLabel asym-IDAuth seq-IDLabel seq-ID
11chain 'H' and (resid 1 through 44 )HA1 - 441 - 44
22chain 'H' and (resid 45 through 83 )HA45 - 8345 - 83
33chain 'H' and (resid 84 through 119 )HA84 - 11984 - 119
44chain 'H' and (resid 120 through 165 )HA120 - 165120 - 159
55chain 'H' and (resid 166 through 202 )HA166 - 202160 - 196
66chain 'H' and (resid 203 through 221 )HA203 - 221197 - 215
77chain 'L' and (resid 1 through 18 )LB1 - 181 - 18
88chain 'L' and (resid 19 through 38 )LB19 - 3819 - 38
99chain 'L' and (resid 39 through 75 )LB39 - 7539 - 75
1010chain 'L' and (resid 76 through 103 )LB76 - 10376 - 103
1111chain 'L' and (resid 104 through 114 )LB104 - 114104 - 114
1212chain 'L' and (resid 115 through 151 )LB115 - 151115 - 151
1313chain 'L' and (resid 152 through 175 )LB152 - 175152 - 175
1414chain 'L' and (resid 176 through 191 )LB176 - 191176 - 191
1515chain 'L' and (resid 192 through 212 )LB192 - 212192 - 212
1616chain 'A' and (resid 1 through 35 )AC1 - 351 - 35
1717chain 'A' and (resid 36 through 148 )AC36 - 14836 - 148
1818chain 'A' and (resid 149 through 228 )AC149 - 228149 - 228
1919chain 'B' and (resid 1 through 25 )BD1 - 251 - 25
2020chain 'B' and (resid 26 through 38 )BD26 - 3826 - 38
2121chain 'B' and (resid 39 through 61 )BD39 - 6139 - 61
2222chain 'B' and (resid 62 through 75 )BD62 - 7562 - 75
2323chain 'B' and (resid 76 through 102 )BD76 - 10276 - 102
2424chain 'B' and (resid 103 through 114 )BD103 - 114103 - 114
2525chain 'B' and (resid 115 through 151 )BD115 - 151115 - 151
2626chain 'B' and (resid 152 through 198 )BD152 - 198152 - 198
2727chain 'B' and (resid 199 through 214 )BD199 - 214199 - 214
2828chain 'E' and (resid 333 through 373 )EE333 - 3731 - 41
2929chain 'E' and (resid 374 through 394 )EE374 - 39442 - 62
3030chain 'E' and (resid 395 through 479 )EE395 - 47963 - 147
3131chain 'E' and (resid 480 through 517 )EE480 - 517148 - 185

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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