登録情報 | データベース: PDB / ID: 7qbu |
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タイトル | B12-dependent radical SAM methyltransferase, Mmp10 with [4Fe-4S] cluster, cobalamin, and S-methyl-5'-thioadenosine bound. |
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要素 | Methyl coenzyme M reductase-arginine methyltransferase Mmp10 |
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キーワード | METAL BINDING PROTEIN / Radical SAM / B12 binding / methyltransferase / sp3 carbon methylation |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
iron-sulfur cluster binding / 転移酵素; 一炭素原子の基を移すもの; メチル基を移すもの / methyltransferase activity / methylation / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Radical SAM methyltransferase MA_4551-like / Putative radical SAM, N-terminal / Radical SAM-like domain / Radical SAM core domain profile. / Radical SAM / Aldolase-type TIM barrel類似検索 - ドメイン・相同性 CO-METHYLCOBALAMIN / : / 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / IRON/SULFUR CLUSTER / Methyl coenzyme M reductase-arginine methyltransferase Mmp10類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Methanosarcina acetivorans (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.298 Å |
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データ登録者 | Fyfe, C.D. / Chavas, L.M.G. / Legrand, P. / Benjdia, A. / Berteau, O. |
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資金援助 | フランス, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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European Research Council (ERC) | 617053 | フランス | Agence Nationale de la Recherche (ANR) | ANR-17-CE11-0014 | フランス |
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引用 | ジャーナル: Nature / 年: 2022 タイトル: Crystallographic snapshots of a B 12 -dependent radical SAM methyltransferase. 著者: Fyfe, C.D. / Bernardo-Garcia, N. / Fradale, L. / Grimaldi, S. / Guillot, A. / Brewee, C. / Chavas, L.M.G. / Legrand, P. / Benjdia, A. / Berteau, O. |
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履歴 | 登録 | 2021年11月19日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2022年2月2日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2022年2月16日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.2 | 2022年2月23日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2024年1月31日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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