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Yorodumi- PDB-7q14: Acetyllysine73-incorporated OXA-48 complexed with imipenem and br... -
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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 7q14 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Acetyllysine73-incorporated OXA-48 complexed with imipenem and bromide ions in both active and inactive acyl-enzyme intermediates | |||||||||
Components | Beta-lactamase | |||||||||
Keywords | HYDROLASE / OXA / Imipenem / K73ALY | |||||||||
| Function / homology | Function and homology informationpenicillin binding / antibiotic catabolic process / cell wall organization / beta-lactamase activity / beta-lactamase / response to antibiotic / plasma membrane Similarity search - Function | |||||||||
| Biological species | Klebsiella pneumoniae (bacteria) | |||||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.15 Å | |||||||||
Authors | Zhou, Q. / He, Y. / Jin, Y. | |||||||||
| Funding support | China, 1items
| |||||||||
Citation | Journal: Acs Cent.Sci. / Year: 2023Title: An Ion-Pair Induced Intermediate Complex Captured in Class D Carbapenemase Reveals Chloride Ion as a Janus Effector Modulating Activity Authors: Zhou, Q. / Catalan, P. / Bell, H. / Baumann, P. / Cooke, R. / Evans, R. / Yang, J. / Zhang, Z. / Zappala, D. / Zhang, Y. / Blackburn, G.M. / He, Y. / Jin, Y. | |||||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 7q14.cif.gz | 785 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb7q14.ent.gz | Display | PDB format | |
| PDBx/mmJSON format | 7q14.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 7q14_validation.pdf.gz | 9.5 MB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 7q14_full_validation.pdf.gz | 10.1 MB | Display | |
| Data in XML | 7q14_validation.xml.gz | 89.2 KB | Display | |
| Data in CIF | 7q14_validation.cif.gz | 110.1 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/q1/7q14 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/q1/7q14 | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 7nrjC ![]() 7o5nC ![]() 7o5tC ![]() 7o9nC ![]() 7pehC ![]() 7peiC ![]() 7pepC ![]() 7pfnC ![]() 7pgoC ![]() 7pseC ![]() 7psfC ![]() 4s2pS S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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| Similar structure data | Similarity search - Function & homology F&H Search |
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Links
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
|
Movie
Controller
Components
About Yorodumi



Klebsiella pneumoniae (bacteria)
X-RAY DIFFRACTION
China, 1items
Citation











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