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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7nbk | |||||||||||||||||||||||||||||||
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タイトル | Solution structure of DNA duplex containing a 2'-deoxy-2'2'-difluorodeoxycytidine (gemcitabine) modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / Fluorine modification / modified DNA / gemcitabine | 機能・相同性 | DNA | ![]() 生物種 | synthetic construct (人工物) | 手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ![]() Cabrero, C. / Martin-Pintado, N. / Mazzini, S. / Gargallo, R. / Eritja, R. / Avino, A. / Gonzalez, C. | 資金援助 | | ![]()
![]() ![]() タイトル: Structural Effects of Incorporation of 2 -Deoxy-2 2 -difluorodeoxycytidine (Gemcitabine) in A- and B-form Duplexes. 著者: Cabrero, C. / Martin-Pintado, N. / Mazzini, S. / Gargallo, R. / Eritja, R. / Avino, A. / Gonzalez, C. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 81.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 51.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 325.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 377.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7nblC ![]() 7nejC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 1845.198 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物) 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: fewest violations | ||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: all calculated structures submitted 計算したコンフォーマーの数: 10 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |