温度: 283 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 詳細: 0.02 M phosphate buffer pH 7.5, 27% PEG 8000, 100 mM NaCl
-
データ収集
回折
平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源
由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU MICROMAX-007 / 波長: 1.54187 Å
検出器
タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2011年10月17日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54187 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.939→70.47 Å / Num. obs: 25162 / % possible obs: 96.4 % / 冗長度: 7.4 % / Rpim(I) all: 0.024 / Rrim(I) all: 0.066 / Rsym value: 0.062 / Net I/av σ(I): 9.2 / Net I/σ(I): 21.6
反射 シェル
Diffraction-ID: 1
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Mean I/σ(I) obs
Num. unique obs
Rpim(I) all
Rrim(I) all
Rsym value
% possible all
1.939-2.03
7.1
0.304
2.5
3104
0.121
0.328
0.304
82.5
2.03-2.15
7.4
0.202
3.8
3512
0.079
0.218
0.202
97.6
2.15-2.3
7.4
0.148
5.2
3311
0.058
0.159
0.148
97.9
2.3-2.49
7.4
0.121
6.3
3103
0.047
0.13
0.121
98.5
2.49-2.73
7.4
0.092
8.1
2837
0.036
0.099
0.092
98.9
2.73-3.05
7.4
0.064
11.5
2614
0.025
0.069
0.064
99.3
3.05-3.52
7.5
0.043
16
2321
0.017
0.046
0.043
99.6
3.52-4.31
7.5
0.037
17.3
1955
0.014
0.039
0.037
99.8
4.31-6.09
7.4
0.033
18.6
1542
0.013
0.036
0.033
100
6.09-43.012
7.3
0.032
8.7
863
0.014
0.035
0.032
99.8
-
位相決定
位相決定
手法: 分子置換
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
MOSFLM
データ削減
SCALA
3.3.16
データスケーリング
PHASER
位相決定
REFMAC
5.8.0158
精密化
PDB_EXTRACT
3.25
データ抽出
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: Inhouse 解像度: 1.94→70.47 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.962 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.939 / SU B: 5.135 / SU ML: 0.08 / SU R Cruickshank DPI: 0.135 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.135 / ESU R Free: 0.126 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : WITH TLS ADDED
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.1902
1270
5 %
RANDOM
Rwork
0.1518
-
-
-
obs
0.1538
23885
97.86 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK