登録情報 データベース : PDB / ID : 6z2q 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of wild type OgpA from Akkermansia muciniphila in complex with an O-glycopeptide (GalGalNAc-TS) product 要素Glycodrosocin O-glycan protease 詳細キーワード HYDROLASE / O-glycan endopeptidase / mucins / OgpA. metalloprotease機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 構成要素
positive regulation of biosynthetic process of antibacterial peptides active against Gram-negative bacteria / defense response to insect / response to bacterium / defense response / antibacterial humoral response / defense response to Gram-negative bacterium / defense response to Gram-positive bacterium / defense response to bacterium / innate immune response / extracellular region / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 Thomsen-Friedenreich antigen / ACETIC ACID / Peptidase M43 pregnancy-associated plasma-A domain-containing protein / Drosocin antimicrobial peptides 類似検索 - 構成要素生物種 Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 (バクテリア)synthetic construct (人工物) 手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.347 Å 詳細データ登録者 Trastoy, B. / Naegali, A. / Anso, I. / Sjogren, J. / Guerin, M.E. 引用ジャーナル : Nat Commun / 年 : 2020タイトル : Structural basis of mammalian mucin processing by the human gut O-glycopeptidase OgpA from Akkermansia muciniphila.著者 : Trastoy, B. / Naegeli, A. / Anso, I. / Sjogren, J. / Guerin, M.E. 履歴 登録 2020年5月18日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2020年9月30日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2021年11月3日 Group : Data collection / Database referencesカテゴリ : citation / citation_author ... citation / citation_author / database_2 / diffrn_source / pdbx_database_proc Item : _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title ... _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site 改定 1.2 2021年11月10日 Group : Data collection / Database references / カテゴリ : citation / pdbx_database_procItem : _citation.journal_volume / _citation.page_first ... _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title 改定 1.3 2024年1月24日 Group : Data collection / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / diffrn_source / pdbx_initial_refinement_model Item : _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site
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