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Yorodumi- PDB-6u49: Structure-based discovery of a novel small-molecule inhibitor of ... -
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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 6u49 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Structure-based discovery of a novel small-molecule inhibitor of methicillin-resistant S. aureus | ||||||
Components | Alpha-hemolysin | ||||||
Keywords | TOXIN / alpha-toxin / PVL / Leukocidins / MRSA | ||||||
| Function / homology | Function and homology informationcytolysis in another organism / The NLRP3 inflammasome / Purinergic signaling in leishmaniasis infection / toxin activity / extracellular region / identical protein binding Similarity search - Function | ||||||
| Biological species | ![]() | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.35 Å | ||||||
Authors | Liu, J. / Kozhaya, L. / Torres, V.J. / Unutmaz, D. / Lu, M. | ||||||
| Funding support | United States, 1items
| ||||||
Citation | Journal: J.Biol.Chem. / Year: 2020Title: Structure-based discovery of a small-molecule inhibitor of methicillin-resistantStaphylococcus aureusvirulence. Authors: Liu, J. / Kozhaya, L. / Torres, V.J. / Unutmaz, D. / Lu, M. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 6u49.cif.gz | 849 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb6u49.ent.gz | 710.3 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 6u49.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 6u49_validation.pdf.gz | 792.8 KB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 6u49_full_validation.pdf.gz | 816.2 KB | Display | |
| Data in XML | 6u49_validation.xml.gz | 4 KB | Display | |
| Data in CIF | 6u49_validation.cif.gz | 27.8 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u4/6u49 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u4/6u49 | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 6u2sC ![]() 6u33C ![]() 6u3fC ![]() 6u3tC ![]() 6u3yC ![]() 6u4pC ![]() 7ahlS C: citing same article ( S: Starting model for refinement |
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| Similar structure data |
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Links
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Beg auth comp-ID: ALA / Beg label comp-ID: ALA / End auth comp-ID: ASN / End label comp-ID: ASN / Refine code: _ / Auth seq-ID: 1 - 293 / Label seq-ID: 1 - 293
|
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Controller
Components
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X-RAY DIFFRACTION
United States, 1items
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