登録情報 | データベース: PDB / ID: 6u05 |
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タイトル | Crystal Structure of Fungal RNA Kinase |
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要素 | tRNA ligase |
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キーワード | TRANSFERASE / RNA ligase / RNA repair / polynucleotide kinase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
GTP-dependent polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity / RNA ligase (ATP) / RNA ligase (ATP) activity / tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation / phosphoric diester hydrolase activity / endonuclease activity / ATP binding / nucleus類似検索 - 分子機能 tRNA ligase Trl1, fungi / tRNA ligase, phosphodiesterase / tRNA ligase, kinase domain, fungi / Fungal tRNA ligase phosphodiesterase domain / tRNA ligase kinase domain / T4 RNA ligase 1, N-terminal / RNA ligase / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase類似検索 - ドメイン・相同性 GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / PHOSPHATE ION / tRNA ligase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Candida albicans (酵母) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.948 Å |
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データ登録者 | Shuman, S. / Goldgur, Y. / Banerjee, A. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM42498 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2019 タイトル: Atomic structures of the RNA end-healing 5'-OH kinase and 2',3'-cyclic phosphodiesterase domains of fungal tRNA ligase: conformational switches in the kinase upon binding of the GTP phosphate donor. 著者: Banerjee, A. / Goldgur, Y. / Schwer, B. / Shuman, S. |
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履歴 | 登録 | 2019年8月13日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2019年11月6日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2019年11月27日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.2 | 2019年12月25日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2020年1月1日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.4 | 2023年10月11日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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