PDB-6s5p: Cfucosylated peptide SBL2 bound to Fucose binding Lectin LecB (PA...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6s5p

タイトル

Cfucosylated peptide SBL2 bound to Fucose binding Lectin LecB (PA-IIL) from Pseudomonas aeruginosa at 1.46 Angstrom resolution

要素

Fucose-binding lectin
SBL2

キーワード

SUGAR BINDING PROTEIN / Lectin / Fucosylated

機能・相同性

機能・相同性情報

single-species biofilm formation / carbohydrate binding / metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌)
synthetic construct (人工物)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.46 Å

データ登録者

Baeriswyl, S. / Stocker, A. / Reymond, J.-L.

資金援助

スイス, 1件

引用

ジャーナル: Acs Chem.Biol. / 年: 2019
タイトル: X-ray Crystal Structures of Short Antimicrobial Peptides as Pseudomonas aeruginosa Lectin B Complexes.
著者: Baeriswyl, S. / Gan, B.H. / Siriwardena, T.N. / Visini, R. / Robadey, M. / Javor, S. / Stocker, A. / Darbre, T. / Reymond, J.L.

履歴

登録	2019年7月2日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2019年8月21日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2019年8月28日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author
改定 1.2	2020年7月29日	Group: Data collection / Derived calculations カテゴリ: chem_comp / pdbx_struct_conn_angle ...chem_comp / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.type / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id ..._chem_comp.type / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.3	2024年1月24日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6s5p.cif.gz	262.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6s5p.ent.gz	216.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6s5p.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/s5/6s5p ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/s5/6s5p	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6q6wC 6q6xC 6q77C 6q79C 6q85C 6q86C 6q87C 6q8dC 6q8gC 6q8hC 1oxcS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1our-1 2jdm-d 1ovp-1 2vuc-d 5ney-d 5a6x-d 2vud-d 3dcq-d 5nes-d 1ovs-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Fucose-binding lectin

B: Fucose-binding lectin

C: Fucose-binding lectin

D: Fucose-binding lectin

H: SBL2

E: SBL2

F: SBL2

ヘテロ分子

50.4 kDa, 7 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
ソフトウェアが定義した集合体
根拠: mass spectrometry

単位格子

Length a, b, c (Å)	123.099, 56.264, 70.498
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	18
Space group name H-M	P2₁2₁2

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	D-454- HOH

#1: タンパク質	Fucose-binding lectin / Fucose-binding lectin II (PA-IIL) / Fucose-binding lectin PA-IIL 分子量: 11865.905 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現詳細: Fucose binding lectin LecB (PA-LII) from Pseudomonas aeruginosa 由来: (組換発現) Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌) 遺伝子: lecB, C0044_25260, CAZ10_21840, DT376_00595, DY979_15445, ECC04_10105, EFK27_13700, EGV95_09240, EGY23_15550, IPC669_23070, PA5486_01888, PAERUG_E15_London_28_01_14_00983, PAMH19_1713, RW109_RW109_02453 発現宿主: Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' (大腸菌) 参照: UniProt: A0A069Q9V4, UniProt: Q9HYN5*PLUS
#2: タンパク質・ペプチド	SBL2 分子量: 590.759 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: SBL2 N-terminally fucosylated peptide linker / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)
#3: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#4: 糖	ChemComp-ZDC / 3,7-anhydro-2,8-dideoxy-L-glycero-D-gluco-octonic acid タイプ: D-saccharide / 分子量: 206.193 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₄O₆ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 411 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.56 Å³/Da / 溶媒含有率: 51.94 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 0.2 M Ammonium phosphate monobasic, 0.1 M Tris pH 8.5, 50% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol

-
データ収集

回折	平均測定温度: 80 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06DA / 波長: 1.000033 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 2M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2018年7月5日
放射	プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.000033 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.46→46.365 Å / Num. obs: 164044 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 6.7 % / B_iso Wilson estimate: 23.4 Å² / CC_1/2: 0.998 / R_rim(I) all: 0.168 / Net I/σ(I): 9.95
反射シェル	解像度: 1.46→1.467 Å / 冗長度: 6.4 % / Mean I/σ(I) obs: 1.04 / Num. unique obs: 26246 / CC_1/2: 0.529 / R_rim(I) all: 1.801 / % possible all: 98.7

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

	最高解像度	最低解像度
Rotation	2.63 Å	46.37 Å
Translation	2.63 Å	46.37 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHASER	2.8.1	位相決定
PHENIX	1.11.1_2575	精密化
PDB_EXTRACT	3.25	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1OXC

1oxc

解像度: 1.46→46.365 Å / SU ML: 0.2 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.25 / 位相誤差: 23.37 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.1944	8222	5.02 %
R_work	0.1766	155666	-
obs	0.1775	163888	99.7 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 88.29 Å² / B_iso mean: 23.7699 Å² / B_iso min: 12.86 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.46→46.365 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3340	0	118	411	3869
B_iso mean	-	-	30.36	33.94	-
残基数	-	-	-	-	464

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.014	3435
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.914	4703
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.093	600
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	622
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	18.714	1131

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
1.4599-1.4765	0.4184	258	0.4078	4946	5204	94
1.4765-1.4939	0.3889	271	0.3914	5150	5421	100
1.4939-1.5121	0.3807	279	0.368	5207	5486	100
1.5121-1.5312	0.3652	274	0.3382	5220	5494	100
1.5312-1.5514	0.3167	274	0.3116	5174	5448	100
1.5514-1.5726	0.3128	280	0.3089	5215	5495	100
1.5726-1.5951	0.3135	272	0.2826	5164	5436	100
1.5951-1.6189	0.286	274	0.2827	5212	5486	100
1.6189-1.6442	0.2796	272	0.2719	5207	5479	100
1.6442-1.6712	0.2771	279	0.2682	5218	5497	100
1.6712-1.7	0.277	269	0.2517	5159	5428	100
1.7-1.7309	0.2736	278	0.2377	5215	5493	100
1.7309-1.7642	0.2496	276	0.2269	5216	5492	100
1.7642-1.8002	0.2388	280	0.217	5175	5455	100
1.8002-1.8394	0.2211	275	0.2067	5204	5479	100
1.8394-1.8822	0.2247	271	0.1976	5202	5473	100
1.8822-1.9292	0.1834	278	0.1768	5192	5470	100
1.9292-1.9814	0.2121	276	0.1639	5173	5449	100
1.9814-2.0397	0.1589	272	0.1621	5180	5452	100
2.0397-2.1055	0.1933	272	0.1645	5231	5503	100
2.1055-2.1808	0.196	273	0.1652	5194	5467	100
2.1808-2.2681	0.1655	268	0.1456	5195	5463	100
2.2681-2.3713	0.1623	280	0.1422	5209	5489	100
2.3713-2.4963	0.1422	279	0.1374	5171	5450	100
2.4963-2.6527	0.1464	276	0.1364	5213	5489	100
2.6527-2.8575	0.1398	273	0.1306	5184	5457	100
2.8575-3.145	0.1761	276	0.1299	5220	5496	100
3.145-3.6	0.1466	274	0.1269	5200	5474	100
3.6-4.535	0.167	267	0.1381	5211	5478	100
4.535-46.3885	0.1855	276	0.19	5209	5485	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.2951	0.1566	0.0155	0.9888	-0.4044	0.8909	0.0118	0.0127	0.0214	-0.1412	-0.0187	-0.0004	0.0952	-0.025	0.0069	0.2774	0.0044	0.0023	0.1576	-0.0053	0.1628	-29.7465	8.6715	-29.4385
2	0.2718	0.3031	-0.4208	1.7582	-0.9719	1.0121	-0.0147	0.0726	0.0242	-0.246	0.0204	-0.0003	0.0975	-0.0622	-0.0052	0.3116	-0.0114	-0.0166	0.1697	-0.0076	0.157	-28.5881	11.3541	-33.4898
3	5.2871	1.4321	5.3843	3.06	2.608	5.9685	0.2942	-0.2216	-0.364	-0.0557	-0.2013	0.6675	0.3613	-0.3937	0.0911	0.277	-0.0037	-0.0226	0.1821	-0.0117	0.2166	-42.5337	4.4824	-24.528
4	0.4072	0.3698	0.0939	0.5682	0.0846	0.21	0.0268	-0.0185	0.0806	-0.0098	-0.0106	0.0374	-0.0107	-0.0127	-0.0136	0.271	0.0022	0.002	0.1548	0	0.1671	-26.1698	12.9555	-22.1128
5	4.5977	4.7264	-2.1415	6.1364	-2.2687	1.6583	0.0807	-0.1579	-0.0208	0.0759	-0.1158	-0.1462	-0.0034	0.0251	0.0293	0.2572	0.0099	0.0012	0.1543	-0.0048	0.1867	-13.9773	9.2809	-8.605
6	0.9107	-0.1478	-0.9147	1.2479	-0.4817	5.6681	-0.0349	0.0316	-0.1198	-0.0383	-0.0096	-0.1473	0.3106	0.2395	0.0677	0.2517	0.0185	0.0059	0.1131	-0.0138	0.1968	-10.2595	2.9154	-22.4981
7	0.9818	0.5432	-2.9946	1.4649	-0.6928	9.9027	-0.1495	-0.1271	-0.1727	-0.1155	-0.0852	-0.1472	0.7804	0.2881	0.2423	0.2888	0.0188	0.0105	0.1505	0.0016	0.2057	-16.113	-1.4099	-19.3207
8	4.5534	1.3708	-4.589	0.6134	-0.6217	7.2008	0.0196	-0.4333	-0.1135	0.1085	-0.1098	-0.1564	0.0004	0.4501	0.0795	0.3084	0.0244	-0.0108	0.1926	0.0146	0.2124	-9.5535	5.1647	-10.7866
9	5.354	-5.4532	-1.5114	6.3149	3.0484	3.3905	0.3159	0.5975	0.3503	-0.7311	-0.055	-1.2148	0.3521	0.6243	-0.3262	0.333	0.0586	0.0941	0.2581	-0.0241	0.341	1.7933	7.88	-24.9315
10	1.1848	-0.7889	-0.5204	0.9787	0.6393	0.7443	0.0331	-0.0046	0.0358	-0.0555	-0.0082	-0.1072	-0.0253	0.0441	-0.0136	0.2463	0.0068	0.0112	0.1494	-0.0037	0.1785	-14.3067	14.4894	-20.4189
11	2.7181	1.233	-2.5629	0.716	-1.2862	2.505	-0.0718	0.0048	0.0449	-0.1967	0.0827	0.0288	0.1674	0.0036	0.0111	0.2489	0.0061	0.0107	0.1373	-0.0045	0.1638	-20.3898	5.9932	-16.8724
12	3.8243	0.814	3.9234	0.3301	1.3107	5.9866	0.0071	-0.0533	-0.176	-0.0193	0.0371	-0.0356	0.0082	-0.0521	-0.0477	0.2685	0.005	0.0209	0.1406	0.0014	0.169	-28.8642	19.1377	-3.418
13	2.4513	-2.1429	1.4213	3.5521	-2.692	2.1609	-0.0493	-0.0427	0.1987	0.0989	-0.0691	-0.0996	-0.1823	-0.0645	0.1957	0.2985	0.0144	0.0234	0.1325	-0.023	0.1713	-29.882	34.7097	-7.749
14	0.0377	0.3594	-0.4076	2.2009	-2.5594	3.2618	0.0103	-0.0229	-0.0027	0.2579	0.064	0.278	-0.1766	-0.1107	-0.1447	0.302	0.0232	0.0181	0.1664	0.004	0.2048	-35.5975	30.4785	-0.9693
15	3.8169	-2.5157	-0.2767	2.4947	1.0128	1.9569	-0.0107	0.1636	0.4308	-0.1799	0.0518	-0.069	-0.3898	0.0228	-0.1216	0.3295	0.0047	0.0068	0.1479	0.0055	0.2083	-31.5081	42.5485	-14.7715
16	1.3991	-2.5557	3.5088	4.7169	-6.3717	8.679	-0.0136	-0.0741	-0.0099	0.5024	0.0807	0.3012	-0.53	-0.0038	-0.0601	0.2961	0.0142	0.0163	0.1571	-0.0146	0.1711	-26.8894	33.962	-0.5581
17	3.3967	-2.5477	5.0832	3.7637	-4.7185	8.0626	0.0516	-0.2327	-0.0973	-0.0073	0.132	0.1918	0.0823	-0.3084	-0.3286	0.271	0.017	0.0327	0.1729	0.0065	0.1882	-33.3515	23.1268	-1.1436
18	4.2325	4.1866	1.682	4.319	1.3575	1.8043	0.1476	0.0617	0.6548	0.6365	-0.0951	1.4347	-0.4896	-0.5164	-0.0646	0.3278	0.0386	0.0721	0.1894	-0.0007	0.3416	-44.7368	32.718	-10.7063
19	1.8147	-0.8372	0.0269	1.0492	-0.0499	0.1468	-0.0818	-0.007	-0.0137	0.055	0.0574	0.0494	-0.1009	0.005	0.0313	0.2419	0.0063	0.0117	0.1437	0.0008	0.1621	-24.697	22.9797	-11.3675
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22	5.7314	-3.9215	2.9611	5.4276	-2.5718	2.4965	0.0905	0.1599	0.0291	-0.2892	-0.0682	-0.0967	0.1882	0.0266	-0.0299	0.2714	-0.0097	0.0171	0.1533	0.0072	0.1538	-15.1183	31.3104	-24.8667
23	1.3083	0.2256	1.7277	0.8603	-0.2293	7.0212	0.0122	0.0039	0.1568	-0.0935	-0.0116	0.028	-0.1438	0.2377	0.0253	0.2814	-0.0041	0.0224	0.1079	-0.0144	0.1972	-13.1408	37.8833	-13.3867
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25	9.1477	1.6456	6.0416	6.312	1.5515	4.0443	0.1102	-0.3731	0.1592	0.5247	0.0539	0.185	-0.0868	-0.1279	-0.1407	0.2853	-0.024	0.0494	0.1987	-0.0293	0.1775	-15.0184	36.086	0.8572
26	2.299	-0.6237	2.6321	1.2483	-0.2	3.6402	-0.1072	0.0207	0.208	-0.1043	-0.0038	-0.0294	-0.7902	0.2171	0.3003	0.3085	-0.0055	0.0101	0.1206	-0.0073	0.2067	-19.1803	42.0425	-14.7919
27	4.8075	-0.9315	4.79	0.1943	-0.861	6.4162	-0.0758	0.3244	0.2835	-0.1544	-0.1333	-0.1127	0.1216	0.3263	0.3228	0.2976	-0.0229	0.0266	0.167	0.031	0.1994	-11.3961	36.0567	-22.6647
28	8.6882	5.9148	3.1449	5.1324	4.5775	6.5444	0.3462	-0.0946	-0.2225	0.8264	-0.0578	-0.3625	0.327	-0.0047	-0.2509	0.2659	-0.0019	-0.0177	0.1323	0.0101	0.2145	-0.5338	34.8993	-8.0242
29	0.34	0.1649	-0.0307	0.1163	0.0518	0.2718	0.0151	-0.029	0.0291	-0.045	-0.0041	-0.0061	-0.0676	-0.0059	-0.0005	0.2448	0.001	0.0069	0.1405	-0.0015	0.1731	-17.1472	28.4182	-13.9995

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 1 through 48 )	A	1 - 48
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 49 through 68 )	A	49 - 68
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 69 through 74 )	A	69 - 74
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 75 through 114 )	A	75 - 114
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 1 through 12 )	B	1 - 12
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 13 through 48 )	B	13 - 48
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 49 through 56 )	B	49 - 56
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 57 through 68 )	B	57 - 68
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 69 through 74 )	B	69 - 74
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 75 through 104 )	B	75 - 104
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 105 through 114 )	B	105 - 114
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 1 through 12 )	C	1 - 12
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 13 through 25 )	C	13 - 25
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 26 through 42 )	C	26 - 42
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 43 through 48 )	C	43 - 48
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 49 through 56 )	C	49 - 56
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 57 through 68 )	C	57 - 68
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 69 through 74 )	C	69 - 74
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 75 through 95 )	C	75 - 95
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 96 through 104 )	C	96 - 104
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 105 through 114 )	C	105 - 114
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 1 through 12 )	D	1 - 12
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 13 through 34 )	D	13 - 34
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 35 through 42 )	D	35 - 42
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 43 through 48 )	D	43 - 48
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 49 through 56 )	D	49 - 56
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 57 through 68 )	D	57 - 68
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 69 through 74 )	D	69 - 74
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 75 through 114 )	D	75 - 114

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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