PDB-6q8g: Structure of Fucosylated D-antimicrobial peptide SB8 in complex w...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6q8g

タイトル

Structure of Fucosylated D-antimicrobial peptide SB8 in complex with the Fucose-binding lectin PA-IIL at 1.190 Angstrom resolution

要素

Fucose-binding lectin
SB8

キーワード

ANTIBIOTIC / Antimicrobial / Lectin / Complex

機能・相同性

機能・相同性情報

single-species biofilm formation / carbohydrate binding / metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌)
synthetic construct (人工物)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.19 Å

データ登録者

Baeriswyl, S. / Stocker, A. / Reymond, J.-L.

資金援助

スイス, 1件

引用

ジャーナル: Acs Chem.Biol. / 年: 2019
タイトル: X-ray Crystal Structures of Short Antimicrobial Peptides as Pseudomonas aeruginosa Lectin B Complexes.
著者: Baeriswyl, S. / Gan, B.H. / Siriwardena, T.N. / Visini, R. / Robadey, M. / Javor, S. / Stocker, A. / Darbre, T. / Reymond, J.L.

履歴

登録	2018年12月14日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2019年3月20日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2019年5月1日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last
改定 1.2	2020年7月29日	Group: Data collection / Derived calculations カテゴリ: chem_comp / pdbx_struct_conn_angle ...chem_comp / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.type / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id ..._chem_comp.type / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.3	2024年1月24日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6q8g.cif.gz	216.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6q8g.ent.gz	174.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6q8g.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	6q8g_validation.pdf.gz	483.1 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6q8g_full_validation.pdf.gz	485.4 KB	表示
XML形式データ	6q8g_validation.xml.gz	25.7 KB	表示
CIF形式データ	6q8g_validation.cif.gz	37.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/q8/6q8g ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/q8/6q8g	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	6q6wC 6q6xC 6q77C 6q79C 6q85C 6q86C 6q87C 6q8dC 6q8hC 6s5pC 1oxcS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	6q85-3 6q85-4 6q79-4 6q79-1 6q85-2 6q6w-d 6q85-1 6q6x-3 6q6x-2 6q6x-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Fucose-binding lectin

E: SB8

B: Fucose-binding lectin

F: SB8

C: Fucose-binding lectin

G: SB8

D: Fucose-binding lectin

ヘテロ分子

51.9 kDa, 7 ポリマー
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1

A: Fucose-binding lectin

E: SB8

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
根拠: mass spectrometry
13.3 kDa, 2 ポリマー
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2

B: Fucose-binding lectin

F: SB8

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
13.3 kDa, 2 ポリマー
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3

C: Fucose-binding lectin

G: SB8

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
13.5 kDa, 2 ポリマー
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4

D: Fucose-binding lectin

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
11.8 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	56.445, 72.085, 123.593
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 / Polypeptide(D) / 糖 , 3種, 11分子 ABCDEFG

#1: タンパク質	Fucose-binding lectin / Fucose-binding lectin II (PA-IIL) / Fucose-binding lectin PA-IIL 分子量: 11734.707 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現詳細: Fucose-binding lectin PA-IIL Lectin B from Pseudomonas aeruginosa 由来: (組換発現) Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌) 遺伝子: lecB, C0043_24310, C0044_25260, C0046_23510, CAZ10_21840, CW299_25270, DI492_13230, DT376_00595, PAERUG_E15_London_28_01_14_00983, PAMH19_1713, RW109_RW109_02453 発現宿主: Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' (大腸菌) 参照: UniProt: A0A069Q9V4, UniProt: Q9HYN5*PLUS
#2: Polypeptide(D)	SB8 分子量: 1253.666 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: Fucosylated D-antimicrobial peptide SB8 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)
#4: 糖	ChemComp-ZDC / 3,7-anhydro-2,8-dideoxy-L-glycero-D-gluco-octonic acid タイプ: D-saccharide / 分子量: 206.193 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₄O₆

-
非ポリマー , 3種, 599分子

#3: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION 分子量: 40.078 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#5: 化合物	ChemComp-NH2 / AMINO GROUP 分子量: 16.023 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: NH₂
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 589 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.53 Å³/Da / 溶媒含有率: 51.36 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 0.8 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.5% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5,000

-
データ収集

回折	平均測定温度: 80 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06DA / 波長: 1.00003 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 2M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年12月19日
放射	プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.00003 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.19→46.916 Å / Num. obs: 276822 / % possible obs: 88.6 % / 冗長度: 3.01 % / R_rim(I) all: 0.062 / Net I/σ(I): 11.74
反射シェル	解像度: 1.19→1.196 Å / Mean I/σ(I) obs: 0.82 / Num. unique obs: 189

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

	最高解像度	最低解像度
Rotation	2.89 Å	46.92 Å
Translation	2.89 Å	46.92 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX		精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHASER	2.8.0	位相決定
PDB_EXTRACT	3.24	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1OXC

1oxc

解像度: 1.19→46.916 Å / SU ML: 0.1 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0.96 / 位相誤差: 16.12 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.1605	13820	4.99 %
R_work	0.1447	262883	-
obs	0.1455	276703	88.6 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 80.09 Å² / B_iso mean: 19.3658 Å² / B_iso min: 8.52 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.19→46.916 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3442	0	74	589	4105
B_iso mean	-	-	22.34	32.12	-
残基数	-	-	-	-	478

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.008	3536
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.981	4841
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.107	624
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.006	635
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	6.53	1163

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
1.1903-1.2038	0.3452	56	0.3352	977	1033	10
1.2038-1.218	0.3741	117	0.3514	2213	2330	23
1.218-1.2328	0.3595	173	0.3358	3509	3682	35
1.2328-1.2484	0.3352	326	0.3086	5958	6284	60
1.2484-1.2648	0.2921	391	0.2976	7410	7801	75
1.2648-1.2822	0.3153	431	0.2873	8461	8892	85
1.2822-1.3005	0.2737	461	0.2646	8938	9399	90
1.3005-1.3199	0.2525	495	0.233	9414	9909	96
1.3199-1.3405	0.243	507	0.2106	9607	10114	97
1.3405-1.3625	0.2225	512	0.1961	9710	10222	98
1.3625-1.386	0.1908	514	0.1849	9787	10301	99
1.386-1.4112	0.1751	516	0.1698	9832	10348	100
1.4112-1.4384	0.1812	524	0.1673	9870	10394	100
1.4384-1.4677	0.158	515	0.1548	9804	10319	100
1.4677-1.4996	0.169	511	0.1459	9875	10386	100
1.4996-1.5345	0.1555	521	0.1394	9890	10411	100
1.5345-1.5729	0.1703	522	0.1357	9831	10353	100
1.5729-1.6154	0.1414	520	0.1352	9878	10398	100
1.6154-1.663	0.148	519	0.1341	9856	10375	100
1.663-1.7166	0.1651	518	0.1342	9880	10398	100
1.7166-1.778	0.1554	520	0.1293	9793	10313	100
1.778-1.8492	0.1591	512	0.1289	9876	10388	100
1.8492-1.9334	0.1457	520	0.1214	9839	10359	100
1.9334-2.0353	0.1245	522	0.1179	9800	10322	99
2.0353-2.1628	0.1358	519	0.123	9833	10352	99
2.1628-2.3298	0.1382	514	0.1263	9848	10362	99
2.3298-2.5642	0.1588	526	0.1367	9815	10341	99
2.5642-2.9352	0.1465	505	0.1367	9779	10284	99
2.9352-3.6979	0.1481	515	0.1311	9802	10317	99
3.6979-46.9529	0.1556	518	0.1452	9798	10316	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.1379	1.0979	-1.1279	1.1391	-0.7529	1.2065	0.0593	-0.105	0.1579	0.1213	-0.0243	-0.0515	-0.1019	0.0323	-0.0268	0.113	-0.0129	-0.0004	0.0988	-0.0073	0.1419	-7.6647	-0.7389	33.8221
2	3.6117	0.8302	1.0326	1.6433	0.221	1.2428	-0.0432	0.1225	0.2106	-0.075	0.0119	0.1167	-0.1447	-0.0051	0.0367	0.0935	0.0096	-0.006	0.1195	0.028	0.1064	-15.1278	-1.8451	22.6797
3	4.5545	3.0511	3.5208	2.9295	1.3486	3.9588	-0.1868	0.2155	0.3657	-0.2022	0.0074	0.0897	-0.3375	0.0171	0.1464	0.1302	0.0189	-0.0057	0.1876	0.0381	0.1775	-13.9283	2.765	19.4464
4	1.7135	0.1457	-0.2649	1.065	-0.0592	0.9719	-0.0564	0.2444	0.0556	-0.1435	0.0289	0.0737	-0.0517	-0.0297	0.0273	0.1121	0.0131	-0.0213	0.1367	0.0266	0.1233	-15.7464	-6.7541	17.8464
5	5.6334	0.6197	1.383	0.3686	0.384	0.5802	0.0091	-0.01	0.4909	0.0093	-0.0613	0.0569	-0.1696	-0.0079	0.0503	0.1021	-0.008	-0.0052	0.1106	0.0179	0.1769	-11.4973	2.9858	28.8999
6	0.5893	-0.2575	0.5672	0.9537	-0.3776	1.0964	-0.0236	0.0217	-0.0322	0.0704	0.0432	0.1485	-0.0886	-0.0944	-0.0083	0.0769	0.0053	0.0083	0.0913	0.0119	0.1212	-18.3182	-7.249	30.7853
7	0.187	0.0855	-0.3822	0.4865	-0.3012	0.869	-0.019	0.0752	-0.0751	-0.0614	-0.0112	-0.0011	-0.02	0.0152	0.0231	0.0753	0.0045	-0.0063	0.0938	0.0092	0.1174	-7.6192	-8.4731	26.136
8	3.3187	-0.3553	0.8164	1.3825	-0.4165	1.9113	-0.0485	-0.0314	-0.1394	0.0647	0.0629	0.1084	0.1143	-0.111	-0.0602	0.1025	-0.0126	-0.0028	0.1017	-0.0098	0.1256	-17.281	-26.9963	30.0514
9	2.0928	0.9806	-1.3439	1.3444	-0.4214	1.4509	-0.0584	0.3747	0.1233	-0.1398	0.0904	-0.007	0.0417	-0.0567	0.0007	0.1032	0.0153	-0.0024	0.1372	-0.0022	0.0977	-8.8872	-18.1968	19.3226
10	2.5511	0.8019	-0.6019	0.9372	-0.1674	1.5574	-0.1368	0.2531	-0.2797	-0.1489	0.0832	-0.0355	0.2417	-0.0792	0.0732	0.1516	0.0023	0.0098	0.1697	-0.0416	0.1671	-11.039	-27.9325	18.1848
11	3.1733	0.0979	-0.5565	7.1467	3.4812	6.4066	-0.0609	0.1954	0.1563	-0.4588	0.0868	-0.2584	-0.3223	0.296	-0.0063	0.1289	-0.0138	0.0139	0.192	0.0257	0.139	0.0816	-12.3779	16.1439
12	2.748	1.3611	-0.8439	1.3602	-1.0811	2.244	-0.1266	0.3783	-0.1645	-0.1562	0.1434	0.0552	0.1873	-0.218	-0.0097	0.1161	0.0088	0.0004	0.1495	-0.0364	0.1381	-17.8444	-22.8616	19.2367
13	8.0619	1.9743	-3.2725	1.0676	-1.5038	2.1548	-0.2928	0.1765	-0.5657	-0.125	0.073	-0.2121	0.2206	-0.0038	0.2024	0.1134	0.0057	0.0078	0.135	-0.0379	0.1722	-8.5975	-28.4949	23.5892
14	0.9959	-0.537	-0.2591	3.69	2.9085	2.3229	0.2137	0.537	-0.2002	-0.7562	-0.1569	-0.4114	0.4931	0.328	0.023	0.2463	0.0669	0.0531	0.2017	-0.0387	0.1899	2.206	-29.2118	20.0754
15	0.2367	0.1195	-0.4261	0.5956	-0.0243	1.0377	0.0178	0.002	-0.0064	0.0274	-0.018	-0.0493	0.0244	0.0691	0.016	0.0809	0.0071	-0.0058	0.095	-0.0038	0.1051	-7.7389	-18.3988	30.1882
16	0.0636	0.2069	0.1734	0.8551	0.177	1.1325	-0.0107	0.047	0.2465	-0.0353	0.0002	0.0553	0.0184	-0.0865	0.0344	0.0684	0.0099	-0.0071	0.1148	-0.007	0.1188	-17.3854	-17.4377	24.928
17	0.7157	0.2199	-0.0848	4.6067	1.866	2.5081	0.0614	0.0218	0.065	0.0579	0.0451	-0.2951	-0.1355	0.2238	-0.0653	0.1407	-0.0263	-0.0348	0.1275	0.008	0.148	1.5026	-12.6638	44.0025
18	1.1194	0.3302	0.3144	1.2876	-0.25	0.7575	0.1389	-0.1091	-0.1429	0.3	-0.0956	-0.1935	0.0433	0.0734	-0.0274	0.2366	-0.0366	-0.0617	0.1285	0.0232	0.1165	-3.0797	-22.4866	55.1176
19	2.115	2.195	-0.9948	3.4251	-1.0442	1.6523	0.1868	-0.1906	-0.0159	0.4299	-0.2318	-0.2839	-0.135	0.2154	-0.0107	0.2434	-0.052	-0.0665	0.1587	0.025	0.1457	-0.9265	-13.3384	55.2826
20	1.0179	1.5327	-0.4913	3.544	-1.9561	1.8006	0.0547	-0.0289	-0.1515	0.1008	-0.1153	-0.4217	0.0926	0.2514	0.0885	0.1849	-0.0063	-0.0612	0.1381	0.0117	0.1699	2.6502	-22.3963	48.8985
21	6.0802	1.4246	-0.8548	7.2346	-3.0548	8.5536	0.0115	-0.4546	-0.4362	0.3628	0.1002	-0.1571	0.5091	0.381	0.0396	0.27	0.0313	-0.0874	0.1899	0.0229	0.234	2.144	-33.6222	50.6565
22	0.7118	0.0577	0.2714	1.1658	-0.9237	0.9567	0.106	0.0123	-0.0709	0.129	-0.091	-0.0405	0.0638	0.0365	0.0084	0.1282	-0.0103	-0.0213	0.1015	-0.0015	0.1051	-8.2521	-20.9355	43.9398
23	0.882	0.1652	0.2001	0.0423	-0.0729	1.0831	0.1156	-0.1301	0.0434	0.2619	-0.1201	0.179	-0.054	-0.0046	0.0146	0.176	-0.0279	-0.0137	0.1054	-0.0044	0.1056	-7.0838	-12.2478	50.5983
24	1.2277	0.1936	0.7479	3.9244	-0.5834	2.3026	0.1389	0.0074	-0.0204	0.1092	-0.0519	0.2401	0.0427	-0.155	-0.094	0.1211	-0.016	0.0309	0.1243	-0.0071	0.1391	-26.2091	-18.1879	43.3033
25	1.4597	0.4426	-0.0052	1.0607	0.755	1.2088	0.1577	-0.221	0.157	0.2736	-0.1376	0.2181	-0.0288	-0.1216	0.0257	0.2387	-0.0458	0.0672	0.1338	-0.0262	0.1237	-23.3679	-13.121	55.9063
26	3.2152	-2.7318	-2.8899	3.5591	3.6972	4.7269	0.1436	-0.5804	0.2909	0.4058	-0.0265	-0.1153	-0.0991	0.2686	-0.1357	0.3108	-0.0936	0.034	0.2048	-0.0519	0.1539	-11.1005	-5.2442	61.0096
27	0.7361	1.0049	1.0358	2.1177	1.1705	2.7641	0.1853	-0.2315	0.0866	0.3681	-0.2464	0.2832	0.2288	-0.3166	-0.0029	0.218	-0.0636	0.0482	0.1736	-0.0218	0.1262	-23.6246	-20.7395	54.3197
28	1.5567	1.6853	1.1839	3.9965	2.7841	3.3069	0.1298	-0.1133	0.2485	0.0119	-0.2291	0.3877	-0.179	-0.2577	0.0912	0.1977	-0.0185	0.0706	0.1294	-0.0276	0.1769	-27.2557	-10.2444	50.7505
29	2.9075	0.106	0.298	1.9853	0.4811	6.8188	0.1349	-0.5662	0.2672	0.5538	-0.0712	0.336	-0.5103	-0.3567	0.0084	0.3255	-0.0006	0.1514	0.2378	-0.0529	0.2641	-26.6706	0.0753	55.5508
30	0.6091	-0.4428	-0.6227	1.2526	1.1256	2.1095	0.118	-0.014	0.0828	0.1371	-0.0366	-0.0835	-0.0175	-0.0357	-0.0319	0.1073	-0.0139	0.0149	0.0855	-0.005	0.1147	-16.8375	-15.6495	43.1737
31	0.8729	0.3517	0.0009	1.3058	0.5481	0.984	0.1414	-0.0608	0.1094	0.1796	-0.0968	-0.0265	-0.1451	-0.0101	-0.0304	0.1852	-0.0269	0.0451	0.1065	-0.0133	0.1096	-16.5417	-9.7808	49.973

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 1 through 12 )	A	1 - 12
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 13 through 34 )	A	13 - 34
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 35 through 42 )	A	35 - 42
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 43 through 56 )	A	43 - 56
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 57 through 69 )	A	57 - 69
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 70 through 104 )	A	70 - 104
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 105 through 114 )	A	105 - 114
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 1 through 12 )	B	1 - 12
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 13 through 25 )	B	13 - 25
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 26 through 42 )	B	26 - 42
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 43 through 47 )	B	43 - 47
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 48 through 61 )	B	48 - 61
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 62 through 69 )	B	62 - 69
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 70 through 74 )	B	70 - 74
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 75 through 104 )	B	75 - 104
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 105 through 114 )	B	105 - 114
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 1 through 12 )	C	1 - 12
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 13 through 47 )	C	13 - 47
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 48 through 61 )	C	48 - 61
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 62 through 69 )	C	62 - 69
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 70 through 74 )	C	70 - 74
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 75 through 104 )	C	75 - 104
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 105 through 114 )	C	105 - 114
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 1 through 12 )	D	1 - 12
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 13 through 42 )	D	13 - 42
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 43 through 47 )	D	43 - 47
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 48 through 61 )	D	48 - 61
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 62 through 69 )	D	62 - 69
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 70 through 74 )	D	70 - 74
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 75 through 95 )	D	75 - 95
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'D' and (resid 96 through 114 )	D	96 - 114

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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