登録情報 | データベース: PDB / ID: 6rum |
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タイトル | Crystal structure of GFP-LAMA-G97 - a GFP enhancer nanobody with cpDHFR insertion and TMP and NADPH |
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要素 | GFP-LAMA-G97 a GFP enhancer nanobody with cpDHFR insertion |
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キーワード | PROTEIN BINDING / LAMA / nanobody / circular permutant of DHFR / TMP / NADPH |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
methotrexate binding / dihydrofolic acid binding / response to methotrexate / NADP+ binding / folic acid binding / dihydrofolate metabolic process / dihydrofolate reductase / dihydrofolate reductase activity / folic acid metabolic process / NADPH binding ...methotrexate binding / dihydrofolic acid binding / response to methotrexate / NADP+ binding / folic acid binding / dihydrofolate metabolic process / dihydrofolate reductase / dihydrofolate reductase activity / folic acid metabolic process / NADPH binding / tetrahydrofolate biosynthetic process / one-carbon metabolic process / NADP binding / response to xenobiotic stimulus / response to antibiotic / cytosol類似検索 - 分子機能 Dihydrofolate reductase / Dihydrofolate reductase conserved site / Dihydrofolate reductase (DHFR) domain signature. / Dihydrofolate reductase domain / Dihydrofolate reductase / Dihydrofolate reductase (DHFR) domain profile. / Dihydrofolate reductase-like domain superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-NDP / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / TRIMETHOPRIM / Dihydrofolate reductase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_mammal.gif) lama glama (ラマ)
![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.6 Å |
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データ登録者 | Farrants, H. / Tarnawski, M. / Mueller, T.G. / Otsuka, S. / Hiblot, J. / Koch, B. / Kueblbeck, M. / Kraeusslich, H.-G. / Ellenberg, J. / Johnsson, K. |
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引用 | ジャーナル: Nat.Methods / 年: 2020 タイトル: Chemogenetic Control of Nanobodies. 著者: Farrants, H. / Tarnawski, M. / Muller, T.G. / Otsuka, S. / Hiblot, J. / Koch, B. / Kueblbeck, M. / Krausslich, H.G. / Ellenberg, J. / Johnsson, K. |
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履歴 | 登録 | 2019年5月28日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2020年2月12日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2020年2月26日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name |
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改定 1.2 | 2020年3月18日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.3 | 2024年1月24日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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