PDB-6rmo: Structure of Plasmodium falciparum IMP-nucleotidase

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6rmo

タイトル

Structure of Plasmodium falciparum IMP-nucleotidase

要素

IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

キーワード

HYDROLASE / nucleotidase / activator / native structure / BIOSYNTHETIC PROTEIN

機能・相同性

機能・相同性情報

nicotinamide riboside biosynthetic process / nicotinic acid riboside biosynthetic process / inosine salvage / IMP-specific 5'-nucleotidase / : / IMP catabolic process / magnesium ion binding / ATP binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Plasmodium falciparum 3D7 (マラリア病原虫)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.6 Å

データ登録者

Carrique, L. / Ballut, L. / Violot, S. / Aghajari, N.

資金援助

フランス, 1件

引用

ジャーナル: Nat Commun / 年: 2020
タイトル: Structure and catalytic regulation of Plasmodium falciparum IMP specific nucleotidase.
著者: Carrique, L. / Ballut, L. / Shukla, A. / Varma, N. / Ravi, R. / Violot, S. / Srinivasan, B. / Ganeshappa, U.T. / Kulkarni, S. / Balaram, H. / Aghajari, N.

履歴

登録	2019年5月7日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2020年7月15日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年1月24日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb6rmo.ent.gz	2.1 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6rmo.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	6rmo_validation.pdf.gz	570 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6rmo_full_validation.pdf.gz	656.5 KB	表示
XML形式データ	6rmo_validation.xml.gz	220.6 KB	表示
CIF形式データ	6rmo_validation.cif.gz	301.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rm/6rmo ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rm/6rmo	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6rmdSC 6rmeC 6rmwC 6rn1C 6rnhC 6rnw S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6rmd-1 3anq-d 3rik-d 6rnh-1 5oa2-d 6o3b-d 6tnp-d 5fwy-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

B: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

C: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

D: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

E: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

F: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

G: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

H: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

I: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

J: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

K: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

L: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

M: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

N: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

O: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

P: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

832 kDa, 16 ポリマー
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1

A: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

B: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

C: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

D: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration, SAXS
208 kDa, 4 ポリマー
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2

E: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

F: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

G: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

H: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
208 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

3

I: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

J: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

K: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

L: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
208 kDa, 4 ポリマー
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4

M: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

N: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

O: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

P: IMP-specific 5'-nucleotidase, putative

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
208 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	148.960, 204.070, 149.280
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.02, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	IMP-specific 5'-nucleotidase, putative 分子量: 51973.570 Da / 分子数: 16 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Plasmodium falciparum 3D7 (マラリア病原虫) 遺伝子: PF3D7_1206100 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A144A134, 5'-nucleotidase
#2: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1305 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 2.73 Å³/Da / 溶媒含有率: 54.92 %
結晶化	温度: 292 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: 0.1 M Tris pH 8.5, 8% (w/v) PEG 8,000

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データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID23-1 / 波長: 0.973 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2015年6月27日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.973 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.6→48.34 Å / Num. obs: 250293 / % possible obs: 91.7 % / 冗長度: 3 % / CC_1/2: 0.99 / Net I/σ(I): 7.5
反射シェル	解像度: 2.6→3.18 Å / Num. unique obs: 114842 / CC_1/2: 0.82

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解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.17.1_3660: ???)	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 6RMD

6rmd

解像度: 2.6→48.3 Å / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.83 / 位相誤差: 29.6

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.253	13486	5.39 %
R_work	0.2298	-	-
obs	0.2359	250293	91.71 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.6→48.3 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	51136	0	0	1305	52441

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.002	52185
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.484	70480
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	19.975	19302
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.04	7903
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	8895

LS精密化シェル

解像度: 2.6→3.16 Å

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.252	603	-
R_work	0.25	11440	-
obs	-	-	82 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.0858	0.6799	0.3031	3.7044	0.2541	0.7662	-0.0685	0.4412	0.528	-0.2534	0.1606	0.3905	-0.2398	0.2098	-0.1724	0.4416	0.0967	0.0238	1.1934	0.0765	0.5242	10.6445	19.6069	78.8014
2	0.3043	-0.033	-0.4541	1.7927	1.3234	2.3323	-0.3824	0.1357	-0.0221	0.2691	0.2761	-0.2833	-0.5652	0.724	-0.1596	0.5108	0.1094	-0.0101	0.8787	0.1059	0.4543	7.3952	9.9871	61.9003
3	0.685	-1.0241	-0.1983	1.8	1.3306	1.6548	-0.0156	-0.0235	0.1724	-0.0913	0.046	0.0631	-0.258	-0.0863	0.049	0.3317	0.0412	-0.0018	0.6701	0.0951	0.4288	-8.5925	24.5681	68.8906
4	1.6153	-0.1205	0.9631	0.5572	0.6605	1.7742	-0.016	-0.1124	-0.0619	-0.049	-0.0285	-0.0513	-0.0637	-0.1541	0.107	0.3921	0.0379	0.0252	0.7323	0.1203	0.2832	0.2156	25.861	82.1781
5	1.9766	0.4033	-0.5178	1.6682	-1.0864	1.6627	0.0342	0.1405	0.2076	-0.1907	-0.048	0.0757	-0.215	0.1003	0.0948	0.3746	0.0335	-0.0395	0.7012	0.0728	0.3803	34.0686	26.9775	71.3505
6	0.4056	0.32	-0.482	0.3069	0.4865	1.2107	-0.2421	0.5416	0.2034	-0.2197	0.2601	-0.1631	-0.3081	0.5312	-0.4174	0.6482	0.0265	0.0368	1.1335	0.199	0.4724	32.4135	29.8672	43.2174
7	1.7036	0.1555	-0.1821	0.9755	-0.1108	1.7399	0.2642	-0.0202	0.2325	-0.175	-0.1243	0.0041	-0.5321	0.5735	0.045	0.6163	0.0028	0.0719	0.9161	0.1152	0.4192	17.3766	22.3847	45.8645
8	1.8562	0.4411	1.0202	0.9725	0.2447	0.5561	-0.1841	0.3102	0.0696	0.2194	0.2233	0.4163	0.0754	0.1913	0.0167	0.5853	0.0129	0.1688	0.936	0.1036	0.4916	35.449	27.5436	51.7455
9	0.9538	-0.1191	-1.0432	2.7314	-1.3273	1.8831	0.1404	0.3284	-0.3753	-1.0855	-0.014	-0.3592	0.7474	-0.8102	0.1781	0.6507	0.0377	-0.1443	1.0601	0.1806	0.2698	34.8184	25.6783	64.6905
10	0.1732	0.9108	-0.5921	4.4104	-1.2515	5.3243	-0.2102	-0.7819	0.6974	0.2258	-0.2982	-0.109	-1.4433	0.0781	-0.1162	0.5255	0.0621	0.0069	0.8707	0.0822	0.3299	33.2924	35.799	77.3299
11	1.6693	-0.8171	0.6946	0.7086	-0.4562	0.9962	0.0681	0.2598	0.3462	0.066	-0.2531	-0.155	-0.3111	0.9894	-0.0541	0.3639	0.0039	-0.0791	1.2874	0.0891	0.7123	13.1168	-12.6102	79.3947
12	0.4761	0.3186	0.3046	1.8699	-0.7692	0.9523	-0.0381	-0.01	-0.1275	0.1476	-0.0201	-0.0251	-0.0832	-0.086	0.0574	0.2804	0.0544	0.0131	0.7319	0.1225	0.377	26.3541	-6.3347	92.5925
13	2.3377	-0.6544	0.7778	0.9596	-0.239	2.2716	-0.0351	-0.312	-1.1524	-0.4096	-0.0277	-0.2503	-0.2834	-0.2701	-0.0032	0.4115	0.1122	0.0277	0.6639	0.2141	0.5226	16.7713	-30.2905	99.057
14	2.5199	-0.6803	0.8823	1.579	-0.1497	1.5314	-0.2161	-0.3023	-1.1376	0.1002	0.1352	0.1885	0.4198	-0.2161	0.1263	0.5465	0.0695	0.0638	0.7582	0.2122	0.5161	8.6634	-32.654	102.3332
15	2.4292	0.5464	-0.7469	1.0303	-0.0868	2.7413	0.0202	0.0979	-0.2867	-0.1311	-0.2859	0.3721	0.2313	0.0794	-0.0379	0.3122	0.1082	-0.038	0.5854	0.083	0.4333	-4.7941	-23.7787	78.0899
16	0.3937	0.519	0.2911	0.5718	-0.021	0.4758	0.1224	0.7689	0.4932	0.0261	-0.0805	0.025	0.0666	0.3195	0.073	0.3893	0.0921	0.0387	0.8031	0.1818	0.4948	7.1075	-17.1033	93.7977
17	1.7245	0.4607	0.7591	1.6563	-0.2416	1.7162	-0.5584	0.2383	-0.1913	0.3015	0.2293	-1.2536	0.1617	0.0975	-0.0125	0.4106	0.139	-0.0054	0.706	0.0852	0.6271	30.124	-20.5001	95.2224
18	1.8841	-0.6139	-1.3505	1.0224	0.3937	3.4485	-0.2284	0.2793	0.003	0.0801	0.0587	0.1123	0.3116	-0.0451	0.0034	0.3765	0.0847	-0.0652	0.75	0.0659	0.3425	6.6856	-7.1372	53.662
19	2.142	-1.292	-0.0317	1.8294	0.3696	1.7884	-0.1064	0.0527	-0.2142	0.0172	-0.0043	-0.1388	0.2472	0.1574	0.0296	0.3971	0.0856	-0.0295	0.7198	0.1043	0.3597	17.155	-22.1182	54.888
20	2.0458	0.5653	0.626	1.4641	0.0938	1.3231	-0.2519	-0.0579	-0.7322	0.043	0.2038	-0.2275	0.6335	0.6205	-0.2116	0.7928	0.3694	0.0098	0.8866	0.0978	0.7805	35.8044	-36.4036	51.7804
21	1.6485	-0.2036	0.671	0.9469	0.1994	2.3452	0.0373	0.3827	-0.4137	-0.1566	-0.167	0.0989	-0.3159	-0.1693	0.0284	0.4174	0.0365	-0.0117	0.76	0.0604	0.5557	44.7129	-15.9465	68.8214
22	2.4587	-0.3108	-1.6955	1.4534	0.0977	2.3052	-0.063	-0.2651	-0.1051	-0.2645	-0.0436	-0.1456	0.4384	0.2069	0.0759	0.4863	0.1757	-0.0141	0.7306	0.0891	0.4904	20.3039	-24.7914	53.2487
23	1.0435	-0.0887	1.3143	1.5445	0.0153	1.9273	0.3198	-1.0332	-0.4414	-0.2318	0.0965	0.3725	0.1356	-0.1715	-0.2475	0.7493	-0.0025	-0.1493	1.2907	0.1096	0.5791	97.5907	16.4992	-6.4475
24	1.5417	1.4175	-0.2657	2.4179	-1.0661	0.6031	-0.0394	-0.0728	0.012	0.0413	-0.0073	-0.0719	-0.0297	0.0971	-0.1023	0.3302	0.1031	-0.0042	0.6529	0.1239	0.3419	112.7175	16.0886	5.0819
25	2.4229	0.0817	0.9185	0.4836	0.4352	1.786	-0.0613	0.0328	0.2607	-0.0996	-0.0445	0.0231	-0.0231	0.0307	0.0794	0.379	0.0383	0.0323	0.6462	0.1418	0.3938	110.6953	29.8612	-15.7179
26	2.1985	0.9331	1.3898	1.7217	-0.7019	2.016	0.3286	-0.7374	-0.0867	0.3184	-0.1838	-0.3312	-0.2233	-0.058	0.0694	0.5663	0.0484	0.0109	0.7009	0.0799	0.3561	114.346	25.7753	10.5624
27	2.0271	-0.5197	-0.431	1.6772	1.1695	1.5667	-0.0501	-0.2119	0.0439	0.0429	-0.0372	0.1066	-0.1735	-0.1825	0.0403	0.3267	0.0864	-0.0191	0.6432	0.0874	0.4152	73.3838	22.9326	-5.2884
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71	1.3232	0.9936	0.7318	1.9883	0.8888	1.3429	0.0188	0.005	0.153	0.0161	-0.0731	0.0502	-0.2103	-0.0822	0.0468	0.3769	0.0903	0.0526	0.637	0.0936	0.3368	84.8852	20.8271	94.8538
72	1.7941	0.0929	-0.7359	0.436	0.8581	2.3537	0.057	-0.171	0.059	-0.0473	-0.1046	-0.0413	-0.2334	0.0721	0.0679	0.3624	0.0807	-0.0099	0.6999	0.1195	0.3911	106.2623	28.4514	88.506
73	1.7341	-0.6927	-0.187	1.8433	1.0481	3.1909	-0.4489	-0.1165	0.0536	0.1176	-0.1254	0.7282	0.0339	-0.5231	-0.0308	0.3653	0.1231	0.0241	0.5919	0.0902	0.7082	77.7484	25.5603	95.1395
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75	1.2396	-1.3824	-0.6234	3.7629	-1.0946	3.0796	0.2429	0.1388	-0.3533	-0.0649	-0.123	-0.0227	0.3893	-0.2352	-0.1478	0.3752	0.0546	-0.1203	1.0275	0.1189	0.4023	88.5637	11.6016	46.6094
76	2.2529	-0.7603	0.57	0.7714	-0.6165	1.29	-0.0393	-0.007	0.6025	0.0972	0.0947	-0.0092	-0.6809	-0.1359	-0.0224	0.6201	0.1314	0.0688	0.7651	0.1194	0.5163	86.9523	35.4789	56.168
77	1.4379	0.3714	-1.6924	0.5753	-0.5596	1.1751	0.0243	0.5935	0.3895	-0.1106	0.0776	0.13	-0.0292	-0.4423	-0.1447	0.5305	0.0937	-0.0787	0.9866	0.1671	0.592	66.3134	26.5751	60.9232
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83	0.5854	0.135	-0.9295	1.1299	-0.2995	3.7226	0.2092	-0.259	-0.2978	-0.2072	-0.123	0.4788	0.6326	0.1345	-0.0269	0.3897	0.0964	-0.0441	0.762	0.0992	0.5181	114.7947	-31.1932	71.5704
84	1.3773	-0.6084	-0.3735	1.6791	0.6843	2.1104	-0.1077	0.5182	-0.2766	0.02	0.1271	0.5427	1.2854	-0.1439	-0.0693	0.6569	0.1311	0.0593	0.6355	0.1015	0.7621	120.262	-36.424	73.3038
85	0.5922	0.1518	-0.0645	1.7624	0.6816	2.0748	0.0718	-1.1369	-0.6039	0.0995	0.2188	-0.318	0.3253	0.5659	0.0512	0.369	0.1354	0.0381	1.0225	0.2082	0.4741	122.7267	-28.6298	86.7246
86	2.8871	-0.9791	0.818	0.8413	-0.9511	2.3354	0.2102	-0.3105	-0.4685	0.0558	-0.2577	0.1468	0.3698	0.0545	-0.1648	0.3914	0.0546	0.0008	0.6964	0.0636	0.3557	96.9876	-24.2666	93.0847
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89	1.8412	0.0277	0.1565	1.917	0.472	1.0961	0.0262	0.2237	0.2575	-0.1999	-0.1396	0.2655	0.0607	-0.0953	0.0702	0.3334	0.0417	0.0321	0.6334	0.1042	0.4004	72.8236	-12.9243	77.6668
90	2.1831	1.8113	-1.9595	1.0305	-1.4846	2.3186	-0.2383	0.5328	-0.4665	-0.2344	0.1225	0.0032	0.4113	-0.1716	0.0734	0.63	0.0371	-0.0158	0.8621	-0.0131	0.5497	79.5406	-26.9306	50.3607
91	5.1409	-0.3886	1.5656	3.6741	0.5873	5.0747	-0.3836	0.3309	-0.3777	0.1851	0.3978	0.1709	-0.2971	-0.1431	0.0112	0.4146	0.0651	-0.0376	0.8997	0.0152	0.3795	73.5152	-25.1148	70.5562

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
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2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 39 through 83 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 84 through 265 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 266 through 444 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 59 through 243 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 244 through 295 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 296 through 363 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 364 through 382 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 383 through 416 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 417 through 442 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 11 through 60 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 61 through 184 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 185 through 211 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 212 through 274 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 275 through 348 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 349 through 409 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 410 through 444 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 60 through 99 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 100 through 211 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 212 through 274 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 275 through 370 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 371 through 444 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'E' and (resid 12 through 60 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resid 61 through 211 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'E' and (resid 212 through 409 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 410 through 444 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'F' and (resid 60 through 211 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resid 212 through 243 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resid 244 through 295 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'F' and (resid 296 through 363 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resid 364 through 382 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 383 through 416 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 417 through 444 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'G' and (resid 9 through 83 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'G' and (resid 84 through 443 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'H' and (resid 60 through 99 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'H' and (resid 100 through 121 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'H' and (resid 122 through 184 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'H' and (resid 185 through 211 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'H' and (resid 212 through 243 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'H' and (resid 244 through 274 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'H' and (resid 275 through 296 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'H' and (resid 297 through 363 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'H' and (resid 364 through 393 )
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'H' and (resid 394 through 416 )
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'H' and (resid 417 through 444 )
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'I' and (resid 12 through 60 )
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'I' and (resid 61 through 158 )
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'I' and (resid 159 through 184 )
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'I' and (resid 185 through 296 )
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'I' and (resid 297 through 331 )
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'I' and (resid 332 through 409 )
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'I' and (resid 410 through 444 )
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'J' and (resid 59 through 144 )
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'J' and (resid 145 through 211 )
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'J' and (resid 212 through 382 )
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'J' and (resid 383 through 404 )
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'J' and (resid 405 through 444 )
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'K' and (resid 8 through 52 )
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'K' and (resid 53 through 211 )
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'K' and (resid 212 through 382 )
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'K' and (resid 383 through 444 )
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'L' and (resid 58 through 99 )
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'L' and (resid 100 through 174 )
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'L' and (resid 175 through 265 )
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'L' and (resid 266 through 348 )
67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'L' and (resid 349 through 382 )
68	X-RAY DIFFRACTION	68	chain 'L' and (resid 383 through 404 )
69	X-RAY DIFFRACTION	69	chain 'L' and (resid 405 through 444 )
70	X-RAY DIFFRACTION	70	chain 'M' and (resid 12 through 60 )
71	X-RAY DIFFRACTION	71	chain 'M' and (resid 61 through 243 )
72	X-RAY DIFFRACTION	72	chain 'M' and (resid 244 through 409 )
73	X-RAY DIFFRACTION	73	chain 'M' and (resid 410 through 444 )
74	X-RAY DIFFRACTION	74	chain 'N' and (resid 59 through 99 )
75	X-RAY DIFFRACTION	75	chain 'N' and (resid 100 through 121 )
76	X-RAY DIFFRACTION	76	chain 'N' and (resid 122 through 243 )
77	X-RAY DIFFRACTION	77	chain 'N' and (resid 244 through 393 )
78	X-RAY DIFFRACTION	78	chain 'N' and (resid 394 through 416 )
79	X-RAY DIFFRACTION	79	chain 'N' and (resid 417 through 444 )
80	X-RAY DIFFRACTION	80	chain 'O' and (resid 8 through 38 )
81	X-RAY DIFFRACTION	81	chain 'O' and (resid 39 through 83 )
82	X-RAY DIFFRACTION	82	chain 'O' and (resid 84 through 174 )
83	X-RAY DIFFRACTION	83	chain 'O' and (resid 175 through 211 )
84	X-RAY DIFFRACTION	84	chain 'O' and (resid 212 through 243 )
85	X-RAY DIFFRACTION	85	chain 'O' and (resid 244 through 274 )
86	X-RAY DIFFRACTION	86	chain 'O' and (resid 275 through 348 )
87	X-RAY DIFFRACTION	87	chain 'O' and (resid 349 through 409 )
88	X-RAY DIFFRACTION	88	chain 'O' and (resid 410 through 444 )
89	X-RAY DIFFRACTION	89	chain 'P' and (resid 58 through 174 )
90	X-RAY DIFFRACTION	90	chain 'P' and (resid 175 through 382 )
91	X-RAY DIFFRACTION	91	chain 'P' and (resid 383 through 444 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)