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- PDB-6rcv: PfRH5 bound to monoclonal antibodies R5.011 and R5.016 -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 6rcv
タイトルPfRH5 bound to monoclonal antibodies R5.011 and R5.016
要素
  • R5.011 heavy chain
  • R5.011 light chain
  • R5.016 heavy chain
  • R5.016 light chain
  • Reticulocyte binding protein homologue 5
キーワードCELL ADHESION / Plasmodium falciparum Erythrocyte invasion Potentiating antibody Neutralising antibody Human monoclonal antibody
機能・相同性
機能・相同性情報


rhoptry lumen / rhoptry / symbiont entry into host / host cell membrane / bicellular tight junction / apical part of cell / heparin binding / cytoplasmic vesicle / host extracellular space / host cell surface receptor binding ...rhoptry lumen / rhoptry / symbiont entry into host / host cell membrane / bicellular tight junction / apical part of cell / heparin binding / cytoplasmic vesicle / host extracellular space / host cell surface receptor binding / host cell plasma membrane / protein-containing complex / extracellular region / membrane
類似検索 - 分子機能
Rh5 coiled-coil domain / Rh5 coiled-coil domain / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Reticulocyte-binding protein homolog 5
類似検索 - 構成要素
生物種Plasmodium falciparum (マラリア病原虫)
Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.582 Å
データ登録者Alanine, D.W.G. / Draper, S.J. / Higgins, M.K.
資金援助 英国, 1件
組織認可番号国
Wellcome Trust 英国
引用ジャーナル: Cell / 年: 2019
タイトル: Human Antibodies that Slow Erythrocyte Invasion Potentiate Malaria-Neutralizing Antibodies.
著者: Alanine, D.G.W. / Quinkert, D. / Kumarasingha, R. / Mehmood, S. / Donnellan, F.R. / Minkah, N.K. / Dadonaite, B. / Diouf, A. / Galaway, F. / Silk, S.E. / Jamwal, A. / Marshall, J.M. / Miura, ...著者: Alanine, D.G.W. / Quinkert, D. / Kumarasingha, R. / Mehmood, S. / Donnellan, F.R. / Minkah, N.K. / Dadonaite, B. / Diouf, A. / Galaway, F. / Silk, S.E. / Jamwal, A. / Marshall, J.M. / Miura, K. / Foquet, L. / Elias, S.C. / Labbe, G.M. / Douglas, A.D. / Jin, J. / Payne, R.O. / Illingworth, J.J. / Pattinson, D.J. / Pulido, D. / Williams, B.G. / de Jongh, W.A. / Wright, G.J. / Kappe, S.H.I. / Robinson, C.V. / Long, C.A. / Crabb, B.S. / Gilson, P.R. / Higgins, M.K. / Draper, S.J.
履歴
登録2019年4月11日登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.02019年6月26日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12019年7月10日Group: Data collection / Database references
カテゴリ: citation / database_PDB_rev / database_PDB_rev_record
Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last
改定 1.22024年11月6日Group: Data collection / Database references / Structure summary
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Reticulocyte binding protein homologue 5
B: R5.011 light chain
C: R5.011 heavy chain
D: R5.016 light chain
E: R5.016 heavy chain
F: Reticulocyte binding protein homologue 5
G: R5.011 light chain
H: R5.011 heavy chain
I: R5.016 light chain
J: R5.016 heavy chain


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)367,20310
ポリマ－367,20310
非ポリマー00
水00
1
A: Reticulocyte binding protein homologue 5
D: R5.016 light chain
E: R5.016 heavy chain

B: R5.011 light chain
C: R5.011 heavy chain


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)183,6015
ポリマ－183,6015
非ポリマー00
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
crystal symmetry operation2_544-x+1/2,-y-1,z-1/21
Buried area11990 Å2
ΔGint-64 kcal/mol
Surface area53130 Å2
手法PISA
2
F: Reticulocyte binding protein homologue 5
I: R5.016 light chain
J: R5.016 heavy chain

G: R5.011 light chain
H: R5.011 heavy chain


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)183,6015
ポリマ－183,6015
非ポリマー00
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
crystal symmetry operation2_445-x-1/2,-y-1,z+1/21
Buried area11630 Å2
ΔGint-66 kcal/mol
Surface area53080 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)140.994, 150.991, 163.974
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number19
Space group name H-MP212121

-
要素

#1: タンパク質 Reticulocyte binding protein homologue 5


分子量: 59993.844 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Plasmodium falciparum (マラリア病原虫)
遺伝子: PF3D7_0424100
発現宿主: Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ)
参照: UniProt: Q8IFM5
#2: 抗体 R5.011 light chain


分子量: 23065.367 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#3: 抗体 R5.011 heavy chain


分子量: 25685.484 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#4: 抗体 R5.016 light chain


分子量: 23953.613 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#5: 抗体 R5.016 heavy chain


分子量: 50902.977 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
Has protein modificationY

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実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.38 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.25 %
結晶化温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法
詳細: 10% PEG 20000, 20% PEG 550MME, 0.02 M amino acids, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID23-1 / 波長: 0.9763 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年11月30日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.9763 Å / 相対比: 1
反射解像度: 3.58→49.16 Å / Num. obs: 41777 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 6.7 % / Net I/σ(I): 4.7
反射 シェル解像度: 3.58→3.73 Å / Num. unique obs: 4579

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX(1.10.1_2155: ???)精密化
XDSデータ削減
XDSデータスケーリング
PHASER位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 3.582→49.156 Å / SU ML: 0.43 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 37.46
Rfactor反射数%反射
Rfree0.3054 2037 4.91 %
Rwork0.2802 --
obs0.2815 41468 99.17 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 3.582→49.156 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数18311 0 0 0 18311
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.00918771
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d1.27725500
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d23.2336816
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.2522833
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.0073220
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
3.5822-3.66550.40061310.38372524X-RAY DIFFRACTION97
3.6655-3.75720.35661490.35772563X-RAY DIFFRACTION99
3.7572-3.85870.34681660.32262565X-RAY DIFFRACTION99
3.8587-3.97220.31641440.3372601X-RAY DIFFRACTION100
3.9722-4.10040.35571320.31792596X-RAY DIFFRACTION99
4.1004-4.24680.3471230.28862620X-RAY DIFFRACTION99
4.2468-4.41680.30561210.27732626X-RAY DIFFRACTION99
4.4168-4.61770.29041120.26122629X-RAY DIFFRACTION99
4.6177-4.86090.29521110.25282661X-RAY DIFFRACTION100
4.8609-5.16520.25731450.25882634X-RAY DIFFRACTION100
5.1652-5.56350.31151200.26852655X-RAY DIFFRACTION100
5.5635-6.12240.35971380.26942646X-RAY DIFFRACTION100
6.1224-7.00610.29661150.29652697X-RAY DIFFRACTION100
7.0061-8.81870.30491200.25132730X-RAY DIFFRACTION100
8.8187-49.16030.23912100.22392684X-RAY DIFFRACTION97
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
12.96380.03120.96612.228-1.90654.9025-0.10890.09930.08080.01910.098-0.06070.12820.05930.03960.54160.12180.12330.6562-0.00890.390322.9651-71.2531-10.8609
23.0552-0.24550.16161.87411.58911.2470.5741-0.0582-1.120.2135-0.3657-0.37121.63830.3375-0.30371.06580.01920.06351.22540.15981.066817.3909-101.29194.6809
32.396-0.8881.11353.1821-0.02042.402-0.0902-0.2255-0.31630.15340.2277-0.39730.7371-0.0121-0.09920.69450.19650.11830.55760.03240.466415.4302-83.5318-6.5539
42.4863-0.88741.48990.58620.24635.9310.1963-0.0508-0.25510.0895-0.1622-0.5998-0.3506-0.328-0.01120.54470.03010.03050.81180.1060.358833.3894-72.402926.644
53.7203-0.8357-1.81571.72180.45441.38420.459-0.66220.8877-0.2873-0.27770.6512-1.803-0.8869-0.30451.28780.3743-0.10371.4625-0.09050.744618.2748-52.819166.0718
62.6243-1.062-1.14532.0163-1.00056.6280.0462-0.0057-0.43170.5337-0.4811.1762-0.2704-0.7490.46780.7460.1506-0.05721.2341-0.14810.561225.1995-65.741561.5522
71.34330.26330.2463.70761.82834.1777-0.271-0.6043-0.16530.5721-0.74260.4613-0.7082-1.34450.89130.87520.1826-0.14671.0838-0.19520.829723.2995-61.215861.0842
81.2142-0.36620.29042.51660.84651.5224-0.4816-0.77960.29110.76720.51870.2484-0.51020.3096-0.19930.9919-0.03570.01751.2728-0.00360.436829.613-64.410767.1499
94.767-0.57790.74291.3442-0.37214.9103-0.3111-0.5223-0.05620.04980.0915-0.0582-0.3178-0.81040.17350.56390.112-0.03020.8571-0.07150.411312.8283-61.070121.7481
101.13280.1560.75920.6122-0.07385.2372-0.3742-0.31250.39910.3861-0.0248-0.0482-1.1089-0.61430.41930.8910.2779-0.13860.91160.00020.733620.5928-57.755738.5786
115.91470.7028-1.91031.32011.50665.08810.8998-2.1271.4417-0.2794-0.5559-0.3275-1.22681.4413-0.2371.8937-0.0083-0.24781.519-0.30830.930430.8276-43.016660.7087
121.3232-0.2991.30152.9899-1.53221.8860.95671.03531.4962-0.2277-0.2942-0.0323-0.7927-0.7666-0.40421.62990.772-0.24451.61580.14510.847117.5854-42.672556.0932
135.4383-0.5166-0.55672.99471.57982.47781.1912-0.44611.240.5395-0.71210.0156-0.68150.5111-0.72591.0343-0.1250.18010.7323-0.06780.731944.7361-44.4528-21.4527
145.4861.37381.10223.49230.59926.26710.23390.1449-0.15420.3236-0.2278-0.33010.03490.641-0.00020.79850.01350.10670.7153-0.12570.583544.1576-53.4046-17.6065
152.9328-0.2427-1.96632.77540.38131.02360.4406-0.69060.96470.20780.0851-1.1166-0.55921.2056-0.5040.8636-0.28350.10491.469-0.1681.146872.696-48.1488-28.8582
162.2398-1.57551.3032.2211-2.06432.02981.38620.76430.0291-0.13720.47160.37710.21650.9438-1.17521.5536-0.33950.45171.7573-0.70091.519883.4317-40.6292-24.9826
174.54411.0726-1.41853.30970.47233.6482-0.16180.96870.2475-0.02420.3371-0.2101-0.4703-0.1753-0.20240.6510.04030.06320.9402-0.05610.357241.6739-64.2008-35.9521
184.42510.66030.91542.41221.38144.03730.34010.4145-0.06170.90730.3321-0.54490.39770.7862-0.52290.91810.1127-0.04870.99460.01991.002179.1066-62.5017-29.0281
191.7195-0.7140.57232.51493.64326.0228-0.0742-0.2140.13690.3516-0.0190.15540.1186-0.46290.0280.59510.07890.03610.84820.11730.3459-24.8947-71.4575-0.5122
203.09170.7644-0.50549.0342.31772.1021-0.29240.1405-0.3362-0.127-0.16362.5170.940.32070.60640.983-0.0809-0.04580.92080.04330.6345-35.9325-84.4161-18.5268
213.7432-0.5933-0.34061.8383-0.51540.3873-0.2199-0.122-0.38410.36930.162-0.02830.1967-0.07880.07120.7180.11020.06040.6883-0.08150.5251-14.1063-74.03252.5563
222.7508-3.420.9477.88481.07461.64460.16781.246-0.6496-0.09280.18180.48560.69490.0298-0.43142.5823-0.403-0.3220.41520.29081.7043-25.5623-109.3543-25.2783
233.01241.21680.42192.8640.25711.3943-0.01110.3174-0.5001-0.03070.1066-0.01070.352-0.3187-0.0320.68380.11810.07810.8454-0.05410.4425-15.169-83.3126-4.5787
242.11181.63940.54743.03081.9764.6504-0.15130.0731-0.0022-0.04760.00770.54190.13190.02930.06360.54850.12180.02660.88270.01450.4368-34.1963-72.8676-36.2568
251.98070.52991.58611.9679-1.25194.617-0.38710.04070.3499-0.59850.2956-0.09610.2508-0.1011-0.00220.5640.18860.06220.3906-0.03080.4286-26.2354-64.0326-62.4721
261.05863.0754-0.51828.7379-1.24683.3392-0.25710.55221.2842-1.5784-0.0432-1.45010.20180.2693-0.09860.7260.38750.11221.0761-0.01130.9556-19.4311-68.9437-77.2734
273.14650.92850.37092.79550.24113.2803-0.39260.3174-0.0949-0.77260.0675-0.07340.01430.03750.08520.76130.2517-0.07061.08920.03280.5201-23.3769-61.2195-72.2812
284.89992.1008-0.74927.1336-1.25186.4255-2.3930.3121-0.1846-0.83861.0296-1.01680.2364-0.18930.88010.73190.18540.08120.82370.00420.5425-30.0314-64.9276-77.8967
295.31471.7851-0.51242.6431-1.06123.791-0.26210.2638-0.00410.09460.022-0.22380.0588-0.37840.24750.56240.1817-0.09140.7899-0.02670.3723-15.6347-62.8721-31.8863
303.52860.711-0.33240.15360.14162.84250.57760.44931.56740.3347-0.86510.61120.31640.1940.04920.6971-0.0895-0.00340.77260.24951.0912-14.3895-51.5107-66.392
312.2210.8602-1.15934.25280.8214.3826-0.0707-0.20510.20810.08190.15650.2661-0.16890.5217-0.34740.7416-0.1094-0.15381.0180.17760.6173-20.885-51.7808-63.1537
323.6161-1.38841.68322.6312-1.0742.03720.24811.19581.6071-0.42410.10351.9506-1.8918-0.4001-0.07280.99490.277-0.30071.59360.4331.0205-31.3743-43.1081-71.7933
333.59510.6081-1.52222.48430.47890.86171.4767-0.09620.5306-0.6449-0.3866-0.67440.1246-0.1478-0.87851.4977-0.0769-0.01131.1292-0.00850.779-18.3249-42.5428-67.4655
345.69930.0930.26883.1876-1.14514.7033-0.05750.19060.6937-0.66520.23190.6843-0.4387-0.1444-0.27160.82890.3273-0.03030.74210.11550.7078-44.4535-50.33397.4583
351.8919-0.77880.3020.9728-0.67311.15560.2715-0.05970.9996-0.18790.33671.2145-0.3383-0.3368-0.69141.03250.37510.08851.23510.09761.7476-73.8877-47.287516.9674
365.6078-0.8901-2.11922.76020.12443.51380.1131-0.1710.418-0.01960.23170.3316-0.30510.0672-0.36160.63340.22790.00430.82050.05170.3856-40.9925-63.992124.6405
373.5976-0.5891-0.3764-0.0311-0.2750.98740.111-0.662-0.644-0.37990.34161.16880.4077-0.9525-0.30910.97670.0665-0.27311.39070.11551.5122-76.814-63.339118.7785
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 144 through 375 )
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 376 through 403 )
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 404 through 500 )
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'B' and (resid 2 through 115 )
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'B' and (resid 116 through 131 )
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'B' and (resid 132 through 163 )
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'B' and (resid 164 through 192 )
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'B' and (resid 193 through 212 )
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'C' and (resid 1 through 91 )
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'C' and (resid 92 through 192 )
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'C' and (resid 193 through 209 )
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'C' and (resid 210 through 231 )
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'D' and (resid 2 through 32 )
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'D' and (resid 33 through 90 )
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'D' and (resid 91 through 198 )
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'D' and (resid 199 through 211 )
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'E' and (resid 1 through 127 )
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'E' and (resid 128 through 232 )
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'F' and (resid 144 through 239 )
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'F' and (resid 240 through 320 )
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'F' and (resid 321 through 395 )
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'F' and (resid 396 through 403 )
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'F' and (resid 404 through 499 )
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'G' and (resid 2 through 91 )
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'G' and (resid 92 through 152 )
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'G' and (resid 153 through 163 )
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'G' and (resid 164 through 192 )
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'G' and (resid 193 through 211 )
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'H' and (resid 1 through 126 )
30X-RAY DIFFRACTION30chain 'H' and (resid 127 through 150 )
31X-RAY DIFFRACTION31chain 'H' and (resid 151 through 192 )
32X-RAY DIFFRACTION32chain 'H' and (resid 193 through 208 )
33X-RAY DIFFRACTION33chain 'H' and (resid 209 through 231 )
34X-RAY DIFFRACTION34chain 'I' and (resid 2 through 90 )
35X-RAY DIFFRACTION35chain 'I' and (resid 91 through 211 )
36X-RAY DIFFRACTION36chain 'J' and (resid 1 through 119 )
37X-RAY DIFFRACTION37chain 'J' and (resid 120 through 232 )

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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