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- PDB-6qfd: The complex structure of hsRosR-S4 (vng0258/RosR-S4) -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 6qfd
タイトルThe complex structure of hsRosR-S4 (vng0258/RosR-S4)
要素
  • (DNA (28-MER)) x 2
  • DNA-binding protein
キーワードDNA BINDING PROTEIN / Halophiles / wHTH DNA binding protein / RosR / High salt medium / Protein-DNA interactions
機能・相同性Transcription regulator PadR, N-terminal / Transcriptional regulator PadR-like family / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / metal ion binding / : / DNA / DNA (> 10) / PadR family transcription regulator RosR
機能・相同性情報
生物種Halobacterium salinarum NRC-1 (好塩性)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.133 Å
データ登録者Shaanan, B. / Kutnowski, N.
資金援助 イスラエル, 1件
組織認可番号国
Israel Science Foundation1382/13 イスラエル
引用ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2019
タイトル: Specificity of protein-DNA interactions in hypersaline environment: structural studies on complexes of Halobacterium salinarum oxidative stress-dependent protein hsRosR.
著者: Kutnowski, N. / Shmulevich, F. / Davidov, G. / Shahar, A. / Bar-Zvi, D. / Eichler, J. / Zarivach, R. / Shaanan, B.
履歴
登録2019年1月10日登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.02019年7月10日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12019年7月24日Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author
Item: _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title ..._citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name
改定 1.22019年10月23日Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation
Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last
改定 1.32024年1月24日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: DNA-binding protein
B: DNA-binding protein
C: DNA-binding protein
D: DNA-binding protein
E: DNA (28-MER)
F: DNA (28-MER)
G: DNA (28-MER)
H: DNA (28-MER)
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)90,17343
ポリマ－87,1408
非ポリマー3,03335
水2,090116
1
A: DNA-binding protein
B: DNA-binding protein
E: DNA (28-MER)
F: DNA (28-MER)
ヘテロ分子


  • 登録者が定義した集合体
  • 根拠: SAXS, SAXS results indicating that one protein dimer bound a single sequence., gel filtration, The elution volume of the complex indicated that hsRosR binds one DNA molecule as a dimer., ...根拠: SAXS, SAXS results indicating that one protein dimer bound a single sequence., gel filtration, The elution volume of the complex indicated that hsRosR binds one DNA molecule as a dimer., isothermal titration calorimetry, The binding stoichiometry was approximately one, indicating that one protein dimer bound a single sequence.
  • 45.1 kDa, 4 ポリマー
  • Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)45,09422
ポリマ－43,5704
非ポリマー1,52418
水724
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
2
C: DNA-binding protein
D: DNA-binding protein
G: DNA (28-MER)
H: DNA (28-MER)
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)45,08021
ポリマ－43,5704
非ポリマー1,51017
水724
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
単位格子
Length a, b, c (Å)46.805, 83.995, 88.876
Angle α, β, γ (deg.)81.530, 86.180, 74.480
Int Tables number1
Space group name H-MP1

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要素

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タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質
DNA-binding protein


分子量: 13179.443 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: hsRosR-DNA binding protein
由来: (組換発現) Halobacterium salinarum NRC-1 (好塩性)
遺伝子: VNG_0258H / Variant: NRC-1 / 発現宿主: Haloferax volcanii (古細菌) / 参照: UniProt: Q9HSF4

-
DNA鎖 , 2種, 4分子 EGFH

#2: DNA鎖 DNA (28-MER)


分子量: 8525.505 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: DNA sequence (28-MER) / 由来: (合成) Halobacterium salinarum NRC-1 (好塩性)
#3: DNA鎖 DNA (28-MER)


分子量: 8685.601 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: DNA sequence (28-MER) / 由来: (合成) Halobacterium salinarum NRC-1 (好塩性)

-
非ポリマー , 3種, 151分子

#4: 化合物...
ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン


分子量: 96.063 Da / 分子数: 27 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: SO4
#5: 化合物
ChemComp-MN / MANGANESE (II) ION


分子量: 54.938 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: Mn
#6: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 116 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.74 Å3/Da / 溶媒含有率: 60 %
結晶化温度: 293 K
詳細: The complex crystallized from a buffer containing 20 mM HEPES, pH 7, 2 M KCl and 0.02% azide. Crystals grown with S4 (DNA/hsRosR ratio = 1.45) appeared after 3 days in wells containing 2.94 M ...詳細: The complex crystallized from a buffer containing 20 mM HEPES, pH 7, 2 M KCl and 0.02% azide. Crystals grown with S4 (DNA/hsRosR ratio = 1.45) appeared after 3 days in wells containing 2.94 M (NH4)2SO4, 40 mM MnCl2 and 0.02% azide.
手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7
詳細: The complex crystallized from a buffer containing 20 mM HEPES, pH 7, 2 M KCl and 0.02% azide. Crystals grown with S4 (DNA/hsRosR ratio = 1.45) appeared after 3 days in wells containing 2.94 M ...詳細: The complex crystallized from a buffer containing 20 mM HEPES, pH 7, 2 M KCl and 0.02% azide. Crystals grown with S4 (DNA/hsRosR ratio = 1.45) appeared after 3 days in wells containing 2.94 M (NH4)2SO4, 40 mM MnCl2 and 0.02% azide.

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06DA / 波長: 1.00003 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS 2M / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年12月17日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1.00003 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.133→44.585 Å / Num. obs: 45836 / % possible obs: 89.4 % / 冗長度: 3.7 % / Rpim(I) all: 0.037 / Net I/σ(I): 10
反射 シェル解像度: 2.133→2.356 Å

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX1.14_3260精密化
XDSデータ削減
Aimlessデータスケーリング
STARANISOデータスケーリング
PHASER位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: The starting model for molecular replacement was VNG0258H/RosR (from KCl; PDB code 6FDH) and a DNA model derived from Mycobacterium tuberculosis MosR (PDB code 4FX4).

6fdh

4fx4


解像度: 2.133→44.585 Å / SU ML: 0.27 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.96 / 位相誤差: 33.55
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2318 2308 5.04 %
Rwork0.2099 --
obs0.211 45794 63.76 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
原子変位パラメータBiso max: 801.25 Å2 / Biso mean: 77.923 Å2 / Biso min: 20.41 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 2.133→44.585 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数3667 2296 143 116 6222
Biso mean--127.74 42.28 -
残基数----570
LS精密化 シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0 / Total num. of bins used: 16

解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkNum. reflection all% reflection obs (%)
2.1331-2.17950.342130.34561261293
2.1795-2.23020.3951250.33462913167
2.2302-2.2860.3707420.327956861014
2.286-2.34780.3728540.31721131118526
2.3478-2.41680.31661010.31081516161737
2.4168-2.49480.32651150.31392017213248
2.4948-2.5840.34441260.32762488261458
2.584-2.68740.34991550.32962953310869
2.6874-2.80970.32311810.30313597377884
2.8097-2.95780.33052290.29214122435197
2.9578-3.14310.29142360.27784161439798
3.1431-3.38570.2752230.23434101432497
3.3857-3.72630.21082350.19524144437998
3.7263-4.26510.20131920.16924219441197
4.2651-5.37220.18051810.16234063424495
5.3722-44.59450.16772100.16313989419993
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
13.46785.0077-3.59487.3572-4.64845.1663-0.20991.7747-1.9256-2.0649-1.0123-2.62761.65760.97881.41121.26140.3860.31561.0734-0.05551.046116.8559-14.7448-23.7103
22.4843-6.19567.2832.2063-5.17374.1504-0.4831-0.1422-0.24960.02150.4562-0.2111-0.0221-0.25820.25430.4442-0.0130.03540.3689-0.06870.45710.9788-18.121-11.222
34.9377-5.1472-2.40956.20660.78055.0247-0.1489-0.604-0.29450.02890.55680.18870.6404-0.026-0.42610.3448-0.0622-0.09420.30340.00020.53323.5463-19.5605-6.0478
47.47270.60543.68549.8149-1.41667.1757-0.5859-0.32520.1889-0.996-0.2111.36120.5218-0.7530.72350.4299-0.1523-0.28870.4128-0.11150.631-2.541-21.0085-12.7177
52.1312-3.1517-3.50580.91891.08263.0509-0.14760.9175-1.2835-1.45490.3646-0.65431.2081-0.3553-0.24951.0153-0.05420.01010.4965-0.23740.73148.7935-25.3782-19.4057
61.83380.91360.32283.3625-1.08622.813-0.28430.1486-1.4186-0.93340.0703-0.58251.38350.31580.29990.82860.12360.11940.3789-0.10471.012913.1837-29.3691-11.9641
74.38170.48982.80144.85882.44978.2513-0.30330.53770.0242-0.57240.2702-0.2133-0.2880.85480.05490.2865-0.02140.08660.41990.06960.443822.2247-2.3308-12.5314
87.27575.2992-3.35955.9914-2.12628.0808-0.2234-0.4763-0.58540.4979-0.499-1.40780.01010.07520.46070.13480.0719-0.02990.38880.0010.42821.2489-6.4351.6737
98.5587-4.03931.28622.1175-8.75468.2610.0568-0.07520.34090.83561.10840.9936-0.7467-2.1093-0.5660.38870.04040.10470.60920.16920.4992.7344-2.6102-8.5448
102.30487.05486.45418.29928.10212.3288-0.82351.02110.4407-1.42110.744-0.2803-0.41430.41730.12770.4162-0.0310.03590.42860.09720.399212.2970.0245-19.1923
115.9349-2.633.56028.6822-3.19133.81870.17411.48360.1513-2.075-0.2206-0.60340.18380.7459-0.01240.9312-0.05450.11670.71230.01530.36613.00690.1162-29.0895
122.0164-1.36060.2422.05777.13018.1449-0.54480.05910.2567-1.1416-0.38941.4108-0.2708-1.67620.58170.55310.0007-0.1990.68340.10220.62031.58623.8828-20.0573
138.18362.9216-6.37099.5662-7.56278.0277-0.08310.99241.4253-0.370.2247-0.1266-1.3115-0.2489-0.32590.944-0.0078-0.14020.57270.14240.57517.909514.3776-25.1075
143.3476-6.89587.95459.6563-4.40067.0332-0.31590.0310.2301-0.61710.1941-0.4644-0.2781-0.21730.11370.2852-0.06870.03330.3310.03860.313510.67853.2717-11.1814
154.14434.17581.66174.46722.96967.1445-0.2871-0.62-0.5747-0.11820.1529-0.15960.20070.08670.09070.22780.0595-0.01440.35260.02920.483418.4118-14.0384-4.7089
166.0663-3.81481.41056.5869-0.85659.6980.17760.2542-0.041-0.2992-0.5617-1.3207-0.5041.39650.56660.2771-0.03280.13170.738-0.05530.599129.7676-5.0388-9.2192
178.58472.01778.59262.01021.91568.7754-1.28831.9793-1.655-1.95541.6911-2.9047-1.12193.2275-0.630.531-0.02490.27420.9066-0.2070.37988.9032-9.627915.1835
188.68365.1928-3.26949.393-2.2166.90910.18170.04630.46830.51390.58781.1299-0.7043-0.6796-0.70880.21460.04770.05080.2322-0.00320.31553.44032.07679.6893
192.49814.1617-7.31182.2034-3.42266.81950.7352-0.68881.07331.2478-0.06620.7812-1.079-0.2226-0.64720.64120.01320.16440.4965-0.0530.54511.186110.138114.9222
206.72731.58361.90145.47234.64218.78590.3731-0.9357-0.3181.0107-0.3094-0.6492-0.74870.5483-0.29230.4672-0.1529-0.02050.4654-0.08330.228912.52953.913814.2874
217.18025.27090.93542.37481.78744.8826-0.39430.95590.0327-0.75240.527-0.6302-0.74150.7218-0.16630.3582-0.09640.0440.53050.03690.389612.14215.41483.3204
226.04592.6149-8.48189.9188-3.6281.98630.5862-1.1803-2.11861.58360.2967-2.08771.66321.8626-0.63260.41820.1692-0.2120.6398-0.00570.71342.041-10.09587.8083
236.51622.88692.13791.96120.84187.84340.5741-0.1438-1.0250.08430.24420.61820.3632-0.7144-0.8140.30970.01170.00420.41220.1870.6704-10.4213-15.16829.5636
242.39134.7077-1.71242.2409-6.51062.3439-0.08130.16270.49870.46780.62410.1929-0.9171-1.6582-0.58510.40890.1240.10560.56380.10550.6276-14.6789-2.64322.823
256.51611.1023.62931.0309-0.04262.77260.1827-0.47470.76631.15-0.09970.9316-0.9993-0.9946-0.1080.57750.12770.230.80380.12410.618-4.3605-4.075922.5575
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491.36652.7016-1.39515.2741-2.82135.47340.5342-1.5893-0.59250.8559-0.6662-0.59570.76360.64180.19351.7185-0.49290.20750.78742.8323-1.85786.1942-25.119843.3579
504.6757-0.39360.35610.212-0.93234.12880.6281-0.6064-1.05120.3232-0.7422-0.771.6505-0.23570.0771.6555-0.0697-0.01141.36460.80761.3117-3.7703-37.896137.7259
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558.6592-4.5361.43233.4001-1.47489.5352-0.3555-1.33732.50292.0525-0.7592.0693-1.83052.74010.99681.6898-0.5363-0.06560.9211-0.24581.146518.529319.274322.8997
563.36084.07870.33475.572.35618.1179-0.61350.48890.23771.40770.20740.9621-2.9040.87890.48931.4738-0.4078-0.12650.65690.29541.287915.643726.07326.3447
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1(chain A and resid 7:16)A7 - 16
2X-RAY DIFFRACTION2(chain A and resid 17:29)A17 - 29
3X-RAY DIFFRACTION3(chain A and resid 30:46)A30 - 46
4X-RAY DIFFRACTION4(chain A and resid 47:53)A47 - 53
5X-RAY DIFFRACTION5(chain A and resid 54:66)A54 - 66
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8X-RAY DIFFRACTION8(chain A and resid 107:121)A107 - 121
9X-RAY DIFFRACTION9(chain B and resid 6:15)B6 - 15
10X-RAY DIFFRACTION10(chain B and resid 16:30)B16 - 30
11X-RAY DIFFRACTION11(chain B and resid 31:55)B31 - 55
12X-RAY DIFFRACTION12(chain B and resid 56:64)B56 - 64
13X-RAY DIFFRACTION13(chain B and resid 65:76)B65 - 76
14X-RAY DIFFRACTION14(chain B and resid 77:93)B77 - 93
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16X-RAY DIFFRACTION16(chain B and resid 106:121)B106 - 121
17X-RAY DIFFRACTION17(chain C and resid 11:16)C11 - 16
18X-RAY DIFFRACTION18(chain C and resid 17:31)C17 - 31
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20X-RAY DIFFRACTION20(chain C and resid 48:66)C48 - 66
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25X-RAY DIFFRACTION25(chain D and resid 7:22)D7 - 22
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28X-RAY DIFFRACTION28(chain D and resid 49:78)D49 - 78
29X-RAY DIFFRACTION29(chain D and resid 79:92)D79 - 92
30X-RAY DIFFRACTION30(chain D and resid 93:99)D93 - 99
31X-RAY DIFFRACTION31(chain D and resid 100:103)D100 - 103
32X-RAY DIFFRACTION32(chain D and resid 104:121)D104 - 121
33X-RAY DIFFRACTION33(chain E and resid 1:4)E1 - 4
34X-RAY DIFFRACTION34(chain E and resid 5:11)E5 - 11
35X-RAY DIFFRACTION35(chain E and resid 12:15)E12 - 15
36X-RAY DIFFRACTION36(chain E and resid 16:19)E16 - 19
37X-RAY DIFFRACTION37(chain E and resid 20:23)E20 - 23
38X-RAY DIFFRACTION38(chain E and resid 24:28)E24 - 28
39X-RAY DIFFRACTION39(chain F and resid 1:5)F1 - 5
40X-RAY DIFFRACTION40(chain F and resid 6:9)F6 - 9
41X-RAY DIFFRACTION41(chain F and resid 10:13)F10 - 13
42X-RAY DIFFRACTION42(chain F and resid 14:20)F14 - 20
43X-RAY DIFFRACTION43(chain F and resid 21:24)F21 - 24
44X-RAY DIFFRACTION44(chain F and resid 25:28)F25 - 28
45X-RAY DIFFRACTION45(chain G and resid 1:6)G1 - 6
46X-RAY DIFFRACTION46(chain G and resid 7:10)G7 - 10
47X-RAY DIFFRACTION47(chain G and resid 11:16)G11 - 16
48X-RAY DIFFRACTION48(chain G and resid 17:20)G17 - 20
49X-RAY DIFFRACTION49(chain G and resid 21:24)G21 - 24
50X-RAY DIFFRACTION50(chain G and resid 25:28)G25 - 28
51X-RAY DIFFRACTION51(chain H and resid 1:5)H1 - 5
52X-RAY DIFFRACTION52(chain H and resid 6:11)H6 - 11
53X-RAY DIFFRACTION53(chain H and resid 12:15)H12 - 15
54X-RAY DIFFRACTION54(chain H and resid 16:19)H16 - 19
55X-RAY DIFFRACTION55(chain H and resid 20:23)H20 - 23
56X-RAY DIFFRACTION56(chain H and resid 24:28)H24 - 28

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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