登録情報 | データベース: PDB / ID: 6qf1 |
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タイトル | X-Ray structure of Proteinase K crystallized on a silicon chip |
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要素 | Proteinase K |
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キーワード | HYDROLASE / Proteinase K / on-chip crystallization / in-situ crystallization / room-temperature |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
peptidase K / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular space / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Proteinase K-like catalytic domain / Peptidase S8/S53 domain / : / Peptidase S8 propeptide/proteinase inhibitor I9 / Peptidase inhibitor I9 / Peptidase S8 propeptide/proteinase inhibitor I9 superfamily / Peptidase S8, subtilisin, His-active site / Serine proteases, subtilase family, histidine active site. / Serine proteases, subtilase family, aspartic acid active site. / Peptidase S8, subtilisin, Asp-active site ...Proteinase K-like catalytic domain / Peptidase S8/S53 domain / : / Peptidase S8 propeptide/proteinase inhibitor I9 / Peptidase inhibitor I9 / Peptidase S8 propeptide/proteinase inhibitor I9 superfamily / Peptidase S8, subtilisin, His-active site / Serine proteases, subtilase family, histidine active site. / Serine proteases, subtilase family, aspartic acid active site. / Peptidase S8, subtilisin, Asp-active site / Serine proteases, subtilase family, serine active site. / Peptidase S8, subtilisin, Ser-active site / Serine proteases, subtilase domain profile. / Peptidase S8, subtilisin-related / Peptidase S8/S53 domain superfamily / Subtilase family / Peptidase S8/S53 domain / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Parengyodontium album (菌類) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.737 Å |
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データ登録者 | Lieske, J. / Cerv, M. / Kreida, S. / Barthelmess, M. / Fischer, P. / Pakendorf, T. / Yefanov, O. / Mariani, V. / Seine, T. / Ross, B.H. ...Lieske, J. / Cerv, M. / Kreida, S. / Barthelmess, M. / Fischer, P. / Pakendorf, T. / Yefanov, O. / Mariani, V. / Seine, T. / Ross, B.H. / Crosas, E. / Lorbeer, O. / Burkhardt, A. / Lane, T.J. / Guenther, S. / Bergtholdt, J. / Schoen, S. / Tornroth-Horsefield, S. / Chapman, H.N. / Meents, A. |
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資金援助 | ドイツ, スウェーデン, 米国, 6件 組織 | 認可番号 | 国 |
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European Research Council | 609920 | ドイツ | European Union | Horizon 2020, No. 654220 | ドイツ | German Federal Ministry for Education and Research | 05K2018-2017-06727MXD | ドイツ | Swedish Research Council | 2010-5208 | スウェーデン | Swedish Research Council | 2012-2849 | スウェーデン | Department of Energy (DOE, United States) | DE-AC02-76SF00515 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Iucrj / 年: 2019 タイトル: On-chip crystallization for serial crystallography experiments and on-chip ligand-binding studies. 著者: Lieske, J. / Cerv, M. / Kreida, S. / Komadina, D. / Fischer, J. / Barthelmess, M. / Fischer, P. / Pakendorf, T. / Yefanov, O. / Mariani, V. / Seine, T. / Ross, B.H. / Crosas, E. / Lorbeer, O. ...著者: Lieske, J. / Cerv, M. / Kreida, S. / Komadina, D. / Fischer, J. / Barthelmess, M. / Fischer, P. / Pakendorf, T. / Yefanov, O. / Mariani, V. / Seine, T. / Ross, B.H. / Crosas, E. / Lorbeer, O. / Burkhardt, A. / Lane, T.J. / Guenther, S. / Bergtholdt, J. / Schoen, S. / Tornroth-Horsefield, S. / Chapman, H.N. / Meents, A. |
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履歴 | 登録 | 2019年1月9日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2019年7月10日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2019年7月31日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title |
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改定 1.2 | 2022年3月30日 | Group: Author supporting evidence / Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / pdbx_audit_support ...database_2 / pdbx_audit_support / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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改定 1.3 | 2024年1月24日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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