登録情報 | データベース: PDB / ID: 6p3q |
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タイトル | Calpain-5 (CAPN5) Protease Core (PC) |
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要素 | Calpain-5 |
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キーワード | HYDROLASE / Cystein protease / peptide binding protein / Calcium binding protein / protease domain |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity / Degradation of the extracellular matrix / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; システインプロテアーゼ / focal adhesion / synapse / cell surface / signal transduction / proteolysis / extracellular exosome / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Calpain C2 domain / Calpain subdomain III / Peptidase C2, calpain, domain III / calpain_III / Peptidase C2, calpain, large subunit, domain III / Peptidase C2, calpain family / Calpain large subunit, domain III superfamily / Calpain large subunit, domain III / Peptidase C2, calpain, catalytic domain / Calpain family cysteine protease ...Calpain C2 domain / Calpain subdomain III / Peptidase C2, calpain, domain III / calpain_III / Peptidase C2, calpain, large subunit, domain III / Peptidase C2, calpain family / Calpain large subunit, domain III superfamily / Calpain large subunit, domain III / Peptidase C2, calpain, catalytic domain / Calpain family cysteine protease / Cysteine proteinase, calpain-type, catalytic domain profile. / Calpain-like thiol protease family. / C2 domain / Protein kinase C conserved region 2 (CalB) / Cysteine proteinases / Cysteine peptidase, cysteine active site / Eukaryotic thiol (cysteine) proteases cysteine active site. / C2 domain / C2 domain profile. / Cathepsin B; Chain A / C2 domain superfamily / Papain-like cysteine peptidase superfamily / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.8 Å |
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データ登録者 | Velez, G. / Sun, Y.J. / Khan, S. / Yang, J. / Koster, H.J. / Lokesh, G. / Mahajan, V. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Eye Institute (NIH/NEI) | R01EY024665 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Cell Rep / 年: 2020 タイトル: Structural Insights into the Unique Activation Mechanisms of a Non-classical Calpain and Its Disease-Causing Variants. 著者: Velez, G. / Sun, Y.J. / Khan, S. / Yang, J. / Herrmann, J. / Chemudupati, T. / MacLaren, R.E. / Gakhar, L. / Wakatsuki, S. / Bassuk, A.G. / Mahajan, V.B. |
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履歴 | 登録 | 2019年5月24日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2020年2月5日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2024年3月13日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id |
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改定 1.2 | 2024年4月3日 | Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model |
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