登録情報 | データベース: PDB / ID: 6lui |
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タイトル | Crystal structure of the SAMD1 WH domain and DNA complex |
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要素 | - Atherin
- DNA (5'-D(*AP*CP*CP*TP*GP*CP*GP*CP*AP*CP*CP*AP*T)-3')
- DNA (5'-D(*AP*TP*GP*GP*TP*GP*CP*GP*CP*AP*GP*GP*T)-3')
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キーワード | DNA BINDING PROTEIN / CpG islands / transcription / polycomb |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
lipoprotein lipid oxidation / foam cell differentiation / regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin formation / low-density lipoprotein particle binding / protein homooligomerization / chromatin organization / chromosome / chromatin binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / DNA binding ...lipoprotein lipid oxidation / foam cell differentiation / regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin formation / low-density lipoprotein particle binding / protein homooligomerization / chromatin organization / chromosome / chromatin binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / DNA binding / extracellular space / nucleus類似検索 - 分子機能 : / SAM domain-containing protein 1, WH domain / SAMD1-like winged helix (WH) domain profile. / SAM domain (Sterile alpha motif) / SAM domain profile. / Sterile alpha motif. / Sterile alpha motif domain / Sterile alpha motif/pointed domain superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / Sterile alpha motif domain-containing protein 1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 1.781 Å |
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データ登録者 | Zhou, Y. / Cao, Y. / Wang, Z. |
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資金援助 | 中国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Natural Science Foundation of China (NSFC) | 31870725 | 中国 | National Natural Science Foundation of China (NSFC) | 31570729 | 中国 |
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引用 | ジャーナル: Sci Adv / 年: 2021 タイトル: The SAM domain-containing protein 1 (SAMD1) acts as a repressive chromatin regulator at unmethylated CpG islands. 著者: Stielow, B. / Zhou, Y. / Cao, Y. / Simon, C. / Pogoda, H.M. / Jiang, J. / Ren, Y. / Phanor, S.K. / Rohner, I. / Nist, A. / Stiewe, T. / Hammerschmidt, M. / Shi, Y. / Bulyk, M.L. / Wang, Z. / Liefke, R. |
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履歴 | 登録 | 2020年1月29日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2021年2月3日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2021年7月7日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year |
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