PDB-6kxk: BON1

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6kxk

タイトル

BON1

要素

(Protein BONZAI ...) x 5

キーワード

LIPID BINDING PROTEIN /

Copines / BON1 /

C2 domain (C2ドメイン) / vWA domain /

Phospholipid (リン脂質) /

Membrane. (生体膜)

機能・相同性

機能・相同性情報

response to humidity /

原形質連絡 / calcium-dependent phospholipid binding /

色素体 / response to temperature stimulus / positive regulation of cell size / defense response /

metal ion binding /

細胞膜
類似検索 - 分子機能

生物種

Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.5 Å

データ登録者

Wang, Q.C. / Jiang, M.Q. / Isupov, M.N. / Sun, L.F. / Wu, Y.K.

引用

ジャーナル: To be published
タイトル: Crystal Structure of an Arabidopsis Copine providing insights into this protein family
著者: Wang, Q.C. / Jiang, M.Q. / Isupov, M.N. / Sun, L.F. / Wu, Y.K.

履歴

登録	2019年9月12日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2020年9月16日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年3月27日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6kxk.cif.gz	884.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6kxk.ent.gz	714.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6kxk.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kx/6kxk ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kx/6kxk	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	6kxtC 6kxuC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6kxu-1 6kxu-3 6kxu-6 6kxu-4 6kxu-8 6kxu-5 1e57-d 1wrl-d 3bb5-d 6sur-3 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#196 - 2016年4月鉛の毒 (Lead Poisoning) 類似性 (5) #134 - 2011年2月インテグリン (Integrin) 類似性 (4) #148 - 2012年4月 Rasタンパク質 (Ras Protein) 類似性 (5) #239 - 2019年11月ホスホリパーゼA2 (Phospholipase A2) 類似性 (5) #55 - 2004年7月 DNAリガーゼ (DNA Ligase) 類似性 (3) #166 - 2013年10月プロテアソーム (Proteasome) 類似性 (3)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#196 - 2016年4月
鉛の毒 (Lead Poisoning)
類似性 (5)
#134 - 2011年2月
インテグリン (Integrin)
類似性 (4)
#148 - 2012年4月
Rasタンパク質 (Ras Protein)
類似性 (5)
#239 - 2019年11月
ホスホリパーゼA2 (Phospholipase A2)
類似性 (5)
#55 - 2004年7月
DNAリガーゼ (DNA Ligase)
類似性 (3)
#166 - 2013年10月
プロテアソーム (Proteasome)
類似性 (3)

登録構造単位

A: Protein BONZAI 1

B: Protein BONZAI 1

C: Protein BONZAI 1

D: Protein BONZAI 1

E: Protein BONZAI 1

F: Protein BONZAI 1

G: Protein BONZAI 1

H: Protein BONZAI 1

ヘテロ分子

494 kDa, 8 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Protein BONZAI 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
63.2 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

B: Protein BONZAI 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
59.8 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

3

C: Protein BONZAI 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
62.6 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

4

D: Protein BONZAI 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
63.1 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

5

E: Protein BONZAI 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
61.8 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

6

F: Protein BONZAI 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
62.8 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

7

G: Protein BONZAI 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
58.7 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

8

H: Protein BONZAI 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
61.6 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	122.284, 118.716, 222.253
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.200, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Component-ID: 0 / Refine code: 0

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	GLY	GLY	ARG	ARG	A	A	16 - 542	26 - 552
2	1	GLY	GLY	ARG	ARG	B	B	16 - 542	1 - 527
1	2	GLY	GLY	ASN	ASN	A	A	-9 - 543	1 - 553
2	2	GLY	GLY	ASN	ASN	C	C	-9 - 543	1 - 553
1	3	GLY	GLY	ASN	ASN	A	A	-9 - 543	1 - 553
2	3	GLY	GLY	ASN	ASN	D	D	-9 - 543	1 - 553
1	4	SER	SER	ASN	ASN	A	A	-6 - 543	4 - 553
2	4	SER	SER	ASN	ASN	E	E	-6 - 543	1 - 550
1	5	GLY	GLY	ASN	ASN	A	A	-9 - 543	1 - 553
2	5	GLY	GLY	ASN	ASN	F	F	-9 - 543	1 - 553
1	6	LEU	LEU	ARG	ARG	A	A	17 - 542	27 - 552
2	6	LEU	LEU	ARG	ARG	G	G	17 - 542	1 - 526
1	7	GLY	GLY	ASN	ASN	A	A	-9 - 543	1 - 553
2	7	GLY	GLY	ASN	ASN	H	H	-9 - 543	1 - 553
1	8	GLY	GLY	ARG	ARG	B	B	16 - 542	1 - 527
2	8	GLY	GLY	ARG	ARG	C	C	16 - 542	26 - 552
1	9	GLY	GLY	ARG	ARG	B	B	16 - 542	1 - 527
2	9	GLY	GLY	ARG	ARG	D	D	16 - 542	26 - 552
1	10	GLY	GLY	ARG	ARG	B	B	16 - 542	1 - 527
2	10	GLY	GLY	ARG	ARG	E	E	16 - 542	23 - 549
1	11	GLY	GLY	ARG	ARG	B	B	16 - 542	1 - 527
2	11	GLY	GLY	ARG	ARG	F	F	16 - 542	26 - 552
1	12	LEU	LEU	ARG	ARG	B	B	17 - 542	2 - 527
2	12	LEU	LEU	ARG	ARG	G	G	17 - 542	1 - 526
1	13	GLY	GLY	ARG	ARG	B	B	16 - 542	1 - 527
2	13	GLY	GLY	ARG	ARG	H	H	13 - 542	23 - 552
1	14	GLY	GLY	ASN	ASN	C	C	-9 - 543	1 - 553
2	14	GLY	GLY	ASN	ASN	D	D	-9 - 543	1 - 553
1	15	SER	SER	ASN	ASN	C	C	-6 - 543	4 - 553
2	15	SER	SER	ASN	ASN	E	E	-6 - 543	1 - 550
1	16	GLY	GLY	ASN	ASN	C	C	-9 - 543	1 - 553
2	16	GLY	GLY	ASN	ASN	F	F	-9 - 543	1 - 553
1	17	LEU	LEU	ARG	ARG	C	C	17 - 542	27 - 552
2	17	LEU	LEU	ARG	ARG	G	G	17 - 542	1 - 526
1	18	GLY	GLY	ASN	ASN	C	C	-9 - 543	1 - 553
2	18	GLY	GLY	ASN	ASN	H	H	-9 - 543	1 - 553
1	19	SER	SER	ASN	ASN	D	D	-6 - 543	4 - 553
2	19	SER	SER	ASN	ASN	E	E	-6 - 543	1 - 550
1	20	GLY	GLY	ASN	ASN	D	D	-9 - 543	1 - 553
2	20	GLY	GLY	ASN	ASN	F	F	-9 - 543	1 - 553
1	21	LEU	LEU	ARG	ARG	D	D	17 - 542	27 - 552
2	21	LEU	LEU	ARG	ARG	G	G	17 - 542	1 - 526
1	22	GLY	GLY	ASN	ASN	D	D	-9 - 543	1 - 553
2	22	GLY	GLY	ASN	ASN	H	H	-9 - 543	1 - 553
1	23	SER	SER	ASN	ASN	E	E	-6 - 543	1 - 550
2	23	SER	SER	ASN	ASN	F	F	-6 - 543	4 - 553
1	24	LEU	LEU	ARG	ARG	E	E	17 - 542	24 - 549
2	24	LEU	LEU	ARG	ARG	G	G	17 - 542	1 - 526
1	25	SER	SER	ARG	ARG	E	E	-6 - 542	1 - 549
2	25	SER	SER	ARG	ARG	H	H	-6 - 542	4 - 552
1	26	LEU	LEU	ARG	ARG	F	F	17 - 542	27 - 552
2	26	LEU	LEU	ARG	ARG	G	G	17 - 542	1 - 526
1	27	GLY	GLY	ASN	ASN	F	F	-9 - 543	1 - 553
2	27	GLY	GLY	ASN	ASN	H	H	-9 - 543	1 - 553
1	28	LEU	LEU	ARG	ARG	G	G	17 - 542	1 - 526
2	28	LEU	LEU	ARG	ARG	H	H	17 - 542	27 - 552

NCSアンサンブル:

-
Protein BONZAI ... , 5種, 8分子 ACDFBEGH

#1: タンパク質	Protein BONZAI 1 / COPINE 1 分子量: 61060.125 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) 遺伝子: BON1, CPN1, At5g61900, K22G18.2 / プラスミド: pET32a / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q941L3
#2: タンパク質	Protein BONZAI 1 / COPINE 1 分子量: 58420.270 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) 遺伝子: BON1, CPN1, At5g61900, K22G18.2 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q941L3
#3: タンパク質	Protein BONZAI 1 / COPINE 1 分子量: 60814.898 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) 遺伝子: BON1, CPN1, At5g61900, K22G18.2 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q941L3
#4: タンパク質	Protein BONZAI 1 / COPINE 1 分子量: 58363.223 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) 遺伝子: BON1, CPN1, At5g61900, K22G18.2 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q941L3
#5: タンパク質	Protein BONZAI 1 / COPINE 1 分子量: 61074.156 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) 遺伝子: BON1, CPN1, At5g61900, K22G18.2 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q941L3

-
非ポリマー , 8種, 739分子

#6: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル / ジエチレングリコール分子量: 106.120 Da / 分子数: 17 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
#7: 化合物	... ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル / エチレングリコール分子量: 62.068 Da / 分子数: 81 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#8: 化合物	... ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル / グリセリン分子量: 92.094 Da / 分子数: 27 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#9: 化合物	ChemComp-PGE / TRIETHYLENE GLYCOL / トリエチレングリコ-ル / ポリエチレングリコール分子量: 150.173 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₄
#10: 化合物	ChemComp-PG4 / TETRAETHYLENE GLYCOL / テトラエチレングリコ-ル / ポリエチレングリコール分子量: 194.226 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₈O₅ / コメント: 沈殿剤*YM
#11: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド / 塩化物分子量: 35.453 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#12: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#13: 水	ChemComp-HOH / water / 水分子量: 18.015 Da / 分子数: 603 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.36 Å³/Da / 溶媒含有率: 63.39 % / Mosaicity: 0.13 °
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 0.05 M MES (PH 7.0), 0.05 M HEPES (PH 7.5), 7% PEG 8000

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SSRF

/ ビームライン: BL17U1 / 波長: 0.9789 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2017年10月1日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9789 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.5→48.21 Å / Num. obs: 215443 / % possible obs: 98.2 % / 冗長度: 4 % / CC_1/2: 0.997 / R_merge(I) obs: 0.116 / R_pim(I) all: 0.065 / R_rim(I) all: 0.134 / Net I/σ(I): 8.2

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. measured all	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Net I/σ(I) obs	% possible all
2.5-2.54	4.1	0.2442	44256	10744	0.249	0.1364	0.2804	0.7	98.9
13.69-48.16	3.7	0.029	5063	1370	0.999	0.017	0.033	33.3	96.1

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
Aimless	0.7.4	データスケーリング
REFMAC	5.8.0238	精密化
PDB_EXTRACT	3.25	データ抽出
XDS		データ削減
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.5→48.21 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.949 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.927 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.43 / ESU R Free: 0.282 / 詳細: U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2662	10856	5 %	RANDOM
R_work	0.2271	-	-	-
obs	0.229	204561	98.03 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 228.1 Å² / B_iso mean: 68.067 Å² / B_iso min: 18.62 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-1.75 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	5.31 Å²	0 Å²
3-	-	-	-3.56 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.5→48.21 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	33809	0	685	603	35097
B_iso mean	-	-	75.51	48.5	-
残基数	-	-	-	-	4345

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.007	0.012	35009
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.533	1.629	47071
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.476	5	4331
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	39.093	23.155	1667
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	18.958	15	6056
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	22.447	15	168
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.118	0.2	4559
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.007	0.02	25890

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	15663	0.11
1	2	B	15663	0.11
2	1	A	16958	0.09
2	2	C	16958	0.09
3	1	A	16737	0.1
3	2	D	16737	0.1
4	1	A	16338	0.11
4	2	E	16338	0.11
5	1	A	16758	0.1
5	2	F	16758	0.1
6	1	A	15383	0.09
6	2	G	15383	0.09
7	1	A	16596	0.1
7	2	H	16596	0.1
8	1	B	15651	0.11
8	2	C	15651	0.11
9	1	B	15506	0.11
9	2	D	15506	0.11
10	1	B	15780	0.11
10	2	E	15780	0.11
11	1	B	15555	0.11
11	2	F	15555	0.11
12	1	B	15459	0.09
12	2	G	15459	0.09
13	1	B	15834	0.11
13	2	H	15834	0.11
14	1	C	16754	0.09
14	2	D	16754	0.09
15	1	C	16307	0.11
15	2	E	16307	0.11
16	1	C	16829	0.1
16	2	F	16829	0.1
17	1	C	15382	0.09
17	2	G	15382	0.09
18	1	C	16554	0.1
18	2	H	16554	0.1
19	1	D	16165	0.11
19	2	E	16165	0.11
20	1	D	16946	0.09
20	2	F	16946	0.09
21	1	D	15190	0.1
21	2	G	15190	0.1
22	1	D	16389	0.11
22	2	H	16389	0.11
23	1	E	16270	0.11
23	2	F	16270	0.11
24	1	E	15445	0.09
24	2	G	15445	0.09
25	1	E	16623	0.1
25	2	H	16623	0.1
26	1	F	15320	0.1
26	2	G	15320	0.1
27	1	F	16485	0.11
27	2	H	16485	0.11
28	1	G	15500	0.09
28	2	H	15500	0.09

LS精密化シェル

解像度: 2.5→2.565 Å / R_factor R_free error: 0

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.426	859	-
R_work	0.35	15064	-
obs	-	-	98.52 %

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
Protein BONZAI ... , 5種, 8分子 ACDFBEGH

-
非ポリマー , 8種, 739分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-Protein BONZAI ... , 5種, 8分子 ACDFBEGH

-非ポリマー , 8種, 739分子

-詳細

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
Protein BONZAI ... , 5種, 8分子 ACDFBEGH

-
非ポリマー , 8種, 739分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)