PDB-6hr8: HMG-CoA reductase from Methanothermococcus thermolithotrophicus i...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6hr8

タイトル

HMG-CoA reductase from Methanothermococcus thermolithotrophicus in complex with NADPH at 2.9 A resolution

要素

(HMG-CoA reductase) x 2

キーワード

OXIDOREDUCTASE / HMG-CoA / Mevalonate biosynthesis / statins / cholesterol biosynthesis / isoprenoids / NADPH / structural rearrangement.

機能・相同性

機能・相同性情報

hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH) / hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH) activity / sterol biosynthetic process / coenzyme A metabolic process / isoprenoid biosynthetic process / nucleotide binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Methanothermococcus thermolithotrophicus DSM 2095 (古細菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.9 Å

データ登録者

Wagner, T. / Voegeli, B. / Erb, T.J. / Shima, S.

資金援助

ドイツ, 1件

引用

ジャーナル: Febs Lett. / 年: 2019
タイトル: Crystal structure of archaeal HMG-CoA reductase: insights into structural changes of the C-terminal helix of the class-I enzyme.
著者: Vogeli, B. / Shima, S. / Erb, T.J. / Wagner, T.

履歴

登録	2018年9月26日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2019年2月13日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2019年3月20日	Group: Data collection / Database references カテゴリ: citation / citation_author / pdbx_database_proc Item: _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ISSN ..._citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.name
改定 1.2	2024年1月24日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.3	2024年11月20日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6hr8.cif.gz	912.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6hr8.ent.gz	773.5 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6hr8.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hr/6hr8 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hr/6hr8	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6hr7SC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6hr7-1 1hwi-d 1hw8-d 6m4o-d 7k0q-d 1dqa-d 6p4f-1 7cqi-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#96 - 2007年12月酸化スクアレン環化酵素 (Oxidosqualene Cyclase) 類似性 (12)

登録構造単位

A: HMG-CoA reductase

B: HMG-CoA reductase

C: HMG-CoA reductase

D: HMG-CoA reductase

E: HMG-CoA reductase

F: HMG-CoA reductase

ヘテロ分子

286 kDa, 6 ポリマー
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1

A: HMG-CoA reductase

B: HMG-CoA reductase

C: HMG-CoA reductase

D: HMG-CoA reductase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration, Other archaeal and human homologs are tetrameric
191 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

E: HMG-CoA reductase

F: HMG-CoA reductase

ヘテロ分子

E: HMG-CoA reductase

F: HMG-CoA reductase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
190 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	231.790, 231.790, 98.714
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	90
Space group name H-M	P42₁2

-
タンパク質 , 2種, 6分子 ABCDEF

#1: タンパク質	HMG-CoA reductase 分子量: 46653.793 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現詳細: The residue 233 is an oxidized cysteine. The N-terminal contains the poly-histidine tag. The C-terminal was too flexible to be modelled. Side chain of K87 was truncated because of an absence of electron density. 由来: (組換発現) Methanothermococcus thermolithotrophicus DSM 2095 (古細菌) 遺伝子: HMGR / プラスミド: pET-28b / 発現宿主: Escherichia coli BL21 (大腸菌) / Variant (発現宿主): BL21 AI 参照: UniProt: A0A4V8GZY0*PLUS, hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH)
#2: タンパク質	HMG-CoA reductase 分子量: 46637.793 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現詳細: The N-terminal contains the poly-histidine tag. The C-terminal was too flexible to be modelled. Side chain of D24 was truncated because of an absence of electron density. 由来: (組換発現) Methanothermococcus thermolithotrophicus DSM 2095 (古細菌) 遺伝子: HMGR / プラスミド: pET-28b / 発現宿主: Escherichia coli BL21 (大腸菌) / Variant (発現宿主): BL21 AI 参照: UniProt: A0A4V8GZY0*PLUS, hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH)

#1: タンパク質

HMG-CoA reductase

分子量: 46653.793 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
詳細: The residue 233 is an oxidized cysteine. The N-terminal contains the poly-histidine tag. The C-terminal was too flexible to be modelled. Side chain of K87 was truncated because of an absence of electron density.
由来: (組換発現)

Methanothermococcus thermolithotrophicus DSM 2095 (古細菌)
遺伝子: HMGR / プラスミド: pET-28b / 発現宿主:

Escherichia coli BL21 (大腸菌) / Variant (発現宿主): BL21 AI
参照: UniProt: A0A4V8GZY0*PLUS, hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH)

#2: タンパク質

HMG-CoA reductase

分子量: 46637.793 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現
詳細: The N-terminal contains the poly-histidine tag. The C-terminal was too flexible to be modelled. Side chain of D24 was truncated because of an absence of electron density.
由来: (組換発現)

Methanothermococcus thermolithotrophicus DSM 2095 (古細菌)
遺伝子: HMGR / プラスミド: pET-28b / 発現宿主:

Escherichia coli BL21 (大腸菌) / Variant (発現宿主): BL21 AI
参照: UniProt: A0A4V8GZY0*PLUS, hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH)

-
非ポリマー , 4種, 22分子

#3: 化合物	ChemComp-NAP / NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / 2'-MONOPHOSPHOADENOSINE 5'-DIPHOSPHORIBOSE 分子量: 743.405 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₁H₂₈N₇O₁₇P₃
#4: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#5: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
#6: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na

-
詳細

Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 2.37 Å³/Da / 溶媒含有率: 48.19 % / 解説: Prism shape
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: HMGR at 10 mg/ml was supplemented with a final concentration of 2 mM NADPH. The sample was centrifuged for 5 minute at 13.000 RPM to remove any aggregates and dust. 0.7 ul of protein sample ...詳細: HMGR at 10 mg/ml was supplemented with a final concentration of 2 mM NADPH. The sample was centrifuged for 5 minute at 13.000 RPM to remove any aggregates and dust. 0.7 ul of protein sample was spotted on a 96-well 2-drop MRC Crystallization Plates (Molecular Dimensions, Suffolk, UK) and 0.7 ul of reservoir solution was mixed. The best crystals were obtained after several month using a solution containing 40% v/v PEG 400, 100 mM Tris PH 8.5 and 200 mM Li2SO4. Temp details: The temperature was fluctuating of +/- 3 degree

結晶

マシュー密度: 2.37 Å³/Da / 溶媒含有率: 48.19 % / 解説: Prism shape

結晶化

温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5
詳細: HMGR at 10 mg/ml was supplemented with a final concentration of 2 mM NADPH. The sample was centrifuged for 5 minute at 13.000 RPM to remove any aggregates and dust. 0.7 ul of protein sample ...
Temp details: The temperature was fluctuating of +/- 3 degree

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID23-1 / 波長: 0.97662 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年2月12日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97662 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.9→25 Å / Num. obs: 59867 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 7.3 % / B_iso Wilson estimate: 93.25 Å² / CC_1/2: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.095 / R_pim(I) all: 0.037 / R_rim(I) all: 0.102 / Net I/σ(I): 13.3
反射シェル	解像度: 2.9→3.06 Å / 冗長度: 7.7 % / R_merge(I) obs: 1.285 / Mean I/σ(I) obs: 1.6 / Num. unique obs: 8592 / CC_1/2: 0.427 / R_pim(I) all: 0.491 / R_rim(I) all: 1.377 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.10.1_2155: ???)	精密化
XDS	3.3.22	データ削減
SCALA		データスケーリング
PHASER	2.6.0	位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 6HR7

6hr7

解像度: 2.9→24.987 Å / SU ML: 0.41 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 25.26
詳細: For the last round of refinement, many side chains have been truncated were the electron density was absent. The last round of refinement has been done with hydrogens in riding position. ...

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2426	2998	5.01 %
R_work	0.2111	-	-
obs	0.2127	59830	99.96 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso mean: 113 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.9→24.987 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	17794	0	279	0	18073

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	18318
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.653	24793
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	17.28	11011
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.047	2939
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	3126

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.9-2.9475	0.3884	124	0.3405	2635	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9475-2.9982	0.3594	135	0.3344	2697	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9982-3.0527	0.3465	142	0.3324	2644	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0527-3.1113	0.3423	144	0.321	2685	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1113-3.1746	0.3559	160	0.3177	2649	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1746-3.2435	0.3306	144	0.2941	2658	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2435-3.3188	0.2889	142	0.2957	2685	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3188-3.4016	0.2583	149	0.2713	2661	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4016-3.4934	0.3415	140	0.2632	2688	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4934-3.5959	0.2612	129	0.2606	2689	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5959-3.7116	0.2689	156	0.2422	2668	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7116-3.8438	0.2582	129	0.2279	2707	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8438-3.9971	0.2417	140	0.218	2711	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9971-4.1782	0.2161	130	0.2075	2705	X-RAY DIFFRACTION	100
4.1782-4.3974	0.2221	147	0.1968	2701	X-RAY DIFFRACTION	100
4.3974-4.6712	0.2285	154	0.1834	2720	X-RAY DIFFRACTION	100
4.6712-5.0291	0.203	131	0.1795	2731	X-RAY DIFFRACTION	100
5.0291-5.5303	0.2354	138	0.1944	2747	X-RAY DIFFRACTION	100
5.5303-6.3192	0.2679	139	0.2047	2760	X-RAY DIFFRACTION	100
6.3192-7.9192	0.1963	180	0.1906	2752	X-RAY DIFFRACTION	100
7.9192-24.9876	0.2088	145	0.1578	2939	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.7196	-0.2397	0.8026	2.113	1.4763	2.0623	0.9335	-0.0295	-1.5654	-0.6504	0.2688	-1.5877	0.7417	0.4131	-0.413	1.6117	-0.0188	-0.1101	1.0695	-0.4538	1.8459	266.4507	43.6486	93.8133
2	0.8933	-0.0235	-0.6266	5.094	-0.1752	1.4948	-0.1787	1.0787	-0.6151	-1.4064	-0.0795	-0.4201	-0.6745	-0.2084	0.0644	1.4419	-0.221	0.1504	1.55	-0.6274	1.1992	259.3668	55.655	92.3634
3	1.6593	0.0388	0.0265	2.4555	0.7122	1.3597	0.046	0.7048	-0.4219	-0.7731	-0.0468	-0.4437	-0.1124	0.0681	0.0069	0.7146	-0.0254	0.078	0.8073	-0.1579	0.6227	259.8683	77.5622	111.7611
4	2.093	0.8109	0.392	4.1124	-0.8375	2.547	0.114	-0.4274	-0.6002	0.558	-0.1974	-1.2594	-0.1973	0.5897	0.1099	0.609	0.0576	-0.156	0.769	0.0829	1.2336	274.6221	63.3937	134.9505
5	1.5798	-0.2583	-0.7184	2.4136	0.4148	1.9739	0.0589	-0.2867	-1.0913	-0.1916	0.0542	-0.4103	0.3447	0.488	0.0212	0.6651	0.0133	-0.1214	0.616	-0.043	1.3068	273.6919	57.0287	130.8046
6	3.5034	-0.2737	-0.2429	2.6801	-0.7753	2.5153	0.0335	0.4547	-0.3888	-0.3244	0.0345	-0.0077	-0.145	0.2723	-0.1033	0.5673	-0.0355	-0.0946	0.555	-0.1255	0.5042	253.63	80.9905	120.2437
7	5.474	0.7236	-0.2269	2.0835	-0.4682	4.1104	0.1487	0.973	0.574	-0.1701	0.0759	-0.0032	-0.5553	-0.6122	-0.2355	0.6418	0.0467	0.0043	0.6477	-0.1039	0.3269	247.09	85.7269	118.0375
8	4.4027	-0.1149	-1.8789	2.8253	-0.6808	4.8784	0.4888	1.4355	1.1908	0.1792	0.5128	-0.2373	1.1285	-0.7408	-0.593	1.6123	-0.0225	0.0807	1.5214	-0.0563	1.0472	251.8049	94.0092	93.2708
9	1.8055	-1.1485	0.0604	1.8282	-0.5829	1.3405	0.0217	2.6139	1.1028	-0.3418	-0.7707	-0.6078	0.1538	0.1549	0.0121	1.502	-0.1306	0.1306	1.4681	-0.2219	0.7675	258.8743	81.8973	93.7927
10	1.3853	0.1074	-1.0868	0.5745	-0.2428	1.2093	-0.2563	0.3314	-0.5503	-0.7602	0.26	-0.1728	0.2014	-0.0519	0.0064	0.8545	-0.0924	0.0377	0.9089	-0.3077	0.8496	249.8367	57.5675	108.0907
11	4.0131	-0.7695	0.1665	3.6328	1.3121	4.5334	0.0424	0.8245	-1.0425	-0.2204	-0.2108	0.4342	0.2732	-0.6851	0.0618	0.5125	0.0493	-0.1746	0.7526	-0.1878	0.7891	225.6814	69.5132	122.4543
12	2.1567	0.3736	-1.2978	3.3127	0.8706	3.8408	0.0071	0.6206	-0.3256	-0.6634	0.043	-0.0622	-0.4273	-0.6218	-0.0663	0.6108	0.0759	-0.0994	0.6765	-0.1421	0.5628	228.3494	76.3847	120.0886
13	1.7909	0.3846	0.7283	1.7305	-0.2222	3.4097	-0.4405	0.0142	-1.1252	0.2184	0.1825	-0.0113	0.2818	0.3963	0.2576	0.6263	0.0699	0.0286	0.576	-0.1519	1.3288	255.0506	48.8934	125.4095
14	1.7089	0.5161	-0.2925	3.3057	-0.9363	3.7266	-0.5385	-0.1841	-0.2912	-1.0501	0.4266	-0.6877	0.6088	-0.3989	0.2463	0.7071	0.0161	0.0588	0.8188	-0.2994	0.9739	251.5908	54.1405	118.7946
15	2.1834	-0.1205	0.1304	2.9437	0.1823	2.8839	-0.1516	0.6903	-0.6089	-0.5129	-0.0233	-0.2771	0.2118	0.1379	0.1947	0.7927	-0.0624	0.1203	0.8653	-0.4145	1.0704	250.9401	54.3898	110.1454
16	1.9456	0.6652	-1.9705	3.2977	-1.1477	4.1331	0.4609	0.2817	0.4897	-0.6327	-0.1762	0.006	0.3741	1.006	-0.7287	1.4556	-0.0101	0.1498	1.4257	-0.1474	0.9982	229.7276	87.5379	173.8788
17	1.1256	-1.0809	0.6014	1.9087	0.2796	2.0298	-0.0598	-0.961	-0.2651	0.7251	-0.0788	-0.0819	0.0171	0.1568	0.128	1.0552	-0.1471	-0.1602	1.2454	0.3419	0.7802	245.6854	62.8956	165.786
18	3.0617	0.5563	0.4064	3.3842	-1.4847	3.9567	0.2504	-0.8191	-0.3384	0.6458	-0.228	-0.5609	-0.4147	0.2822	0.0001	0.6961	-0.1485	-0.1901	0.7653	0.0729	0.5989	263.6717	85.0376	146.6003
19	0.711	-0.09	0.3869	4.652	-0.3658	0.9974	-0.0597	-0.5295	-0.3068	0.1512	-0.0725	-0.5522	-0.0689	-0.0174	0.0153	0.6461	-0.1073	-0.0819	0.7996	0.1786	0.6812	256.4228	74.204	145.4475
20	1.8735	0.9004	0.1284	2.8208	-0.5948	3.5422	0.1927	-0.5833	-1.0777	0.1693	-0.0509	-0.7705	0.5267	0.5353	0.0869	0.7639	0.0657	-0.2225	0.7391	0.3752	1.1215	250.5374	50.6982	147.5201
21	4.8757	-2.8457	-4.4123	1.7693	2.7127	4.4314	-0.8849	-0.1598	-1.199	-0.0959	0.597	0.0858	0.3728	1.0734	0.1389	0.8346	0.1424	-0.1268	0.9313	0.3092	1.1467	258.6594	47.3158	143.9528
22	2.8064	-0.4722	-0.0344	2.4481	0.0217	2.2396	0.2661	-0.7143	-0.114	0.8846	-0.2942	-0.3939	0.38	0.4281	0.0682	1.0093	-0.0454	-0.132	1.0654	0.2662	0.7276	253.2537	55.8195	158.7492
23	1.4322	-0.3355	1.5457	3.0725	-0.2704	2.0812	0.6359	-0.4356	-0.606	0.9853	0.0063	-0.1257	-0.1072	-0.3082	-0.6059	1.6478	-0.1639	-0.2201	1.5152	0.5279	1.0259	246.6029	46.8389	176.2472
24	2.1541	-0.0567	-0.0062	1.4415	-0.5034	1.17	0.1031	-0.8582	-0.4978	0.6832	0.0069	0.2272	-0.1115	-0.303	-0.042	0.8329	-0.0996	-0.0195	1.0539	0.2682	0.5467	232.3889	69.0873	156.4368
25	2.4411	-1.5282	-0.9899	4.1351	0.6655	3.7413	-0.02	-0.1275	-0.9791	-0.0543	0.0105	0.4772	0.6111	-0.2694	-0.0209	0.6445	-0.1317	-0.0589	0.6181	0.1125	1.1769	231.5439	46.2969	135.926
26	3.6005	-0.0481	-0.9441	1.9218	0.1142	2.2226	0.3151	-0.8023	-0.3758	0.3027	-0.3027	0.0983	-0.1266	0.091	0.0551	0.6811	-0.0752	-0.1429	0.7304	0.1112	0.4289	235.9658	76.7097	148.1161
27	1.3861	0.2566	-0.3284	0.7833	0.6394	0.63	-0.7609	0.3941	0.2439	-0.6868	0.9954	0.7231	0.6326	0.7635	0.2843	1.1003	-0.3305	0.2189	2.1703	-0.3201	1.2914	179.1932	28.0242	136.8648
28	0.0452	0.2867	-0.0726	1.2717	0.6213	0.8746	-0.113	-0.5483	0.689	0.2514	-0.0139	0.4124	-0.0496	-0.3385	-0.0016	0.9232	-0.1668	-0.1445	1.3134	-0.3674	1.6709	207.6884	37.819	117.8326
29	1.47	0.5805	1.7083	2.7216	0.9065	2.7376	0.1922	-0.4827	0.0929	0.5618	-0.5892	0.2317	0.393	-0.5796	0.3554	0.8962	-0.2982	0.0401	1.1207	-0.0942	1.2853	212.6543	17.708	115.0413
30	1.1787	1.1082	0.3083	3.6926	1.5102	4.247	0.9654	0.0967	0.396	1.4252	-0.4023	-0.424	1.5007	-2.5516	-0.4581	1.7138	-0.3742	-0.1432	1.5178	0.1489	1.0366	207.9908	7.5193	138.6594
31	1.5115	0.129	0.5309	-0.1906	0.2271	1.8762	0.0919	-0.9184	0.1463	0.5602	-0.3451	0.7098	0.2507	-0.9073	0.266	0.9797	-0.3677	0.1733	1.6456	-0.3798	2.0257	186.6455	22.4692	119.1613
32	5.1571	0.8773	-1.4198	2.7169	0.0364	3.467	0.1139	-0.55	0.2835	-0.168	-0.1121	0.3935	0.431	-0.2895	-0.0607	0.992	-0.1724	-0.1047	0.88	-0.0881	1.0732	195.6939	1.9937	96.9338
33	2.2122	-1.8107	-0.3946	1.762	0.8825	1.6695	0.3479	-0.1688	0.8517	0.2471	-0.6893	-0.4245	0.0894	-0.6016	0.3522	0.8062	-0.2356	-0.0682	1.1298	-0.3414	1.5376	192.4382	20.5153	103.6228
34	4.5828	-1.8646	-2.9995	0.5074	1.0104	3.713	1.0766	-1.1544	2.2651	0.1088	-0.3698	-1.128	-0.7338	-0.4042	0.1963	1.0028	-0.1402	-0.1905	1.0173	-0.73	2.5486	191.2753	41.3356	106.4605
35	1.9848	-0.1127	-0.5509	-0.0385	-0.135	1.0115	-0.1706	-0.9613	0.9594	0.3297	-0.3605	0.3718	-0.2609	-0.1892	0.507	0.7936	-0.2197	0.0847	1.4142	-0.5715	1.7169	188.2105	29.4227	111.085
36	1.53	0.0379	-1.5398	0.3494	-0.8992	2.0723	0.2998	-0.527	0.415	1.4058	-1.0118	0.6701	-0.2159	-0.6299	0.6029	0.9843	-0.3274	-0.0111	1.7091	-0.5346	1.7919	184.7658	25.6488	117.4605

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 5 through 27 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 28 through 56 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 57 through 137 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 138 through 197 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 198 through 239 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 240 through 369 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 370 through 401 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 5 through 27 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 28 through 56 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 57 through 137 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 138 through 197 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 198 through 239 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 240 through 296 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 297 through 338 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 339 through 400 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 6 through 27 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 28 through 133 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 134 through 219 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 220 through 255 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 256 through 319 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 320 through 338 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 339 through 401 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 6 through 56 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 57 through 137 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 138 through 239 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 240 through 401 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 6 through 56 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resid 57 through 239 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'E' and (resid 240 through 401 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'F' and (resid 6 through 56 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resid 57 through 137 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 138 through 219 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 220 through 264 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'F' and (resid 265 through 296 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'F' and (resid 297 through 338 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'F' and (resid 339 through 401 )

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