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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6hq1 | ||||||
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タイトル | Solution structure of the globular domain from human histone H1.0 | ||||||
要素 | Histone H1.0 | ||||||
キーワード | DNA BINDING PROTEIN (DNA結合タンパク質) / alpha-helical (Αヘリックス) / nucleosome assembly (ヌクレオソーム) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 negative regulation of DNA recombination / positive regulation of transcription regulatory region DNA binding / Apoptosis induced DNA fragmentation / chromosome condensation / Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) / minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding / nucleosomal DNA binding / heterochromatin formation / transcription repressor complex / ユークロマチン ...negative regulation of DNA recombination / positive regulation of transcription regulatory region DNA binding / Apoptosis induced DNA fragmentation / chromosome condensation / Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) / minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding / nucleosomal DNA binding / heterochromatin formation / transcription repressor complex / ユークロマチン / chromatin DNA binding / structural constituent of chromatin / ヌクレオソーム / nucleosome assembly / マイクロフィラメント / double-stranded DNA binding / nuclear body / クロマチン / ゴルジ体 / RNA binding / 核質 / 細胞核 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Martinsen, J.H. / Bugge, K. / Kragelund, B.B. | ||||||
資金援助 | デンマーク, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Micromolar affinity association of an IDP and a folded protein without the involvement of persistent binding sites 著者: Bugge, K. / Martinsen, J.H. / Fernandes, C.B. / Borgia, A. / Schuler, B. / Best, R. / Kragelund, B.B. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 6hq1.cif.gz | 455.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb6hq1.ent.gz | 382.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 6hq1.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hq/6hq1 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hq/6hq1 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8163.378 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: H1F0, H1FV / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P07305 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 165 mM / Label: 13C15N / pH: 7.4 / 圧: 1 atm / 温度: 283 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |