登録情報 | データベース: PDB / ID: 6h8l |
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タイトル | Structure of peptidoglycan deacetylase PdaC from Bacillus subtilis |
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要素 | Peptidoglycan-N-acetylmuramic acid deacetylase PdaC |
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キーワード | HYDROLASE / Deacetylase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds / 加水分解酵素; ペプチド以外のCN結合加水分解酵素; 鎖状アミドに作用 / carbohydrate metabolic process / metal ion binding / plasma membrane類似検索 - 分子機能 Peptidoglycan GlcNAc deacetylase / Deacetylase PdaC / Deacetylase PdaC / Domain of unknown function DUF3298 / PdaC/RsiV-like superfamily / Protein of unknown function (DUF3298) / Glycoside hydrolase/deacetylase / NodB homology domain profile. / NodB homology domain / Polysaccharide deacetylase ...Peptidoglycan GlcNAc deacetylase / Deacetylase PdaC / Deacetylase PdaC / Domain of unknown function DUF3298 / PdaC/RsiV-like superfamily / Protein of unknown function (DUF3298) / Glycoside hydrolase/deacetylase / NodB homology domain profile. / NodB homology domain / Polysaccharide deacetylase / Glycoside hydrolase/deacetylase, beta/alpha-barrel / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 L(+)-TARTARIC ACID / Peptidoglycan-N-acetylmuramic acid deacetylase PdaC類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 (枯草菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.54 Å |
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データ登録者 | Sainz-Polo, M.A. / Grifoll-Romero, L. / Albesa-Jove, D. / Planas, A. / Guerin, M.E. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2019 タイトル: Structure-function relationships underlying the dualN-acetylmuramic andN-acetylglucosamine specificities of the bacterial peptidoglycan deacetylase PdaC. 著者: Grifoll-Romero, L. / Sainz-Polo, M.A. / Albesa-Jove, D. / Guerin, M.E. / Biarnes, X. / Planas, A. |
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履歴 | 登録 | 2018年8月2日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2019年11月13日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2020年3月25日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.2 | 2020年4月1日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.3 | 2024年1月17日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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