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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6gzn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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タイトル | Adenine-driven structural switch from two- to three-quartet DNA G-quadruplex | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
要素 | DNA (5'-D(*キーワード | DNA / G-quadruplex / basket-type topology / RANKL gene / osteoporosis | 機能・相同性 | DNA / DNA (> 10) | 機能・相同性情報 生物種 | Homo sapiens (ヒト) | 手法 | 溶液NMR / simulated annealing | データ登録者 | Lenarcic Zivkovic, M. / Rozman, J. / Plavec, J. | 資金援助 | スロベニア, 3件 |
引用 | ジャーナル: Angew. Chem. Int. Ed. Engl. / 年: 2018 | タイトル: Adenine-Driven Structural Switch from a Two- to Three-Quartet DNA G-Quadruplex. 著者: Lenarcic Zivkovic, M. / Rozman, J. / Plavec, J. 履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 6gzn.cif.gz | 132 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb6gzn.ent.gz | 106.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 6gzn.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gz/6gzn ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gz/6gzn | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 6410.127 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト) |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 100 mM / Label: conditions_1 / pH: 7 / 圧: 1 atm / 温度: 278 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 3 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |