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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6gz7 | ||||||||||||||||||||
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タイトル | Polyamide - DNA complex NMR structure | ||||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() UNKNOWN FUNCTION / Polyamide DNA complex | 機能・相同性 | Chem-FGW / DNA / DNA (> 10) | ![]() 生物種 | synthetic construct (人工物) | 手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ![]() Aman, K. | ![]() ![]() タイトル: Structural and Kinetic Profiling of Allosteric Modulation of Duplex DNA Induced by DNA-Binding Polyamide Analogues. 著者: Aman, K. / Padroni, G. / Parkinson, J.A. / Welte, T. / Burley, G.A. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 209.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 168.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3940.603 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物) #2: 化合物 | ChemComp-FGW / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | Ionic strength units: Not defined / Label: PA-ODN1 complex conditions / pH: 7.4 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE II / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE II / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 2 詳細: the structures are based on a total of 310 NOE distance restraints | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: minimized average structure | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: all calculated structures submitted 計算したコンフォーマーの数: 11 / 登録したコンフォーマーの数: 11 |