分子量: 1642.983 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: TemporinL is an antimicrobial peptide found in Rana temporaria. 由来: (合成) Rana temporaria (ヨーロッパアカガエル) 参照: UniProt: P57104
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
Sample state
Spectrometer-ID
タイプ
1
1
1
isotropic
1
2D 1H-1H TOCSY
1
2
1
isotropic
1
2D 1H-1H NOESY
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試料調製
詳細
タイプ: micelle 内容: 2 mM Temporin L, 100 mM [U-2H] deuterated sodium dodecyl sulphate, 0.05 % w/w 2H 3-(trimethylsilyl)propionic-2,2,3,3-d4 acid, 90% H2O/10% D2O 詳細: Peptide solubilised in a solution of SDS micelles at a L/P ratio of 50 Label: TL-SDS / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
2mM
TemporinL
naturalabundance
1
100mM
deuteratedsodiumdodecylsulphate
[U-2H]
1
0.05 % w/w
3-(trimethylsilyl)propionic-2,2,3,3-d4 acid
2H
1
試料状態
イオン強度: no salts Not defined / Label: TL-SDS_conditions / pH: 7.0 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K
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NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 500 MHz
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解析
NMR software
名称
開発者
分類
TopSpin
BrukerBiospin
解析
CARA
KellerandWuthrich
chemicalshiftassignment
CARA
KellerandWuthrich
peakpicking
X-PLOR
Brunger
structurecalculation
X-PLOR
Brunger
精密化
精密化
手法
ソフトェア番号
distance geometry
4
simulated annealing
3
代表構造
選択基準: none
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20