根拠: The diffusion coefficient (NMR), the rotational correlation time (NMR) and the sedimentation coefficient (ultracentrifugatio) agree with a monomer
タイプ
名称
対称操作
数
identity operation
1_555
1
Buried area
0 Å2
ΔGint
0 kcal/mol
Surface area
7040 Å2
手法
PISA
NMR アンサンブル
データ
基準
コンフォーマー数 (登録 / 計算)
10 / 500
structures with the lowest energy
代表モデル
モデル #1
lowest energy
-
要素
#1: タンパク質
Hydrophobin /
分子量: 14502.397 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: NMR EXPERIMENTS AND STRUCTURE CALCULATIONS WERE PERFORMED WITH THE PREDICTED FULL-LENGTH PROTEIN (RESIDUES 19-159) AFTER CLEAVAGE OF THE N-TERMINAL SECRETION SIGNAL PEPTIDE (1-18). BECAUSE ...詳細: NMR EXPERIMENTS AND STRUCTURE CALCULATIONS WERE PERFORMED WITH THE PREDICTED FULL-LENGTH PROTEIN (RESIDUES 19-159) AFTER CLEAVAGE OF THE N-TERMINAL SECRETION SIGNAL PEPTIDE (1-18). BECAUSE RESIDUES 19-39 ARE DISORDERED, ONLY THE STRUCTURE FOR RESIDUES 39-159 IS DEPOSITED. 由来: (組換発現) Neosartorya fumigata (strain CEA10 / CBS 144.89 / FGSC A1163) (アスペルギルス・フミガーツス) 株: CEA10 / CBS 144.89 / FGSC A1163 / 遺伝子: AFUB_057130 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / 参照: UniProt: B0Y4B1
濃度: 0.36 mM / 構成要素: RodA / Isotopic labeling: [U-99% 13C; U-99% 15N]
試料状態
イオン強度: 20 mM / Ionic strength err: 0.1 / Label: conditions_1 / pH: 4.3 / PH err: 0.05 / 圧: 1 atm / 温度: 298.15 K / Temperature err: 0.1
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ: Agilent NMR System / 製造業者: Agilent / モデル: NMR System / 磁場強度: 600 MHz / 詳細: Equipped with a cryoprobe
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
VnmrJ
4.3
Agilent
collection
NMRPipe
Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, PfeiferandBax
解析
CcpNmr Analysis
2.3
CCPN
データ解析
ARIA
2.3
Linge, O'DonoghueandNilges
structurecalculation
CNS
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
TALOS-N
ShenandBax
structurecalculation
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 5 詳細: The structures are based on a total of 2737 restraints, 1590 are unambiguous and 987 ambiguous NOE-derived distances restraints and from 160 dihedral angle constraints derived from Talos-N and HNHA experiment.
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 500 / 登録したコンフォーマーの数: 10