PDB-6gbg: Helicobacter pylori adhesin HopQ type I bound to the N-terminal d...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6gbg

タイトル

Helicobacter pylori adhesin HopQ type I bound to the N-terminal domain of human CEACAM1

要素

Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1
Outer membrane protein

キーワード

CELL ADHESION / Helicobacter pylori / adhesin / Helicobacter outer membrane protein

機能・相同性

機能・相同性情報

regulation of endothelial cell differentiation / insulin receptor internalization / negative regulation of cytotoxic T cell degranulation / granulocyte colony-stimulating factor signaling pathway / regulation of homophilic cell adhesion / regulation of sprouting angiogenesis / regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway / regulation of blood vessel remodeling / negative regulation of hepatocyte proliferation / filamin binding ...regulation of endothelial cell differentiation / insulin receptor internalization / negative regulation of cytotoxic T cell degranulation / granulocyte colony-stimulating factor signaling pathway / regulation of homophilic cell adhesion / regulation of sprouting angiogenesis / regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway / regulation of blood vessel remodeling / negative regulation of hepatocyte proliferation / filamin binding / negative regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity directed against tumor cell target / negative regulation of lipid biosynthetic process / bile acid transmembrane transporter activity / negative regulation of T cell mediated cytotoxicity / regulation of endothelial cell migration / negative regulation of granulocyte differentiation / Fibronectin matrix formation / insulin catabolic process / common myeloid progenitor cell proliferation / negative regulation of interleukin-1 production / negative regulation of fatty acid biosynthetic process / positive regulation of vasculogenesis / cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules / negative regulation of platelet aggregation / regulation of immune system process / bile acid and bile salt transport / negative regulation of vascular permeability / wound healing, spreading of cells / transport vesicle membrane / microvillus membrane / negative regulation of T cell receptor signaling pathway / blood vessel development / regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules / tertiary granule membrane / lateral plasma membrane / specific granule membrane / regulation of cell migration / regulation of ERK1 and ERK2 cascade / protein tyrosine kinase binding / basal plasma membrane / integrin-mediated signaling pathway / regulation of cell growth / Cell surface interactions at the vascular wall / adherens junction / negative regulation of protein kinase activity / kinase binding / cellular response to insulin stimulus / cell-cell junction / cell migration / cell junction / actin binding / protein phosphatase binding / angiogenesis / protein dimerization activity / calmodulin binding / cell adhesion / apical plasma membrane / Neutrophil degranulation / cell surface / signal transduction / protein homodimerization activity / extracellular exosome / identical protein binding / membrane / plasma membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

Helicobacter pylori (ピロリ菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.8 Å

データ登録者

Moonens, K. / Kruse, T. / Gerhard, M. / Remaut, H.

資金援助

ベルギー, 2件

引用

ジャーナル: EMBO J. / 年: 2018
タイトル: Helicobacter pyloriadhesin HopQ disruptstransdimerization in human CEACAMs.
著者: Moonens, K. / Hamway, Y. / Neddermann, M. / Reschke, M. / Tegtmeyer, N. / Kruse, T. / Kammerer, R. / Mejias-Luque, R. / Singer, B.B. / Backert, S. / Gerhard, M. / Remaut, H.

履歴

登録	2018年4月13日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2018年6月27日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年7月11日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / Item: _citation.journal_volume
改定 1.2	2024年1月17日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6gbg.cif.gz	183.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6gbg.ent.gz	145.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6gbg.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	6gbg_validation.pdf.gz	437.5 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6gbg_full_validation.pdf.gz	440.9 KB	表示
XML形式データ	6gbg_validation.xml.gz	16.5 KB	表示
CIF形式データ	6gbg_validation.cif.gz	22.3 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gb/6gbg ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gb/6gbg	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6gbhC 5lp2S S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6aw3-d 6gbh-1 6gbh-2 6bqg-d 6xv8-4 6mdf-d 3zkj-2 4iy9-d 7aro-d 6ul4-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#267 - 2022年3月血管内皮増殖因子と血管新生 (Vascular Endothelial Growth Factor (VegF) 類似性 (3) #186 - 2015年6月終末糖化産物受容体 (Receptor for Advanced Glycation End Products) 類似性 (3) #63 - 2005年3月 T細胞受容体 (T-Cell Receptor) 類似性 (2) #247 - 2020年7月ミエリン関連糖タンパク質 (Myelin-associated Glycoprotein) 類似性 (1) #132 - 2010年12月アデノウイルス (Adenovirus) 類似性 (2) #169 - 2014年1月 HIV外被糖タンパク質 (HIV Envelope Glycoprotein) 類似性 (2) #122 - 2010年2月エンハンセオソーム (Enhanceosome) 類似性 (1) #220 - 2018年4月脱ハロゲン酵素 (Dehalogenases) 類似性 (1)

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「今月の分子」の関連する項目

#267 - 2022年3月
血管内皮増殖因子と血管新生 (Vascular Endothelial Growth Factor (VegF)
類似性 (3)
#186 - 2015年6月
終末糖化産物受容体 (Receptor for Advanced Glycation End Products)
類似性 (3)
#63 - 2005年3月
T細胞受容体 (T-Cell Receptor)
類似性 (2)
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ミエリン関連糖タンパク質 (Myelin-associated Glycoprotein)
類似性 (1)
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アデノウイルス (Adenovirus)
類似性 (2)
#169 - 2014年1月
HIV外被糖タンパク質 (HIV Envelope Glycoprotein)
類似性 (2)
#122 - 2010年2月
エンハンセオソーム (Enhanceosome)
類似性 (1)
#220 - 2018年4月
脱ハロゲン酵素 (Dehalogenases)
類似性 (1)

登録構造単位

D: Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1

A: Outer membrane protein

ヘテロ分子

57.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: SAXS, gel filtration, isothermal titration calorimetry

単位格子

Length a, b, c (Å)	94.430, 94.430, 119.700
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number	154
Space group name H-M	P3₂21

#1: タンパク質	Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1 / Biliary glycoprotein 1 / BGP-1 分子量: 12956.362 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: CEACAM1, BGP, BGP1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P13688
#2: タンパク質	Outer membrane protein 分子量: 44222.402 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Helicobacter pylori (strain G27) (ピロリ菌) 株: G27 / 遺伝子: hopQ, HPG27_1120 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: B5Z8H1
#3: 化合物	ChemComp-BR / BROMIDE ION / ブロミド分子量: 79.904 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Br
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.7 Å³/Da / 溶媒含有率: 54.47 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: Condition B3 of the Morpheus HT-96 screen (Molecular Dimensions)(0.09 M Halogens mix (0.3M Sodium fluoride; 0.3M Sodium bromide; 0.3M Sodium iodide), 0.1 M Buffer System 1 (1.0M Imidazole; ...詳細: Condition B3 of the Morpheus HT-96 screen (Molecular Dimensions)(0.09 M Halogens mix (0.3M Sodium fluoride; 0.3M Sodium bromide; 0.3M Sodium iodide), 0.1 M Buffer System 1 (1.0M Imidazole; MES monohydrate (acid); pH 6.5), 50 % v/v Precipitant Mix 3 (40% v/v Glycerol; 20% w/v PEG 4000)

結晶

マシュー密度: 2.7 Å³/Da / 溶媒含有率: 54.47 %

結晶化

温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5
詳細: Condition B3 of the Morpheus HT-96 screen (Molecular Dimensions)(0.09 M Halogens mix (0.3M Sodium fluoride; 0.3M Sodium bromide; 0.3M Sodium iodide), 0.1 M Buffer System 1 (1.0M Imidazole; ...

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Diamond / ビームライン: I02 / 波長: 0.98 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2016年6月28日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.98 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.8→67.52 Å / Num. obs: 15692 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 10.5 % / B_iso Wilson estimate: 73.3 Å² / CC_1/2: 0.998 / R_merge(I) obs: 0.147 / R_pim(I) all: 0.047 / Net I/σ(I): 13.6
反射シェル	解像度: 2.8→2.85 Å / 冗長度: 10.7 % / Mean I/σ(I) obs: 1.6 / Num. unique obs: 760 / CC_1/2: 0.628 / R_pim(I) all: 0.538 / % possible all: 99.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0049	精密化
xia2		データ削減
xia2		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5LP2

5lp2

解像度: 2.8→67.52 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.937 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.905 / SU B: 31.74 / SU ML: 0.291 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.799 / ESU R Free: 0.353 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.26328	807	5.2 %	RANDOM
R_work	0.20131	-	-	-
obs	0.20471	14860	99.91 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 71.153 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.64 Å²	0.32 Å²	0 Å²
2-	-	0.64 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-2.08 Å²

精密化ステップ

サイクル: 1 / 解像度: 2.8→67.52 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3271	0	3	12	3286

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.012	0.019	3328
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	3119
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.457	1.94	4518
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.782	3	7170
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	7.102	5	426
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	41.573	26.968	155
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	18.261	15	557
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	13.315	15	5
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.076	0.2	520
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.006	0.02	3905
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	756
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.943	3.56	1719
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	1.942	3.559	1718
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	3.156	5.33	2137
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other	3.156	5.33	2138
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.315	3.831	1609
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other	2.314	3.832	1610
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other	3.806	5.638	2381
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined	5.683	28.483	3753
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other	5.682	28.481	3753
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 2.8→2.873 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.39	45	-
R_work	0.27	1100	-
obs	-	-	99.74 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	6.1423	-4.6006	9.5767	6.0503	-4.8449	17.7036	0.2794	0.1294	-0.2772	-0.5874	-0.3408	0.5303	0.2406	-0.6652	0.0614	0.3181	-0.0041	-0.0864	0.7619	-0.1057	0.3849	-35.8778	-27.2097	-47.3135
2	2.5475	0.5505	1.6686	0.5921	0.2389	3.1241	0.0471	-0.0854	0.0224	0.0863	-0.113	0.0955	0.0212	0.0864	0.0659	0.2719	-0.0305	0.0137	0.3338	-0.0402	0.194	-9.5143	-31.2683	-17.2433
3	7.4556	1.185	5.0097	3.9923	-0.288	7.8015	0.3558	-0.3949	-0.4808	0.7874	-0.2841	-0.0959	0.4097	0.3871	-0.0718	0.4463	-0.0348	0.0095	0.4204	0.051	0.2699	2.1393	-38.0802	-2.511
4	6.4885	1.3348	2.7813	0.916	1.2237	2.7782	-0.1419	-0.2379	0.4128	0.1693	-0.013	0.0924	-0.245	0.0158	0.1549	0.3385	-0.0654	-0.0083	0.3353	-0.0011	0.233	-3.3186	-25.8454	-9.046
5	1.6445	-0.3218	3.5425	0.3182	-1.2536	10.4666	0.1685	-0.12	-0.1346	0.0791	0.0475	0.2355	0.4069	-0.6348	-0.2161	0.3114	-0.0836	0.0646	0.4203	-0.0709	0.4222	-23.987	-33.9888	-18.2702
6	10.0147	3.1917	6.4929	6.2956	0.5874	23.4233	0.1639	-0.9691	-0.1282	0.8883	-0.2192	-0.6445	-0.1212	1.0621	0.0553	0.5003	-0.0158	0.0161	0.6103	-0.1312	0.2866	-10.8328	-34.4612	3.4097
7	4.6516	0.2008	0.5433	1.4401	-0.8146	2.8768	0.0849	0.3696	0.1776	0.0627	-0.1254	0.0329	0.085	0.211	0.0405	0.2944	-0.0331	-0.0197	0.3631	-0.0695	0.1275	-7.6592	-29.3989	-18.9826
8	14.0044	-1.1097	3.8948	1.5862	-0.347	4.5283	0.0318	0.1097	0.43	-0.0246	-0.1486	-0.0393	-0.1731	0.2181	0.1168	0.3173	-0.063	0.0185	0.3732	-0.0135	0.2089	-7.2669	-24.6502	-27.7591
9	3.7493	-1.1118	2.0478	1.3908	-0.4233	2.5667	-0.1239	0.3079	0.1295	-0.0354	-0.0228	0.172	-0.2424	-0.1926	0.1467	0.2976	0.0336	-0.0031	0.45	-0.0281	0.1964	-21.0064	-25.6236	-37.9116
10	7.8657	-2.6782	10.0288	3.0299	-3.1819	18.0752	0.304	0.5274	-0.2039	-0.2484	-0.2453	0.1946	0.6343	0.2566	-0.0587	0.271	0.0189	0.0211	0.378	-0.0826	0.2639	-15.1211	-37.5157	-35.8028
11	7.7541	-9.0862	3.5536	11.4377	-2.0401	7.387	0.6329	0.1678	0.0041	-0.9641	-0.3672	-0.0759	-0.1493	-0.2749	-0.2656	0.4938	0.0722	-0.0988	0.8001	0.0922	0.4737	-30.3731	-19.951	-53.5073
12	5.5246	1.2813	1.7059	9.0776	3.1565	5.1888	0.1974	-0.1847	-0.1838	0.4158	0.0399	-0.6843	0.0345	0.5625	-0.2374	0.4634	-0.0966	-0.1157	0.5823	0.081	0.2166	29.4449	-22.768	5.8775
13	5.1967	1.6298	1.4532	4.2438	-1.5961	1.7615	0.1622	0.5243	-0.4856	0.4079	-0.028	-0.15	0.116	0.5697	-0.1342	0.5386	0.1737	-0.0609	0.7139	0.0124	0.2952	25.4642	-27.6034	-3.2303
14	6.1455	0.8548	2.8772	3.654	-0.7233	1.8882	0.0308	0.1447	0.1497	-0.0552	-0.0974	0.1905	0.1387	0.1099	0.0666	0.3342	-0.0378	-0.0359	0.3306	0.0604	0.2559	14.8066	-26.2192	-4.226
15	12.148	-2.2073	8.7214	4.4552	0.679	8.115	-0.1206	-1.7097	-0.3176	0.9604	0.1464	0.2015	0.4286	-0.7211	-0.0258	0.5423	-0.0881	0.0887	0.8702	0.1021	0.3176	12.0582	-25.5231	9.7
16	7.8645	0.47	4.8663	3.6471	1.7566	19.1518	-0.1409	0.2698	0.616	-0.2439	-0.1064	0.3278	-0.5767	-0.202	0.2473	0.363	-0.0448	-0.0535	0.2693	0.0025	0.3146	12.9451	-19.8052	-4.6287
17	3.3837	1.9936	2.5131	2.7491	2.3874	4.7164	-0.113	-0.4157	0.3614	0.3482	-0.0689	0.1664	-0.337	0.1465	0.1819	0.4676	-0.0843	-0.0387	0.3973	-0.0027	0.2167	20.5819	-16.8924	4.1335
18	10.0542	8.367	7.1536	6.9854	5.8064	8.5687	0.2967	-0.1821	-0.3012	0.2832	-0.1362	-0.1882	0.3803	0.0504	-0.1605	0.4045	-0.0282	0.0257	0.3325	0.0699	0.3633	12.4203	-33.5192	-5.3495
19	10.9251	12.0207	9.5508	19.1358	11.5596	11.8106	0.7296	-0.9934	-0.0313	1.5947	-0.5343	-0.349	0.4942	0.0034	-0.1953	0.515	-0.0999	-0.0777	0.5346	0.0491	0.2271	27.2392	-21.2774	11.9689

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	54 - 70
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	71 - 120
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	121 - 144
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	145 - 171
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	172 - 198
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	199 - 212
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	213 - 263
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	264 - 293
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	294 - 380
10	X-RAY DIFFRACTION	10	A	381 - 404
11	X-RAY DIFFRACTION	11	A	405 - 420
12	X-RAY DIFFRACTION	12	D	0 - 16
13	X-RAY DIFFRACTION	13	D	17 - 26
14	X-RAY DIFFRACTION	14	D	27 - 34
15	X-RAY DIFFRACTION	15	D	35 - 42
16	X-RAY DIFFRACTION	16	D	43 - 54
17	X-RAY DIFFRACTION	17	D	55 - 88
18	X-RAY DIFFRACTION	18	D	89 - 98
19	X-RAY DIFFRACTION	19	D	99 - 109

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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