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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6ffq | |||||||||
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タイトル | Solution NMR structure of CBM64 from S.thermophila | |||||||||
![]() | Glycosyl hydrolase family 5 cellulase CBM64 | |||||||||
![]() | SUGAR BINDING PROTEIN / CBM64 | |||||||||
機能・相同性 | ![]() | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | |||||||||
![]() | Heikkinen, H.A. / Iwai, H. | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: NMR Structure Determinations of Small Proteins Using only One Fractionally 20% 13 C- and Uniformly 100% 15 N-Labeled Sample. 著者: Heikkinen, H.A. / Backlund, S.M. / Iwai, H. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 512.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 437.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 470.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 598.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 30.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 52.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 6ffuC ![]() 6sowC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10025.756 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: C-terminal 86-residue module of CBM64 from S.thermophila, UNP residues 456-541 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: STHERM_c20620 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution / 内容: 6.4 mg/mL [U-13C; U-15N] CBM64_100, 95% H2O/5% D2O / 詳細: NMR sample / Label: 100%-13C and 15N / 溶媒系: 95% H2O/5% D2O |
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試料 | 濃度: 6.4 mg/mL / 構成要素: CBM64_100 / Isotopic labeling: [U-13C; U-15N] |
試料状態 | イオン強度: 20 mM / Label: condition_100% / pH: 6.0 / 圧: 1 bar / 温度: 303 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE III / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE III / 磁場強度: 850 MHz / 詳細: HD |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 3 | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: all calculated structures submitted 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |