PDB-6fc2: Crystal structure of the eIF4E-Eap1p complex from Saccharomyces c...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6fc2

タイトル

Crystal structure of the eIF4E-Eap1p complex from Saccharomyces cerevisiae

要素

Eukaryotic translation initiation factor 4E
Protein EAP1

キーワード

TRANSLATION / Gene expression Translation Translational control 4E-binding proteins

機能・相同性

機能・相同性情報

Activation of the mRNA upon binding of the cap-binding complex and eIFs, and subsequent binding to 43S / positive regulation of formation of translation preinitiation complex / Deadenylation of mRNA / : / eukaryotic initiation factor 4E binding / eukaryotic translation initiation factor 4F complex / mRNA cap binding / deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA / RNA 7-methylguanosine cap binding / phosphatidylinositol-3-phosphate binding ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Saccharomyces cerevisiae S288C (パン酵母)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.92 Å

データ登録者

Gruener, S. / Valkov, E.

引用

ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2018
タイトル: Structural motifs in eIF4G and 4E-BPs modulate their binding to eIF4E to regulate translation initiation in yeast.
著者: Gruner, S. / Weber, R. / Peter, D. / Chung, M.Y. / Igreja, C. / Valkov, E. / Izaurralde, E.

履歴

登録	2017年12月20日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2018年6月27日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年8月8日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.name
改定 1.2	2024年1月17日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6fc2.cif.gz	294.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6fc2.ent.gz	246.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6fc2.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	6fc2_validation.pdf.gz	446.7 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6fc2_full_validation.pdf.gz	449.7 KB	表示
XML形式データ	6fc2_validation.xml.gz	20.3 KB	表示
CIF形式データ	6fc2_validation.cif.gz	28.8 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fc/6fc2 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fc/6fc2	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	6fbzSC 6fc0C 6fc1C 6fc3C S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	2vdv-1 3ois-3 6vvq-2 6ihs-d 4j6o-1 4qn0-5 6ihl-d 4px9-2 2v4u-d 4qn0-6 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#230 - 2019年2月開始因子eIF4E (Initiation Factor eIF4E) 類似性 (11) #161 - 2013年5月リシン (Ricin) 類似性 (3)

登録構造単位

A: Eukaryotic translation initiation factor 4E

B: Protein EAP1

C: Eukaryotic translation initiation factor 4E

D: Protein EAP1

ヘテロ分子

56.8 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Eukaryotic translation initiation factor 4E

B: Protein EAP1

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
28.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

C: Eukaryotic translation initiation factor 4E

D: Protein EAP1

ソフトウェアが定義した集合体
28.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	87.574, 95.116, 56.009
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	18
Space group name H-M	P2₁2₁2

#1: タンパク質	Eukaryotic translation initiation factor 4E / eIF4E / eIF-4F 25 kDa subunit / mRNA cap-binding protein 分子量: 20806.371 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Saccharomyces cerevisiae S288C (パン酵母) 遺伝子: CDC33, TIF45, YOL139C / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P07260
#2: タンパク質	Protein EAP1 / eIF4E-associated protein 1 分子量: 7590.755 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Saccharomyces cerevisiae S288C (パン酵母) 遺伝子: EAP1, YKL204W / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P36041
#3: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 218 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.05 Å³/Da / 溶媒含有率: 40.11 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法詳細: 0.1 M Hepes-NaOH (pH 7.5) 30% (w/v) Jeffamine ED-2001

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X10SA / 波長: 0.99996 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2016年12月2日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.99996 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.92→48.263 Å / Num. obs: 36515 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 13.2 % / R_sym value: 0.105 / Net I/σ(I): 17.5
反射シェル	解像度: 1.92→1.97 Å / 冗長度: 12.7 % / Mean I/σ(I) obs: 1.6 / Num. unique all: 30566 / Num. unique obs: 2408 / CC_1/2: 0.542 / R_sym value: 1.711 / % possible all: 99.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.11_2567: ???)	精密化
XDS		データ削減
Aimless		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 6FBZ, chain A

6fbz

解像度: 1.92→48.263 Å / SU ML: 0.23 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 20.91

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2065	1786	4.9 %
R_work	0.1735	-	-
obs	0.175	36466	99.97 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.92→48.263 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3876	0	1	218	4095

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.01	4004
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.747	5432
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.97	2383
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.044	576
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	695

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.92-1.9719	0.2988	142	0.2717	2618	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9719-2.0299	0.2888	125	0.2407	2627	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0299-2.0955	0.2605	136	0.2232	2619	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0955-2.1704	0.249	141	0.2065	2643	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1704-2.2573	0.2255	109	0.1908	2663	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2573-2.36	0.2241	151	0.1824	2619	X-RAY DIFFRACTION	100
2.36-2.4844	0.2048	149	0.1797	2638	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4844-2.6401	0.2114	149	0.1742	2637	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6401-2.8439	0.2269	142	0.1753	2649	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8439-3.13	0.2413	159	0.171	2663	X-RAY DIFFRACTION	100
3.13-3.5828	0.2058	141	0.1583	2687	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5828-4.5134	0.1388	122	0.1416	2736	X-RAY DIFFRACTION	100
4.5134-48.2783	0.1968	120	0.1759	2881	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.3651	0.4027	0.6864	3.6307	-0.2679	1.7406	0.0366	-0.1308	-0.2613	0.0765	0.0508	0.0228	0.1209	0.0424	-0.0965	0.1819	0.007	-0.0203	0.1832	-0.0068	0.1971	114.4145	107.615	81.1921
2	2.7392	3.9168	-4.4635	7.2113	-4.9959	8.5814	-0.153	0.131	-0.5806	-0.2962	0.0173	-0.907	0.1074	0.8644	0.2378	0.245	-0.0105	0.0304	0.3684	-0.0438	0.3577	121.298	108.7607	78.5551
3	2.7139	-0.1322	-0.0071	2.6369	-0.7059	2.7135	0.056	0.0265	-0.1822	-0.1337	0.1079	0.1208	0.0105	-0.193	-0.1679	0.2588	-0.0079	-0.0156	0.2328	-0.0062	0.2502	109.5633	107.615	76.9484
4	5.409	-1.9057	-1.1299	8.42	4.1439	8.2372	-0.0447	-0.1368	-0.2305	-0.1463	0.3479	-0.8716	0.3073	0.7865	-0.2293	0.3099	0.0361	-0.0263	0.3253	0.0029	0.5273	124.9906	95.2591	78.0288
5	4.0901	-4.4384	-2.34	9.5758	-0.2544	4.4731	0.3772	0.5768	0.528	-1.4328	-0.1281	-0.4248	-0.1283	-0.9583	-0.2109	0.546	-0.0523	-0.0612	0.4232	-0.0145	0.4258	110.2242	98.8174	62.1044
6	2.3663	0.1881	-0.1034	2.6897	-0.1843	1.8564	0.0467	0.2014	-0.6247	-0.1908	0.0523	0.0937	0.3188	-0.1417	-0.0759	0.2864	-0.0366	-0.0381	0.2381	-0.0405	0.3641	110.6553	93.6556	71.9885
7	2.4609	-2.1749	-2.4795	5.222	-0.2851	4.3533	0.0424	0.775	-0.2414	-0.7295	-0.0435	-0.0697	0.5853	-0.2189	-0.086	0.5404	-0.0517	-0.0027	0.4176	-0.1525	0.4452	114.2268	89.7658	61.8857
8	3.5027	-0.3348	1.503	4.4313	1.6542	4.1108	0.2013	-0.1589	-0.793	0.0566	-0.0138	0.8812	0.6122	-0.0855	-0.0963	0.3684	-0.0929	0.0001	0.3673	0.0909	0.5763	99.5116	91.4235	81.6585
9	2.9688	0.4464	-0.9089	3.0775	-0.7105	6.0811	-0.0866	-0.1528	-0.0193	-0.0004	-0.0638	0.1973	-0.2494	-0.3079	-0.0496	0.2643	0.0536	-0.0053	0.2487	0.0015	0.3047	107.0102	115.7312	82.6148
10	4.6324	2.5784	1.3489	4.2295	-1.0743	3.5377	-0.2905	0.6234	-0.1092	-0.7244	0.2266	-0.0494	0.1628	-0.178	-0.015	0.252	0.0025	0.0386	0.3979	-0.0219	0.2071	87.8269	118.0919	56.7703
11	2.4252	1.4384	-1.3273	1.6865	0.1851	1.8602	-0.2568	0.4611	1.2088	-0.5467	0.1507	-1.1101	-2.1106	0.4012	-0.1313	0.7347	-0.0788	-0.0453	0.3916	0.1969	0.8956	104.7251	138.5404	64.5978
12	2.1493	0.4287	-1.0705	6.8683	-2.1281	9.8102	-0.0532	0.13	0.346	-0.5568	-0.0518	-0.3419	-1.0355	0.6065	0.1233	0.2425	0.0076	-0.0086	0.417	0.0579	0.3265	95.7803	130.044	58.4507
13	0.0857	-0.0482	-0.0681	0.1116	0.0769	0.0706	0.0767	0.4281	-0.5171	-0.211	-0.2279	0.0005	0.4605	0.1941	-0.0003	0.3519	0.0083	0.0129	0.4482	0.0039	0.2756	92.5839	111.9572	58.3415
14	5.1038	-0.6733	-0.115	3.0374	0.0644	2.0158	0.0816	0.7316	0.63	-0.1231	-0.1624	-0.2152	-0.1261	0.1079	0.0803	0.2637	-0.0029	0.0226	0.2764	0.0727	0.255	89.9285	128.5221	63.1866
15	3.6799	-4.6878	3.4287	7.3186	-2.4564	6.3645	-0.1672	-0.581	0.4855	0.8826	-0.0971	-1.0929	-0.0514	0.4969	0.4055	0.3839	-0.0404	-0.0734	0.4645	0.0755	0.4437	88.3562	125.1711	78.5332
16	3.7379	-0.8236	-1.4359	1.4653	0.2637	2.1439	-0.0788	0.0237	0.1084	0.1154	0.0475	0.0342	0.0283	-0.1184	0.0331	0.2757	-0.0093	-0.0232	0.2542	0.0176	0.2187	81.6757	122.2114	71.2905
17	6.6597	1.2516	0.4104	2.5499	1.8429	7.0215	0.0373	-0.3943	1.0161	-0.1155	0.0141	-0.3457	-0.7234	0.264	-0.045	0.3882	0.0411	0.0367	0.3203	-0.0298	0.4732	78.8199	135.0255	76.4468
18	4.1989	0.8383	-2.8857	4.0742	2.848	4.9884	-0.0962	-0.4549	-0.8748	1.0973	0.3295	-0.4764	1.4758	0.0056	-0.3578	0.5088	-0.0269	-0.0682	0.3894	0.0436	0.4883	80.7052	107.4203	75.1836
19	2.3438	-1.0228	3.543	1.6103	-2.1181	5.6371	0.0896	0.0233	-0.6805	-0.1794	0.5999	0.5949	0.7501	-0.9899	-0.7025	0.3717	-0.1164	-0.0676	0.5959	0.072	0.4105	73.0892	111.3797	60.9082
20	5.3621	-4.4665	-1.7939	4.7176	0.8505	4.3695	-0.2212	-0.5795	-1.2229	0.8788	-0.7149	-0.4769	0.3576	0.3075	0.5445	0.4859	-0.031	0.0054	0.2112	0.0991	0.5225	85.3162	105.7018	66.0386
21	3.8572	-2.8149	3.0008	2.6921	-1.0442	5.0502	-0.1198	0.8198	-0.3985	-0.8476	0.9586	-0.6321	-0.6737	1.1546	-0.7388	0.8626	-0.1577	0.1408	0.7211	-0.0675	0.6328	98.1348	103.0598	56.417
22	4.4241	3.0612	3.2396	5.4545	2.5721	2.4053	0.1787	1.6055	-0.3127	-2.1802	0.4171	-0.5913	-0.6802	-0.5832	-0.4349	0.644	-0.018	0.1339	0.6893	0.0318	0.4089	98.5707	112.1995	49.4489
23	6.3598	1.3337	3.1239	9.3895	5.2173	3.9783	0.2268	0.2155	-0.6563	-0.2736	0.4297	-1.7699	-0.0649	1.1436	-0.709	0.3585	-0.0603	0.009	0.4808	0.0604	0.6445	104.9819	122.5287	59.0546
24	4.1119	-2.9306	4.7416	9.4745	-1.0515	6.2016	-0.0211	-0.476	1.2839	1.8073	0.3363	-1.1711	-0.0475	1.2835	-0.2282	0.557	0.1334	-0.0336	0.8687	0.0559	0.606	109.3133	126.5961	69.2456

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 31 through 57 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 58 through 68 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 69 through 97 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 98 through 112 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 113 through 125 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 126 through 185 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 186 through 213 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 91 through 117 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 118 through 150 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 35 through 48 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 49 through 57 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 58 through 68 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 69 through 80 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 81 through 112 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 113 through 125 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 126 through 193 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 194 through 213 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 91 through 96 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 97 through 110 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 111 through 117 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 118 through 129 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 130 through 137 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 138 through 145 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 146 through 150 )

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)